G685215


Basic Information

Item Value
gene id G685215
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 21925117 ~ 21926356 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU780275
gccctaatttatggatttcacatgactgggaatacagatatgcatctgttggtcacagacaccttaaaaaaaAGAGTtgggggtgtggatcagaaaaccagtccatACCTGGTATTGACCACCATTTGCATCATGCAGTGCAAAACATCtctttcgcatagagttgatcaggctgttgattgtggcctgtggaatgttgtcccactcctcttcaatggctgtgtgaagttgctggatattatatagattttttaaaacctttatttaactaggcaagtcagttaagaacaaattcttatttacaacgacggcctaccccggccaaacctggacgatgctgggccaattgtgctccgtcctatcccaatcacggccggatgtgatacagcctggaatcgaaccagggactgtagtgacgcctcttgcactgagatgcagtgtcttagaccgctctgtggttgtgagaccggttggaagTACTTCCAAAATCTCTAAAACGAAATTGGAGGCGTCTTATGGTAGACAAATgtacattcaattatctggcaacagctctggtggacattcctgcggtcagcatgccaattgcatgcttcctcaaaagttgagacgtctgtggcattgtgatgtgACAAAACAGAACATTTTAGAGTTGTCCCCAGCacgaggtgcacctgtgtaatgatcatgtttaattagcttcttgatatgccacacctgtcaggtagatggattatcttggcaaaggataaatgctcactatcaggaatgtaaacaaatttgtgcacaaaattcaCATTTTTGTGCGTGTGGAAAATGTCGGGGATCTTTTTATTtccgctcatgaaacatgggaccaacacattacatgttgcgtttatatttttgttcagtatagtagagtTAGATTGGTAGTACTGACTAAAATATCGTTGACCtataacgttaactagctagctatataacgttagctagctaatgaatGCGCTTTACTTTACCAACACTCAGATGACTGTCATCGTGGTCTGATAAATATTATTGTTATCTACGTAAGCTTACCTCAATATCCAGCTTAAGTCAAATATAGATTAATGTTGGTAATTTTTAGGTAGATAACAGCACAAACTACATAAAATTCTCGCTTGTTCAAAATATGTGTAATTT
>TU780277
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>TU780265
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>TU780268
TCGGGGATCTTTTTATTtccgctcatgaaacatgggaccaacacattacatgttgcgtttatatttttgttcagtatagtagagtTAGATTGGTAGTACTGACTAAAATATCGTTGACCtataacgttaactagctagctatataacgttagctagctaatgaatGCGCTTTACTTTACCAACACTCAGATGACTGTCATCGTGGTCTGATAAATATTATTGTTATCTACGTAAGCTTACCTCAATATCCAGCTTAAGTCAAATATAGATTAATGTTGGTAATTTTTAGGTAGATAACAGCACAAACTACATAAAATTCTCGCTTGTTCAAAATATGTGTAATTT

Function

NR:

description
CREB-binding protein-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU780275 False 1164 TUCP 0.41 1 21925117 21926280
TU780277 False 1240 TUCP 0.41 1 21925117 21926356
TU780265 False 946 TUCP 0.41 1 21925284 21926229
TU780268 True 345 lncRNA 0.33 1 21925936 21926280

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110529604 NA coding upstream 14507 21905011 ~ 21912494 (+)
LOC110529601 LOC106571541 coding upstream 46348 21876894 ~ 21879588 (+)
LOC110529600 LOC106571396 coding upstream 49192 21874399 ~ 21876744 (+)
LOC110529597 LOC106571394 coding upstream 109246 21789216 ~ 21816690 (+)
LOC110529596 LOC106571393 coding upstream 143222 21779870 ~ 21782714 (+)
LOC110529606 exoc8 coding downstream 730 21927010 ~ 21929650 (+)
LOC110529607 LOC106571401 coding downstream 4762 21931042 ~ 21958665 (+)
gnpat LOC106571402 coding downstream 34721 21961001 ~ 21970793 (+)
LOC118965501 NA coding downstream 362006 22288286 ~ 22292263 (+)
LOC110529613 LOC106571406 coding downstream 392213 22318493 ~ 22403025 (+)
G685212 NA non-coding upstream 12112 21913573 ~ 21913824 (+)
G685183 LOC106571395 non-coding upstream 61285 21864060 ~ 21864651 (+)
G685164 NA non-coding upstream 100651 21824969 ~ 21825285 (+)
G685163 NA non-coding upstream 101163 21824556 ~ 21824773 (+)
G685365 NA non-coding downstream 234343 22160623 ~ 22161261 (+)
G685415 NA non-coding downstream 306343 22232623 ~ 22232848 (+)
G685495 NA non-coding downstream 427252 22353532 ~ 22354430 (+)
LOC110529616 LOC106586086 non-coding downstream 493510 22419790 ~ 22433035 (+)
LOC110529590 LOC106571388 other upstream 501372 21406192 ~ 21424564 (+)
G684314 NA other upstream 847065 21077070 ~ 21078871 (+)
G683845 NA other upstream 1218565 20707058 ~ 20707371 (+)
G683757 LOC106571373 other upstream 1293037 20626950 ~ 20632899 (+)
G683669 NA other upstream 1362502 20562875 ~ 20563434 (+)
G685311 NA other downstream 157594 22083874 ~ 22084224 (+)
G685469 NA other downstream 520491 22446771 ~ 22448073 (+)
G685551 NA other downstream 554043 22480323 ~ 22482139 (+)
G686448 LOC106571417 other downstream 1020221 22946501 ~ 22972836 (+)

Expression


Co-expression Network