efr3a (efr3a)


Basic Information

Item Value
gene id efr3a
gene name efr3a
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 44184993 ~ 44436559 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021612600.2
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ACCTATATTTCCCCCATTAAACagagaaatatgtaatacattaTATTGTTTAGGAGCGAAGAGGTGACATATCGCTTCAAGAGCGACTCCTACTTCCGTGTTGTCCCTCAATGTAAAGCAGTCCTATTACAGGAAGCTGTAGCCTAATCTGTGGGGGTTAATCCGCGTAGTTTACAGGAGCAGCGATTTCGGAGAATACGGacgatataaactacatgtagcAAAACAGAAGATTCAATCGCTGCCCACGTCAGAGGAACTGCGGTACATTAGCGGAAGAATGCCAGCGGGAGTTTGTGGCTGCTGTGGACCCCTGAGGCCCAGGTACAAACGCCTGGTTGATAACATCTTCCCAGAGGACCCCAAAGATGGCCTGTCCAAGTCAGACATGGAGAAGCTCACCTTCTACGCGGTTTCAGCCCCGGAGAAGTTGGACAGGATTGGGGCCTACCTGGCGGAGCGACTGAGCCGAGATGTGGTCCGCCACCGCTACGGGTACGTAGTCATCGCCATGGAGGCTCTGGACCAGCTCCTGATGGCCTGTCACTCCCAGAGCATCAAGCCCTTTGTGGAGAGCTTCCTCCACATGGTGGCCAAGCTGCTGGAGTCCCGGGAGCCAGACCTGCAGGTCCTGGGGACCAACTCGTTTGTCAAGTTTGCCAACATCGAGGAGGACACACCGTCCTACCACCGGCGCTATGACTTCTTTGTCTCCCAGTTCAGCGCCATGTGCCACTCAACCCATGAAGATCCTGAGACCAGAACCAGGATCCGTGTGGCCGGTATCAAAGGGCTGCAGGGTGTGGTGAGGAAGACGGTGAACGATGAGCTTCAGGCCATCATCTGGGAGCCCCAGCACATGGACAAACTCATCCCCTCCATGCTGTTCAACATGCAGGATGCTGAGGACCTAGACAGggTGGGCCCACCCGGCACGCCTTCGGAGACAGGGCAGGATGGTGAGGAAAACCCAGCGTCTCTGGCCGAGAGCTGCTTCAGAGAGCTGCTGGGAAGAGCTGCCTACGGCAACATGAACAACGCCGTCCGCCCTGTACTAGTTCATCTGGACAACCACCGGCTGTGGGAGCCCAACGAGTTTGCTGTTTCCTGTTTCCGGATCATCATGTACTCCATACAGGCCCAACACTCTCACCACGTCATCCAGCAGGTCCTGGGCCACCTGGACACACACAACAAGAACACCCCTCGCATGAGGGCCGGCATCGTGCAGGTCCTTCTCGAGACGGTCGCCATAGCAGCCAAAGGCTCCGTCGGCCCTACAGTACTGGAGGTGTTCAACACACTGCTCAAGCACCTGCGGATGAGTGTGGACTTTGAGCTGGGTGAGAACTCCAGACGGAACTCTGGCGCCAGTGTGTCCTCGTCCGGACGGGTCAAGGAGAGCGAGGAGCGCATTGTCCAGAACGCCATCATCCAGACAATCGGGTTCTTTGGTGGCAACCTGCCAGACTACCAGCGCGCGGAGGTGATGATGTTCATCATGGGCAAGGTGCCCGTGTATGGCACCCCCTGCCACACCCTGGACACTGTGAAGATTGGGCACCAGGGCACCAAGCGTATCCAGGCCATGCTGCTGAGCTCGCTCATCATGGTGACCTCTGGTTTCAAGTCCAAGACCATGGTGGCAGCGCTGCCCGCACCCTTCCTGGACCCACTTTTCTCCATTTCACTCATGGAGGACTGCGAGCTTCGCCAGTTGGTCCTTGAGATCCTGCTCAACATCATCGATCGCCACGACAACCGTGCCAAGCTGCGGGGCATCAGGATCATTCCTAATGTGGCGGCCTTGAAGATAAAGAGGGAGAAGATATCAAAACAAGACGTTGGGTTCATGAAAAAGcATGGGCAGCAGTTGTACCGTCACATCTACCTGGGCTGTAAGGAGGAGGACAACGGTCACAAGAACTTTGAGCTGCTCTTCACTACCCTGGCCGTGCTCACCATTGAGCTGGCCaatgaggaggtggtggtggaccTCATCAGGCTGGCTCTTGCCCTGCAGGATATGTCCTTGGCTAATGAGGAGAACATGCCCATGGTCATCCGCTGTGGCATCATGGCACTGGTGGCGGCCTACCTGAACTTTCTTAGTCAGATGATCGCCAACCCAGCCTTCTGTCAACACGTCAGCAAGGTGATTGAGATGAGGAACCTGGAggccccttacctcctccctgagCACATCTTCAGAGAGAAGTGTCCGCTTCCAAATTGTCTTGAGAAGGAAGACCGGAGCCTATATTTCCAGACGGTTGACCTGGCGGAGTGCCTGGTCGCGCCAGGATACAACGCTGAGCGTCTTTCAATCCCCTACGTCCCTCAAGTGACGGATGAAGACCGCCTCACCAGAAGAAAGAGTTTGGTTGACACCATTTCTCTTCAAGTGGATTTCCCTTCCGATAGCCTACCAGATAAGTCTCTGCTGGCTGAGGAGATCACCTTCGAGACTCTGAAAAAGGCCATTGACACCACAGGGttggaggagcaggagaaggagaagagacgCCAGGTCATGGAGAAGTTCCAGAAGGCTCCATTTGAGGAGATTGCCGCCCACTGCGAGTCCAAGGCCAATATGTTACATGACAGACTGGCACAAATCTTCGAGCTCACTATCCGGCCCCCTCCCAGCCCCTCTGGGGTGGTGTCTATCTCTGCAGGCCACGCTCAACACCAGTCTGTCCCTGTCTACGAGATGAAGTTCCCCGACCTGTGTGTCTACTAGATCAAAGACCAGCCACTAACGCCTTGTatcctcaaccctaaccctaaccctaacccaaccactAACCATACCCAGACCTGTGTGTCTACTGGAGCAAAGACAACCACATAGCCATTACCCTAACCACTAACACATtgtagcctcaaccctaacccatttCCTAACCCCTTCAGATCTGCATGTCTCTTAAAGCAAAAACAGTGGCAGTTTAGAACCACTAAAACCCTATACCCTCAACCCTACCGCCTAAGTCTGCTCCTTAGCCCTATACAAGGTATGTCAGCTACAGCAGAGACTAACTGTGGTACTGTACCACTAAGCCCGAATACTGTGTTCCCTATTTCTTAACACTGCACATTGTTCCTGCCCCTCCTCAGACTAATGTGTCTATTACCAGATGAGATGGCTGTATGACTGTAGTTTCCAGTCACACGCACACAGTCTACGCACACGTGAACGTGCGCGCACACGCACATTCGTATTTATAGTCTAATCAATTAGCTGTGGTGTGTTGGCTTATACACTTGGAAAGTGGAGATGTCATAGAACATCGAAAAGTGAATATTACTGGAGGCACATTGTCGTTTCAAAGATACCATCGCGCTTGCTAGCGAAGAGATTTGTAGTGGCTAATTAACAGTAAATAAGTTAATTGTTTTGCCTCACAGTTAGCCAAGAGGCATACCTAACCAGCTAAAATTGTTTACAGCTAGTTAGCAATCGTTTCAAAACTATTTTGCTAGCAACATAGTGCTGCCGTGTTAATTATAACCGGTCTCACAAAATGTGTCTCCAGTTGTTTACCTTTTACCATTGTGCATATCCATGCAGTTCTGTGCATATTAGAGAAAAGTAATTTTAGCGGCCAGTCTGAAAAATTGCTTATTTTATTGGCTTTTTCAGACAGATAAGCCACAGTGCTGCAGAAAGctaatacttttttttaatgtCCCAATTTAATGAAAACCAATTCATATATGTTAATCTGTGTGGACAAGGTGAATTTCAGGTAGAACATTGAGAGTCTTGGAAATGTGGAAATTCTATTCTGGAATAGACATCTTGGTGGATTGAGTCTTTATTGCAGGTCCATTATGGCAGTGTTTCAAAAATGTTGGGTATGAGACCAGGCTAGTAACCCCCCTGTTATGTTATGGTCTTGGATTTTGGTTCCTTCGATAGGAATCCAGTCACCACTGTTCAAAACCTACTGGAGTCATGCCCTTCAGGACCTGTACTGAGGAATGGTATTGTGGACCAGCTAACGCTAATAGAAAAGCAATCAGTTGATTACTAAAGGCACCATGTTATTTAGTTGATATATTGATAGTTTAGGATGATATGGCAGCCAAGTGCATTCACCTGTTTTGGTATTAATTGAAGTGTTCGGGCAGCTGTACACTCCCTTCTCCTCACCATCTTTTTCATAGCACTTTCACAATATGGTACAAAAACATGTAGTTATTTTTATTACACCCTCTTGACAAGATTCATGTGAAGGCTATTAAGTCGTCTTTATCTTCTCAATCCGCTCACCGACGCTGAGCACAATACAAATATTCTAACGCAATGGACTTTGGATAGTTGCATCTATTTTCTTGTAAGGCATTTTACATGAACATTTAGAGATTTTTCATTATTGATTATCACATTTCAAATCTCTGTCATTTCTCTTTCCAGTAATTTGATGAACCTGCATTTTGACATGACGTATTGGTTTGATATCACAATGCATCAAATaaatatagatacagtatatacaatgtTATGCTTATTGCTATAGGCCAGATGTTTGTGTGCAGTATAATTGGTATTGTTCACATGGGTTTCATAGCTTGCAGCTTCCTGTGGATATGTGTCATGATGATTTGTCTTGAGTTAGTATTGATTGTTATTTAGAGTATGTGGGAAAATATAATTGAGAGGGTTCACCAATATCGTTTTCCAACTTACCTGGCAGGACAAGATCTGTCATAACTCTGTTGGCCATCTAGAATACCAAAACGCTTTCATCTTTACCAAAGAATCCATTTGCCACGGCCCCCATCCGTCCCCTCCCTCTAATGTCTTAATAACGATGTCACTCAACATTTTGTTTCTGAGGGAACCAAAtatctgtctgtgtgctgtttgGGGCTCGCCACTGGGCTGTTTAATAACCCAGGTTGTTATCTTACTATTGTTACATCCTGGCTTGGTGCGGGTGTCTCTCCTGTTTCTAGTGCTAGGTATGATGCAGACATGCTGTGTAAAA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Function

symbol description
efr3a Predicted to be involved in protein localization to plasma membrane. Predicted to be active in plasma membrane. Orthologous to human EFR3A (EFR3 homolog A).

NR:

description
protein EFR3 homolog A

GO: NA

KEGG:

id description
K21842 EFR3; protein EFR3

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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G714425 LOC106568665 other upstream 2741865 47178424 ~ 47178736 (-)

Expression


Co-expression Network