si:ch211-212g7.6 (LOC106571509)


Basic Information

Item Value
gene id si:ch211-212g7.6
gene name LOC106571509
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 26845680 ~ 26868116 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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Function

NR:

description
sphingosine-1-phosphate phosphatase 1-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_021612180.2 True 5125 mRNA 0.42 3 26845681 26868116
Loading

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110529712 LOC106571498 coding upstream 254722 26466178 ~ 26590958 (+)
LOC110529706 LOC106571495 coding upstream 452133 26381097 ~ 26393547 (+)
atp5mpl cssa15h14orf2 coding downstream 21679 26889795 ~ 26891532 (+)
ppp1r13bb ppp1r13b coding downstream 48553 26916669 ~ 26997843 (+)
LOC110529722 LOC106571714 coding downstream 143043 27011159 ~ 27244178 (+)
nudt14 LOC106571713 coding downstream 523601 27391717 ~ 27483687 (+)
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G691111 NA non-coding downstream 20472 26888588 ~ 26888904 (+)
G691113 NA non-coding downstream 27334 26895450 ~ 26895702 (+)
G691116 NA non-coding downstream 29504 26897620 ~ 26897850 (+)
G691119 NA non-coding downstream 34509 26902625 ~ 26902882 (+)
LOC110529702 LOC106607944 other upstream 650136 26133191 ~ 26195544 (+)
LOC110529690 LOC106571476 other upstream 1163953 25678604 ~ 25685894 (+)
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G692343 LOC106571710 other downstream 1027585 27895701 ~ 27895987 (+)
xrcc3 xrcc3 other downstream 1102360 27951635 ~ 27972016 (+)
G692424 NA other downstream 1201784 28069900 ~ 28070228 (+)
btbd7 btbd7 other downstream 1627169 28495104 ~ 28605625 (+)

Expression

si:ch211-212g7.6(LOC106571509) Expression in all Baseline Samples

Bar chart with 20 bars.
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying values. Range: 0 to 20.
End of interactive chart.

si:ch211-212g7.6(LOC106571509) Expression in each Bioproject

Bar chart with 21 bars.
si:ch211-212g7.6(LOC106571509) Expression in each Sample
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying Expression. Range: 0 to 600.
End of interactive chart.

Co-expression Network