G657560


Basic Information

Item Value
gene id G657560
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048571.1
NCBI id CM023225.2
chromosome length 90918291
location 85171231 ~ 85173498 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU747449
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>TU747450
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>TU747451
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>TU747452
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Function

NR:

description
GDP-mannose pyrophosphorylase B, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU747449 False 2103 lncRNA 0.44 2 85171231 85173498
TU747450 False 2034 lncRNA 0.44 2 85171231 85173498
TU747451 False 2034 lncRNA 0.44 3 85171231 85173498
TU747452 True 2113 lncRNA 0.44 2 85171231 85173498

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
amigo3 amigo3 coding upstream 261870 84904628 ~ 84909361 (+)
LOC118965371 NA coding upstream 769712 84372197 ~ 84401519 (+)
LOC110528627 stl3 coding upstream 1289645 83878342 ~ 83881586 (+)
LOC118965393 NA coding upstream 1368631 83800611 ~ 83802600 (+)
nicn1 nicn1 coding upstream 1388766 83759738 ~ 83782465 (+)
LOC110528638 NA coding downstream 120730 85294228 ~ 85297684 (+)
LOC110528636 LOC106583767 coding downstream 128056 85301554 ~ 85363683 (+)
pusl1 pusl1 coding downstream 378295 85551793 ~ 85617931 (+)
tamm41 tamm41 coding downstream 457480 85630978 ~ 85648641 (+)
vgll4b vgll4 coding downstream 476347 85649845 ~ 85744794 (+)
G657592 NA non-coding upstream 2770 85168070 ~ 85168461 (+)
G657589 NA non-coding upstream 6287 85163595 ~ 85164944 (+)
G657587 NA non-coding upstream 8816 85162114 ~ 85162415 (+)
G657585 NA non-coding upstream 11357 85159242 ~ 85159874 (+)
G657547 terf2ip non-coding upstream 59405 85110982 ~ 85111826 (+)
G657599 NA non-coding downstream 9433 85182931 ~ 85183198 (+)
G657609 NA non-coding downstream 24605 85198103 ~ 85200192 (+)
G657613 NA non-coding downstream 34938 85208436 ~ 85209164 (+)
G657619 NA non-coding downstream 43137 85216635 ~ 85216999 (+)
G657623 NA non-coding downstream 45545 85219043 ~ 85219441 (+)
G657481 NA other upstream 163733 85006479 ~ 85007498 (+)
G657292 NA other upstream 552514 84612829 ~ 84618717 (+)
G657254 NA other upstream 616458 84551996 ~ 84554773 (+)
G657228 NA other upstream 650813 84503549 ~ 84520418 (+)
G656551 NA other upstream 1610713 83558837 ~ 83560518 (+)
G658885 NA other downstream 713094 85886592 ~ 85887121 (+)
G658887 NA other downstream 722328 85895826 ~ 85896149 (+)
G659058 NA other downstream 1235204 86408702 ~ 86412974 (+)
G659136 NA other downstream 1347562 86521060 ~ 86521822 (+)
G659706 NA other downstream 1926966 87100464 ~ 87102270 (+)

Expression


Co-expression Network