G709653


Basic Information

Item Value
gene id G709653
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 43339334 ~ 43345311 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU807011
cttatttaggtgtcataaccagccataaattaactacagtgttggggttggtgggttttaacactcttacgTAAGTGTCATaagcagccataaattaactatatTGTTTGGGTTGTTGGGTtccaacactcttatttaggtgtcataaccagccataaattaactacagtgttggggttggtgggttttaacactcttatgtaagtgtcataagcagccataaattaactacagtgttggggttgttgggttttaacactcttctttaggtgtcataaccagaccTAAATTAACTacggtgttggggttggtgggttttaacactgttatgtaggtgtcataaccagccataaattaactacagtggaaggtttggtgggttttaacactgttatgtaggtgtcataaccagccataaattaactacagtggaaggtttggtgggttttaacactctcatgtaggtgtcattaccagccttaaattaactacagtgttggcgtTGATGGGTTTTAatactcttatgtaggtgtcataaccagccataaatgaactagaGTGGAGGGTTtgctgggttttaacactcttatttaggtgtcatagccagccataaattaactatggtgttgggttttggtgggttttaacactcttaatTAGTTgacataaccagccataaattaactacagtgttggggttggttggttttaacactcttatgtaggtgtcataaccagccataaatgaactacagtggaaggtttgctgggttttaacactcttatttaggtgtcataaccagccataaattaactacagtggacGGTTTGGTGGGctttttaacactcttatttaggtgtcataaccagccataaatgaactacagtgttggggttggtgggttttaacactcttgtttaggtgtcataaccagtcataaattaactagaacgttggggttggtgggttttaacactattatgtgggtgtcataaccagccataaaataactacagtgttggggttggtgggttataacactcttatttaggtgtcataaccagtcataaattaactagagtgtttgggttggtgggttttaacactcttatttaggtgtcataaccagccataaattaactacagtgttggggttggtgggttttaacactcttatgtaggtgtcatagccAGCCATAAAGTAACTAGAGCGGAAGTTTTGGTgagttttaacactcttatttaggtgtcataaccagccataaattaactacagtggaaggtttggtgggttttaacactctcatgtaggtgtcattaccagccttaaattaactacagtgtctGCGTtgatgggttttaacactcttatgtaggtgtcataaccagccatcaAGTAACGTCAGTGGAAGTTTtgatgggttttaacactcttatgtaggggttataaccagccataaattaactacattgttggtgttggtgggttttaacaaaCACTCTTATGTAATTGTCATaagcagccataaattaactacagtgttggggttggtttgTTTTAACACTCCTCTGTAGGTGTCATAACTAGCCATAAATTAAccacagtgttggggttggtgggttctAACACTCTTATGTggatgtcataaccagccataaattaactacagtggaaggtttggtgggtttcaACAATCTTATGTTGTTGTCAGAACCATTCCATAAATTAACT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU807011 True 1733 lncRNA 0.38 2 43339334 43345311

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
puf60a puf60 coding downstream 812748 42431791 ~ 42526586 (-)
klhl18 klhl18 coding downstream 919247 42340682 ~ 42420087 (-)
LOC118965611 NA coding downstream 1610347 41725469 ~ 41728987 (-)
LOC110529916 LOC106571797 coding downstream 2369856 40958142 ~ 40969478 (-)
LOC118965517 NA coding downstream 2539297 40779851 ~ 40800037 (-)
mycb myc coding upstream 254443 43599754 ~ 43602305 (-)
LOC118965613 NA coding upstream 414018 43759329 ~ 43763318 (-)
efr3a efr3a coding upstream 839682 44184993 ~ 44436559 (-)
LOC110529930 NA coding upstream 1045567 44390878 ~ 44394639 (-)
LOC110529115 NA coding upstream 1635658 44980969 ~ 44984268 (-)
G709651 NA non-coding downstream 1386 43335395 ~ 43337948 (-)
G709609 NA non-coding downstream 59627 43279491 ~ 43279707 (-)
G709603 NA non-coding downstream 62811 43276322 ~ 43276523 (-)
G709597 NA non-coding downstream 68477 43270654 ~ 43270857 (-)
G709519 NA non-coding downstream 125417 43213526 ~ 43213917 (-)
G709655 NA non-coding upstream 2111 43347422 ~ 43353199 (-)
G709657 NA non-coding upstream 11257 43356568 ~ 43362477 (-)
G709661 NA non-coding upstream 18706 43364017 ~ 43370595 (-)
G709662 NA non-coding upstream 24419 43369730 ~ 43372842 (-)
G709663 NA non-coding upstream 29636 43374947 ~ 43377664 (-)
G709454 NA other downstream 168252 43170760 ~ 43171082 (-)
G709272 NA other downstream 618635 42719771 ~ 42720699 (-)
slc22a16 LOC106571810 other downstream 3379721 39956961 ~ 40017167 (-)
G706683 stxbp5 other downstream 4113021 39219644 ~ 39226313 (-)
G704874 NA other downstream 5025531 38313489 ~ 38313803 (-)
G711133 NA other upstream 1193482 44538793 ~ 44539504 (-)
G712814 NA other upstream 2112466 45457777 ~ 45458248 (-)
crfb16 LOC106568648 other upstream 2965819 46309732 ~ 46325685 (-)
LOC110529973 LOC106568664 other upstream 3706156 47051073 ~ 47067973 (-)
G714425 LOC106568665 other upstream 3833113 47178424 ~ 47178736 (-)

Expression


Co-expression Network