LOC118965623


Basic Information

Item Value
gene id LOC118965623
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 29204150 ~ 29208928 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036986865.1
agcagtagtagcagcagtagcagcagcagtagcagcagcagcagcagcagcagcagcagcagcagtagcagtagcagcagcagtagtagtagcagcagcagcagtagcagcagtagtagcagtagtagtagcagtaacagcagcagcagcagcagcagtagcagcagtagtagcagcagcagcagtagtagcagcagcagcagcagcagcagtagcagcagcagtagcagcagtagcagaagcagcagtagcagcagtagcagcagcagtaacagcagtagcagcagcagcagtagcagttgtagcagcagtagtagcagcagtagcagcagtagtagcagcagtagcagcagcagtagcagcagtagcagcagcagcagcagtagcagcagcagcagcagtagtagcagcagcagcagcagcagtagcagcagtagtagcagtagcagtagtagtagcagcagtagcagtagtagcagcagtagcagcaatagcaggagcagcagtagcagcagcagtagcagcagtagcagcagcagcagtagcagcagtagcagcagcagcagtagcagcagcagcagtagcagcagtagcagcagcagtagcagcagtagcagcagcagtagcagcagtagcagcagtagtagcagcagtagtagcagcagtagcagcagcagcagcagcagcagcagtagcagcagtagtagcagcagtagtagtagcagcagtagcagcagtagtagcagcagtagtagcagcagtagtaggaaaagtagtagcagcagtagtagcagcagcagtagtagcagcagtagcagcagcagtagcagcagcagcagcagcagcagcagcagtagcagtagcagcagcacagcaacagtagcagcagtagtagcagcagcagcagtagtagcagcagcagcaagtagcagcaataGCAGGagcagaagtagtagcagcagtagcagcagtagcagcagcagcagtagcagcagtagcagcagcagcagtagcagcagcagcagtagcagcagtagcagcagcagtagcagcagtagcagcagcagcagtagcagcagtagtagcagcagtagtagcagcagtagcagcagcagcagtagcagttgtagcagcagtagtagcagcagtagcagcagtagcagcagtagcagcagcagtagcagcagaagcagcagtagcaacagtagtatcagcagtagcagcagtagcagcagcagtagcagtagcagcagcagtagcagcagtagtagcagcagcaggagtagcagtagtagcagcagtagtagcagcagtagcagcagcagtagcagcagtagcagcagcagcagcagtagcagtagcagtagcagcagcagcagcagtagtagcagcagcagcagcagcagtagcagcagtagtagcagtagcagtagtagtaacagcagtagcagtagtagcagcagtagcagcaatagcaggagcagcagtagcagcagcagtagcagcagcagcagcagcagcagcagcagtagcagcagcagtagtagtagcagcagcagcagtagcagcagtagtagcagtagtagtagcagcagtagcagcagtagcagcagcagtaacagcagcagcagcagcagtagcagcagtagtagcagcagcagcagtagtagcagcagcagcagcagaagtagtagcagcagcagcagcagcagtagcagcagcagtagcagcagtagcagcagcagcagtagcagcagtagcagcagcagtaacagcagtagcagcagcagcagtagcagttgtagcagcagtagtagcagcagtagcagcagtagcagcagtagcagcagcagtagcagcagaagcagcagtagcaacagtagtatcagcagtagcagcagtagcagcagcagtagcagtagcagcagcagtagcagcagtagtagcagcagcaggagtagcagtagtagcagcagtagtagcagcagtagcagcagcagtagcagcagtagcagcagcagcagcagtagcagtagcagtagcagcagcagcagcagtagtagcagcagcagcagcagcagtagcagcagtagtagcagtagcagtagtagtaacagcagtagcagtagtagcagcagtagcagcaatagcaggagcagcagtagtagcagcagtagcagcagtagcagcagcagcagtagcagcagtaggagaagcagcagcagcagcagcagcagcagcagtagcagtagcagtagcagtagcagcagcagcagcagtagtagcagcagcagcagcagcagtagcagcagtagtagcagtagcagtagtagtagcagcagtagcagtagtagcagcaggagcagcagtagcagcagcagtagtagcagcagcacagtagcagcagcagctgcagcagcagcagtagcagcagcagctgcagcagcagcaTTTGTAGTCAGTAGAAGAGTACTGCTGCCTGCTGTCAAGTACATACAGGCCATCTACACAGGATGGACTGACCACTACTTGAGAACCTGA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036986865.1 True 2541 mRNA 0.55 5 29204150 29208928

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118965622 NA coding downstream 670 29202386 ~ 29203480 (-)
LOC110529223 snw1 coding downstream 108115 29046423 ~ 29096035 (-)
lcb2 lcb2 coding downstream 174434 29025283 ~ 29029716 (-)
LOC110529757 LOC106571682 coding downstream 198990 28990257 ~ 29005160 (-)
ahsa1a LOC106571686 coding downstream 344039 28850874 ~ 28860111 (-)
LOC118965608 NA coding upstream 3224 29212152 ~ 29213579 (-)
LOC118965624 NA coding upstream 4859 29213787 ~ 29223764 (-)
LOC110529760 LOC106571680 coding upstream 252062 29460990 ~ 29465444 (-)
LOC110529761 cep128 coding upstream 681627 29890555 ~ 29938331 (-)
gtf2a1 LOC106571676 coding upstream 763583 29972511 ~ 29986359 (-)
G693862 NA non-coding downstream 13058 29190734 ~ 29191092 (-)
G693852 NA non-coding downstream 24722 29179211 ~ 29179428 (-)
G693836 NA non-coding downstream 37882 29166028 ~ 29166268 (-)
G693816 NA non-coding downstream 66699 29137248 ~ 29137451 (-)
G693815 NA non-coding downstream 67076 29136874 ~ 29137074 (-)
G693906 NA non-coding upstream 32755 29241683 ~ 29242006 (-)
G693907 NA non-coding upstream 33591 29242519 ~ 29242788 (-)
G693920 NA non-coding upstream 41447 29250375 ~ 29250584 (-)
G693927 NA non-coding upstream 46842 29255770 ~ 29256077 (-)
G693962 NA non-coding upstream 71814 29280742 ~ 29280965 (-)
G693665 NA other downstream 245318 28958395 ~ 28958832 (-)
G693383 btbd7 other downstream 609719 28593341 ~ 28594431 (-)
si:dkey-85n7.8 NA other downstream 722252 28478817 ~ 28481944 (-)
G692859 NA other downstream 1088102 28115736 ~ 28116048 (-)
G691747 NA other downstream 1888215 27315568 ~ 27315935 (-)
G694858 LOC105017690 other upstream 792835 30001763 ~ 30062168 (-)
G696068 NA other upstream 1637974 30846902 ~ 30847209 (-)
G696073 NA other upstream 1646179 30855107 ~ 30855407 (-)
G696499 NA other upstream 2268426 31477354 ~ 31478027 (-)
LOC110529793 LOC106571728 other upstream 2448798 31657632 ~ 31703525 (-)

Expression


Co-expression Network