XLOC_026164


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_026164
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 11576654 ~ 11580720 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00052963
ccgaaataaaacaaataagactttctccagaagaaaaaatattgtcaaacatgctgtaaaaatttccttgctctgttaaacatcatttgggaaatataaaacaaaataattcaaagggggcgaataattctgacttcaactgtatatatatatatttttgtatatatgcTAATAGTTCAAAATTCTTGACAAACTgcacaaataaatatttgtgaaaTTGAATCTAGCAATTTCTGTGGGAACAATTAGTTTCTTACTTAAAAGAATAGGATTAGCGGCGTTGAAACAATAACCCAGCTGAAATGAGCACACAGAGACGCATGGAGAGTTATTGTTACTGCTTTCATTGGTGAACACTTCAGAAACAGCATTATTCAATATCCGACACATGTAGTCAGTATAACACCAGCACCAAAAAAACACCAGAATGATGTGTGACGAGGACATCGGATGAGGTTTCGCAGTTGGATCTGAAAAGGCCAGAGTTATGTGCTAAAACGGGATGTAGAAAGAGTTTACAAAAGTTCATCCGTGCAGTCCCACAGTTCATCCCGAAATCACCAGTCAGAATTACAAAAAGTTCAAATGCTAAAACCTGAACACGAGATCGCCTCTCTGAGTGAATATACCTCTCAGTGTATGAAGGTGAGAAAATGGGTagaaaatagggctgcacgatatatggtttcagcatcgatatcgcaatgtgtgcatccacaatagcCAAATCGCCAGATATGCGacgttgagtctggattatagttgacagTAGGGGTggacggtttaccggtactatagTAGTATCGTGATACCTTGGCTCCGAAATACTGGCaatgccactgtagtttgtaaatggtAGTTTAGCCATAATGTCTTTTTTCTACAATACATAATGTGGCATGTGGATAAGTCACGATaatgctcacacgtttgtgcaacaataaaccattttatttgaatagtctgtggagccctttaacGTTGCAAAAGTGTGTAGAATGTGCGCCTTTTATGGTAGCCTGTTGCACGTTTTTTAATGCTTCAGTTCAAACGCACATCTGAACGCCGAATTCCGCACATTttgtccaatatcgtgcagccttagtAGAAAACGTTCATTATTCTGAGTTTTGAAAAAGATACGAGTCATTTGTACTTGTTTAGTAGCCATATGACGTGTTTTGTGGATCACAGTGACAATATTACGAACAAATCTTGTGCAAAAAACACTTAAATGTGCAGGAGAGCAGCAGTTCAGACCTCCGGGTTTAGCACTTTAAAAAGCTCAGCCGAATGCATTCACAGTGtcagaaacacaacagaaaccaTTGTGAAacgatgatgacgatgatgatttttacactgaaaaaagcgattagttgtctcaactttaaaaacagtgtagaccaattgccttaaaatgattaaagtCTGCAAGAATTGTTCTATTGTTATTCTGAAGGTGTATAAttcatttgctttgttttggtaatcttcaattaaAACCTGAGCATTTGCTTTCGTGTTTGGAGTGTCGGTCCTTCTGTTGACGTCAACCTCAAGGGTTTCCAACTGCATATTAATACCCTCTCTTATTGTTAGTTTGTTATCAGCGAATGATACagaaaagaaagccccgcccctctACTGAATAttcatttcagttggaagtacagcaacataatttaaaaaatctcaGCAACTTTCAGTTTACGCAGACGTTAACAAACTATGCGAATCAAGTTACATCAACTTAAAAGTTGCCTTGAGTTTACTCatgtttttaaatactgtaactaatcgctttttacagtgtagtgggTGAATAAGGTTGAGATGTGCATGATGGGACTGTTTGCTGGCGCCGTTAGCATTTTTTTGTTGTCGGATAACAAATATTTTGCCCATATTAACACTATTGATATGTCAGTCCATGATCAAATCGCATAAAACCATAATACATAATATAGTgaagcattttattattattatttttttttttttttgatttgtgaATTCTTCATTAAGGTTTATAATGGTATTAAAGAATAACTTAAAGAAGAAATCTTTACAAAATATGGAGGGAAATGATCATATAAACAAAATGTATTCTGGTAAGCCTTTTTTTCTTATGAGTTTTGAGGGGTCTGTTTAATACCGACTAATACAGCTTTATTTATGCATTTCTTAGTGAAATTAAGCcagacaaatgacaaaaagaaaaaatatataatattaaaatattaaattacagtatTTGTATGTATActgatgaaaaataaattgaagtTACaagtttttaatcatgtttttatgaTTTTGCGGAGAAATATGGTGTATTTAATATCATTTATTtcgtttttttaaatgatttttgaacGACTAATAGTTTTATACACATTACCCATTTTTGACTGTTATTAAACAAGACAAATGACAgaaagaatatataaatataatacaaaaataacaaattaacaatattattatgatatTCATACTTGTTAGCTATTCTTAATCAAAATATGCATTGAAAATTGTGCTGCATTTGGGAAACATCACAGAGTTCGTCTTTAAGGTGGTTCAGGCGTTTAAAAGCCATCCTGCATATGTAAACGTGGACGCACACAGCAGTGTATGAACGACATTATCCACCAGCATCAATCCCATCAGCCTCTCCACCACATGCTCCAATGCAATATCAAATACAAGTGGTTCTTCCTGTTAGAAAAGTGCCGCATAGTGAAAAAGAATGCTTAGTGAGACACTTTCAAATCCTGCTGAAAGAGCATCAACACGGAGAAGAGCGTAGGAAAAAATACAACTAGACAAAAATCTCCAGTTAAAACCCATTTGAGATACATTAATACATGTAATACAGTGTTGGGTGGAAAAAAGTAATATGTTACAATCTAAAGTTACTATTTTTTAAGTAACTGTTACTTAGTAAATGtagaaaaagtaatttaaaaaaataaaagtaactgttacttagtaaatgtattaatatagttacttttttcaaaaaaaaagcaAGTTACTTGGTAAATGtagtaataaagtaaaaataatgttgttttttttcaaaaacagcaATTGTTACTTATCAAATGTAGTAAAAGTTAGCTTTTTTTCCCAAAAGCATAACTGTTACTTAGTAAATGTGGTAAAGTAActttttcaaaaaagtaactttTACTTATTAAATGTAGTAATAAAGTAATTTCTCACAAAAGTTAAtgtaataataaagtaatgttttttttttcaaaaaagaaaCTGTTTCTCATTAAATGTAGtaaaaaaagtaacttttttccAAAAAAGTAACTGTTACGCATTAAATGTGGTAATAAAGTAActttttcaaaaaagtaactgtTACGCATTAAATGTGGTAATAAAGTAATCTTTTTCAAAAAGTGACTGTTAGTCATTAAATGTAGGAAGTAACCTTTTTCAAAACAGTAACTGTAACTAGTAAATGTAGTAAAAGTTATCTTTTTTTCATTACCACAATTACTAAGTAGcagttacttttttgaaaaatagtaacttttaatacatttcttaAGTTACTTTTTTGAGTGACTTTTTAATACATCTAAGTAACAGCtacctttaagtttttttttaaactgttactTATTAAATGTAGTAAAACTAACTTTTTTCAAAAAAAACTAACTGTTACTTAGTAAATCTAATGATgaagtaacttttaaaaaaagggTAAATGTTACTTATTAAACATAGTAATGAAACTTTTCAAAAAAGTTACTGTTACTTAGTAAATGTAGTAAtaaagtaactttttaaaaaggtaactGTTACTTAGTAAACAGTAATGAAACTTTTCAAAAAAGAAAGCTACTTAGTAAATGTAGTAATAAAGTAActttttcaaaaaagtaactgtTACTTAGTAATTGTAATAATgaag

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00052963 True 3943 lncRNA 0.31 2 11576654 11580720

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_026163 NA coding downstream 66602 11491443 ~ 11510052 (-)
XLOC_026162 AL935044.3 coding downstream 175354 11397269 ~ 11401300 (-)
XLOC_026161 AL935044.1 coding downstream 203219 11371786 ~ 11373435 (-)
XLOC_026160 AL935044.4 coding downstream 214271 11358518 ~ 11362383 (-)
XLOC_026159 AL935044.2 coding downstream 253922 11306799 ~ 11322732 (-)
XLOC_026165 hlfa coding upstream 4578 11585298 ~ 11624694 (-)
XLOC_026166 NA coding upstream 123189 11703909 ~ 11717849 (-)
XLOC_026167 FOXK2 coding upstream 198969 11779689 ~ 11828206 (-)
XLOC_026168 coro7 coding upstream 286981 11867701 ~ 11922713 (-)
XLOC_026169 hmox2b coding upstream 377872 11958592 ~ 11972516 (-)
XLOC_026158 NA non-coding downstream 272726 11298792 ~ 11303928 (-)
XLOC_026157 NA non-coding downstream 322787 11253472 ~ 11253867 (-)
XLOC_026171 NA non-coding upstream 530440 12111160 ~ 12113782 (-)
XLOC_026175 NA non-coding upstream 774812 12355532 ~ 12358516 (-)
XLOC_026177 NA non-coding upstream 1248476 12829196 ~ 12849611 (-)
XLOC_026182 NA non-coding upstream 1550357 13131077 ~ 13131324 (-)

Expression


Co-expression Network