XLOC_025151


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_025151
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 14277650 ~ 14287841 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00052622
GAATGTGTCGGTTCGACAAGAGTATCTCAGTGGGACGGCTGAGTGCTTCCTGAACACAAAAACATCTTTTGGAAAGCAAGGTGAGCAGCTGTTGAAGTGCCTTCCATAATGTGTTCAACAAAATTATGCTTGGGTGAGGTTTGTTTTGAAGACAGCAGGGCTTATTTAGTAGAGGCTTAAAGGGATAACTCACCCCAAAATttaatatttactcactatttgctcactgctaagtggttccaaaccgttgagattcttctgttgaatactgaagatattttgaagaaacatgaattaaaaaaagtGGTTAGCAGTGTCGCTGCAAAGCACAAaaattgctggtttgagtccctgctgggACAGTAGGCATGTTGtatggactttgcatgttctcctagtgttggcgtgggtttcctcaaggtgctctggtttcccccacagtccaaaggcgctataggtaaattgagtaCACAAAATtggtcggtgtgtgtgtgtgtgtgtggggggtgtgtgtgtgtgtggacgttaATATTAACGTCTTAATATTAAGACGTTTACACTGGAAGTGTCATGCGAcaatttgtttgtaaatatttgcAGTTTAGATAACTTGTCCTACATTCAACAGTTTGCTTTTCTGGTAAGCTTTAACAAAAAATTACAGCAGTTGCTTATCTTTTTTGCTATTAGAACAGTCTCAGGTGGTTTTTGTTGATTTGTTTGACCATGGTGTGTTGGTTCTCTATCTTCAGCCAAAGCAGAGAGTTCTGGCTGGCTCCTCGATGAATTATTCAGCTCTACTATGACCTGCTGTGGGCTAGTTTTTAAAGTCTCCTGCAACCTTCATTTGCTTTTAGAGACCCGGCAGGTGTTTCTGCGCAAACTGTTTTCTCAAATTGCATTTTTTCTTATGTGatggttttaaaaaatggtgATATTCTGACATCCATAGAGagaccaaaaaacaaacaaacctgggAATAGTTTCTGCTTACCAGTGTTTATGTAATCTCAAGCATTTGGAGTTCagagccaggacttgaaccagtgaccttctggctgtgaggcgacagtgctaaccactgagccacagcgCTGCCCACATTCAGTGTTATAAGTTAGTTTTTCACAAATCTTACCATTCAAGAGCAACTGTTGACCATGTGAAGGCTCTTTGAACATCATGCTTGAACTCAAGGGTGAAATCAATGCTTTGATTGACCAACAACACTGCTCAAACGTTCCCAACATGCATTGCTGCATGAATAAATTCTGTGCATACTTTTATATTGGGGATGCTTTATGAACAATATATGTTGCCGCTGTTACTTGTAGCTTTTTATGTAATATTCAGAtgttttgtatgtgtatgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtagtgtagtgtagtgttatGTGTGGTGGTGTTTTATTGCCATCTTTATTGACAACTAGTTGTATTGAATGCTAAGACAAATGCATGAAAGAATTGTCTGTGTACTTTGATATGGGGAAACTTTATACGCAGTATTTGTTGCGGCTGTAGTTTGTGTTATGTGATGTTCAGATGTTGTTTATGTGTGTTGTGGTGTTATTTGTGGTGTTGTATATTGCCACCTTTATAGACAACTAGTTATATCAGTTCAGTATGTTAAGACAATTGATGATTTCCTGTGTTACTGGTATGTTGTGTGGTATCCAGTTGCTGTGAAACTCCGCCATATGTTGCTTTGATTGCTAAATtgttattatgaataattattttttaatttgtaaaagaaaaatcctattatatatatatatatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatatatgtatgtatatatatgtatgtatattctAGCTCATCTTTTTCTCTTAGACAGCAGATTGTATTTGGGGTCTCCATGTTCTTTTTTTAGTCCTCAGGAATATCCGAATATTATCTTAAATTGTGCTCCCTGAATTTTATATTCGCTCTGATATATTCTATTTCACAATATGGACGTGGTACTAAAAAAATCTGGAGAAatgtctggatggatggatggatggatggatggatggatggatggatggaaggatggaccaAATATTTGGATGGGTAAATGTTTGACTAGACAGACAATATAATGGATGGACAGAAAATATAATGGATGaacagttggatggatggatggacagacaaaatATTTGGATGGGTAAATGGTTGGATGGACAGACAATATAATTGATGGACagaaaatataatgaataaatggacgatggatggatggatggatggatggataaacggatggatggacaaaatatTTGGATGAGTAAATGGTTCAATGAATAGACATTctaatggatgaatggacagtggatgaatggatggacaaaatATTTGGATGGATAAATGGTTGGATGGTCAGACAATATAATGGATGGACAGAAaatataatggatggatggatggatggacaaaatatTTGGATGAGTAAATGGCTGAATGAACAGACAATATAATGGATGGATTGGTGAACTCTTTTAATCTTCAGGAATATCTGAATATTATCCTAAATTGTGTTCCGTGAATTTTTTATTCGCTCTGATGGTTTTAGGACATTTTGGAGAAATTTGAGTTATACATTATGCTTTAATGTTTGCTGAACTATGAAAGTGCTATCTCTTAGCAGTGACATTTGACTTTTAATTACACTTTTGTGAAAAAATAAGAAGAAATCTTCTTTTCTTTGGAATAATGAGGACAGATTAATTGTGCATCGCCTTTGTGTTCCACTGAAGAAGCAAAGCCACAGATTTGGAATGACACAAGGGGGTATTTTTCTTCCTCAAATTGTAAATTGTCCCTTTAAGTGGCACAATCATTTGCAgggaatgattttttttattgttgcccAGAGCTGATTAGTCGTCCTCTGTATGTGTGCTTCGCCCACAGAAAACCTCCACTCTCCTCGATCGCTTTCCTCTTTTATCAGTTCTGCTCTCTGTTGGGGTGGATTGTCTCATATGGTCTTTAAGCCCTGAACACGAAAGCAATCTGCTCAGGCACATCAGATGGCAGGAGGCTTTCCTTTAATAAACACTGTTTGATTGCATAACACAGTATCATTACAAAAAGTTAAGAAATCATTTGAAAACTAAGATGTGTGGACGGATGGTCATTTGGATgattatatggatggatgaatgaggaTGTAGGTGGATATATGGATTAATTGACGGATAGACAGTTATAATATTCTATGGATGGAGGGTCGGCCAGACAGCTGGATGGATGTGCACTTGGTTGGATAGATGGTTAAATAGACAGACACttgaatgaatgcatggatggtcagacagttaaataaatatatggatGGTTGGACCAATGGAGACCTAGATAGCtaaatggatagattgatggacaaACAGATGACCAATAAAGATAGAGACAGTCAACTAGGCAGAAAGATTGTTGGACAATCGATATTACAGTTCAATAGGTATTGATGGttgcttggatggatggatggaaaagatAGTTGGATGGATAAAGGGTTTGGTGAACAGACAATATAATGGATAATTGGATTGTTGGTCAGCCAGGTGAATGGATGGAAAAGACAGTTGGATGAACAGAAAATATAATGGATAGACGGTTGGTCAGACAGTTGGATAAAtagagaaaaatatatttaaatgggTGGAAGGACAGACAAAATACTGGATGGACAGAAAatataatagatggatggatgtacaaaATATTTTGATGGGTTAATGGTTGGATGGACAGAcaataaaatggatggatggacaaaatatTTGGATGGTAAATAGTTGGATGGACAGACAATAAAATGGGTCGACAGAAaatataatggatggatggatggatggatggatggatggattgatggacggaCAAATTTTTGGATGGATAAATCGTTGGATGGACAGATaatataatggatggatggacggatggatggacaaaatatTTGGATGGGTAAATGGTTGGATGAACAGAAaatataatggatggatggacagtttgATGGATGGATATTTGGATGGGTTATTGGTTGGATGgacagacaatattttaaatggacAGAAAATATAACGAATGGATGGACagttggatgaatagatggatggaaggatggatggacaaaatatTTAGATGGGTAAATGGTTGGATAGACAGACAATataatggatgaatagatggatggacaataTATGTGGATGGGTAAATGGTTGGATGGACAGAAAAtaaaatggatagatagatggatggatggacaaaatatTTGGATGGGTAAATGGTTGGATAAACAGACAATAGAACGGATGAACGATTGGTCGgccagatggatgaatggatgaatggatggatggatggatggatggatggatggatggaaaagacAGTTGGATAAATTGTTTGCTGGAAAGAAAAtgcaatagatggatggacagttggTCAGacagttggatggatgaatggatggagaaaATATTTGGATGGATAAATAATTGCATGGACAGAAAATGTAATGGAGGGATGGACAGTTGATCACACAGTTAGgttgatggatgcatggatgggtggacagatagatggatggagaaatGGAGAGATGGATAGATTGTTGGATGAACAGACAGCTTGCaggacagacaaatggatggacaaAGTCAAATGGGTAGAAGGATGGAGGCACAAACGGTTATATCCAGATGGATGGAAAGACggttggattgatggatgatCTGGAAGACGGATGAATGGAAAGACAGATAGGTAAATGGATGAACGGTTGGATTAAAAGTTGATCTGATAGATGGACTGACAGATGGATTTGCAGACACtgtattttttcaacatttctgagTTTTCAGTAGTAGTAAATTATTGTACTAAAGGTGTTTGGTTCAAATAATATTTGTACTTG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Function

GO:

id name namespace
GO:0015349 thyroid hormone transmembrane transporter activity molecular_function

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00052622 True 10192 lncRNA 0.37 1 14277650 14287841

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_025150 si:ch211-108d22.1 coding upstream 16853 14259115 ~ 14260797 (+)
XLOC_025149 NA coding upstream 22885 14251244 ~ 14254765 (+)
XLOC_025148 AL954138.2 coding upstream 29112 14242119 ~ 14248538 (+)
XLOC_025147 NA coding upstream 75131 14201043 ~ 14202519 (+)
XLOC_025146 si:ch211-108d22.2 coding upstream 88628 14157090 ~ 14189022 (+)
XLOC_025152 plppr2a coding downstream 29961 14317802 ~ 14373165 (+)
XLOC_025153 tlcd4b coding downstream 100169 14388010 ~ 14452325 (+)
XLOC_025154 CU639471.1 coding downstream 111384 14399225 ~ 14399652 (+)
XLOC_025155 cnn1b coding downstream 176100 14463941 ~ 14486959 (+)
XLOC_025156 tmem205 coding downstream 211234 14499075 ~ 14508761 (+)
XLOC_025429 BX649540.1 misc downstream 15960898 30248739 ~ 30249036 (+)
XLOC_025145 NA non-coding upstream 203880 14028243 ~ 14073770 (+)
XLOC_025134 NA non-coding upstream 799777 13476872 ~ 13477873 (+)
XLOC_025164 NA non-coding downstream 942111 15229952 ~ 15231838 (+)
XLOC_025169 NA non-coding downstream 1217343 15505184 ~ 15506157 (+)
XLOC_025170 NA non-coding downstream 1229711 15517552 ~ 15517899 (+)
XLOC_025172 NA non-coding downstream 1330437 15618278 ~ 15621754 (+)

Expression


Co-expression Network