G606412


Basic Information

Item Value
gene id G606412
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048571.1
NCBI id CM023225.2
chromosome length 90918291
location 40115588 ~ 40125497 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU690525
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>TU690528
CATTTTTACTTCAGGTTAGAGAAGGTTTATTCAATTGTAGGTTTATTCAACAAAAGAAAGGCATTAAATCAAAATATTGTAACACATTCCGAGGTTTTACATCTTTAATCTCCAATCAGTAACAATCGATTTGCTCTATATAATGGAGACCTATTCAGAATTACAATGTGACAGACAGTTGTTGACATCTGAGTTGGTTGTGGACATGGATATGAACTCTATACCAGAGAGTACTaaggaagaaaaataaataaaaggcaaCAAAAACAAAATCTTCATAAATATAGGAAAGGGTAGGATACAGCGGTTGTAGACATGAACCATTTCATTGTTTGTTCTCTCCAGTCAGTCAtatgtacatgtttttttttttccagCATCCAGAACCATCCTATAGAAAAACAAGTGGCATATATATAACTTTAAAACTCACCGAAAGTTATTGACTGTCTCGACATATTTCACATCAAAAGAGAGAAAGTATATAAAGAGCTTATAAAGACCACCTCACCTTTTTGTAAAGGCCTCATTCCGCTTCTAATTTGGGACTGTAACAGATGTAAAGAACAGGTGTCAATTCACATGCCATATTTAGCCAACTGTGGTGGTTAGAACTGCAGTAGCAGGTCTACAAAATGtataacataaaaaaaaaatgcagccAGTTTAAAATATTCATATTacacaaaaacatgttttttttgcaaGTGAATAGAGCTGATTGAATCTCCACGGGGGATACTCAACACCTTGGTGGGTGAAAAGCTGCTTGCAATGCTGTGGGTCCTGGTAGTAAATTGCAGTGTCTCGCTGGTCCCTAATGGGCCCGCTATGCCGAGTCAAGGAAATTATGTCGTCCCCCAACTGAGTGCAACTCCACTGTATATGGAGCCATTACAGGACTATTTTATGAGCAGCAGATAGGACTAGCACTCAGACCCTTGCGATTGCAGAGGCCACCTTTCCACCTCCCACTTTAGGGCTCACCATGTAAGGCCAGCCTTGGAGAATATGTACGTCACACCAGGACTCAAATAGACTTTGGTACATATTAAAATAAATGTTGGTGCAACATTTTAGGTGATAATATGGGTACATATAAACTCTCTCTCCAATAAGACCAAAGTCAAAGCAGATGAAATGCCAAGatggatatttatttattttaataaagATATTAAAGAAGTATATTTTGTTacaaagtggccttttatttatTAATTCAGTCAACTTCTGAATTCGGGCCTTGTAAATTGAAGCCCATTTGCCACATGAAACCTTATTCATGCCAATAAGAGTGACTGACCTGTATGCATGTGCATTTACTGTTCCTACTCGTCTTTGTCAGTGTCTGCATGCAAAGGCTCTGTTGAGGTAAATATAATTCATTTAGTGATCATGAACAAATGGCAATATTTCCACACAGCCTGATTTCAAATACAGCAAATATCGAGTGTCTAAATTTGCATGGATAATGAATAATATATAACACCACTAAAagtagaaatacatttgattacaAAAGCATGGTCTATATTATAGATGAACTCGCTTCATACTTTGCGAGACTTCTTCCTCGGGTAAAACCATGTATGAGAAAGCACTTTCCCACTAGgtacagacatcaattcaacttTTATCCCACGTTGATTTAATGTAATTTTATTGAAATGGCGTGGAGACAATGTTGATTCAAGCCGAGTGTGCCCAGGGTGTTCGAAATTAATTTACTTTTACATTTGAtaatttagtcatttagcagaagctcttatccagaaagacttacAGTTAGTTACTTAAGTTGAGACAACCACATaccacagtcatagtaagtacaatTTTCTCAACAAAGCAGTTATCCTACTAGAAGAGATAGTACTAGCAggaaaagacaaaaaaaagacaCCACAACAACTTACTTTTGACCTCCAGCTTGCAGCCGGTGTCGACCTTCCCCAGTGTATTCTCGGCTCTGCAGACATACTCACCACCGTCGTATGGGCCAGGCTTACGGATCTCCAGGGTGCAGATGCCCCCTGTGCTGATCATCCTGTACTTGGGGTTGTCCATGTTGTTGAGAATCATCTTGTTCTTCATCCACATGATCTTAGGGGCATCCCCTCACAGAGCACAGCAGCTTGGTGCTGTAGCCAACAGTGGTGGACCTGTCGTTCAAAACAGTGGTGAACTTGGGAGCCTCGGTGAAGTCATGCTCCACGAACGGGGTAGGTTTGTAGTCAATACCTCCTTCACAATGGTGGCTTCTCCCTTGGTCACGGCACATTCCTCACTGAGTCCGCACTTGTTCTCTGCAAAGATCCTGAAGGTGTAGGTGTTGCCCATAATGAGGTCTGAGATGGTGGCGTTTAGTCTGGTGTAGTGCTCCAAAATGTTGAACCAGTCCTGAGCAAGAGACCATATGAGTATTAATAACATTTCAATGGCTTGTTATTACACATATTGTATTTTCTTTTGGAAGACAATTTTTTGGTGTAAAGTATACTGAGATGTACTTTTAAATAACATTTTGGGGGATTGTATTTGATTACAGGGAATATATTTGCTGCTGAATCAATGGGAATTGTGTAGATGAGAGGGCTACAGAAGTTGTGAATGACTCAGTATGTCATTCACTATGACACTGTATGGTAAGCAAGAGGGTTTCTCACCCCGGTCTTCTTGTCAGCTTTCTGGACAGTGTAGCCTGTGATCTCTGTGTTACCATTATCTTTGGGTACGGTCCACTCCAAAGCAACGTTGAATCCCCAGACATCCACAATCTTAATGCTGGCTGGTGGCCCAGGCAACTCTGTGGGAGAGCAAGCACCGAGATACATGGTTCAATATGGGTTGCATCATTAGTATCAGTAGACTCACAAAAAACTTAATCACTCTCTAGATCAGTTAAGACCTGAC
>TU690530
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Function

NR:

description
myosin-binding protein H-like

GO: NA

KEGG:

id description

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU690525 False 4901 lncRNA 0.40 3 40115588 40120632
TU690528 False 2916 lncRNA 0.40 3 40115588 40125497
TU690530 True 2532 lncRNA 0.41 5 40115588 40125497

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110527739 LOC106582710 coding upstream 88130 39992766 ~ 40027458 (+)
LOC110527736 LOC106582707 coding upstream 341864 39433189 ~ 39773724 (+)
LOC110527735 LOC106582706 coding upstream 738732 39370730 ~ 39376856 (+)
LOC110527730 LOC106582703 coding upstream 805354 39291656 ~ 39310234 (+)
LOC110527729 LOC106582701 coding upstream 875380 39228701 ~ 39240208 (+)
csrp1b LOC106582712 coding downstream 158056 40283553 ~ 40287403 (+)
tnni1b LOC100462680 coding downstream 166543 40292040 ~ 40296179 (+)
tnnt2b LOC106582714 coding downstream 179625 40305122 ~ 40314447 (+)
LOC110527751 NA coding downstream 313382 40438879 ~ 40457742 (+)
LOC110527752 LOC106582721 coding downstream 348269 40473766 ~ 40481140 (+)
G606411 NA non-coding upstream 6979 40108369 ~ 40108609 (+)
G606409 NA non-coding upstream 7720 40107638 ~ 40107868 (+)
G606405 NA non-coding upstream 13285 40102056 ~ 40102303 (+)
G605248 NA non-coding upstream 529261 39580045 ~ 39586327 (+)
G606400 LOC105027254 non-coding downstream 1963 40126534 ~ 40141972 (+)
G606414 NA non-coding downstream 10265 40135762 ~ 40140407 (+)
G606436 LOC106582711 non-coding downstream 51153 40176650 ~ 40176947 (+)
G606439 NA non-coding downstream 53684 40179181 ~ 40179502 (+)
G606442 NA non-coding downstream 61290 40186787 ~ 40187269 (+)
G604258 NA other upstream 1524294 38584474 ~ 38594822 (+)
G604207 NA other upstream 1615926 38499031 ~ 38499662 (+)
G602295 gli1 other upstream 3024832 37089624 ~ 37090756 (+)
LOC110527686 LOC106582662 other upstream 3539516 36573811 ~ 36582978 (+)
G600531 NA other upstream 5144183 34971128 ~ 34971405 (+)
G606452 LOC106582711 other downstream 81072 40206569 ~ 40206897 (+)
G606464 LOC106582711 other downstream 97678 40223027 ~ 40224171 (+)
G606469 NA other downstream 105388 40230885 ~ 40231225 (+)

Expression


Co-expression Network