XLOC_025713



Basic Information


Item Value
gene id XLOC_025713
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 49490554 ~ 49506172 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence


>TCONS_00052788
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Function


GO:

id name namespace
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GO:0005854 nascent polypeptide-associated complex cellular_component

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00052788 True 15619 lncRNA 0.37 1 49490554 49506172

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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XLOC_025711 tecra coding upstream 69280 49397115 ~ 49421274 (+)
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XLOC_025718 rsad1 coding downstream 649073 50155245 ~ 50269145 (+)
XLOC_025429 BX649540.1 misc upstream 19241518 30248739 ~ 30249036 (+)
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XLOC_025703 NA non-coding upstream 582724 48894467 ~ 48907830 (+)
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XLOC_025723 NA non-coding downstream 1289149 50795321 ~ 50796217 (+)

Expression



Co-expression Network