G694939


Basic Information

Item Value
gene id G694939
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 30154300 ~ 30159354 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU791047
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>TU791048
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>TU791045
TTTTATTTGGGTTTGCAAGGTATAAGATGTAATGTTTCTTTAGGCCTGCTGCTAGTTACTTGAAATGAGACAAATAATCATGACAAAACATGGTTCGAAAAATGTAAttcactgacagagagacagctaaTGAAACACTAGAATCCTGAGCAGGCACATTGACGTTTACAGTAGCTGGCTAGGCTAGTCAAACTAACATTGGCTAACTTTCAATAAATTGGTAAAATGGTCAACGGAGTTGCGTCTTCGTACGATCAAGACAATTCATATTGCATGCTGCATATTTCAAGTGCACTCGAAAACATATTTATCTTTTTCAGTCTTTGGGAGttcatcacacacagacagacagcagcttgAGTTTTCACCAGGCTCTGTTTACATCTTAGGAGCAGGCCATTGGCTGCATTGATCACAAGGGGTATGTACAGGAGTTCTGATTGGTTCCAAGTTTAGCAGTTCGGTGTTGAAATGTACATTTTTATGATCAAATGTGCAAGAATTGAAGGCGCTAACAAATGTTATAGCCATAAGAATGTTTTACTGTCATAAACAAAAAATCAGCTCCTCTCTCGATTGGGATTGATCAACTTCATGTTCTTTGGCTTTGACCCCCCCAATCTATTATACCGATTTATGACTTCCTCTTGGCACATACTGTAACAAAAAAGTGGATTAAATGTTTAGAAGCGGAATATCTGATTATTCTTTTGCTTCTTTGCCAGGCCTTGATTTGGAGTGAAAGCCGGATGTGACTTTATTTACTCGACTAGGCTTATGCATTGAATTATGATGATGACTCACAGAAACAGTATGTTAATCATACTGTATCCTAATTCACTTCTACCCAATAGCCGCATGGGAGCTCTCATAAGCCATTGAGATAATGCACAACTCCCACCTTTTCTCTCAGCTCTCTGCGCTCACCCTCATTCGCACATGCTTCATAATGGGATTGTGATTGATATACTTATTGTTGCAGCAATTTACTCCTATTCACATAATGACTGAGGTTTTACTAATCGAATGAATAAGCCAGTCTTTCTACGCCCGTCATCACCTCATGTGCATCTGTCTGGTCTAATTCAAGAGCCTTTGTAAGACTGTTTACCCCGGACAAGAATTAACCACACCAGACTCAAAATAGCCTATCTAGCTCTAGCATGTCAGCACCTTTTAACATTCTTGTTGTTACACGTGCAGGGACATTAGTTTCACAACCCCATGGCCCCAATAGGAAGAAAATCTCCAGTCTCTAGCTTTTCAACACCTCATCTCTATTTCGTCATATCTCAAGTCATCTGTATTTATGTTAGCTATATGTGTTTATCCAGTGTGGCGGCAGTGTTCTTGGGAATGGGCATAAAGGGAATAGTGAGTGGGCAGCCACTTAACACTCAACTCCAGCTAGGAACTCCACAAAGAGCTATTGTGACTACATGTGATTTGACAGGAGCTTTGAATAACGCAGTGAGTCACCATCTCTTCTCACACCTCCTGTTTGCTAGGCAGCGGTGAAGAggctccctcaccctctctctgcctccctcctgaGGGACAGTAGCCAACTACTAGCCTCGGCTCCCAGGTCTCGCTCCTGTTGGTGAAAGCCTGGTAGAGGCTAGCCAACTACTGTTCTCTCTGTGATAAAGTTAGTCCCAACGGGACAACATACAAACAAGACCACCAAACAAGATAATTTCAGGCTTATCCATATTTTTTCTGTCATATTCTTGCCAGTACTCTACAGTTAGTTGTAATTTCTTTGTCAACAGTATAGTCACCCAATGATACATTGGTTgtttcaaaatggatgaaattacaAAGTAGCAAAAACAATCTGCTAGTGACAATAAGTAGCAGAGTTGTATCATTTTCTCAATAATATACTGTACCACTGTTTCAAATCGTGACATGAAATTAGATCACCATTTGGTACAAAAATATTAGGTCACATTAATTTGCTGACTCATACTGTGGGCTATGCTGTATTCAGACCGCCACACCTGTTATACTGCTTCTCCACTGTAGTGCGTTATTAGAGGTAACAGGGAAGACATGATAAATTGGCTTTTTCTTTTCTCTACGGCTTTTCGGAATAACTAGCTGGGTATTGAGACATTCAGCACGAAAGCTCGCTGTGATGTAAATCTGTAGGAGTCTGTCTCACTAGCACCATGTATAATTTGAGCATCTTCTTCGGTGCGTTCAACAAGGCGTGTGAAGAGGCGTATGTCGCCCCTGCTCCAACCCAATCCATAATGTAGACTGTGATCTGAACagttctgctcttctctctctctctctctctctctctctctctctgctcattaCTGCTTTCTTTCCCCCAAAACTGGCTCTCCTTTTCACAGATCTGTCCATTTCTACTTCTCCGTTTTCTCTTTCACCCAACCGGCCATTTTGTTTTCTTACAGATCCCTTTCtcacttgtctctctctttctctcattccagtTTCAGAATAGAACGAGAACATAACACCTCTGTCGTGGAAAGAATGAGAAAAAAGGCCCTGAAATAACCTTAGAGAGAGACTTGTTTTTCATGGCATTAATATGAGCATGCTGGCCAGGTCCAGATAGATATGGACAAAAGAGTGATACTTCATTGTTAGAGTCCGTATGCTGCTGCCTTATGGTGCTTCCACATAGTGTGGTGAAACAGCAAGATAACAGCCCTCTGATAATACGCTCTAAATTGGAATCTCGAAAGAATAGaattctgtttttcattttggaTAGAATAAATAGATATCCATTAGTATGTAATGGCGCAGTGCTGTGCTGGGTGTTATTGTCCATTGCACTATGTCTCAAACATAACAGATAACAAGTTAGAGGCGGCAGTGCAATGGAAAACCCATTACAGCTGATGAACATAACAAGTCTGTAGCCATAACCACTCAGACAGAAGCATGATATTTAGACAGCTGAATGTGGCAAACAGAAACCCTGTCTCTAAAAGTCTTGCCTGCCTTTTCATAAGGCTGTCTCCCCTTATAGATCGGTTGCGGTTTCTTACACATAGTGGAAATTCAGTATTTTTCTCAGAAGGCTACTTCCCCTCTAGGTGTTTTCTCTGAAAAGCAGGCGAGCGGTGGGTCTTCTTGATCAAGATGACAGTATAGGGTGTTTGTAGTCGTGGTGATGAGCAGTTTGTTGGCTAGCTGTTATTCGCTAGTGATATGAAGAATACCATAGGGTAGTTTGAAACCACTCAGCTACAATGTCTTTGGGTAGCTTTCTGTATTCTGTAGTGTCACCATGGAAACTGCCTCAGTAACTAACCACCAGATTCCAGCAGTAGCTACAGTTGGTTGTGATCCAGATGTGGGTGAAGGAGACACGTGCACACCAACACACTCATGTACGCACGCACATAGACACTGCCTGATGAACCAGCATGCATCAGAGAAGAATGGGTGGCGGCAGGCAGAGTTCTCTTACAGTGGAACCTCGTTGCGGTATAGGTTGGTACTTCAGGTCAATTATTCTCCTGTGATGGACAGCTTGATTAAGTAGGGCAGACGTATTGTATTTCATTGTCCCTACAGTTATGAAACGGCAAACTTCCTGCACACTGAATGCCAATGCACTTCCTTTCCCTTCGCAGCTTGATTGGATGTGCGGGGTGTACGTGACATATTCTGAACTGATGTGGTCTGGCCAGGCTTTAGTCCATGGGGTCAATTATTCTCCTGGAATTGAGTTGGGTATTGTACATTTCTCTATTTGTTCAATTAAAACCAATGCATTTTTAGAGGAAGTCCTGATTTCTTGTGACTGTCTCTCTGGCCAGTCAATCAGTCTGACTTATATGTATACGTAGGTGTAGGCCTATCTATCCACGCTGGTCTCTGCCAGGCGGTTGTTCATGATGCCCAGGGCGCCCACCCCTCCGG
>TU791050
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU791047 False 4115 lncRNA 0.43 1 30154300 30158414
TU791048 False 4012 lncRNA 0.43 1 30154300 30158311
TU791045 False 3921 lncRNA 0.42 1 30154391 30158311
TU791050 True 3771 lncRNA 0.41 1 30155584 30159354

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC118965505 NA coding downstream 114289 30038581 ~ 30040011 (-)
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LOC110529761 cep128 coding downstream 215969 29890555 ~ 29938331 (-)
LOC110529760 LOC106571680 coding downstream 688856 29460990 ~ 29465444 (-)
LOC110529769 LOC106571671 coding upstream 57654 30217008 ~ 30227240 (-)
LOC100135953 LOC100135953 coding upstream 84150 30243504 ~ 30251391 (-)
LOC110529225 LOC106571669 coding upstream 104231 30263585 ~ 30292341 (-)
LOC110529226 gphn coding upstream 133097 30292451 ~ 30419612 (-)
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G694932 NA non-coding downstream 9258 30144755 ~ 30145042 (-)
G694931 NA non-coding downstream 10909 30143103 ~ 30143391 (-)
G694928 NA non-coding downstream 13463 30140509 ~ 30140837 (-)
G694927 NA non-coding downstream 16317 30137741 ~ 30137983 (-)
G695092 NA non-coding upstream 15650 30175004 ~ 30175377 (-)
G695099 NA non-coding upstream 27118 30186472 ~ 30187500 (-)
G695102 rbm25 non-coding upstream 68787 30228141 ~ 30233037 (-)
G695100 NA non-coding upstream 92127 30251481 ~ 30252854 (-)
G694858 LOC105017690 other downstream 92132 30001763 ~ 30062168 (-)
G693665 NA other downstream 1195468 28958395 ~ 28958832 (-)
G693383 btbd7 other downstream 1559869 28593341 ~ 28594431 (-)
si:dkey-85n7.8 NA other downstream 1672402 28478817 ~ 28481944 (-)
G692859 NA other downstream 2038252 28115736 ~ 28116048 (-)
G696068 NA other upstream 687548 30846902 ~ 30847209 (-)
G696073 NA other upstream 695753 30855107 ~ 30855407 (-)
G696499 NA other upstream 1318000 31477354 ~ 31478027 (-)
LOC110529793 LOC106571728 other upstream 1498372 31657632 ~ 31703525 (-)
LOC110529804 ypel5 other upstream 2055132 32214451 ~ 32217572 (-)

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