G657943


Basic Information

Item Value
gene id G657943
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048571.1
NCBI id CM023225.2
chromosome length 90918291
location 84274985 ~ 84276918 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU747913
AGACAACTGTTAAACACAACAACGTTCCCTTGGCAACCAAACTATGCTTGTTGTGCATCTGTCATACCCGCCGAATCCACTAAGGCAGAGGTCGAATCATCTAACCTGATATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTCAAATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTCAAATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTA
>TU747914
AGACAACTGTTAAACACAACAACGTTCCCTTGGCAACCAAACTATGCTTGTTGTGCATCTGTCATACCCGCCGAATCCACTAAGGCAGAGGTCGAATCATCTAACCTGATATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTCAAATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTCAAATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTA
>TU747915
AGACAACTGTTAAACACAACAACGTTCCCTTGGCAACCAAACTATGCTTGTTGTGCATCTGTCATACCCGCCGAATCCACTAAGGCAGAGGTCGAATCATCTAACCTGATATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTCAAATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTCAAATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTA
>TU747918
AGACAACTGTTAAACACAACAACGTTCCCTTGGCAACCAAACTATGCTTGTTGTGCATCTGTCATACCCGCCGAATCCACTAAGGCAGAGGTCGAATCATCTAACCTGATATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTCAAATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTCAAATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTCAAATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTA
>TU747920
TCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTCAAATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTCAAATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCCAACATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTCAAATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTCAAATCTAAAAACAAGTCCTCTAACCTAACATCTAAAAACAAGTCCTCTA

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106601902

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU747913 False 829 lncRNA 0.36 2 84274985 84276918
TU747914 False 856 lncRNA 0.36 2 84274985 84276918
TU747915 False 587 lncRNA 0.36 2 84274985 84276918
TU747918 False 1072 lncRNA 0.35 2 84274985 84276918
TU747920 True 827 lncRNA 0.34 3 84274985 84276807

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110528630 stl3 coding downstream 357871 83913871 ~ 83917114 (-)
stl3 stl3 coding downstream 369719 83888444 ~ 83905266 (-)
LOC110528625 LOC106583755 coding downstream 539488 83731185 ~ 83735497 (-)
LOC118965325 NA coding downstream 714567 83559538 ~ 83560418 (-)
LOC118965369 NA coding downstream 1218553 83056001 ~ 83056432 (-)
LOC110529055 rnf123 coding upstream 567413 84844331 ~ 85106696 (-)
LOC110528641 terf2ip coding upstream 830053 85106971 ~ 85119900 (-)
LOC110528639 LOC106583772 coding upstream 864306 85141224 ~ 85169972 (-)
gmppb gmppb coding upstream 894200 85171118 ~ 85184654 (-)
LOC110529054 ip6k1 coding upstream 924241 85201159 ~ 85271192 (-)
G657938 NA non-coding downstream 8798 84265301 ~ 84266187 (-)
G657895 NA non-coding downstream 73153 84200585 ~ 84201832 (-)
G657879 NA non-coding downstream 103598 84167402 ~ 84171387 (-)
G657812 NA non-coding downstream 211761 84056270 ~ 84063224 (-)
G657727 NA non-coding downstream 322903 83951395 ~ 83952082 (-)
G657949 NA non-coding upstream 6633 84283551 ~ 84285240 (-)
G657950 NA non-coding upstream 9425 84286343 ~ 84287334 (-)
G658036 NA non-coding upstream 236565 84513483 ~ 84518648 (-)
G658076 NA non-coding upstream 324092 84601010 ~ 84603645 (-)
G658077 NA non-coding upstream 324689 84601607 ~ 84602202 (-)
LOC110528632 LOC105007334 other downstream 318217 83954195 ~ 84332909 (-)
G656671 dag1 other downstream 658987 83608532 ~ 83615998 (-)
G656314 NA other downstream 946805 83327479 ~ 83328180 (-)
G655715 LOC106583745 other downstream 1941687 82328398 ~ 82333651 (-)
G655651 NA other downstream 2048440 82225952 ~ 82226545 (-)
G658255 NA other upstream 729808 85006726 ~ 85007505 (-)
G659250 NA other upstream 1883324 86160242 ~ 86160923 (-)
G659543 NA other upstream 2355489 86632407 ~ 86633856 (-)
G659824 NA other upstream 2726818 87003736 ~ 87007292 (-)
LOC110528667 cenpp other upstream 3007983 87114104 ~ 87293966 (-)

Expression


Co-expression Network