atg9b (LOC106569346)


Basic Information

Item Value
gene id atg9b
gene name LOC106569346
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 71659108 ~ 71682417 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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>TU843297
ATGTAAATCTAACTTGTTTTCCTTAATGTATGTCTCATACAACATTGAACAAAactgattttaaaaaatatatatttttgttgaatTGCCTTTGACAAAACATAAAGTAACTATCCATATGCAACTTTGAAATGAAACAATCCTTCATGTTGCTGGTGTCATCAGTACAGTACAACTCAAAGGAGGGCACACTTGTCTGCATGTAAATGCTGAATGTAACCCAGCCATCATCCCATGAAATACGTGGCATGATGTATCATTGGTACTGTAGCCAGAACAGTTTATTGAAACATTATACTAAAGCTCCATTACTGCTACTGTATCCATGTCCCACTGATACAATAACCTAGTCCACACCTATACGTATATCTCTGTATCCTCtacaacattttagtcatttagcagctgctcttatctagagcgacttacagtagtgagtgtatacatttttgttttggtCCCCcggtgggaatcaaacccacaaccctggcattgcaagcaccatgctctaccaactcagCCAAACAGGACCACTATTGTAAGACTAGAGAGTATATGTGTTTGATGACTTTTTCCCTTCATTTAGTTTTTTTCATTTGTGTTTTGAAGTGGTGTGGATGTAGACATCAACCTAACTATGCTAAGCTAACGTTGACTCAAAAGTTTTGCActgattgaaaataaaaattataTTGCTAGAGACCTGCATCAAACTATATTTTCGATCCAGCCGAGGTCTCAAAGGAACAGTGAGTGGAACTCCCTTCCTGAATGGCCTCTCTCACTATATATAATAACCATATGTAGGATTGTTATCATCCATACCGTGGGCCTATCACAGACCTGGTTGTTGTTACCTCTGGTCAGCAAAAGTTCACCAATTAGTGGGGAATGTCTGTCAATGTTTTAAGTAACATTATAGGCCTAGTCAATGCCACATATGGTATTGCTGTTGGTGTTCCATTTGTTTTACTGATGTAATAAGTTTTAGGGGAGATGTGGTAGTTCATGAGTCTTGCCAGTTTCCATAGCCTAGATTGCACTGCCTCTCCCtatctttttttatttgattattttgcTTTATTTTGAGCAGTGCCTTAGGGTTAGCTTTAGTTCATATTAGAAACCATTGAAACCGTCAGAGCTCATTTTACTTTGTATTTTAGCAGCACATAATGTACAGTATTTCTTTTGGCAGGATTGTCATGTTTTGGCACCAAGTATACAGTGGGACTTGTATTCTAATATTGTTGATGAGTCCTGAGTAACATGAACTACAACAGACTGATATTTGACATAAAAGTAGTCAAATCACTTTCACCTGATGACAGAATTAATCTGATCAAAGTGTTTCGTTCTGTACTGTCTGCCTCCCCAGTCCAAAATAATCAGTTGGGGAGGGGAAATGTTCTATACCCTTTTCATTTATGTTTAATTATTATTTAATTCCATCCTTGAGGCTCCCCATTCAATATCATTGCTTCTTATCCACTACAAACCAGTCTCCcccaaaaaaacatgttgactggTACAAGGTGCTACGTTTTCATATTCTTAGTGTTGAATAGATTTTGAGCCATCTATTCTTTGTTGCTTAGGTTTgttctttttgtttgttttgtttaatttaAGAAACACTAGCTGAGAATGAACAATGCCAAAATAACTTGTTTTCAGCAAAGCTTTATCATAcacattttatttgttttctGTAACTGAATAGGCAAAGTAATTCTTATTGTGTGTATTTAATCATTAAAGTGTGTCCCAAATTCTAATGTACTTGATttgaaataaaacatgtaata

Function

NR:

description
PREDICTED: autophagy-related protein 9B

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_036986126.1 False 6113 mRNA 0.45 14 71660063 71682298
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TU843296 False 1929 lncRNA 0.36 1 71680489 71682417
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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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wnt9a wnt9a coding downstream 225261 71907559 ~ 71934937 (+)
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LOC110530494 LOC106569334 coding downstream 464055 72146353 ~ 72155430 (+)
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LOC110530502 LOC106569321 other downstream 952586 72634238 ~ 72714065 (+)
LOC110530507 LOC106569317 other downstream 1178110 72779485 ~ 72872336 (+)
G744696 NA other downstream 1179958 72862256 ~ 72864703 (+)

Expression


Co-expression Network