G630516


Basic Information

Item Value
gene id G630516
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048571.1
NCBI id CM023225.2
chromosome length 90918291
location 60468931 ~ 60483057 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU716906
AAGGTCTGAGTGTCTGGTGAAGCAGGTGTTATGACTCGTTTGGTGGTGGTTCCTCTGACCTTGACGCAGTACACACGCAGGAAGTAGGAATGTTGTGAGCTGTCTTCGACCAGACACACTACCCCAGAGCCCTCATGCCTCCACACCTGACGCCCAGGGAAGGACACATACACCTGGGCTACTGCTGAGACCACTGCCTGAAacggacacacacatatacacactcacaatTTGTAACCGGTTACAGATTAGGTTCACTATTTAACacactagctctcacagtctcacgacAGAATTAGAcagttaagttcaggcattaactccgaaatcttaaggttaggcattaactcaaaatggttaaggtaagggttaaggtttgggataggcatAAATGAAAAATCGCAAACAAATTGTCTATCGCTGGATTAGAATTtacaacctttggaatcagatgcTTAACCAAAACATACTTGAAGGTAgcagtgctcactgttgcccctagtggccggtttctaCGTCAtctaatactgacttgtatcaagAGTGACCTTGATAGTccaatactgacttgtatcaagGGTGACCTGGATGTACAATCTATATGATTGTACATTTTACACTTGTAACTTACTACTAGGTCGTGGTattcaaaatagatggcatttgTATCAACCACAACCAAATGATCTCCTCTGCCCTCACACACAGTCCTTTCACCTGCAGGGCTGGAAAGTACTGGAAAGTACCTCAGGACTTTCAAAGATCATCACCATCCCTGACTGGATACTATATATTATTGTTTGTTACTTATTTCATCCTAATATTTTGTCTGCAAAGTTTTTAAAACCAAGGATACAATCCGctacgtatttatttggacaaAGAAGCTAAAACTTTAAATTTGGCTCTATACTACAGCCTTTTCGATTTGAGATGAAATGTTTTCTGAAGTGACAGTTCAGAATGTTACCTTTTTTTTGGAGGGTATTTGAATAAATATCTGTTTTAACATTGAGAAATTAATGCACTTTatgtacagttccttcagaaagtattccaccactttgttgtgttacaaagtgggatgcaaatttatttaattgtcattttttggtCAAaattctacacaaaatactctaatgtcaaaatggatgatgagtgagaaagatgCACAAAGATCATGACCCAAAtgcatgctaacctctcaccagtACCAATAATGGgggttagcatttttggggggtatcatatttatgcctctgtaacttcttcactcatcattattcatgagtCATGATTATATGTGATCATGCTAGCACCCACAATAATGTACAAGTGTTCAAAAACAtcttctattcttatttacaataaaagtgattccaaaatcacacaatacattattaacCATTCATTTATATTGGGCACAACATAATACGAAGCacaactgcaaatgcatccaacaagtttgtagagtcataaGCCTTATGttgtcattgcgtgctaggaatatgggaccaaacaaTAAAAGTTTGACTGACTTTAATACACTATATGTGAATTTGTCCAATTATGACACcctcaaatggggggactagatacaagtgctttcatttctaaacgatAAAACATATGTAAGAAAAtatcctcaaataaaaggtgGCATTTGGTACTGTTGCTTCATATAAAACATttaatctcaaatccaaaattctGGAGTCTAGTGCCAAATTAAacattttagcttcactgtccaaataaatatttAGTGAAGTGTACATGTGGCAACAGTGGGGTTGGGTGGAGAACAACAGGGAAATTAGTGAGTCCTCACTGGCCGTCAAGAGCTCAGATACATGAGAGAATGAGGAGAAATACGGAGGGATAACCAGCAACAGAAAGTgtgaacaaagagagaaagaaggaagaatGTTAAAGATGCCTCTAGTGGTTAAACTGACCTTACACTTGGCTCCCAGGAGAGTGAAGAGCAAAGCATTCTCACGGACCGTCAAGAGGTTGCTGAAAACTGGACATCCACACCCCCCATTGCACGCCATCCCCCACTccttctctctttattctctctctctctctctctttttatcagCAATTCACTGACAATTTCTGTCTATGTACCACACACTGCAGTCTCAGTCAGAGATCCAAGCTGTCCAAGTACATTTACAGTGCACAAAATGTGATTACGCTTACCGTCCAGTACATTCACTTAGTACATCCTCATGCAAATGTCTGTATGGGTATGCATGGTGTTTGAGGGACTGATGCGTatgtcagataaaaaaaatatacaggCATAGTACTGTTTTTCACTGACACACACGTCAGTCACTTAAACAGATACACACATTTGCATGAGGAAGTACTGAGTGAAGATGCTGTACTCCATGTGAGACCACGTCTTCATACATGATGCATGCTGACCCAAACTTCcttaaaaacaaacatttatttaattaaaATAGATCcagtaaattgtatttttttatttaatcaggcaagtcaaattcttatttacaatgacggcctacaccggccaaactcggacaatgctgggccaattgtgcgctgccttacggaactcccaatcacggctggttgtgatacagcctggattcaaaccagggtgtctgtagtgacgcctctagaactgagatgcagggccttagaccgctgcgccaccagGGAGTCCACAAAACAAAGGCAATGATATTATTGATCAGCCTGTGGTCGGTTGGTCTGACAGCTGGAATCTCATATGTGCTGGTGACAGAACAAGtaaaggaaaaagagagagataaaagccTCCAATCTCACATCATTCTGATTACTGCCAACAGAGGACAAACTGCTGCCATCTCAATCTTGAAGGGGTCCAATTAAAAACACATGTTGACCAACAACAATGAAAAGAGGCTACAATTTTCCTGATGAGAAGATCTGACCAGGTCCAGAATAAACTTGtaatcaggaaaaactcctggtccTGGTGATGATTGGTTCAAATAATGACCTTAACTCTTGAGCTCACAGTACTTTTGCACTGTTTCGCTATGGCTATATTCATCAATCTGGCAAGAGGGCaatatttattttacaataaaGCTATGGCCTTTGGCTTGCAACTGGAATTGTTTatttacagagccttcagaaagtattcataccccttgacttattccacattttgttatgttagtcTGAATTAAAAATTGATTATTTTTGTCacccatcgacacacaatactccataatgacaaagtgaacgtTTGTTTTTTGTCTTAACTTGTCTTACACACACATTATTAGATTATAGTCTTATAATTCTAATACATTTCACACAGTTTCAGAGTGGAACACTTTAGCCATTATCTTAAAACATATAAATTATTCTATCAATATGACACAAAATCCTGGGGCTCCTCAACCTACCTAACAAGTTATTGCAGTCTGAAGCAACTGATCTGCACACCGGTGTAAAACTTGTTTGCAGTACGTATGGGTGCATTGAAAAACTGTGATGTGATGCTAAATTCAAAACGCTTTGGGAGGCATGCCAAGAGGGCATGAGCACACCAGCTCCAAGCAATCGATGGAGACTCATGAGTAAAACTCTGCAAGAGTATGTAGTTGAAAGCACAGTGGGTCAGCATGATGATGGAGACAAGAGGGAGTGTAAACGACAGTTTTTTAGCACTTTGGATGCTGTGCTGGGGGAAATGTCATCACAATTTAGGGGAGAAAATAATCAAATGGCGGAAGCTCTGTGTGCCATGAATCCAAAGAGCCCAGACTTTTTGGATGTGAACAAGGTCAAGCCATTGTTGTATCTAACCAAAACTGAACCAGTGGAAGCTGAGTTTATTGTGGCTCGCACATTCTTGAAAAGTGAAGTTGCAACCATAGCCAGCAAGAACAAATGGACCCCACTCAGTGTTCTTCAAAGATACAGTGGGCCTTTGTCAGCAATGCTGTTGGCACTGAAACATGGATTACCATTAGGGGCATCTACAGCAATGTGTGAAAATTCCTTCTCCACCCTGAAGAAGGGATTCTGTGAACACAAACTGACCATGATACATCAGCTTTGCGTTATTTTATGGGTATAGGGACAATAACCAATGTAGCCTATTGGTTGTGCTCTGAGGTGAGGTCTAGTGCGTTGCTCCTATTGTCCTGGATGTCCACTTTGGTGGTACTGAAATTGGCAGCACATCCTTTCATCGTGCTGACTGGCAGTAGCCttctgtccatggtcctgaatcATGGTTATGGTGTGTGCTGTTTTAATGAGCGCATCATGGGCTATCAGTCTCCATGGGGCTTCTCTTCAACATCGCTTGCTTTCTTGTGTGCAAAATAACAGTTGTTGTGTATATGGCTGCATTTCAGATAGGCCTACACTACATTTTGTGTGTCCCAGTAGTATAGGACTATTTAGTTTGCTTTTCTGAAACTCTCCCACAGAAAATATTGCGCGCCTGGAGAAGTGGCGGCATGGCTAACTGTAGGTTACGCTCATTGCGTAGTGTCACAAATTAGACAGAAATGTAGCCTATATAGTGCCGATTTTAGCTTGTATATCTTGGTGggcaaacaaaaaaaatgatgtTTTATGCATGCCAGGaaagccacaacactaaacaatacattcattgcactgtaacggtgacaaacggtgcccacaaactgttaggacctagcttatccttaccaccgctacaacTGGCTTTCAGCGgtgccttgtctggcagcgaaacagttgatacagcctcatttactgcctttttaaaaaccacagctgatatggctgacttgcttaaacaaatgtggttactACGGACTCCTTGTGGATTTGTGTATGTGGATAAGAACCACATTCTCCTTCAACTATAACGAACGCCAAAATTAGTTTTGACCCACAAACATTATTAAATTCATGTCCCGAAATTCATGTTTATTCTTATATCATTACCACTTAGC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Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU716906 True 12228 TUCP 0.41 4 60468931 60483057

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110528142 LOC106583206 coding upstream 112974 60338799 ~ 60355957 (+)
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LOC110528987 LOC106583211 coding upstream 366420 60084526 ~ 60102511 (+)
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LOC110528988 LOC106583198 coding downstream 148555 60631612 ~ 60635398 (+)
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LOC118965359 fancd2 coding downstream 762865 61245922 ~ 61248219 (+)
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G630523 NA non-coding upstream 71537 60395990 ~ 60397394 (+)
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G632776 NA other downstream 1656459 62139516 ~ 62139991 (+)

Expression


Co-expression Network