G632996 (LOC106583176)


Basic Information

Item Value
gene id G632996
gene name LOC106583176
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048571.1
NCBI id CM023225.2
chromosome length 90918291
location 62223219 ~ 62228447 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU719577
CCGGCTTGAAATGATACAACATTCACCAAACAAGTGTGTATATGTTCCTGCTTCCACCACCATTGGGCTTGCACACCTTTTTATAGGAGCTGTCATGTTATTGGAGCAGCGTATTCAATTTTCAAGACTCAAAACATGCGTACACACAAGGTCTACAAACAGCCTCCATATGACCAAATAATACTTATTTCTTAGATGTTAGAGGACCTTGTCATCTTTCTGGTTGTTATAAGCTTTTGGAAACTCATGACTGATACACCCCCACCACGGCACATAATTCTGTATTTCACGTGAACAACACATTCAATGGGATTACGAGCACCACGCATTTCTGCCTTCCCACTAAACCTGCCCTGCTCAAAATGAAAGTGAATTTGTTACTTTTACTTTGCAGATAAGGAAAAGCTCAACATTGAGAAGGCACTAGAATTTTGGTTTGGCCTGAAACTTTTATTTGGACATGAAGAAAGGAGACTGTTAAAAGTATaactggtggacacacacacacacacacttaacacagATGTCGGGGACAAGACCACAGAGCACCGCACACAAAACATTTAGAAATACACAGACGGCAAAATCATTGCAAGCACAGGACCCAGAATCAGCATCTAAGGCAAAAACAAGAAATATTTGTACTTTATTATTCTTTTAAGTTTTTGTTCAGACATCTATTAAATCAGTAATTCAGTGTCTCACATCCCACCCTCGTATGTTACCATGTCCCAGCTGCACCCCCTCCAACGCCTTTGTCCCAGCAGGGAAGTGCTACAAAAACTAATCAAAACAGTTAAAGAAAAATAAAACCCTATTCCTGTAATAATTTCAGCAAACCTGCTAAACACCTTTTCTTCAATGTAGACATCTAAAATGATTTTACACCTTACAGGATTCAGAGATTATTTTCAAACAAAAGTTAGTGCATTTCATTCGACAACACCACTAGCTGCTCTTAACTTAGCCATTAATAGatgtaaaaatataaaacaacaacataggCCCAGTGGTTAGATAGATAACATGTTACTGCACTGCTAGCACCCAGGCAGTGCACCGAATTTTCACTTTACCCAAGTAGCAAATCAGATAACAGTTTTGgaaatactacacacacacacacacacacacacacacacacattttgggaaaaagacaaaaaaaattaaatgcaTTGAAAGAAAAAGGGTACATCAGAGTACATAAAAAAACTAAAGTCAAACTGAGGAACTCTTTCAAAAGATTTACTCAAATCTAAAATGTGCTTACTAATagagggataaaaaaaaaaaaacctgaccAAAGATTAGCCTTCTAGGTGCAAAATCTGTACAAGAACATTCAGACCACCTACACAAGTGGCCTTCGCTCAAATAGGACTACATTAATCAAGCATAACTGGCCAATCAAGAGACAGGGAGCATTATCAATTAACTGACAGCTTTTCCGTCCAACAGTAGGAGGGTTACGAGTTCTCCACATCCCACCCAGAAACAGTTGTGTTGGAGCGAGTTCCCAAGGTTGTCTTTTTGCCTGCTTGACTTTGGTCTGGATCATAGAGATCACAATGTTGTATCTGTGCCaatgaggccatctccatttaaagtagtcaattttcttctgATATTGGAAAAAAGTGTAAAGCTAAAATTGGCATTTTACCACCAGCTACAGTGTTGAAGTCTAGAAACAAATCTTGAGTAATTCATTTATTGTAGCCGCTAGTTGGCGGTCAATGCTCTGATAATTGGTTGATTGCTCCCAatccataggaatccccacccagttgactactttaaaatgacaATGTCCatgcaaaaaaagttattttcaCATAAttatctctatacatttatggtCTGGATAGTGTTCAATCCATTAATACACAAAGGCTGAATTATGAGTTTGCAAGCGCATAGAAAAGGAACAGATCTGAAGGTTGATGCTCCCCATGTCAAGTCAACTCTCCTAATATTACGCAAACTTCCATTTTTCAAACAATGGATGTGTACGGAATTTAAAACAATCGTGAGATATGCATTAAAATCTTCAATCAAAAGAAAACTAAGACAGTAAAGAGAAAATCCAAAAGTGAAATGTACAAGGGAAAAAAGCAGCTAAATCATAATCCTATGAGTTAGCCAGACACCAAAACTCTAATATCCGACAGTCGCTCTGCCCTCAACCCCATCCCAAAATAACGTGACTCATCATTATCACCCTTCAGAATCTCTGCTCAATGAATCAACGGCAACATTGAAAAAGGATAACCCCAAAACGGACATGATCAGAGTTCGACAGCATTTCACGGACAAGAAAACAGCCCTCTGTACACGATAAGCACTAAACACCTACCAACACCACACCTGGAAGTCTCCACTGGCCACCCCTAATCTCATACTGGGACAGGTTCGGTACTGCATGTTATCAACTCAAATTGAGAAGTCAGAACACTAACCGGACTCTTGCTGGGGAAGAACTTTACTGacaaatttattttaaaaaagttttaaaaaataaagtttatttgcattaaaaatgtaaaattccAGTGATCGCTGCTCTAAACCAGTAAGCTCCTTTATAGATTAATTCCTGATGCCAACAAATAAGAGAATGAGAACTGAGTACGTTTACTTGACTTCAGAATTCAGGCCATTTTAAAATGAGCAAGCTCGAATACATAGTACCAAAGACTAGTTTCATGCTTGGGATCCCATTACTATTCTCTAAAATACCATCTAACCTATTCTACATGATACAAGAGCTACCAAAATGCATGGCAGACTACTCTGGAACATGTTGCACAGATATGATGGCATGTTGAAATGGCCAGATATCTGGGGTGGAAAGGTTTCTATTTGATGATAAAGACCACCTGTTCCATCAAGACATAAATAGGAAGGTATATGTTAACGCCGGTATCCTGCATTTGACCACATAGGTACAATTAATTAGACATATTAATACAACAGGTTAAACTTTTATGAAAGACACAAATAATTAAAACTACTCTTCTTAAAAtgacaatcagcagttgaaacaaagCGTTCTCCCTACCCTGTTacagtaaaaagctgagggatggggttggagaaatgtaacaGCTCAAATTCATAGACTGAGCTATGGATGCATAAAAATGACagttgtaaccatgttttgaggctatatagatTTAGTCtgcatttactttgtttacaaacattggagtaaaacaggcttatattttgggttctgatggggtatgacagtggAACAAAGCTTCGATACTTGAAGAATCAAATTGGTACATAAATTAATAATAGGTCCAATAAtgaatgtagcaactgcagactgCCCCTTTAAAAAGGCTACGtataaaatggtcaaattcatgATAACTGTGAACGTGTCAGGTGTCTACAATGCGAGTGCTGACTGCCTCAACTACCAAATACCTTCACTAAGGGAAGACTCCTCCCTTTCTCATGAGCTGTTACCCATGACAACACTTCCTGATCTACTCAAATCCCAACCAATGGATTGGTGGGTCATGTTCATAACACACTGTAGCAAACCacttaaaaaacattttaaaaaaaacttaaaccACTTAAAAAAACAAAAGCAAGCAGTTCATATAGGAAAACTTCTGAGAGTACCTTGCGCCTACTGAACTTGAACCTGGATGGAGAGATTATGCACTAATGGTTGGCGCAATCGTCATTAACCAACCAAAGCATATTTTAACTAAACAGGATTGGCAGACAGTTGGGACCAACAACTCAAACATTTAACCATATGTTTCAAAGTAATAGGACATGGAGTGGAAAATATAATTCAGTGACCGACAGCCTGACTATCCAAACTTTTCCCCACATTTGCACGGTATCCAAGCACCATTATCGTAAAGGTTTTAATGTCCTACTCAAGCAAGGGTATACCAAAAGTGTCCATCAACCGTGAAAATAAAATCATTGATTCTAATAAATTAATATTTTCCCATTGATTCTGAACACAAAATAATTCCAGACTCTTGGCTGACAGGCATCCAAGACTGTTTCTTCACCTAAAAGAAAATGCAGCTTGACAGGCTTCCCAAATCACTCTCTCTCAGAACAGTTCAAAACAGGCACTTCTCTAAAACCATGTGGCCCTCTCGCTTCCAACCTacataaaaacacattttatgaaCTATCCTTAgccctttgccaaaataatcacTTGCCAACCCCTCCAACAACAAATTGCATCATATGTATCAACTCATAACGATGTCATATTGGTGGATGTCCACATCTTTTGCTGTGTCGCATAATGACTAGATTTGCTAACAGctcttttcttttccttttttcccCTTTGCAACTACCAGTATTCTGGTGGTACAAGGCATTACTGTACATTTGTCCCCCATCCCCCACTGACAGAAATCAAATGAACATAGATTTAGCAGTGGAGGGCCCAGCCTTCAAGCTAACCAAGGTGAGGCAGCATGTAAGCATCTCTCGCTATTCTTTCAAACAAGTCCTTCAGTTTATGATTTGTAACACTCGTGTCGGCCCCCTCTTAAAATGATTACCGCTTGCAGTCTTTCCTAAACAAAGGTCAGCGGATGTCCGACCGAGCTTCAGGGGGGTCTTTAAGATGAAGACCACGAATGTGTTCTTTCATCCAataacatacatatatatacacatatatatatatatatatatttatctctttacatatatatacacacacacgtatatagatttgtgtttgtttttctgttAGTCTGTTGGTTGTTGTTTAAACTACTTTGGTGACCGGGGGGGAATGTTCTGTTCCTTCCCGCTCCGTCTGGCCCAGCCCTGGGGGGAGATGCGGCGGCTCATGGACGCACCTCTCTGCTGATCCCAGTACTTTAGGCCCATCCCTCCGGATCGGGCAGGGCCATTAACCCCACAGTATGAGCCAAGGGGATCAAGGCGGGGCTGGCCTTCTCCAGGCCGCTCGGGTTTCTCAGGCCT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>TU719578
TTGGCCTGAAACTTTTATTTGGACATGAAGAAAGGAGACTGTTAAAAGTATaactggtggacacacacacacacacacttaacacagATGTCGGGGACAAGACCACAGAGCACCGCACACAAAACATTTAGAAATACACAGACGGCAAAATCATTGCAAGCACAGGACCCAGAATCAGCATCTAAGGCAAAAACAAGAAATATTTGTACTTTATTATTCTTTTAAGTTTTTGTTCAGACATCTATTAAATCAGTAATTCAGTGTCTCACATCCCACCCTCGTATGTTACCATGTCCCAGCTGCACCCCCTCCAACGCCTTTGTCCCAGCAGGGAAGTGCTACAAAAACTAATCAAAACAGTTAAAGAAAAATAAAACCCTATTCCTGTAATAATTTCAGCAAACCTGCTAAACACCTTTTCTTCAATGTAGACATCTAAAATGATTTTACACCTTACAGGATTCAGAGATTATTTTCAAACAAAAGTTAGTGCATTTCATTCGACAACACCACTAGCTGCTCTTAACTTAGCCATTAATAGatgtaaaaatataaaacaacaacataggCCCAGTGGTTAGATAGATAACATGTTACTGCACTGCTAGCACCCAGGCAGTGCACCGAATTTTCACTTTACCCAAGTAGCAAATCAGATAACAGTTTTGgaaatactacacacacacacacacacacacacacacacacattttgggaaaaagacaaaaaaaattaaatgcaTTGAAAGAAAAAGGGTACATCAGAGTACATAAAAAAACTAAAGTCAAACTGAGGAACTCTTTCAAAAGATTTACTCAAATCTAAAATGTGCTTACTAATagagggataaaaaaaaaaaaacctgaccAAAGATTAGCCTTCTAGGTGCAAAATCTGTACAAGAACATTCAGACCACCTACACAAGTGGCCTTCGCTCAAATAGGACTACATTAATCAAGCATAACTGGCCAATCAAGAGACAGGGAGCATTATCAATTAACTGACAGCTTTTCCGTCCAACAGTAGGAGGGTTACGAGTTCTCCACATCCCACCCAGAAACAGTTGTGTTGGAGCGAGTTCCCAAGGTTGTCTTTTTGCCTGCTTGACTTTGGTCTGGATCATAGAGATCACAATGTTGTATCTGTGCCaatgaggccatctccatttaaagtagtcaattttcttctgATATTGGAAAAAAGTGTAAAGCTAAAATTGGCATTTTACCACCAGCTACAGTGTTGAAGTCTAGAAACAAATCTTGAGTAATTCATTTATTGTAGCCGCTAGTTGGCGGTCAATGCTCTGATAATTGGTTGATTGCTCCCAatccataggaatccccacccagttgactactttaaaatgacaATGTCCatgcaaaaaaagttattttcaCATAAttatctctatacatttatggtCTGGATAGTGTTCAATCCATTAATACACAAAGGCTGAATTATGAGTTTGCAAGCGCATAGAAAAGGAACAGATCTGAAGGTTGATGCTCCCCATGTCAAGTCAACTCTCCTAATATTACGCAAACTTCCATTTTTCAAACAATGGATGTGTACGGAATTTAAAACAATCGTGAGATATGCATTAAAATCTTCAATCAAAAGAAAACTAAGACAGTAAAGAGAAAATCCAAAAGTGAAATGTACAAGGGAAAAAAGCAGCTAAATCATAATCCTATGAGTTAGCCAGACACCAAAACTCTAATATCCGACAGTCGCTCTGCCCTCAACCCCATCCCAAAATAACGTGACTCATCATTATCACCCTTCAGAATCTCTGCTCAATGAATCAACGGCAACATTGAAAAAGGATAACCCCAAAACGGACATGATCAGAGTTCGACAGCATTTCACGGACAAGAAAACAGCCCTCTGTACACGATAAGCACTAAACACCTACCAACACCACACCTGGAAGTCTCCACTGGCCACCCCTAATCTCATACTGGGACAGGTTCGGTACTGCATGTTATCAACTCAAATTGAGAAGTCAGAACACTAACCGGACTCTTGCTGGGGAAGAACTTTACTGacaaatttattttaaaaaagttttaaaaaataaagtttatttgcattaaaaatgtaaaattccAGTGATCGCTGCTCTAAACCAGTAAGCTCCTTTATAGATTAATTCCTGATGCCAACAAATAAGAGAATGAGAACTGAGTACGTTTACTTGACTTCAGAATTCAGGCCATTTTAAAATGAGCAAGCTCGAATACATAGTACCAAAGACTAGTTTCATGCTTGGGATCCCATTACTATTCTCTAAAATACCATCTAACCTATTCTACATGATACAAGAGCTACCAAAATGCATGGCAGACTACTCTGGAACATGTTGCACAGATATGATGGCATGTTGAAATGGCCAGATATCTGGGGTGGAAAGGTTTCTATTTGATGATAAAGACCACCTGTTCCATCAAGACATAAATAGGAAGGTATATGTTAACGCCGGTATCCTGCATTTGACCACATAGGTACAATTAATTAGACATATTAATACAACAGGTTAAACTTTTATGAAAGACACAAATAATTAAAACTACTCTTCTTAAAAtgacaatcagcagttgaaacaaagCGTTCTCCCTACCCTGTTacagtaaaaagctgagggatggggttggagaaatgtaacaGCTCAAATTCATAGACTGAGCTATGGATGCATAAAAATGACagttgtaaccatgttttgaggctatatagatTTAGTCtgcatttactttgtttacaaacattggagtaaaacaggcttatattttgggttctgatggggtatgacagtggAACAAAGCTTCGATACTTGAAGAATCAAATTGGTACATAAATTAATAATAGGTCCAATAAtgaatgtagcaactgcagactgCCCCTTTAAAAAGGCTACGtataaaatggtcaaattcatgATAACTGTGAACGTGTCAGGTGTCTACAATGCGAGTGCTGACTGCCTCAACTACCAAATACCTTCACTAAGGGAAGACTCCTCCCTTTCTCATGAGCTGTTACCCATGACAACACTTCCTGATCTACTCAAATCCCAACCAATGGATTGGTGGGTCATGTTCATAACACACTGTAGCAAACCacttaaaaaacattttaaaaaaaacttaaaccACTTAAAAAAACAAAAGCAAGCAGTTCATATAGGAAAACTTCTGAGAGTACCTTGCGCCTACTGAACTTGAACCTGGATGGAGAGATTATGCACTAATGGTTGGCGCAATCGTCATTAACCAACCAAAGCATATTTTAACTAAACAGGATTGGCAGACAGTTGGGACCAACAACTCAAACATTTAACCATATGTTTCAAAGTAATAGGACATGGAGTGGAAAATATAATTCAGTGACCGACAGCCTGACTATCCAAACTTTTCCCCACATTTGCACGGTATCCAAGCACCATTATCGTAAAGGTTTTAATGTCCTACTCAAGCAAGGGTATACCAAAAGTGTCCATCAACCGTGAAAATAAAATCATTGATTCTAATAAATTAATATTTTCCCATTGATTCTGAACACAAAATAATTCCAGACTCTTGGCTGACAGGCATCCAAGACTGTTTCTTCACCTAAAAGAAAATGCAGCTTGACAGGCTTCCCAAATCACTCTCTCTCAGAACAGTTCAAAACAGGCACTTCTCTAAAACCATGTGGCCCTCTCGCTTCCAACCTacataaaaacacattttatgaaCTATCCTTAgccctttgccaaaataatcacTTGCCAACCCCTCCAACAACAAATTGCATCATATGTATCAACTCATAACGATGTCATATTGGTGGATGTCCACATCTTTTGCTGTGTCGCATAATGACTAGATTTGCTAACAGctcttttcttttccttttttcccCTTTGCAACTACCAGTATTCTGGTGGTACAAGGCATTACTGTACATTTGTCCCCCATCCCCCACTGACAGAAATCAAATGAACATAGATTTAGCAGTGGAGGGCCCAGCCTTCAAGCTAACCAAGGTGAGGCAGCATGTAAGCATCTCTCGCTATTCTTTCAAACAAGTCCTTCAGTTTATGATTTGTAACACTCGTGTCGGCCCCCTCTTAAAATGATTACCGCTTGCAGTCTTTCCTAAACAAAGGTCAGCGGATGTCCGACCGAGCTTCAGGGGGGTCTTTAAGATGAAGACCACGAATGTGTTCTTTCATCCAataacatacatatatatacacatatatatatatatatatatttatctctttacatatatatacacacacacgtatatagatttgtgtttgtttttctgttAGTCTGTTGGTTGTTGTTTAAACTACTTTGGTGACCGGGGGGGAATGTTCTGTTCCTTCCCGCTCCGTCTGGCCCAGCCCTGGGGGGAGATGCGGCGGCTCATGGACGCACCTCTCTGCTGATCCCAGTACTTTAGGCCCATCCCTCCGGATCGGGCAGGGCCATTAACCCCACAGTATGAGCCAAGGGGATCAAGGCGGGGCTGGCCTTCTCCAGGCCGCTCGGGTTTCTCAGGCCTATCCCCATCGCTGCTGGAGGAGGTGGCGGGCTCGTCGGCCTTGTTGACCCGCAGTTCACGCAGGGGTTGGCTGGCTGGGGAGGTGGGAGGGTTTGGGGAGGTGCTTGGCGCTGGGGGCTGGGTGGCTGGCCGCTTGCACATCTCAGCATAGCTCAGTTT

Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU719577 False 5159 lncRNA 0.40 2 62223219 62228447
TU719578 True 4723 lncRNA 0.40 2 62223219 62228011

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110528170 LOC106565587 coding downstream 37273 62175981 ~ 62185946 (-)
LOC110528169 LOC106583177 coding downstream 47728 62159975 ~ 62175491 (-)
LOC110528991 LOC106583180 coding downstream 302080 61800678 ~ 61921139 (-)
LOC110528165 LOC106583181 coding downstream 473238 61634197 ~ 61749981 (-)
LOC110528164 LOC106583182 coding downstream 666031 61542003 ~ 61557188 (-)
LOC110527134 LOC106583149 coding upstream 116635 62345082 ~ 62347315 (-)
LOC110528993 NA coding upstream 120655 62349102 ~ 62349904 (-)
LOC118965309 LOC106583169 coding upstream 277792 62506239 ~ 62520518 (-)
slc4a8 LOC106583168 coding upstream 309886 62538333 ~ 62589748 (-)
LOC118965401 NA coding upstream 316537 62544984 ~ 62545127 (-)
G632997 NA non-coding downstream 90 62222834 ~ 62223129 (-)
G632995 NA non-coding downstream 514 62222501 ~ 62222705 (-)
G632994 LOC106583176 non-coding downstream 774 62221272 ~ 62222445 (-)
G632993 NA non-coding downstream 2120 62220301 ~ 62221099 (-)
G632992 LOC106565589 non-coding downstream 3713 62218495 ~ 62219506 (-)
G633006 atf7 non-coding upstream 9319 62237766 ~ 62263594 (-)
G633054 LOC106583173 non-coding upstream 75796 62304243 ~ 62304693 (-)
G633347 NA non-coding upstream 271043 62499490 ~ 62501459 (-)
G633346 NA non-coding upstream 274908 62503355 ~ 62504805 (-)
G632459 NA other downstream 531575 61691248 ~ 61691644 (-)
G631687 emc3 other downstream 1023781 61198007 ~ 61199438 (-)
G631740 NA other downstream 1032174 61190708 ~ 61191045 (-)
LOC110528989 LOC106583145 other downstream 1475120 60699279 ~ 60822525 (-)
si:dkey-28n18.9 LOC106583160 other upstream 778328 62983119 ~ 63008072 (-)
LOC110528212 LOC106583293 other upstream 1557325 63785772 ~ 63827547 (-)
LOC110528216 LOC106565449 other upstream 1766069 63993536 ~ 64036771 (-)
G635167 NA other upstream 1803999 64032446 ~ 64035381 (-)

Expression


Co-expression Network