XLOC_026052


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_026052
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 6308693 ~ 6376938 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00052927
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>TCONS_00052929
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Function

GO:

id name namespace
GO:0005737 cytoplasm cellular_component

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00052927 False 6199 lncRNA 0.35 2 6308693 6356411
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TCONS_00052929 True 2728 lncRNA 0.36 3 6350238 6376938

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_026051 BX004785.2 coding downstream 27190 6278752 ~ 6281503 (-)
XLOC_026050 NA coding downstream 68628 6237098 ~ 6240065 (-)
XLOC_026049 NA coding downstream 80547 6220081 ~ 6228146 (-)
XLOC_026048 NA coding downstream 96733 6203736 ~ 6211960 (-)
XLOC_026047 si:ch73-144l3.1 coding downstream 116743 6178347 ~ 6191950 (-)
XLOC_026053 jpt1b coding upstream 3222 6380160 ~ 6417328 (-)
XLOC_026054 sumo2b coding upstream 46336 6423274 ~ 6441619 (-)
XLOC_026055 gga3b coding upstream 113582 6490520 ~ 6519760 (-)
XLOC_026056 NA coding upstream 148760 6525698 ~ 6529154 (-)
XLOC_026057 si:ch1073-209h18.1 coding upstream 176424 6553362 ~ 6555154 (-)
XLOC_026046 NA non-coding downstream 212872 6073491 ~ 6095821 (-)
XLOC_026045 NA non-coding downstream 257617 6046988 ~ 6051076 (-)
XLOC_026058 FP016106.1 non-coding upstream 180022 6556960 ~ 6597195 (-)
XLOC_026064 NA non-coding upstream 673581 7050519 ~ 7077819 (-)
XLOC_026065 NA non-coding upstream 706569 7083507 ~ 7121370 (-)
XLOC_026077 NA non-coding upstream 968172 7345110 ~ 7346494 (-)

Expression


Co-expression Network