G662782


Basic Information

Item Value
gene id G662782
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048571.1
NCBI id CM023225.2
chromosome length 90918291
location 90672396 ~ 90676874 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU754294
catgttgtcattggtgtgtagtgatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgatcatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgatcatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgatcatgttgtcattggtgtgtagtgatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgatcatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgatcatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtaatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtaatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtaatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgatcatgttgtcattggtgtgtagtgatg
>TU754290
tgtagtgatgatcatgttgttattggtgtgtagtgatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtaatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgatcatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgatcatgttgttattggtgtgtagtaatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgatcatgtttCACatgttgttattggtgtgtagtaatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgatcatgtttcacatgctgttattggtgtgtagtaaTGTTTCACatgttgttattggtgtgtagtgatgatcatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgatcatgtttCACA
>TU754296
tgtagtgatgatcatgttgttattggtgtgtagtgatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtaatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgatcatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgatcatgttgttattggtgtgtagtaatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgatcatgtttCACatgttgttattggtgtgtagtaatgtttcacatgttgttattggtgtgtagtgatgatcatgttgtcattggtgtgtagtgatg

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU754294 False 540 lncRNA 0.36 3 90672396 90675560
TU754290 False 599 lncRNA 0.35 5 90674919 90676874
TU754296 True 447 lncRNA 0.35 2 90674919 90675560

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
zgc:77375 LOC106593459 coding upstream 44843 90597013 ~ 90627553 (+)
LOC110528704 cnbp coding upstream 109422 90518807 ~ 90562974 (+)
LOC110528705 mkrn2 coding upstream 165527 90484022 ~ 90506869 (+)
tsen2 tsen2 coding upstream 213790 90413719 ~ 90459450 (+)
pparg LOC106583866 coding upstream 263361 90290101 ~ 90409035 (+)
cfap92 LOC106583852 coding downstream 63790 90740664 ~ 90885403 (+)
G662774 NA non-coding upstream 12676 90659361 ~ 90659720 (+)
G662771 NA non-coding upstream 14662 90657534 ~ 90657734 (+)
G662762 NA non-coding upstream 17616 90654477 ~ 90654780 (+)
G662757 NA non-coding upstream 21728 90650442 ~ 90650668 (+)
G662279 NA non-coding upstream 23688 90648494 ~ 90648708 (+)
G662791 NA non-coding downstream 5660 90682534 ~ 90682759 (+)
G662792 NA non-coding downstream 9124 90685998 ~ 90686254 (+)
G662796 NA non-coding downstream 13498 90690372 ~ 90690600 (+)
G662797 NA non-coding downstream 16105 90692979 ~ 90693184 (+)
G662800 NA non-coding downstream 18963 90695837 ~ 90696190 (+)
G662026 NA other upstream 672485 89999277 ~ 89999911 (+)
G661692 NA other upstream 1201005 89467984 ~ 89471391 (+)
G661696 NA other upstream 1202277 89469829 ~ 89470119 (+)
G661541 NA other upstream 1415972 89255760 ~ 89256424 (+)

Expression


Co-expression Network