LOC118965575


Basic Information

Item Value
gene id LOC118965575
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 85384905 ~ 85387277 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036986607.1
taaacaactGAATTTGCAGTGTATTCAATGTCATTTCAGTCAGGCTTTATTTCGCTTTAGAGTATTACAGAGATGGGTGGAGGTCAGGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGCGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGTGATAACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGATGTCAGGCAGCGATGGCAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGCGATGGCAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGATGGAGGTCAAGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGCGATGGCAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGGCAGTGGGAGTAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGATCAAGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGATCAAGCAGAGATGACAGTGGTTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGTGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGATGGAGGTCAAGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAGGCAGCGATGGCAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGGCAGTGGGAGTAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGATCAAGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGATCAAGCAGAGATGACAGTGGTTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGATGGAGGTCAAGCAGAGATGACAGTGGTTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGATCAAGCAGAGATGACAGTGGGTGGATGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGATGGAGGTCAAGCAGAGATGACAGTGGTTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGGCAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGGCAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTAGGAGGGGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGATATTAGGTAGAGGCATCcgtcaacagactgtgggaggAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGATATTAGGTAGAGGCATCcgtcaacagactgtgggaggAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGATATTAGGTAGAGGCATCcgtcaacagactgt
>XM_036986606.1
taaacaactGAATTTGCAGTGTATTCAATGTCATTTCAGTCAGGCTTTATTTCGCTTTAGAGTATTACAGAGATGGGTGGAGGTCAGGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGCGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGTGATAACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGATGTCAGGCAGCGATGGCAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGCGATGGCAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGATGGAGGTCAAGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGCGATGGCAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGGCAGTGGGAGTAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGATCAAGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGATCAAGCAGAGATGACAGTGGTTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGTGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGATGGAGGTCAAGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAGGCAGCGATGGCAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGGCAGTGGGAGTAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGATCAAGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGATCAAGCAGAGATGACAGTGGTTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGATGGAGGTCAAGCAGAGATGACAGTGGTTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGATCAAGCAGAGATGACAGTGGGTGGATGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGATGGAGGTCAAGCAGAGATGACAGTGGTTGGAGGTCAAGCAGAGATGGCAGTGGGTGGAGGTCAAGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGGCAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGGCAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTAGGAGGGGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGATATTAGGTAGAGGCATCcgtcaacagactgtgggaggAGGTCAGGCAGAGATGACAGTGGGAGGAGGTCAGGCAGATATTAGGTAGAGGCATCcgtcaacagactgtgggaggAGGTCAGGCAGATATTAGGTAGAGGCATCcgtcaacagactgtggga

Function

NR:

description
PREDICTED: mucin-13 isoform X2

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036986607.1 False 2217 mRNA 0.57 3 85384905 85387224
XM_036986606.1 True 2221 mRNA 0.57 4 85384905 85387277

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118965574 NA coding upstream 67766 85315909 ~ 85317139 (+)
LOC118965573 NA coding upstream 94896 85288779 ~ 85290009 (+)
LOC118965572 NA coding upstream 121506 85256782 ~ 85264093 (+)
xirp1 LOC106569803 coding upstream 150459 85208608 ~ 85234446 (+)
LOC110530843 LOC106569799 coding upstream 240528 85124558 ~ 85144377 (+)
hhatla hhatl coding downstream 77125 85464402 ~ 85505892 (+)
klhl40a klhl40 coding downstream 124105 85511382 ~ 85525239 (+)
vipr1a LOC106569811 coding downstream 144882 85532159 ~ 85638054 (+)
LOC110530830 LOC106583328 coding downstream 230327 85617604 ~ 85618327 (+)
LOC110530829 mul1b coding downstream 271323 85658600 ~ 85663057 (+)
G756454 NA non-coding upstream 24698 85359904 ~ 85360207 (+)
G756448 NA non-coding upstream 30630 85354030 ~ 85354275 (+)
G756442 NA non-coding upstream 56288 85328293 ~ 85328617 (+)
G756441 NA non-coding upstream 58536 85325580 ~ 85326369 (+)
G756440 NA non-coding upstream 59572 85325121 ~ 85325333 (+)
G756404 NA non-coding downstream 26158 85413435 ~ 85414616 (+)
G756505 NA non-coding downstream 96320 85483597 ~ 85488866 (+)
G756506 NA non-coding downstream 101973 85489250 ~ 85489859 (+)
G756520 NA non-coding downstream 148152 85535429 ~ 85536085 (+)
G756532 NA non-coding downstream 166147 85553424 ~ 85607980 (+)
G756298 NA other upstream 447161 84936066 ~ 84937744 (+)
G756271 NA other upstream 506826 84876994 ~ 84878079 (+)
G756134 NA other upstream 823014 84558786 ~ 84561891 (+)
G755602 NA other upstream 1076631 84303470 ~ 84308274 (+)
G757472 NA other downstream 564691 85951968 ~ 86028274 (+)
G757663 NA other downstream 730386 86117663 ~ 86117948 (+)
G757754 NA other downstream 843074 86230351 ~ 86231459 (+)
G757902 NA other downstream 1143876 86531153 ~ 86532379 (+)
G758045 NA other downstream 1247507 86634784 ~ 86635460 (+)

Expression


Co-expression Network