si:dkey-154p10.3 (LOC106568677)



Basic Information


Item Value
gene id si:dkey-154p10.3
gene name LOC106568677
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 47440133 ~ 47452536 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


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XM_036985520.1 False 4685 mRNA 0.47 8 47440134 47452536
XM_021612700.2 False 4650 mRNA 0.47 8 47440135 47452536
XM_021612699.2 True 4539 mRNA 0.47 8 47440136 47452536

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
ccr9a ccr9 coding upstream 59159 47347501 ~ 47380974 (+)
LOC110529979 NA coding upstream 141852 47296663 ~ 47298281 (+)
LOC110529975 LOC106568666 coding upstream 210798 47209551 ~ 47229335 (+)
LOC110529974 LOC106568665 coding upstream 245573 47140657 ~ 47194560 (+)
LOC110529969 LOC106568662 coding upstream 435803 46978079 ~ 47004330 (+)
LOC110529986 LOC106568678 coding downstream 15944 47468480 ~ 47506234 (+)
si:dkey-181m9.8 LOC106568680 coding downstream 693254 48145790 ~ 48162546 (+)
tnk2b tnk2 coding downstream 1226277 48678813 ~ 48806257 (+)
LOC110530923 LOC106568690 coding downstream 1450401 48902937 ~ 48931678 (+)
adipoqb LOC100653481 coding downstream 1665191 49117727 ~ 49120309 (+)
G714468 NA non-coding upstream 187911 47251818 ~ 47252222 (+)
G714467 NA non-coding upstream 189716 47250075 ~ 47250417 (+)
G714466 NA non-coding upstream 190096 47249811 ~ 47250037 (+)
G714464 LOC106568668 non-coding upstream 191930 47247397 ~ 47248203 (+)
G714624 NA non-coding downstream 3877 47456413 ~ 47456701 (+)
G714626 LOC100194703 non-coding downstream 6667 47459203 ~ 47459493 (+)
G714628 NA non-coding downstream 8170 47460706 ~ 47461046 (+)
G714636 NA non-coding downstream 53798 47506334 ~ 47506918 (+)
G714663 NA non-coding downstream 58317 47510853 ~ 47511102 (+)
G713574 NA other upstream 670887 46715915 ~ 46769246 (+)
G713405 NA other upstream 973906 46465398 ~ 46466227 (+)
G711912 NA other upstream 1645584 45793269 ~ 45794549 (+)
G711845 NA other upstream 1792756 45646857 ~ 45647377 (+)
G711021 NA other upstream 2991160 44448584 ~ 44448973 (+)
G716035 LOC106581475 other downstream 1085207 48537743 ~ 48544164 (+)
G716133 NA other downstream 1307807 48760343 ~ 48760740 (+)
G716862 NA other downstream 1880305 49332841 ~ 49333772 (+)
G716993 LOC100136012 other downstream 2093676 49546212 ~ 49547085 (+)
LOC118965615 NA other downstream 2400851 49853027 ~ 49854435 (+)

Expression



Co-expression Network