XLOC_025434


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_025434
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 30643162 ~ 30655558 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00052707
ccctatcaAGCACTGGCTTTCAGACATTAAACTACAAAACATacttaaatgaacaaataaatgaaacgtGTGCAGGGTTTGAAACATTTTGATTTGATCTTTTGATTTAGTAACTGTAATTACAGTATAATACTTAAAACAATGCATGACTTTTTCTTCTGCACACACATTGAGGATGAAATATATAGTGATTCAGGTCCATTCTGTTATTTGAAGTCGTTGAGATAACAAAATCGACTATCTTGACATGACCGACAGCACTTACTGCCTGCTTTACGTCATCAGCCAACGTCACGCATCATTACCATAGCCACTCACCTGGGACCTTGTATTTCCTCTGCCTATTCCCTCCTGGTGCATTCTGAGAATTTTAATTTCAGTGAACTGGAGCGATGACAGGACACTCCGTTTTAAGACATGTCCTCATTCTTTGGACACAACACTGCTGAACTTAGACCTGGTGAGCTGCAGAATGTCCAGATCACAGGAGTTTGTCCTTGCTGCAGCCTGCAGCCCGATAACATTCTGGAGCAGGTCCTATGCATAGTGGATGTCCATGCATGAGCGGTTGTTTCTagaaacaagaattatttatattaattattaaattaccaaTTACATTGTGTGTTATAAACGTCTACGCTTACCTCAATCTATGTCTTATCTCACTCCGATGTGCCCATCATTCTGGAAAAGGGTAAATCTGGACTCATCAGATCACTTGACCTTCTTCCATTGCTCAAGAGCCCAATCTTTATGCTTATCTCTTGAAAACTGAAGCCCTTTTTTCCGATTAGCCTCACAGATAAGTGCTTTTCCTAAGGCTACACAGTTTGCTGCCAATCCCTTGAGTTCCCTTCCCATAGTGCATGTGAAATGTTCTACCTTTCACTAATAAGCATAGCTGTCAGAtctactgttgttgtttttttttacgttttgatTTCACCATACAATCtcaatcattcatgtttttttcctgacACCATTTTTTCCTCAGAGATGATGGTTCCCCATTATCCACCCAGTGTTTAATAATGCATTGGACAGTTCTTAACCCAATTTTTGCagtttcagatgtttttttttttttttttgcatgatgcATGCTGATAATTAAACTCTTCTGAAACAGATTAACATCTTTTTCACAACCATTTAAACCCTGGTTGTAAATGAGAAGCTACTGTTTGTATCAGTTGGGGTTAAACAACTTGCTAAATAACCAGCTTAAACAGTCGTCCATGCAGTAATTATCCAATTGGAAGCTCTCACCTATTTGCTTAGTTAAATCTAGGTGGTGACTTTTTAATAAGCAGtgcatgtacactcaccggccactttattaggtacacctttggagttggacccccttttgcctttaaaactgccttaatcctttgtggcaaagattcaacaaggtactggattttgggtccatattgacatgatagcatcatgcagttgcagcagatttgtcatctgcacatccatgatgcaaatcttccattccaccacattcataacgtgctctattggattgagttctggtgactgtggaggccatttgagtacaacattgtcatgttcaagaaaccagcctgagatgattcgcgctttatgacatggtgtgctatcctgctgaaagtagccatccaAAGATGATGTAGTTTTTTGGGTGTGTGCTTTAGGTCAAGGTTTTTCAAccaagttcctggaggaccaccagcactgcatgttttggatgtctcctttatctgtcacccattacagatatttccgattctgctaatgagctgatgatctgaatcgggTGTGATTGTTTAAGACGGAGACATGGaaaagacatggaaaatgtgcagaattGGTAATCCTCTAGgtacatggttgagaaacactgctttaggtCATTCACATAAGCACTCCAGCTATGCTGTGTATTTAACTGGACCATGTGGAATTAGGATGCAGTCATGGCACATGGGATGTCACATCTTGCCATATTATAACTTTATAACTTTCTGGCTTTTCTGCACAGCCCCAATGTCAACGTGACCGATGCTCTCTTTATGTCCTCTTGGTCGAAAATGTTCTTTTTCTAAACCATTTGCAGCCTAAAAAACCCTTTTGAATTTTTCTAATAATGGCAGTAGGCAGGGGGTCAGGCAGCTTTGTTGTACACCAGtgaagacttttttttctttttttcctgaagCTATTCTTTCAGTATTTTATTGAGGTTTCTTGGCCATTAATGCACATgattagcttttatttttattatataaagaaCATATGCTGTAAGGAGCTTATATACCAGCAAGATGGTCATTATCACAAAATACACCCTCCGGCAGGGTGACCTGGTATCACCCTGAAATGGTTTATTTGGCAATAATGACTGACTGGCTGTACATTATTCTACTTAACTGACAGCTtctcaacaaataaataaaggtgtGGACATGAAATATTGAGCTGAGTTTGTTTTGTATTCTTGGGTTTCTCCAGTATGTTATCTTCCACTAAAGAAAAAAGTCAGCCTAGCAACAAGATGAACACTTGGCAACAATATTACAGTAATGCTAATGATGAGGTCTAATGAGATCGTTTTCACTATACAGCTGATAATTAAGATGCAATTACACATTATTTGCATGAAACAAGAAAGGGAGGGTGTGTAGTGTGATTCATGAAAGTAATGATGTTCCGGTTACCAAGATCAACTGAAACAGCGCTGCCACAGATAAGGGCGAATGGAGTTCAACCAGCGGGAATCAGAAGTGCAAATCCTTTTCTTTTATTCTCAGAAGAGGAATTGATTTTTAGGGACaacctttaaattaaataaaacagatctACTCTGAGCTGAGATGCtgttgttgattgattgatggtaTATGTACTGAAGCTGTCAATCTGCATCATttaactcattttatttttaaatagatttcCTAGTGACAaactttattattcattttcttttcagtttggtccttttattattctggagtcgccacagtggaatgaaccgccaactcatccagcatacgttttacgcagcgtatgcccttccagctgcaacccagtactgggaaacacccatacactcccattcacacacatacactacggacaatttagcttattcgattcacctatagcgcatgtcttaggactgtgggggaaaactgagcacctggaggaaacccacgcaaatatgggaagaacaagcaaactccaaacagaaatgccaactgacctagctgaggcttgaaccagtgacttttttgctatgaggcaacagcgttacccactgtgccaccacaaaCTACATTGCAAAAGAAGAAATCAAAACCAGCAAATCATGTCAAAAGAACACGGTAATGCCTGCTTACTTCATGACAGAGGCTCCGTTCCATTCTGAAGAGCTCAATCCTATGCCCTAATCTTTTCGATGGGTTCAATAGGATAAAGGGTGTAGGGggccaaaaataaaatactgttcatTCGAGTGTCAACTGCGCCACAATTAAATGGGCAAAGAATAATAGGAGGAAAAAATGGCCATCACTTATGCCCTTGAAAATAATTCCAGATGGCCCTTAGAGGTGCCAGTTTTCAGCACTGTGGTTTGGAACGACCCTTCAGTGTGTCAGCCATGATTGTTTCCACTCTGCAGTGCCCATGAGAGGTCTATTTGTTCAGTTTGGAGCAGAGTGATTGTCAGTCTCTCTAAAATCACAAATTACAATTTTGCATACATTTATTCAGCATTTTACACGTAGAATGATTTGTCACGGAATGTAAATTTAACAattgtatgtctgtctgtctgtcatttttcAAGTGTGTGATTTGCAATGCACATTGTAGttggtttgataaaaaaaaatttatatctgCTGTTTTTCACGCATGGACCAGGAAGTAGATGTCTTTTTTCTTCACTTGAACCGTAAAGGGGACCTATTTTAACCCTTTTACAGggtgtaagataagcctttggtgtctccagaatgtgtctgtaaagtttcagctcaaaatacccatcagattatttataatagcctccagaatctgcccgtTTTGGTGTCTGGggcagtgtagctgtttttgtagccttttGTAGCCACAGAGAGTTgt

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00052707 True 4149 lncRNA 0.39 2 30643162 30655558

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_025432 NA coding upstream 137013 30497721 ~ 30506149 (+)
XLOC_025433 si:dkey-13n23.3 coding upstream 138743 30500968 ~ 30504419 (+)
XLOC_025431 CR936968.2 coding upstream 287575 30354768 ~ 30355587 (+)
XLOC_025430 mybpc2a coding upstream 289907 30257582 ~ 30353255 (+)
XLOC_025428 akt1s1 coding upstream 442605 30190419 ~ 30200557 (+)
XLOC_025435 NA coding downstream 38616 30694174 ~ 30695807 (+)
XLOC_025436 NA coding downstream 212860 30868418 ~ 30873160 (+)
XLOC_025437 NA coding downstream 252334 30907892 ~ 30908126 (+)
XLOC_025438 cldni coding downstream 265688 30921246 ~ 30927002 (+)
XLOC_025439 NA coding downstream 287730 30943288 ~ 30948454 (+)
XLOC_025429 BX649540.1 misc upstream 394126 30248739 ~ 30249036 (+)
XLOC_025426 NA non-coding upstream 676092 29966783 ~ 29967070 (+)
XLOC_025424 BX901883.3 non-coding upstream 713275 29929582 ~ 29929887 (+)
XLOC_025423 NA non-coding upstream 727805 29914444 ~ 29915357 (+)
XLOC_025446 NA non-coding downstream 442375 31097933 ~ 31105653 (+)

Expression


Co-expression Network