stard3nl (stard3nl)


Basic Information

Item Value
gene id stard3nl
gene name stard3nl
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 45725701 ~ 45760239 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021612618.2
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Function

symbol description
stard3nl Predicted to be located in late endosome membrane. Predicted to be integral component of membrane. Orthologous to human STARD3NL (STARD3 N-terminal like).

NR:

description
MLN64 N-terminal domain homolog

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_021612620.2 False 3364 mRNA 0.43 9 45725701 45760239
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XR_002474458.2 True 3412 mRNA 0.43 10 45725701 45760239

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
epdr1 LOC106568636 coding upstream 17189 45692358 ~ 45708512 (+)
ranbp9 ranbp9 coding upstream 49316 45651211 ~ 45676385 (+)
rnf182 rnf182 coding upstream 111408 45611353 ~ 45614293 (+)
myo10 myo10 coding upstream 263050 45203948 ~ 45462651 (+)
LOC118965519 NA coding upstream 427304 45293797 ~ 45298397 (+)
LOC110529945 LOC106568641 coding downstream 204425 45964664 ~ 45975008 (+)
LOC110529944 LOC106568640 coding downstream 242842 46003081 ~ 46008988 (+)
slc39a6 slc39a6 coding downstream 504401 46264640 ~ 46293864 (+)
cldn15la LOC106568649 coding downstream 592547 46352786 ~ 46356523 (+)
saga LOC106568650 coding downstream 602406 46362645 ~ 46376820 (+)
G711880 NA non-coding upstream 3395 45721801 ~ 45722306 (+)
G711756 NA non-coding upstream 197156 45527673 ~ 45528545 (+)
G711734 znf622 non-coding upstream 232374 45485441 ~ 45493327 (+)
G711708 NA non-coding upstream 279294 45446112 ~ 45446407 (+)
G711865 NA non-coding downstream 3423 45763662 ~ 45767095 (+)
G711901 NA non-coding downstream 15831 45776070 ~ 45776367 (+)
G711906 NA non-coding downstream 23507 45783746 ~ 45784333 (+)
G711907 NA non-coding downstream 24623 45784862 ~ 45785204 (+)
G711908 NA non-coding downstream 26671 45786910 ~ 45787121 (+)
G711845 NA other upstream 78324 45646857 ~ 45647377 (+)
G711021 NA other upstream 1276728 44448584 ~ 44448973 (+)
G709490 NA other upstream 2528059 43196560 ~ 43197642 (+)
G708448 NA other upstream 4341518 41380025 ~ 41384183 (+)
LOC110529918 LOC106571794 other upstream 4444220 41160943 ~ 41283719 (+)
G711912 NA other downstream 33030 45793269 ~ 45794549 (+)
G713405 NA other downstream 705159 46465398 ~ 46466227 (+)
G713574 NA other downstream 955676 46715915 ~ 46769246 (+)
G716035 LOC106581475 other downstream 2777504 48537743 ~ 48544164 (+)
G716133 NA other downstream 3000104 48760343 ~ 48760740 (+)

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