efr3a (efr3a)



Basic Information


Item Value
gene id efr3a
gene name efr3a
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 44184993 ~ 44436559 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>XM_021612600.2
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ACCTATATTTCCCCCATTAAACagagaaatatgtaatacattaTATTGTTTAGGAGCGAAGAGGTGACATATCGCTTCAAGAGCGACTCCTACTTCCGTGTTGTCCCTCAATGTAAAGCAGTCCTATTACAGGAAGCTGTAGCCTAATCTGTGGGGGTTAATCCGCGTAGTTTACAGGAGCAGCGATTTCGGAGAATACGGacgatataaactacatgtagcAAAACAGAAGATTCAATCGCTGCCCACGTCAGAGGAACTGCGGTACATTAGCGGAAGAATGCCAGCGGGAGTTTGTGGCTGCTGTGGACCCCTGAGGCCCAGGTACAAACGCCTGGTTGATAACATCTTCCCAGAGGACCCCAAAGATGGCCTGTCCAAGTCAGACATGGAGAAGCTCACCTTCTACGCGGTTTCAGCCCCGGAGAAGTTGGACAGGATTGGGGCCTACCTGGCGGAGCGACTGAGCCGAGATGTGGTCCGCCACCGCTACGGGTACGTAGTCATCGCCATGGAGGCTCTGGACCAGCTCCTGATGGCCTGTCACTCCCAGAGCATCAAGCCCTTTGTGGAGAGCTTCCTCCACATGGTGGCCAAGCTGCTGGAGTCCCGGGAGCCAGACCTGCAGGTCCTGGGGACCAACTCGTTTGTCAAGTTTGCCAACATCGAGGAGGACACACCGTCCTACCACCGGCGCTATGACTTCTTTGTCTCCCAGTTCAGCGCCATGTGCCACTCAACCCATGAAGATCCTGAGACCAGAACCAGGATCCGTGTGGCCGGTATCAAAGGGCTGCAGGGTGTGGTGAGGAAGACGGTGAACGATGAGCTTCAGGCCATCATCTGGGAGCCCCAGCACATGGACAAACTCATCCCCTCCATGCTGTTCAACATGCAGGATGCTGAGGACCTAGACAGggTGGGCCCACCCGGCACGCCTTCGGAGACAGGGCAGGATGGTGAGGAAAACCCAGCGTCTCTGGCCGAGAGCTGCTTCAGAGAGCTGCTGGGAAGAGCTGCCTACGGCAACATGAACAACGCCGTCCGCCCTGTACTAGTTCATCTGGACAACCACCGGCTGTGGGAGCCCAACGAGTTTGCTGTTTCCTGTTTCCGGATCATCATGTACTCCATACAGGCCCAACACTCTCACCACGTCATCCAGCAGGTCCTGGGCCACCTGGACACACACAACAAGAACACCCCTCGCATGAGGGCCGGCATCGTGCAGGTCCTTCTCGAGACGGTCGCCATAGCAGCCAAAGGCTCCGTCGGCCCTACAGTACTGGAGGTGTTCAACACACTGCTCAAGCACCTGCGGATGAGTGTGGACTTTGAGCTGGGTGAGAACTCCAGACGGAACTCTGGCGCCAGTGTGTCCTCGTCCGGACGGGTCAAGGAGAGCGAGGAGCGCATTGTCCAGAACGCCATCATCCAGACAATCGGGTTCTTTGGTGGCAACCTGCCAGACTACCAGCGCGCGGAGGTGATGATGTTCATCATGGGCAAGGTGCCCGTGTATGGCACCCCCTGCCACACCCTGGACACTGTGAAGATTGGGCACCAGGGCACCAAGCGTATCCAGGCCATGCTGCTGAGCTCGCTCATCATGGTGACCTCTGGTTTCAAGTCCAAGACCATGGTGGCAGCGCTGCCCGCACCCTTCCTGGACCCACTTTTCTCCATTTCACTCATGGAGGACTGCGAGCTTCGCCAGTTGGTCCTTGAGATCCTGCTCAACATCATCGATCGCCACGACAACCGTGCCAAGCTGCGGGGCATCAGGATCATTCCTAATGTGGCGGCCTTGAAGATAAAGAGGGAGAAGATATCAAAACAAGACGTTGGGTTCATGAAAAAGcATGGGCAGCAGTTGTACCGTCACATCTACCTGGGCTGTAAGGAGGAGGACAACGGTCACAAGAACTTTGAGCTGCTCTTCACTACCCTGGCCGTGCTCACCATTGAGCTGGCCaatgaggaggtggtggtggaccTCATCAGGCTGGCTCTTGCCCTGCAGGATATGTCCTTGGCTAATGAGGAGAACATGCCCATGGTCATCCGCTGTGGCATCATGGCACTGGTGGCGGCCTACCTGAACTTTCTTAGTCAGATGATCGCCAACCCAGCCTTCTGTCAACACGTCAGCAAGGTGATTGAGATGAGGAACCTGGAggccccttacctcctccctgagCACATCTTCAGAGAGAAGTGTCCGCTTCCAAATTGTCTTGAGAAGGAAGACCGGAGCCTATATTTCCAGACGGTTGACCTGGCGGAGTGCCTGGTCGCGCCAGGATACAACGCTGAGCGTCTTTCAATCCCCTACGTCCCTCAAGTGACGGATGAAGACCGCCTCACCAGAAGAAAGAGTTTGGTTGACACCATTTCTCTTCAAGTGGATTTCCCTTCCGATAGCCTACCAGATAAGTCTCTGCTGGCTGAGGAGATCACCTTCGAGACTCTGAAAAAGGCCATTGACACCACAGGGttggaggagcaggagaaggagaagagacgCCAGGTCATGGAGAAGTTCCAGAAGGCTCCATTTGAGGAGATTGCCGCCCACTGCGAGTCCAAGGCCAATATGTTACATGACAGACTGGCACAAATCTTCGAGCTCACTATCCGGCCCCCTCCCAGCCCCTCTGGGGTGGTGTCTATCTCTGCAGGCCACGCTCAACACCAGTCTGTCCCTGTCTACGAGATGAAGTTCCCCGACCTGTGTGTCTACTAGATCAAAGACCAGCCACTAACGCCTTGTatcctcaaccctaaccctaaccctaacccaaccactAACCATACCCAGACCTGTGTGTCTACTGGAGCAAAGACAACCACATAGCCATTACCCTAACCACTAACACATtgtagcctcaaccctaacccatttCCTAACCCCTTCAGATCTGCATGTCTCTTAAAGCAAAAACAGTGGCAGTTTAGAACCACTAAAACCCTATACCCTCAACCCTACCGCCTAAGTCTGCTCCTTAGCCCTATACAAGGTATGTCAGCTACAGCAGAGACTAACTGTGGTACTGTACCACTAAGCCCGAATACTGTGTTCCCTATTTCTTAACACTGCACATTGTTCCTGCCCCTCCTCAGACTAATGTGTCTATTACCAGATGAGATGGCTGTATGACTGTAGTTTCCAGTCACACGCACACAGTCTACGCACACGTGAACGTGCGCGCACACGCACATTCGTATTTATAGTCTAATCAATTAGCTGTGGTGTGTTGGCTTATACACTTGGAAAGTGGAGATGTCATAGAACATCGAAAAGTGAATATTACTGGAGGCACATTGTCGTTTCAAAGATACCATCGCGCTTGCTAGCGAAGAGATTTGTAGTGGCTAATTAACAGTAAATAAGTTAATTGTTTTGCCTCACAGTTAGCCAAGAGGCATACCTAACCAGCTAAAATTGTTTACAGCTAGTTAGCAATCGTTTCAAAACTATTTTGCTAGCAACATAGTGCTGCCGTGTTAATTATAACCGGTCTCACAAAATGTGTCTCCAGTTGTTTACCTTTTACCATTGTGCATATCCATGCAGTTCTGTGCATATTAGAGAAAAGTAATTTTAGCGGCCAGTCTGAAAAATTGCTTATTTTATTGGCTTTTTCAGACAGATAAGCCACAGTGCTGCAGAAAGctaatacttttttttaatgtCCCAATTTAATGAAAACCAATTCATATATGTTAATCTGTGTGGACAAGGTGAATTTCAGGTAGAACATTGAGAGTCTTGGAAATGTGGAAATTCTATTCTGGAATAGACATCTTGGTGGATTGAGTCTTTATTGCAGGTCCATTATGGCAGTGTTTCAAAAATGTTGGGTATGAGACCAGGCTAGTAACCCCCCTGTTATGTTATGGTCTTGGATTTTGGTTCCTTCGATAGGAATCCAGTCACCACTGTTCAAAACCTACTGGAGTCATGCCCTTCAGGACCTGTACTGAGGAATGGTATTGTGGACCAGCTAACGCTAATAGAAAAGCAATCAGTTGATTACTAAAGGCACCATGTTATTTAGTTGATATATTGATAGTTTAGGATGATATGGCAGCCAAGTGCATTCACCTGTTTTGGTATTAATTGAAGTGTTCGGGCAGCTGTACACTCCCTTCTCCTCACCATCTTTTTCATAGCACTTTCACAATATGGTACAAAAACATGTAGTTATTTTTATTACACCCTCTTGACAAGATTCATGTGAAGGCTATTAAGTCGTCTTTATCTTCTCAATCCGCTCACCGACGCTGAGCACAATACAAATATTCTAACGCAATGGACTTTGGATAGTTGCATCTATTTTCTTGTAAGGCATTTTACATGAACATTTAGAGATTTTTCATTATTGATTATCACATTTCAAATCTCTGTCATTTCTCTTTCCAGTAATTTGATGAACCTGCATTTTGACATGACGTATTGGTTTGATATCACAATGCATCAAATaaatatagatacagtatatacaatgtTATGCTTATTGCTATAGGCCAGATGTTTGTGTGCAGTATAATTGGTATTGTTCACATGGGTTTCATAGCTTGCAGCTTCCTGTGGATATGTGTCATGATGATTTGTCTTGAGTTAGTATTGATTGTTATTTAGAGTATGTGGGAAAATATAATTGAGAGGGTTCACCAATATCGTTTTCCAACTTACCTGGCAGGACAAGATCTGTCATAACTCTGTTGGCCATCTAGAATACCAAAACGCTTTCATCTTTACCAAAGAATCCATTTGCCACGGCCCCCATCCGTCCCCTCCCTCTAATGTCTTAATAACGATGTCACTCAACATTTTGTTTCTGAGGGAACCAAAtatctgtctgtgtgctgtttgGGGCTCGCCACTGGGCTGTTTAATAACCCAGGTTGTTATCTTACTATTGTTACATCCTGGCTTGGTGCGGGTGTCTCTCCTGTTTCTAGTGCTAGGTATGATGCAGACATGCTGTGTAAAA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Function


symbol description
efr3a Predicted to be involved in protein localization to plasma membrane. Predicted to be active in plasma membrane. Orthologous to human EFR3A (EFR3 homolog A).

NR:

description
protein EFR3 homolog A

GO: NA

KEGG:

id description
K21842 EFR3; protein EFR3

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Loading

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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G711007 LOC106584485 non-coding upstream 1346 44437905 ~ 44438369 (-)
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LOC110529973 LOC106568664 other upstream 2614908 47051073 ~ 47067973 (-)
G714425 LOC106568665 other upstream 2741865 47178424 ~ 47178736 (-)

Expression


efr3a(efr3a) Expression in all Baseline Samples

Bar chart with 20 bars.
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying values. Range: 0 to 8.
End of interactive chart.

efr3a(efr3a) Expression in each Bioproject

Bar chart with 21 bars.
efr3a(efr3a) Expression in each Sample
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying Expression. Range: 0 to 200.
End of interactive chart.

Co-expression Network