LOC110529494 (slc35a1)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110529494
gene name slc35a1
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 16413775 ~ 16423971 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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Function

symbol description
slc35a1 Predicted to enable UDP-galactose transmembrane transporter activity. Predicted to act upstream of or within carbohydrate transport and pyrimidine nucleotide-sugar transmembrane transport. Predicted to be located in Golgi membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be integral component of Golgi membrane. Human ortholog(s) of this gene implicated in congenital disorder of glycosylation type IIf. Orthologous to human SLC35A1 (solute carrier family 35 member A1).

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description
CMP-sialic acid transporter

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KEGG:

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K15272 SLC35A1_2_3; solute carrier family 35 (UDP-sugar transporter), member A1/2/3

RNA

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LOC110529505 LOC106571335 coding downstream 469131 16893102 ~ 16921697 (+)
LOC110529507 LOC106571333 coding downstream 497805 16921776 ~ 16925688 (+)
G678326 NA non-coding upstream 133344 16221352 ~ 16280431 (+)
G678333 NA non-coding upstream 247649 16165906 ~ 16166126 (+)
G678332 NA non-coding upstream 248347 16165198 ~ 16165428 (+)
G678309 NA non-coding upstream 257102 16156304 ~ 16156673 (+)
G678305 NA non-coding upstream 258991 16154550 ~ 16154784 (+)
G678449 NA non-coding downstream 8359 16432330 ~ 16432671 (+)
G678451 NA non-coding downstream 10538 16434509 ~ 16434734 (+)
G678453 NA non-coding downstream 12988 16436959 ~ 16437366 (+)
G678455 NA non-coding downstream 14100 16438071 ~ 16438380 (+)
G678417 LOC106571283 other upstream 27830 16384802 ~ 16385945 (+)
LOC110529464 LOC106571299 other upstream 1153785 15258311 ~ 15260331 (+)
G676919 NA other upstream 1306632 15105603 ~ 15107143 (+)
LOC110529454 LOC106571249 other upstream 1654851 14749575 ~ 14758924 (+)
G681909 NA other downstream 2739965 19163936 ~ 19165640 (+)
G682611 NA other downstream 3304862 19728833 ~ 19729671 (+)
G683669 NA other downstream 4138904 20562875 ~ 20563434 (+)
G683757 LOC106571373 other downstream 4202979 20626950 ~ 20632899 (+)

Expression


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