G660096


Basic Information

Item Value
gene id G660096
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048571.1
NCBI id CM023225.2
chromosome length 90918291
location 87495139 ~ 87498551 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU750822
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>TU750823
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Function

NR:

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TU750824 False 2743 lncRNA 0.42 3 87495139 87498551
TU750825 False 3241 lncRNA 0.43 2 87495139 87498551
TU750827 False 3327 lncRNA 0.43 2 87495139 87498551
TU750829 True 3030 lncRNA 0.42 3 87495139 87498551

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
nisch LOC106583810 coding upstream 109816 87346077 ~ 87387283 (+)
nol8 nol8 coding upstream 180023 87293964 ~ 87315116 (+)
ogna LOC106583805 coding upstream 245965 87232952 ~ 87249174 (+)
aspn aspn coding upstream 297130 87169591 ~ 87198009 (+)
ecm2 ecm2 coding upstream 338234 87116760 ~ 87156905 (+)
LOC110528678 dnase1l3 coding downstream 148466 87647017 ~ 87658838 (+)
LOC110528683 slmap coding downstream 452878 87951429 ~ 87953496 (+)
dennd6aa dennd6a coding downstream 468018 87966569 ~ 88011485 (+)
il10 il10 coding downstream 555560 88054111 ~ 88058818 (+)
LOC110528686 NA coding downstream 622318 88120869 ~ 88127498 (+)
G660089 NA non-coding upstream 847 87492825 ~ 87494292 (+)
G660087 NA non-coding upstream 17509 87476355 ~ 87477630 (+)
G659802 NA non-coding upstream 84149 87410196 ~ 87410990 (+)
G659760 NA non-coding upstream 104392 87390362 ~ 87390747 (+)
G660102 NA non-coding downstream 11669 87510220 ~ 87510689 (+)
G660128 NA non-coding downstream 59058 87557609 ~ 87558350 (+)
G660133 NA non-coding downstream 69261 87567812 ~ 87569529 (+)
G660137 NA non-coding downstream 75702 87574253 ~ 87632379 (+)
G660169 NA non-coding downstream 126886 87625437 ~ 87631250 (+)
G659706 NA other upstream 392869 87100464 ~ 87102270 (+)
G659136 NA other upstream 973317 86521060 ~ 86521822 (+)
G659058 NA other upstream 1082554 86408702 ~ 86412974 (+)
G658887 NA other upstream 1598990 85895826 ~ 85896149 (+)
G660790 NA other downstream 924213 88422764 ~ 88427927 (+)
G660853 NA other downstream 1123762 88622313 ~ 88689342 (+)
G660886 NA other downstream 1193343 88691894 ~ 88694076 (+)
G661162 NA other downstream 1318534 88817085 ~ 88817655 (+)
G661172 NA other downstream 1474433 88972984 ~ 88975830 (+)

Expression


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