LOC118965584 (LOC106592566)


Basic Information

Item Value
gene id LOC118965584
gene name LOC106592566
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 89589339 ~ 89598617 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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Function

NR:

description
PREDICTED: major facilitator superfamily domain-containing protein 12-like isoform X4

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036986729.1 False 3651 mRNA 0.45 7 89589339 89598617
XM_036986730.1 False 3582 mRNA 0.44 6 89589339 89598617
XM_036986731.1 True 3515 mRNA 0.44 5 89589340 89598617

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118965582 st6galnac5 coding downstream 181297 89352710 ~ 89408042 (-)
miga1 miga1 coding downstream 440644 89126468 ~ 89148695 (-)
LOC110530869 LOC106569754 coding downstream 516167 89065258 ~ 89073172 (-)
LOC110530871 dnajb4 coding downstream 528836 88991233 ~ 89060503 (-)
LOC110530883 LOC106569748 coding downstream 617530 88923723 ~ 88971809 (-)
LOC118965585 NA coding upstream 7330 89605947 ~ 89607379 (-)
LOC110530891 LOC106925954 coding upstream 39026 89637643 ~ 89707054 (-)
LOC110530894 LOC106569835 coding upstream 125117 89723665 ~ 89770006 (-)
LOC110530892 LOC106569833 coding upstream 174998 89773615 ~ 89791699 (-)
LOC118965586 NA coding upstream 201845 89800462 ~ 89803937 (-)
G760389 NA non-coding downstream 2904 89584118 ~ 89586435 (-)
G760358 NA non-coding downstream 51547 89537233 ~ 89537792 (-)
G760354 NA non-coding downstream 93334 89458709 ~ 89496005 (-)
G760352 NA non-coding downstream 94166 89461567 ~ 89495173 (-)
G760353 NA non-coding downstream 134884 89452749 ~ 89454455 (-)
G760396 NA non-coding upstream 350 89598967 ~ 89615080 (-)
G760414 NA non-coding upstream 68900 89667517 ~ 89667892 (-)
G760417 NA non-coding upstream 81991 89680608 ~ 89682198 (-)
G760424 NA non-coding upstream 93128 89691745 ~ 89692343 (-)
G760426 NA non-coding upstream 98068 89696685 ~ 89697080 (-)
G760362 NA other downstream 53986 89534623 ~ 89535353 (-)
G760306 NA other downstream 256563 89331281 ~ 89332776 (-)
G760192 LOC106569753 other downstream 486957 89099844 ~ 89102382 (-)
G760182 LOC106569755 other downstream 507994 89079298 ~ 89081345 (-)
G760971 NA other upstream 742195 90340812 ~ 90341303 (-)
G761034 NA other upstream 1051779 90635679 ~ 90652740 (-)
G761176 NA other upstream 1197530 90796147 ~ 90797574 (-)
G761467 NA other upstream 1347862 90946479 ~ 90948106 (-)
G761504 NA other upstream 1457130 91055747 ~ 91111937 (-)

Expression


Co-expression Network