G642089


Basic Information

Item Value
gene id G642089
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048571.1
NCBI id CM023225.2
chromosome length 90918291
location 70057997 ~ 70061255 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU729681
GTGTGAAATGCATTTTGATGTATTGTGGATGTGTGTAAAGGGCAGTTGATGTATTGGGGATGTGTGTAAAAGGCAGTTGATGTATTGAGATGTTTGCAAAGGCATTTTGATGTATTGGGATGTGTGTAAAATGCAGTTTGATGTATTGGGGAGGTGTGTAAAAGGCAGTTTGAAGTATTGGGGAGGTGTGTAAAAGGCAGTTGATGCATTGGGGATGTATGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGGATGTGTGTAAAAGGCAGTTTGAAGTATTGGGGAGGTGTGTAAAAGGCAGTTTGAAGTATTGGGGAGGTGTGTAAAAGGCAGTTTGACGTATTGGGGAGGTGTGTAAAAGGCAGTTTGACATATTGGGGATGTGTGTAAAAGGCAGTTGATGCATTTGGGATGTGTGTAAAAGGCAGTTTGACTTATTGTGGATGTGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGGATGTGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGGAGGTGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGGATGAGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGGATGTGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGGATGTGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGGATGTGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGGATATGTGTAAAAGGCAGTTTCATGTATTGTGGATGTGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGGATGTGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGGAGATGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGGATGTATGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGATGTGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGGATGTGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGGAGATGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGGATGTGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGTGGATGTGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGGATGTATGTAAAAGGCAGTTTGATGTGTCAGGGATGTGTGTGGTTGCTGGGCAACTTGCCAATGTGACCTCAGTGTTAACTCATGACACCTGCTCTGTGGAGATGAAAGCAACTCACCCTGCAGAGCACACAGGAGGAACACAGGGGAAAGGTTGGGGTATTGACCTCCCACAGCTGACTGAATACTCCCAGAGCTGCTCATACTCTTCTCAACGAAGCCAGAAACTCACTctttcagacacacacatagattaTTGTGCATGCACGCacggacgcgcacacacacaaaacagaatgatctcctcctactcctatccccacacacacacacacacactccctttcaAAAACTCAACAGTTGACTTCAAACAGGAGCATCAAAGGTCTGTGACATCATTACCAACCACTACTTCCTCAGTTATCTCTGGCTGACTGAAAGGATGCGCTTGATATTCAACTATTCTGTTTACTCACTGCTTAGAGTCCCATTTCTGCCCAAACACCACATTGTAATGATGAGAAAGTAAACATTTCCAAATCTTTCATATTCAAGGAGCTTTCCAGGGAGCCCTGAATCACTTTTTATTGGCTAATTATTTTTCCTGACTTGCTTACTTTGGACAGTTAAACGGAAGGGAAACATTAGCTACAAATGTTTTTAAAGGTTTTCATATACCAATAAATCGTGAATCATATTAATGATCTAAAAAAAAATCCACTTTGGACCCACATAGAATATTTTCAGTAACCAGTTGAATGTATCTAATCCACACATTACTCATAATTTCAAATTGAACATGGTCCTATGTAGCTCAATTGGTAGAGTATgatgcttgcaatgccaggatagtgggtttgattcccaggaacacatttatatgtaaaaaaaaa
>TU729683
TATTGGGGGGGTGTGTAAAAGGCAGTTTGAAGTATTGGGGAGGTGTGTAAAAGCCAGTTGTATTGGGGAGATGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGGGATGTGTAAAAGGCAGTTTGACGTATTGgggatgtgtgtaaaatactttttgatGTATTGGGGAGGTGTGTAAAAGGCAGTTGATGTATTGGGGATGTGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGGAGGTGTGTAAAAGGCAGTTTGACGTATTGGGGAGGTGTGTAAAAGGCAGTTTGACATATTGGGGATGTGTGTAAAAGGCAGTTGATGCATTTGGGATGTGTGTAAAAGGCAGTTTGACTTATTGTGGATGTGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGGATGTGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGGAGGTGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGGATGAGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGGATGTGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGGATGTGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGGATGTGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGGATGTGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGGAGATGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGGATGTGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGTGGATGTGTGTAAAAGGCAGTTTGATGTATTGGGGATGTATGTAAAAGGCAGTTTGATGTGTCAGGGATGTGTGTGGTTGCTGGGCAACTTGCCAATGTGACCTCAGTGTTAACTCATGACACCTGCTCTGTGGAGATGAAAGCAACTCACCCTGCAGAGCACACAGGAGGAACACAGGGGAAAGGTTGGGGTATTGACCTCCCACAGCTGACTGAATACTCCCAGAGCTGCTCATACTCTTCTCAACGAAGCCAGAAACTCACTctttcagacacacacatagattaTTGTGCATGCACGCacggacgcgcacacacacaaaacagaatgatctcctcctactcctatccccacacacacacacacacactccctttcaAAAACTCAACAGTTGACTTCAAACAGGAGCATCAAAGGTCTGTGACATCATTACCAACCACTACTTCCTCAGTTATCTCTGGCTGACTGAAAGGATGCGCTTGATATTCAACTATTCTGTTTACTCACTGCTTAGAGTCCCATTTCTGCCCAAACACCACATTGTAATGATGAGAAAGTAAACATTTCCAAATCTTTCATATTCAAGGAGCTTTCCAGGGAGCCCTGAATCACTTTTTATTGGCTAATTATTTTTCCTGACTTGCTTACTTTGGACAGTTAAACGGAAGGGAAACATTAGCTACAAATGTTTTTAAAGGTTTTCATATACCAATAAATCGTGAATCATATTAATGATCTAAAAAAAAATCCACTTTGGACCCACATAGAATATTTTCAGTAACCAGTTGAATGTATCTAATCCACACATTACTCATAATTTCAAATTGAACATGGTCCTATGTAGCTCAATTGGTAGAGTATgatgcttgcaatgccaggatagtgggtttgattcccaggaacacatttatatgtaaaaaaaaa

Function

NR:

description
nesprin-2

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU729681 False 1870 TUCP 0.41 6 70057997 70061255
TU729683 True 1595 TUCP 0.41 6 70057997 70060921

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110528361 nfasc coding downstream 375146 69554159 ~ 69682851 (-)
cntn2 LOC106583505 coding downstream 557669 69429692 ~ 69500328 (-)
chia.1 LOC106583513 coding downstream 634263 69419408 ~ 69423734 (-)
LOC110528357 LOC106583514 coding downstream 654456 69398112 ~ 69403541 (-)
LOC110528356 LOC106583517 coding downstream 666363 69382887 ~ 69391634 (-)
csf1a csf1 coding upstream 20778 70082033 ~ 70151213 (-)
LOC110528368 abec2 coding upstream 431905 70493160 ~ 70498739 (-)
LOC110528372 LOC106583497 coding upstream 576923 70638178 ~ 70650621 (-)
LOC118965315 NA coding upstream 616370 70677625 ~ 70678507 (-)
LOC110528374 LOC106583494 coding upstream 638225 70699480 ~ 70701885 (-)
G642032 NA non-coding downstream 2159 70033517 ~ 70055838 (-)
G642082 NA non-coding downstream 31203 70024461 ~ 70026794 (-)
G642039 NA non-coding downstream 78781 69977379 ~ 69979216 (-)
G641935 NA non-coding downstream 266553 69790278 ~ 69791444 (-)
G641920 NA non-coding downstream 288867 69768399 ~ 69769130 (-)
G643005 NA non-coding upstream 111143 70172398 ~ 70588245 (-)
G643055 NA non-coding upstream 195378 70256633 ~ 70259809 (-)
G643163 NA non-coding upstream 350871 70412126 ~ 70412986 (-)
G643164 NA non-coding upstream 351844 70413099 ~ 70413947 (-)
G641913 NA other downstream 246737 69808043 ~ 69811260 (-)
G641364 NA other downstream 1248848 68794594 ~ 68809149 (-)
G639226 LOC106583551 other downstream 2641907 67414856 ~ 67416090 (-)
LOC110528308 LOC106583558 other downstream 2782457 67245800 ~ 67276081 (-)
LOC110528300 LOC106583565 other downstream 2978938 67055190 ~ 67079126 (-)
G643054 NA other upstream 194090 70255345 ~ 70258882 (-)
G643159 NA other upstream 345778 70407033 ~ 70408118 (-)
LOC110528382 LOC106583486 other upstream 818656 70877584 ~ 70881519 (-)
LOC110528398 LOC106583475 other upstream 1138381 71198628 ~ 71207030 (-)
LOC110528404 LOC106583471 other upstream 1213828 71274346 ~ 71278978 (-)

Expression


Co-expression Network