XLOC_026058 (FP016106.1)



Basic Information


Item Value
gene id XLOC_026058
gene name FP016106.1
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 6556960 ~ 6597195 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence


>TCONS_00050955
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>TCONS_00050954
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>TCONS_00050956
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Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000098397

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00050955 False 6748 lncRNA 0.37 4 6556960 6595331
TCONS_00050954 False 6621 lncRNA 0.38 5 6556960 6595331
TCONS_00050956 True 386 lncRNA 0.42 6 6563251 6597195

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_026057 si:ch1073-209h18.1 coding downstream 1806 6553362 ~ 6555154 (-)
XLOC_026056 NA coding downstream 27806 6525698 ~ 6529154 (-)
XLOC_026055 gga3b coding downstream 37200 6490520 ~ 6519760 (-)
XLOC_026054 sumo2b coding downstream 115341 6423274 ~ 6441619 (-)
XLOC_026053 jpt1b coding downstream 139632 6380160 ~ 6417328 (-)
XLOC_026059 si:ch73-59f11.3 coding upstream 3099 6600294 ~ 6608342 (-)
XLOC_026060 atg4db coding upstream 95174 6692369 ~ 6719232 (-)
XLOC_026061 mast1b coding upstream 123663 6720858 ~ 6768905 (-)
XLOC_026062 BX000701.1 coding upstream 298360 6895555 ~ 6902975 (-)
XLOC_026063 zgc:113102 coding upstream 395912 6993107 ~ 7106678 (-)
XLOC_026052 NA non-coding downstream 180022 6308693 ~ 6376938 (-)
XLOC_026050 NA non-coding downstream 316895 6237098 ~ 6240065 (-)
XLOC_026049 NA non-coding downstream 328814 6220081 ~ 6228146 (-)
XLOC_026048 NA non-coding downstream 345000 6203736 ~ 6211960 (-)
XLOC_026064 NA non-coding upstream 453324 7050519 ~ 7077819 (-)
XLOC_026065 NA non-coding upstream 486312 7083507 ~ 7121370 (-)
XLOC_026077 NA non-coding upstream 747915 7345110 ~ 7346494 (-)
XLOC_026081 NA non-coding upstream 880608 7477803 ~ 7537078 (-)
XLOC_026082 NA non-coding upstream 882234 7479429 ~ 7493771 (-)

Expression



Co-expression Network