LOC110530017 (LOC106568715)



Basic Information


Item Value
gene id LOC110530017
gene name LOC106568715
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 50146364 ~ 50336325 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>XM_036985560.1
CTGTCGCATCGCTAGAGGAACGGATACTAGGTCAGGCTTTGTTTGTGGATGAGCTCCATCACCTCCTCCCAGAAATGTGGACGGATATAAGGAAACTACTGCTCTTTCATTTGTTAGCCCTGAAACTTCATTCCTCAAAAGGAGCAGAGGCAGAAGAGTGTGAGGATGGTCAGTTTCAGTGCAATAACAAAAGGTGTATACCGACCATATGGAGGTGCGACGATGATGACGACTGCTCAGACAACAGCGACGAGGAAAACTGTGcCAGGAAGACGTGTGCCCCGGCAGAGTTTGCCTGTGCGAACGGCCAGTGTGTACCAGGCCGCTGGCGCTGTGACGGGGAACCAGAGTGTCCCGACGGCTCAGATGAGGCAGACGCCACCTGTAgcAAACAGACCTGCCCTCCGGAGAAGTTTGACTGCGGCGGCTCTACCAACAAGTGTGTCTCAGTGTCGTGGCGATGCGACGGCGAGCGGGACTGTGAGAACGGGTCAGACGAGGAGGACTGTGCCGCCGACGCCAAGTCCTGCCCGAAAAGCGAATTCCAGTGTGCCAACCGCAAGTGCCTGGCACCTGTCTACGTGTGCGACGGCGATGACGACTGCGACGACGGCTCCGACGAACTAAAATGCTCCTCCCGCCACTCGCCAACGACCACCTGCGGTCCGCACGAGTTCCGCTGCAACACCTCAGAGTGCGTGCCTGTCATGTGGAGCTGTGACGGCGACCCAGACTGCCCAGATGGCTCTGACGAGTGGCCGGAGCGTTGTGGGAGTGAAGGGTCGCAATCGCGACGCAGGATGAACTGTACGGTGGAGGAGTTTCGGTGCGCCAACGGGGAGTGTGTGAGGCTGGCGTGGAAATGTGACGGGGATCCGGACTGCAAGGATAAATCGGACGAGGCGGATTGTCCTCTGCTGACGTGCCGCCCAGATGAATTCCAGTGTGGGGACGGCTCCTGTATCCACGGCACCAAGCAGTGTAACAAGGTCCACGACTGTCCTGACCAGAGTGACGAGTCAGGCTGTGTCAACGCCACTAAGTGTGAGGGGCCCCTGAAGTTCCTGTGTAAGAACGGAGAGTGTATCGACAGCGCTAAGGTGTGTGACAACGTCAAGGACTGCAAGGACCGCTCCGATGAGCCCAAGAAGGAGTGTGGACTCAACGAGTGCGCGCTCAACAATGGCGGCTGCTCTCACATCTGCCTGGATCGACCAATCGGCTACGAGTGCCATTGTCCCACCGGGTACCAGCTACTGGACAAGAGGACATGTGGAGACATTGATGAGTGCGAGAGCCCCAACGCCTGCAGCCAGATCTGCATCAACTACAAGGGAGACTTCAAGTGTGAGTGCTACCAAGGCTATGAGATGGACCCCGTCACCAAGACCTGCAAGGCAGAGGGGAAGTCTCCCTACCTGATGTTCACCAACCGCCATGAGATCCGTCGGGTGGACCCAGTGAAGAAGGATTACAGCCAGGTGCTGGCAACCCAGAAAAACGCTGTGGCGCTTGACATAGACGTGGCCAATAACCGCCTGTTCTGGTGCGACCGCTTCCACCGCAACATCTACAGTGCTCTGATCCCGGAGGCCAGTGTCCCGTTCCAGCAGGTGACCCTGGTGGActctggctctctcctctcccccgagGGCCTGGCCCTAGACTGGGTCCAGCACAACCTCTACTGGACCGACTCGGGCCACAAGACGGTCTCGGTGGCCTCGGCCTATGACGGCCTCAAGAGGAGGGTGCTGGTGGACACGGAACTCAGCGAGCCCAGAGCCATAGCCCTGGACCCCCAGCACGGGTTCATGTACTGGTCTGACTGGGGCACCCGGGCCAAGATTGAGAAGGCTGGGATGAATGGGGTGGACCGACAGGTCTTGGTGTCCGATAACATCGAGTGGCCCAACGGCATCACCCTAGATGTAGCCAACAGACGTCTGTACTGGGTGGACTCCAAGCTGCACCTCATCTCCAGCGTGGACCTGAACGGGGCTCACCGCCGGACACACCTGTCCTCCTCAGAGAGACTGGGACACCCCTACGCACTGGCCGTGTTTgagGACCGTATCTActggacagacagggagagggaggcggTGTACAGCGCTAACAGGCTAACCGGCCGAGATGTCAGCACACTGGCCGAGCACCTCAACGACCCCCACGACATAGTGGTCTTCCACCCACTCCGACAGccccaagGCCCAGACAGCTGTAACTTGGGCAGTGAGGCCAACGGTGGCTGTGAGTACCTGTGTCTCAAAGCCCCCCAGATCACAGAGCACTCTCCCAAGTACACCTGCGCCTGCCCCACAGGACAGGACCTGGGGCCCGACATGCGGGGCTGTGTGCcagCAAATGAGACTATTACCACACCGTCGCCATTCCCCACCGGCTCGGTAGCCATCATCACGGCAAGTATCGAGGAGGACAAAGAGGACTCCCATTCCACTTCTGGGTTGTCCCAGGCAGATGCCGGGGTCCGCCACCTCACCCCCGCCCCCTCCAGCACCCCAGAACTCCTCCTCATCGCCAAACCTGGGGCAGAGGTGAAGGAGAAAGATGGCCGGCGTTTGGatcacaccacctccaccacagtAGGGTCTGGGGACACTAATGTCATCAAGGAGGACAGCAATCTCTCTCACCACTCTGGAAGTGAGCATTTTCTCCTGGGGGAGAACCTGACAGTGGCAGTTCTGGGAGTAGTCATCCCTATAGTTCCTATTGTTGCCACAGTGGTCTTCGGTCTGCTCTGCACTGGCGTCTACCTGGTTTGGCGGAACTATCGTGTAAACTCTACCAAGAGTATGAACTTTGACAACCCCGTTTACCGCAAGACCACAGGCGAGGGCGAAGAGGACGAGATTCACATCGGACGGACGGACAGTGGCATGAGCGGCCAGCACGGGCATCACCCGTACCCAGTTGGAGTGGGGTGTGGCGTAGTCGGCGGGGGCGGAAATACATGCCCTCAGTTTATCGCTCTACCACTGGGTGGCAGTATGCCCGACCCGGGGACTCACTGGTACACGGAGCAGCCTATGCTGTCCACTACGGCTAAGTGAGGTGGGCAAAGTGGGAGGATGGAGACTAGACTAAATGGCTGCTCAGGGGGTTAATTTTCAAGATGGCCGCTGCTCaggcgcacacacatacacacatgcacacacacacagtaccaagGTCAGGGGTCACTCACTGAGTCTGTTCAAGGGATGGACATATGATGTTCTCGTCACATCCAGCCATTCGTGACCATGCTGTGCCAATTCATCACACAAAATTGACAGTTTGACACTTTCTAAGGTTTATTTATGTTATGTCAGAGTTGGGGTTGGTTCGGTTTGAATTCCTGTCAATTCAGTTCTTGAATTCTCTATGAATCAATTGAATTTAGATCACTGGACTTGAGTTGCAGCTGAGTCGACACCAATTCTGGATGTTTTTCATCCACTTTTGATCAATTTCAGCAGTATTGAGCTGTGCTATCTGTCTCACGTTTAAGGCCGAGAGGAGTTCCAAGAGAGTCATTTTGCCCTTGACTTTATAAATCTATGCTCTCCATGTTATATCCCTGGTGGATCCTCATTGTCTGGCTTTTTAGGGGGAGGTTTAAAATGAGGGCAGCACCTTAGTTGATGGGACAATCTGTATAGTTTTAAGCTATTAATTCAACACGTTTTATCGTTCACCTCACGATTATTAAAGATGTCATGGTGTTTTGTTATTCTGGTCAGGGCTTTTGTCTTGGAGTGGAGTGAAAGGTTTgagagaggttgttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtacttaggtgtgtgtgtgtgtacttaggTGTGTGTACCTACTCTCTACAGTTCTTCTTTGACGTTATCCTTATTGAACCTAAAAGGCTACAAGAGGACAAGCAGGGCAAAGGGTCGTTGAGAAAGTTTTGTGGCAGCATTGGGAAAGTTTTGTGGCAGCTTTGGGAAAGTTTTGTGGCAGCTTTGGGAAAGTTTTGTGGCAGCTTTGGGATCCAAAAGAAAGCGTAAGGCTTAGCGAGAGAAGCCTTTGTAGTAATTAACGGTAGGCTGGATTTTTAGGCCCAGTGAAGACGTCTAGCTAGTGGCTAACAGTATCCGTGTTAAGGCTTTTGTGTGTGTCTACGACATGTCTCTAGACAATTAGAATGCGGCAAGTATTGCTGGTCAAAACTACATTTCATTTATACTCAGGCTGACTGTCTGTAGATCATCACTACGGTGAAAACGGTTCTACTTTGACCCTGCCACAGTGTCCATTGTCACGAGTAGATAGAGCCACTGGCGCTACATAACCATGACAATAAATTCCAAACGCCTGAttgacagctagctagcttgcattAGCATACAGAATATACATACATTTAATATTATGGACGACTGTATTTTTTGTAGAGCATATGTTAAGTTTAGTTATGGAGCACCCTTGTCTCTTTGCCGTTGGGAGTGAAGACTCCAAAgattctcaacaacaaaaaaatcctggTTAGCAATTGGTAGCCAGCTTAATTCAACCTGTAATTAAACTGACTTTAGCTGAGCTGGCTATCTAGTCAATCTAATTCCAGACTAGGTGTGAGTATGAGAAATCAAACAAACAAATATTAATCTCTTCTCAGGAGAAAGGCGGCTTCCTCCTTGTTTTCTCATTTATACGAGGGATAGAATGTAAGTCACTATCACGTGACAATATAATGCTCATGATATCAACTTTGTGTTTATACAAACAAACCACGTTTGTAAATATAATTTAGATGATATCACTGCAACAACATCTCAATAGATGGACTAAAAACCAGCCTTTAGCTATGATAATGAGAACAGAGTTGGCTAGAGCAGAATTAGCTAGCTAGAAGGCTAATGTTTAACTAGGCTAAAGCAGAACCAGATATGGCTAATGGCTACCAGGCTAATGCTTAGCTAACAGTTTGAGAAAAGCAATTAGAGGGTTGTTGTACTGAGGTGAATAATTTAGGCtattattctcctctcctctttttagCTGTTTTCCATGGCCACAGGTGAATTTGTCATCTGTTATTGTTgattttatttcccctttatcTACTCACTTTgtcagtacaacacacacacagtcactcacccTCAAGAGATCACACACAGGGGTATTCTATTagtatccccattagctgttgagatagcagcagctactattcctggggtccacacagaacatgaagcatgacataatacagaacattaatagacaagaacagctcaagggcAGAACTCCATAAATTGGACGGAActacagaaacattaacttgcaCTAGAAGATACTATTTACACACAGCATACATAATCACTCGCCCTTCACAAACACAAGCATTACACTCAccctaaagacagacagacacacacacacacacacacacacaccagacacacacacacaccagacacgtGAACACAAACATCCATGCCCCTGTCTTCATTCTTTGAAAAGATGTCAATGTGAGCTTTCATATAGGAGGCACTCAGTCAGTGGGAGGTCGACTGCTGACAAAAGGCCCCTGTCAGCCATTTTGGTGGCCGGCATCACTGTGGCAGATTTTTTTTCCTgcttcctaaatggcaccctattccctttttagtacactactctttttttatttttttaccaggacccatacggctctggtcaaaagtagtgcactatgtagggaaaaggatgtcatttgggacacaggcttaAACAGTAATGAGGTTCAGTCAGGTTGGATTCTCCTGTCAGTAAACACAACTGTCTTTTGTCCACCTCTCCTTTTGTCCTGTCCCGCACATTGGTGATCCGCTCAGAAAATAGACATTTCTGAGTCCCCTCCATTGTAGTATTGTCGATCACGGTGATGGGATGAAATAGGATTTGGTAAGAGCCAGATTGAATaggtgtgtgtagtgggggtggatatgtgtgtgtgcctgtgtgtgtgtttatgcgtgtgtgtgagtaTTTGTGTTCATTTCACAGCCATATTGGAAACGTTTTGTACACTTTTTGTTGCCCAGCCCTCTCAGAATGCCTTCTGTATTGTGTGTGTTGCATGAGAGAACGTGTGCGTactcgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgcatgtttgTCAGAATGAGTGCATgtgagtacagtatgtatgttCTTGGGACCGGAGTAGCTGCGAGGGTGTTTTTTGAAATCATGATTTgtaaatacattttcatattgCAAACCAGTTTTTGATAAAGTATTATACAATTCTGTAAAAGAAAAATATGTACATAAGATTTTAGATGAGAATAAAGTGTTGATGACAGCATATTAATTTATTTGTATAAAAGAGCACTGCATTCCCTGATTGTACGAAATATGAATTATCCGCCCAAGTGTTTTGTGTTGTTACTTGGTCTTGCTTCATTTGATAACCTTTTCTCTTTCCAAATGTGTACTTCTTTATCAGTACAAGTAATACAACGTGGTTCCTCCTCAATATCTCCCCGTATCTCATTGTTTCTCAAGCCCAGTGTTTTATAATATGAACGATTTGTTTTCTggtgcctttttttctctctctttgttgtaCTGCTGTTTTGCTGTGGGAGATGGCTTCTTTTCAAGCAACTTCTGGAACATGCAAATAAGAACATCTGCACCCAGAATTGACAAAACCGGTCTCGCTCACCTTTTTATTATTTCATGAAGTTGTTCTTAAATATCTATATATTGGTATATAAAACTTTATTGCAAATCTCTT
>XM_036985561.1
CTGTCGCATCGCTAGAGGAACGGATACTAGGTCAGGCTTTGTTTGTGGATGAGCTCCATCACCTCCTCCCAGAAATGTGGACGGATATAAGGAAACTACTGCTCTTTCATTTGTTAGCCCTGAAACTTCATTCCTCAAAAGGAGCAGAGGCAGAAGAGTGTGAGGATGGTCAGTTTCAGTGCAATAACAAAAGGTGTATACCGACCATATGGAGGTGCGACGATGATGACGACTGCTCAGACAACAGCGACGAGGAAAACTGTGcCAGGAAGACGTGTGCCCCGGCAGAGTTTGCCTGTGCGAACGGCCAGTGTGTACCAGGCCGCTGGCGCTGTGACGGGGAACCAGAGTGTCCCGACGGCTCAGATGAGGCAGACGCCACCTGTAACGCCAAGTCCTGCCCGAAAAGCGAATTCCAGTGTGCCAACCGCAAGTGCCTGGCACCTGTCTACGTGTGCGACGGCGATGACGACTGCGACGACGGCTCCGACGAACTAAAATGCTCCTCCCGCCACTCGCCAACGACCACCTGCGGTCCGCACGAGTTCCGCTGCAACACCTCAGAGTGCGTGCCTGTCATGTGGAGCTGTGACGGCGACCCAGACTGCCCAGATGGCTCTGACGAGTGGCCGGAGCGTTGTGGGAGTGAAGGGTCGCAATCGCGACGCAGGATGAACTGTACGGTGGAGGAGTTTCGGTGCGCCAACGGGGAGTGTGTGAGGCTGGCGTGGAAATGTGACGGGGATCCGGACTGCAAGGATAAATCGGACGAGGCGGATTGTCCTCTGCTGACGTGCCGCCCAGATGAATTCCAGTGTGGGGACGGCTCCTGTATCCACGGCACCAAGCAGTGTAACAAGGTCCACGACTGTCCTGACCAGAGTGACGAGTCAGGCTGTGTCAACGCCACTAAGTGTGAGGGGCCCCTGAAGTTCCTGTGTAAGAACGGAGAGTGTATCGACAGCGCTAAGGTGTGTGACAACGTCAAGGACTGCAAGGACCGCTCCGATGAGCCCAAGAAGGAGTGTGGACTCAACGAGTGCGCGCTCAACAATGGCGGCTGCTCTCACATCTGCCTGGATCGACCAATCGGCTACGAGTGCCATTGTCCCACCGGGTACCAGCTACTGGACAAGAGGACATGTGGAGACATTGATGAGTGCGAGAGCCCCAACGCCTGCAGCCAGATCTGCATCAACTACAAGGGAGACTTCAAGTGTGAGTGCTACCAAGGCTATGAGATGGACCCCGTCACCAAGACCTGCAAGGCAGAGGGGAAGTCTCCCTACCTGATGTTCACCAACCGCCATGAGATCCGTCGGGTGGACCCAGTGAAGAAGGATTACAGCCAGGTGCTGGCAACCCAGAAAAACGCTGTGGCGCTTGACATAGACGTGGCCAATAACCGCCTGTTCTGGTGCGACCGCTTCCACCGCAACATCTACAGTGCTCTGATCCCGGAGGCCAGTGTCCCGTTCCAGCAGGTGACCCTGGTGGActctggctctctcctctcccccgagGGCCTGGCCCTAGACTGGGTCCAGCACAACCTCTACTGGACCGACTCGGGCCACAAGACGGTCTCGGTGGCCTCGGCCTATGACGGCCTCAAGAGGAGGGTGCTGGTGGACACGGAACTCAGCGAGCCCAGAGCCATAGCCCTGGACCCCCAGCACGGGTTCATGTACTGGTCTGACTGGGGCACCCGGGCCAAGATTGAGAAGGCTGGGATGAATGGGGTGGACCGACAGGTCTTGGTGTCCGATAACATCGAGTGGCCCAACGGCATCACCCTAGATGTAGCCAACAGACGTCTGTACTGGGTGGACTCCAAGCTGCACCTCATCTCCAGCGTGGACCTGAACGGGGCTCACCGCCGGACACACCTGTCCTCCTCAGAGAGACTGGGACACCCCTACGCACTGGCCGTGTTTgagGACCGTATCTActggacagacagggagagggaggcggTGTACAGCGCTAACAGGCTAACCGGCCGAGATGTCAGCACACTGGCCGAGCACCTCAACGACCCCCACGACATAGTGGTCTTCCACCCACTCCGACAGccccaagGCCCAGACAGCTGTAACTTGGGCAGTGAGGCCAACGGTGGCTGTGAGTACCTGTGTCTCAAAGCCCCCCAGATCACAGAGCACTCTCCCAAGTACACCTGCGCCTGCCCCACAGGACAGGACCTGGGGCCCGACATGCGGGGCTGTGTGCcagCAAATGAGACTATTACCACACCGTCGCCATTCCCCACCGGCTCGGTAGCCATCATCACGGCAAGTATCGAGGAGGACAAAGAGGACTCCCATTCCACTTCTGGGTTGTCCCAGGCAGATGCCGGGGTCCGCCACCTCACCCCCGCCCCCTCCAGCACCCCAGAACTCCTCCTCATCGCCAAACCTGGGGCAGAGGTGAAGGAGAAAGATGGCCGGCGTTTGGatcacaccacctccaccacagtAGGGTCTGGGGACACTAATGTCATCAAGGAGGACAGCAATCTCTCTCACCACTCTGGAAGTGAGCATTTTCTCCTGGGGGAGAACCTGACAGTGGCAGTTCTGGGAGTAGTCATCCCTATAGTTCCTATTGTTGCCACAGTGGTCTTCGGTCTGCTCTGCACTGGCGTCTACCTGGTTTGGCGGAACTATCGTGTAAACTCTACCAAGAGTATGAACTTTGACAACCCCGTTTACCGCAAGACCACAGGCGAGGGCGAAGAGGACGAGATTCACATCGGACGGACGGACAGTGGCATGAGCGGCCAGCACGGGCATCACCCGTACCCAGTTGGAGTGGGGTGTGGCGTAGTCGGCGGGGGCGGAAATACATGCCCTCAGTTTATCGCTCTACCACTGGGTGGCAGTATGCCCGACCCGGGGACTCACTGGTACACGGAGCAGCCTATGCTGTCCACTACGGCTAAGTGAGGTGGGCAAAGTGGGAGGATGGAGACTAGACTAAATGGCTGCTCAGGGGGTTAATTTTCAAGATGGCCGCTGCTCaggcgcacacacatacacacatgcacacacacacagtaccaagGTCAGGGGTCACTCACTGAGTCTGTTCAAGGGATGGACATATGATGTTCTCGTCACATCCAGCCATTCGTGACCATGCTGTGCCAATTCATCACACAAAATTGACAGTTTGACACTTTCTAAGGTTTATTTATGTTATGTCAGAGTTGGGGTTGGTTCGGTTTGAATTCCTGTCAATTCAGTTCTTGAATTCTCTATGAATCAATTGAATTTAGATCACTGGACTTGAGTTGCAGCTGAGTCGACACCAATTCTGGATGTTTTTCATCCACTTTTGATCAATTTCAGCAGTATTGAGCTGTGCTATCTGTCTCACGTTTAAGGCCGAGAGGAGTTCCAAGAGAGTCATTTTGCCCTTGACTTTATAAATCTATGCTCTCCATGTTATATCCCTGGTGGATCCTCATTGTCTGGCTTTTTAGGGGGAGGTTTAAAATGAGGGCAGCACCTTAGTTGATGGGACAATCTGTATAGTTTTAAGCTATTAATTCAACACGTTTTATCGTTCACCTCACGATTATTAAAGATGTCATGGTGTTTTGTTATTCTGGTCAGGGCTTTTGTCTTGGAGTGGAGTGAAAGGTTTgagagaggttgttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtacttaggtgtgtgtgtgtgtacttaggTGTGTGTACCTACTCTCTACAGTTCTTCTTTGACGTTATCCTTATTGAACCTAAAAGGCTACAAGAGGACAAGCAGGGCAAAGGGTCGTTGAGAAAGTTTTGTGGCAGCATTGGGAAAGTTTTGTGGCAGCTTTGGGAAAGTTTTGTGGCAGCTTTGGGAAAGTTTTGTGGCAGCTTTGGGATCCAAAAGAAAGCGTAAGGCTTAGCGAGAGAAGCCTTTGTAGTAATTAACGGTAGGCTGGATTTTTAGGCCCAGTGAAGACGTCTAGCTAGTGGCTAACAGTATCCGTGTTAAGGCTTTTGTGTGTGTCTACGACATGTCTCTAGACAATTAGAATGCGGCAAGTATTGCTGGTCAAAACTACATTTCATTTATACTCAGGCTGACTGTCTGTAGATCATCACTACGGTGAAAACGGTTCTACTTTGACCCTGCCACAGTGTCCATTGTCACGAGTAGATAGAGCCACTGGCGCTACATAACCATGACAATAAATTCCAAACGCCTGAttgacagctagctagcttgcattAGCATACAGAATATACATACATTTAATATTATGGACGACTGTATTTTTTGTAGAGCATATGTTAAGTTTAGTTATGGAGCACCCTTGTCTCTTTGCCGTTGGGAGTGAAGACTCCAAAgattctcaacaacaaaaaaatcctggTTAGCAATTGGTAGCCAGCTTAATTCAACCTGTAATTAAACTGACTTTAGCTGAGCTGGCTATCTAGTCAATCTAATTCCAGACTAGGTGTGAGTATGAGAAATCAAACAAACAAATATTAATCTCTTCTCAGGAGAAAGGCGGCTTCCTCCTTGTTTTCTCATTTATACGAGGGATAGAATGTAAGTCACTATCACGTGACAATATAATGCTCATGATATCAACTTTGTGTTTATACAAACAAACCACGTTTGTAAATATAATTTAGATGATATCACTGCAACAACATCTCAATAGATGGACTAAAAACCAGCCTTTAGCTATGATAATGAGAACAGAGTTGGCTAGAGCAGAATTAGCTAGCTAGAAGGCTAATGTTTAACTAGGCTAAAGCAGAACCAGATATGGCTAATGGCTACCAGGCTAATGCTTAGCTAACAGTTTGAGAAAAGCAATTAGAGGGTTGTTGTACTGAGGTGAATAATTTAGGCtattattctcctctcctctttttagCTGTTTTCCATGGCCACAGGTGAATTTGTCATCTGTTATTGTTgattttatttcccctttatcTACTCACTTTgtcagtacaacacacacacagtcactcacccTCAAGAGATCACACACAGGGGTATTCTATTagtatccccattagctgttgagatagcagcagctactattcctggggtccacacagaacatgaagcatgacataatacagaacattaatagacaagaacagctcaagggcAGAACTCCATAAATTGGACGGAActacagaaacattaacttgcaCTAGAAGATACTATTTACACACAGCATACATAATCACTCGCCCTTCACAAACACAAGCATTACACTCAccctaaagacagacagacacacacacacacacacacacacaccagacacacacacacaccagacacgtGAACACAAACATCCATGCCCCTGTCTTCATTCTTTGAAAAGATGTCAATGTGAGCTTTCATATAGGAGGCACTCAGTCAGTGGGAGGTCGACTGCTGACAAAAGGCCCCTGTCAGCCATTTTGGTGGCCGGCATCACTGTGGCAGATTTTTTTTCCTgcttcctaaatggcaccctattccctttttagtacactactctttttttatttttttaccaggacccatacggctctggtcaaaagtagtgcactatgtagggaaaaggatgtcatttgggacacaggcttaAACAGTAATGAGGTTCAGTCAGGTTGGATTCTCCTGTCAGTAAACACAACTGTCTTTTGTCCACCTCTCCTTTTGTCCTGTCCCGCACATTGGTGATCCGCTCAGAAAATAGACATTTCTGAGTCCCCTCCATTGTAGTATTGTCGATCACGGTGATGGGATGAAATAGGATTTGGTAAGAGCCAGATTGAATaggtgtgtgtagtgggggtggatatgtgtgtgtgcctgtgtgtgtgtttatgcgtgtgtgtgagtaTTTGTGTTCATTTCACAGCCATATTGGAAACGTTTTGTACACTTTTTGTTGCCCAGCCCTCTCAGAATGCCTTCTGTATTGTGTGTGTTGCATGAGAGAACGTGTGCGTactcgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgcatgtttgTCAGAATGAGTGCATgtgagtacagtatgtatgttCTTGGGACCGGAGTAGCTGCGAGGGTGTTTTTTGAAATCATGATTTgtaaatacattttcatattgCAAACCAGTTTTTGATAAAGTATTATACAATTCTGTAAAAGAAAAATATGTACATAAGATTTTAGATGAGAATAAAGTGTTGATGACAGCATATTAATTTATTTGTATAAAAGAGCACTGCATTCCCTGATTGTACGAAATATGAATTATCCGCCCAAGTGTTTTGTGTTGTTACTTGGTCTTGCTTCATTTGATAACCTTTTCTCTTTCCAAATGTGTACTTCTTTATCAGTACAAGTAATACAACGTGGTTCCTCCTCAATATCTCCCCGTATCTCATTGTTTCTCAAGCCCAGTGTTTTATAATATGAACGATTTGTTTTCTggtgcctttttttctctctctttgttgtaCTGCTGTTTTGCTGTGGGAGATGGCTTCTTTTCAAGCAACTTCTGGAACATGCAAATAAGAACATCTGCACCCAGAATTGACAAAACCGGTCTCGCTCACCTTTTTATTATTTCATGAAGTTGTTCTTAAATATCTATATATTGGTATATAAAACTTTATTGCAAATCTCTT
>XR_005052891.1
CTGTCGCATCGCTAGAGGAACGGATACTAGGTCAGGCTTTGTTTGTGGATGAGCTCCATCACCTCCTCCCAGAAATGTGGACGGATATAAGGAAACTACTGCTCTTTCATTTGTTAGCCCTGAAACTTCATTCCTCAAAAGGAGCAGAGGCAGAAGAGTGTGAGGATGGTCAGTTTCAGTGCAATAACAAAAGGTGTATACCGACCATATGGAGGTGCGACGATGATGACGACTGCTCAGACAACAGCGACGAGGAAAACTGTGcCAGGAAGACGTGTGCCCCGGCAGAGTTTGCCTGTGCGAACGGCCAGTGTGTACCAGGCCGCTGGCGCTGTGACGGGGAACCAGAGTGTCCCGACGGCTCAGATGAGGCAGACGCCACCTGTAgcAAACAGACCTGCCCTCCGGAGAAGTTTGACTGCGGCGGCTCTACCAACAAGTGTGTCTCAGTGTCGTGGCGATGCGACGGCGAGCGGGACTGTGAGAACGGGTCAGACGAGGAGGACTGTGCCGCCGACGCCAAGTCCTGCCCGAAAAGCGAATTCCAGTGTGCCAACCGCAAGTGCCTGGCACCTGTCTACGTGTGCGACGGCGATGACGACTGCGACGACGGCTCCGACGAACTAAAATGCTCCTCCCGCCACTCGCCAACGACCACCTGCGGTCCGCACGAGTTCCGCTGCAACACCTCAGAGTGCGTGCCTGTCATGTGGAGCTGTGACGGCGACCCAGACTGCCCAGATGGCTCTGACGAGTGGCCGGAGCGTTGTGGGAGTGAAGGGTCGCAATCGCGACGCAGGATGAACTGTACGGTGGAGGAGTTTCGGTGCGCCAACGGGGAGTGTGTGAGGCTGGCGTGGAAATGTGACGGGGATCCGGACTGCAAGGATAAATCGGACGAGGCGGATTGTCCTCTGCTGACGTGCCGCCCAGATGAATTCCAGTGTGGGGACGGCTCCTGTATCCACGGCACCAAGCAGTGTAACAAGGTCCACGACTGTCCTGACCAGAGTGACGAGTCAGGCTGTGTCAACGCCACTAAGTGTGAGGGGCCCCTGAAGTTCCTGTGTAAGAACGGAGAGTGTATCGACAGCGCTAAGGTGTGTGACAACGTCAAGGACTGCAAGGACCGCTCCGATGAGCCCAAGAAGGAGTGTGGACTCAACGAGTGCGCGCTCAACAATGGCGGCTGCTCTCACATCTGCCTGGATCGACCAATCGGCTACGAGTGCCATTGTCCCACCGGGTACCAGCTACTGGACAAGAGGACATGTGGAGACATTGATGAGTGCGAGAGCCCCAACGCCTGCAGCCAGATCTGCATCAACTACAAGGGAGACTTCAAGTGTGAGTGCTACCAAGGCTATGAGATGGACCCCGTCACCAAGACCTGCAAGGCAGAGGGGAAGTCTCCCTACCTGATGTTCACCAACCGCCATGAGATCCGTCGGGTGGACCCAGTGAAGAAGGATTACAGCCAGGTGCTGGCAACCCAGAAAAACGCTGTGGCGCTTGACATAGACGTGGCCAATAACCGCCTGTTCTGGTGCGACCGCTTCCACCGCAACATCTACAGTGCTCTGATCCCGGAGGCCAGTGTCCCGTTCCAGCAGGTGACCCTGGTGGActctggctctctcctctcccccgagGGCCTGGCCCTAGACTGGGTCCAGCACAACCTCTACTGGACCGACTCGGGCCACAAGACGGTCTCGGTGGCCTCGGCCTATGACGGCCTCAAGAGGAGGGTGCTGGTGGACACGGAACTCAGCGAGCCCAGAGCCATAGCCCTGGACCCCCAGCACGGGTTCATGTACTGGTCTGACTGGGGCACCCGGGCCAAGATTGAGAAGGCTGGGATGAATGGGGTGGACCGACAGGTCTTGGTGTCCGATAACATCGAGTGGCCCAACGGCATCACCCTAGATGTAGCCAACAGACGTCTGTACTGGGTGGACTCCAAGCTGCACCTCATCTCCAGCGTGGACCTGAACGGGGCTCACCGCCGGACACACCTGTCCTCCTCAGAGAGACTGGGACACCCCTACGCACTGGCCGTGTTTgagGACCGTATCTActggacagacagggagagggaggcggTGTACAGCGCTAACAGGCTAACCGGCCGAGATGTCAGCACACTGGCCGAGCACCTCAACGACCCCCACGACATAGTGGTCTTCCACCCACTCCGACAGccccaagGCCCAGACAGCTGTAACTTGGGCAGTGAGGCCAACGGTGGCTGTGAGTACCTGTGTCTCAAAGCCCCCCAGATCACAGAGCACTCTCCCAAGTACACCTGCGCCTGCCCCACAGGACAGGACCTGGGGCCCGACATGCGGGGCTGTGTGCcagCAAATGAGACTATTACCACACCGTCGCCATTCCCCACCGGCTCGGTAGCCATCATCACGGCAAGTATCGAGGAGGACAAAGAGGACTCCCATTCCACTTCTGGGTTGTCCCAGGCAGATGCCGGGGTCCGCCACCTCACCCCCGCCCCCTCCAGCACCCCAGAACTCCTCCTCATCGCCAAACCTGGGGCAGAGGTGAAGGAGAAAGATGGCCGGCGTTTGGatcacaccacctccaccacagtAGGGTCTGGGGACACTAATGTCATCAAGGAGGACAGCAATCTCTCTCACCACTCTGGAAGTGAGCATTTTCTCCTGGGGGAGAACCTGACAGTGGCAGTTCTGGGAGTAGTCATCCCTATAGTTCCTATTGTTGCCACAGTGGTCTTCGGTCTGCTCTGCACTGGCGTCTACCTGGTTTGGCGGAACTATCGTGTAAACTCTACCAAGAGTATGAACTTTGACAACCCCGTTTACCGCAAGACCACAGGCGAGGGCGAAGAGGACGAGATTCACATCGGACGGACGGACAGTGGCATGAGCGGCCAGCACGGGCATCACCCGTACCCAGTTGGAGTGGGGTGTGGCGTAGTCGGCGGGGGCGGAAATACATGCCCTCAGTTTATCGCTCTACCACTGGGTGGCAGTATGCCCGACCCGGGGACTCACTGGTACACGGAGCAGCCTATGCTGTCCACTACGGCTAAGTGAGGTGGGCAAAGTGGGAGGATGGAGACTAGACTAAATGGCTGCTCAGGGGGTTAATTTTCAAGATGGCCGCTGCTCaggcgcacacacatacacacatgcacacacacacagtaccaagGTCAGGGGTCACTCACTGAGTCTGTTCAAGGGATGGACATATGATGTTCTCGTCACATCCAGCCATTCGTGACCATGCTGTGCCAATTCATCACACAAAATTGACAGTTTGACACTTTCTAAGGTTTATTTATGTTATGTCAGAGTTGGGGTTGGTTCGGTTTGAATTCCTGTCAATTCAGTTCTTGAATTCTCTATGAATCAATTGAATTTAGATCACTGGACTTGAGTTGCAGCTGAGTCGACACCAATTCTGGATGTTTTTCATCCACTTTTGATCAATTTCAGCAGTATTGAGCTGTGCTATCTGTCTCACGTTTAAGGCCGAGAGGAGTTCCAAGAGAGTCATTTTGCCCTTGACTTTATAAATCTATGCTCTCCATGTTATATCCCTGGTGGATCCTCATTGTCTGGCTTTTTAGGGGGAGGTTTAAAATGAGGGCAGCACCTTAGTTGATGGGACAATCTGTATAGTTTTAAGCTATTAATTCAACACGTTTTATCGTTCACCTCACGATTATTAAAGATGTCATGGTGTTTTGTTATTCTGGTCAGGGCTTTTGTCTTGGAGTGGAGTGAAAGGTTTgagagaggttgttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtacttaggTGTGTGTACCTACTCTCTACAGTTCTTCTTTGACGTTATCCTTATTGAACCTAAAAGGCTACAAGAGGACAAGCAGGGCAAAGGGTCGTTGAGAAAGTTTTGTGGCAGCATTGGGAAAGTTTTGTGGCAGCTTTGGGAAAGTTTTGTGGCAGCTTTGGGAAAGTTTTGTGGCAGCTTTGGGATCCAAAAGAAAGCGTAAGGCTTAGCGAGAGAAGCCTTTGTAGTAATTAACGGTAGGCTGGATTTTTAGGCCCAGTGAAGACGTCTAGCTAGTGGCTAACAGTATCCGTGTTAAGGCTTTTGTGTGTGTCTACGACATGTCTCTAGACAATTAGAATGCGGCAAGTATTGCTGGTCAAAACTACATTTCATTTATACTCAGGCTGACTGTCTGTAGATCATCACTACGGTGAAAACGGTTCTACTTTGACCCTGCCACAGTGTCCATTGTCACGAGTAGATAGAGCCACTGGCGCTACATAACCATGACAATAAATTCCAAACGCCTGAttgacagctagctagcttgcattAGCATACAGAATATACATACATTTAATATTATGGACGACTGTATTTTTTGTAGAGCATATGTTAAGTTTAGTTATGGAGCACCCTTGTCTCTTTGCCGTTGGGAGTGAAGACTCCAAAgattctcaacaacaaaaaaatcctggTTAGCAATTGGTAGCCAGCTTAATTCAACCTGTAATTAAACTGACTTTAGCTGAGCTGGCTATCTAGTCAATCTAATTCCAGACTAGGTGTGAGTATGAGAAATCAAACAAACAAATATTAATCTCTTCTCAGGAGAAAGGCGGCTTCCTCCTTGTTTTCTCATTTATACGAGGGATAGAATGTAAGTCACTATCACGTGACAATATAATGCTCATGATATCAACTTTGTGTTTATACAAACAAACCACGTTTGTAAATATAATTTAGATGATATCACTGCAACAACATCTCAATAGATGGACTAAAAACCAGCCTTTAGCTATGATAATGAGAACAGAGTTGGCTAGAGCAGAATTAGCTAGCTAGAAGGCTAATGTTTAACTAGGCTAAAGCAGAACCAGATATGGCTAATGGCTACCAGGCTAATGCTTAGCTAACAGTTTGAGAAAAGCAATTAGAGGGTTGTTGTACTGAGGTGAATAATTTAGGCtattattctcctctcctctttttagCTGTTTTCCATGGCCACAGGTGAATTTGTCATCTGTTATTGTTgattttatttcccctttatcTACTCACTTTgtcagtacaacacacacacagtcactcacccTCAAGAGATCACACACAGGGGTATTCTATTagtatccccattagctgttgagatagcagcagctactattcctggggtccacacagaacatgaagcatgacataatacagaacattaatagacaagaacagctcaagggcAGAACTCCATAAATTGGACGGAActacagaaacattaacttgcaCTAGAAGATACTATTTACACACAGCATACATAATCACTCGCCCTTCACAAACACAAGCATTACACTCAccctaaagacagacagacacacacacacacacacacacacaccagacacacacacacaccagacacgtGAACACAAACATCCATGCCCCTGTCTTCATTCTTTGAAAAGATGTCAATGTGAGCTTTCATATAGGAGGCACTCAGTCAGTGGGAGGTCGACTGCTGACAAAAGGCCCCTGTCAGCCATTTTGGTGGCCGGCATCACTGTGGCAGATTTTTTTTCCTgcttcctaaatggcaccctattccctttttagtacactactctttttttatttttttaccaggacccatacggctctggtcaaaagtagtgcactatgtagggaaaaggatgtcatttgggacacaggcttaAACAGTAATGAGGTTCAGTCAGGTTGGATTCTCCTGTCAGTAAACACAACTGTCTTTTGTCCACCTCTCCTTTTGTCCTGTCCCGCACATTGGTGATCCGCTCAGAAAATAGACATTTCTGAGTCCCCTCCATTGTAGTATTGTCGATCACGGTGATGGGATGAAATAGGATTTGGTAAGAGCCAGATTGAATaggtgtgtgtagtgggggtggatatgtgtgtgtgcctgtgtgtgtgtttatgcgtgtgtgtgagtaTTTGTGTTCATTTCACAGCCATATTGGAAACGTTTTGTACACTTTTTGTTGCCCAGCCCTCTCAGAATGCCTTCTGTATTGTGTGTGTTGCATGAGAGAACGTGTGCGTactcgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgcatgtttgTCAGAATGAGTGCATgtgagtacagtatgtatgttCTTGGGACCGGAGTAGCTGCGAGGGTGTTTTTTGAAATCATGATTTgtaaatacattttcatattgCAAACCAGTTTTTGATAAAGTATTATACAATTCTGTAAAAGAAAAATATGTACATAAGATTTTAGATGAGAATAAAGTGTTGATGACAGCATATTAATTTATTTGTATAAAAGAGCACTGCATTCCCTGATTGTACGAAATATGAATTATCCGCCCAAGTGTTTTGTGTTGTTACTTGGTCTTGCTTCATTTGATAACCTTTTCTCTTTCCAAATGTGTACTTCTTTATCAGTACAAGTAATACAACGTGGTTCCTCCTCAATATCTCCCCGTATCTCATTGTTTCTCAAGCCCAGTGTTTTATAATATGAACGATTTGTTTTCTggtgcctttttttctctctctttgttgtaCTGCTGTTTTGCTGTGGGAGATGGCTTCTTTTCAAGCAACTTCTGGAACATGCAAATAAGAACATCTGCACCCAGAATTGACAAAACCGGTCTCGCTCACCTTTTTATTATTTCATGAAGTTGTTCTTAAATATCTATATATTGGTATATAAAACTTTATTGCAAATCTCTT

Function


NR:

description
low-density lipoprotein receptor-related protein 8-like

GO: NA

KEGG:

id description
K20052 LRP8, APOER2; low-density lipoprotein receptor-related protein 8

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036985560.1 False 6888 mRNA 0.49 18 50146364 50336325
XM_036985561.1 False 6759 mRNA 0.49 17 50146364 50336325
XR_005052891.1 True 6850 mRNA 0.49 19 50146364 50336325

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC110530014 LOC107558802 coding upstream 74373 50043342 ~ 50071991 (+)
LOC110530925 LOC106568799 coding upstream 107880 50015178 ~ 50038484 (+)
LOC110529118 LOC106598598 coding upstream 138550 50004981 ~ 50007814 (+)
LOC118965615 NA coding upstream 291929 49853027 ~ 49854435 (+)
LOC110530010 LOC106568707 coding upstream 299936 49775515 ~ 49846428 (+)
LOC110530020 LOC106568719 coding downstream 43446 50379771 ~ 50383088 (+)
LOC110530019 LOC106568718 coding downstream 47971 50384296 ~ 50397007 (+)
LOC110530022 LOC106568721 coding downstream 98610 50434935 ~ 50441957 (+)
LOC110530023 LOC106568722 coding downstream 107379 50443704 ~ 50578861 (+)
LOC110530024 LOC106568723 coding downstream 271076 50607401 ~ 50641183 (+)
G717779 NA non-coding upstream 210958 49935196 ~ 49935406 (+)
G717768 NA non-coding upstream 225267 49920708 ~ 49921097 (+)
G717767 NA non-coding upstream 225915 49920234 ~ 49920449 (+)
G717765 NA non-coding upstream 227841 49918307 ~ 49918523 (+)
G717764 NA non-coding upstream 228733 49917375 ~ 49917631 (+)
G718044 NA non-coding downstream 78375 50414700 ~ 50416134 (+)
G718053 LOC106568720 non-coding downstream 94597 50430922 ~ 50434684 (+)
G718060 LOC106568726 non-coding downstream 337538 50673863 ~ 50685225 (+)
G718164 LOC106568727 non-coding downstream 354836 50691161 ~ 50692973 (+)
G718200 NA non-coding downstream 399057 50735382 ~ 50735600 (+)
G716993 LOC100136012 other upstream 599279 49546212 ~ 49547085 (+)
G716862 NA other upstream 812592 49332841 ~ 49333772 (+)
G716133 NA other upstream 1385624 48760343 ~ 48760740 (+)
G716035 LOC106581475 other upstream 1602200 48537743 ~ 48544164 (+)
G721689 LOC106583873 other downstream 3040907 53377232 ~ 53377705 (+)
mrpl34 mrpl34 other downstream 3334071 53670348 ~ 53674103 (+)
rps28 NA other downstream 3589892 53926018 ~ 53927959 (+)

Expression



Co-expression Network