XLOC_002618 (BX248511.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_002618
gene name BX248511.1
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007121.7
NCBI id CM002894.2
chromosome length 45420867
location 9534615 ~ 9538335 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00004867
gaagggacagttcacccaaaatgaaaataatagcatctttggcatcctccacttgtttcaaaatagttatatatttaatttgttccgttgaacacaaactcgtattttttaaagaaatttggtttaaatatggatgtcaatagttactggttactaacattcttcaaaatatctgcttcagtgtttaacagaaattcaaactagtttaaaacacgtggagtaaatagtggcaaaatagtaaactattccgttaaatattttattctgagacttttatttatatgtgtcttgtcttttgtcatatggtccttctagcccagattgtgatggacctggaatgcgaaaccagttactcttaagacaagaaccgaataaagcacagatgtggagggatttgcagccaaactaactggagggaaggaacctttagtgtgggtgaacatactacctggatgtccaacaaaggctgcacaagagctcatttgatagcacacattctgtcctgtctacatctctgatgacctggaagtgcttcgacatcagatcatcagaagtgctgctgccctttttcactgtccctttccacatcatttggccttcatcatttcctgtcttgtagcagtattttcacctgtttttaaaattgtaataatttttgatgcattaattgttgactggttttaatgatcaattgtttattagtgttctgttgctctgttatattgaattattgctactgttttagcatggtttacacaataaacctttattgtgaagttaaagtttcagtttctttatatttcttgtatttcttgaacagttaaaataacacttgtgcaatttttgaacatttttacccattataaagtagcactattaaataaaataaaataacatttaataactgtaaaatactatacagtaataatgaaagtaac
>TCONS_00004868
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>TCONS_00004869
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>TCONS_00004870
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>TCONS_00004871
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>TCONS_00004872
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>TCONS_00004873
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Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000092826

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00004867 False 938 lncRNA 0.33 3 9534615 9536874
TCONS_00004868 False 1154 lncRNA 0.34 5 9534771 9537977
TCONS_00004869 False 643 processed_transcript 0.40 6 9534782 9538326
TCONS_00004870 False 650 lncRNA 0.37 4 9534804 9537589
TCONS_00004871 False 825 lncRNA 0.37 5 9536076 9538300
TCONS_00004872 False 729 lncRNA 0.32 3 9536642 9537975
TCONS_00004873 True 367 lncRNA 0.33 2 9537688 9538335

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_002617 morn5 coding downstream 124547 9397305 ~ 9410068 (-)
XLOC_002616 mrrf coding downstream 188255 9305050 ~ 9346360 (-)
XLOC_002614 anxa3b coding downstream 264882 9247593 ~ 9269733 (-)
XLOC_002615 NA coding downstream 266904 9266053 ~ 9267711 (-)
XLOC_002613 si:dkeyp-41f9.4 coding downstream 342165 9186651 ~ 9192450 (-)
XLOC_002619 NA coding upstream 108027 9646362 ~ 9661692 (-)
XLOC_002620 strbp coding upstream 296561 9834896 ~ 10018794 (-)
XLOC_002621 NA coding upstream 723010 10261345 ~ 10288683 (-)
XLOC_002622 NA coding upstream 735394 10273729 ~ 10278533 (-)
XLOC_002623 BX323065.1 coding upstream 780973 10319308 ~ 10332427 (-)
XLOC_002612 NA non-coding downstream 387973 9145508 ~ 9146642 (-)
XLOC_002611 BX323017.1 non-coding downstream 392936 9141565 ~ 9141679 (-)
XLOC_002609 CU694950.1 non-coding downstream 517778 9016721 ~ 9016837 (-)
XLOC_002606 NA non-coding downstream 676047 8841698 ~ 8858568 (-)
XLOC_002625 NA non-coding upstream 1173843 10712178 ~ 10714227 (-)

Expression


Co-expression Network