G709655


Basic Information

Item Value
gene id G709655
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 43347422 ~ 43353199 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU807018
aactacaattttgggttggtgggttttaacactcttatgtaggtgtcatagccagccataaagtaactacagtggaaggtttgatGGGTTTAACActcatgtaggtgtcataaccagccataaattaactacagtgttggggttggtgggttttaacactcttatgtaagtgtcataagcagccataaattaactacagtgttggggttggttggttttaacactcttatttaggtgtcataaccagccataaattaactacagtgtgtgtgttggtgggttttaacactattatgtgggtgtcataaccagccataaaataactacagtgttggggttggtgggttataacactcttatttaggtgtcataaccagtcataaattaactagagtgtttgggttggtgggttttaacactcttatttaggtgtcataaccagccataaattaactacagtgttcgggttggtgggttttaacactcttatgtaggtgtcatagccagccataaagtaactacAGCGGAAGTTTTGGTgagttttaacactcttatttaggtgtcataaccagccataaattaactacagtggaaggtttggtgggttttaacactctcatgtaggtgtcattaccagccttaaattaactacagtgtctGCGTtgatgggttttaacactcttatgtaggtgtcataaccagccatcaAGTAACGTCAGTGGAAGTTTtgatgggttttaacactcttatgtaggggttataaccagccataaattaactacattgttggtgttggtgggttttaacaaaCACTCTTATGTAATTGTCATaagcagccataaattaactacagtgttggggttggttggtTTTAACACTCCTCTGTAGGTGTCATAACTAGCCATAAATTAAccacagtgttggggttggtgggttttaacactcttctttaggtgtcataactagccctaaatgaactacagtgttggggttgttgggttCTAACACTCTTATGTggatgtcataaccagccataaattaactacagtggaaggtttggtgggtttcaACAATCTTATGTTGTTGTCAGAACCATTCCATAAATTAACTAGAG
>TU807017
ttgggttttaacactcttatttaggtgtcataaccagccataaattaccaaagtgtttgggttggtgggttttaacactcttatgtaggtgtcatagccagccataaagtaactacagtggaaggtttgatGGGTTTAACActcatgtaggtgtcataaccagccataaattaactacagtgttggggttggtgggttttaacactcttatgtaagtgtcataagcagccataaattaactacagtgttggggttggttggttttaacactcttatttaggtgtcataaccagccataaattaactacagtggaagttttggtgggttttaacactcttatttaggtgtcataaccagccataaattaactacagtgttggggttggttggttttaacactcttatgtaggtgtcataaccagccataaattaactacagtggaaggtttggtgggttttaacactctcatgtaggtgtcattaccagccttaaattaactacagtgtcgGCGTtgatgggttttaacactcttatgtaggtgtcataaccagccatcaAGTAACGTCAGTGGAAGTTTtgatgggttttaacactcttatgtaggggttataaccagccataaattaactacagtgttggtgttggtgggttttaacactcctCTGTAGGTGTCATAACTAGCCATAAATTA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU807018 False 1114 lncRNA 0.39 2 43347422 43351790
TU807017 True 693 lncRNA 0.39 2 43352051 43353199

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
puf60a puf60 coding downstream 820836 42431791 ~ 42526586 (-)
klhl18 klhl18 coding downstream 927335 42340682 ~ 42420087 (-)
LOC118965611 NA coding downstream 1618435 41725469 ~ 41728987 (-)
LOC110529916 LOC106571797 coding downstream 2377944 40958142 ~ 40969478 (-)
LOC118965517 NA coding downstream 2547385 40779851 ~ 40800037 (-)
mycb myc coding upstream 246555 43599754 ~ 43602305 (-)
LOC118965613 NA coding upstream 406130 43759329 ~ 43763318 (-)
efr3a efr3a coding upstream 831794 44184993 ~ 44436559 (-)
LOC110529930 NA coding upstream 1037679 44390878 ~ 44394639 (-)
LOC110529115 NA coding upstream 1627770 44980969 ~ 44984268 (-)
G709653 NA non-coding downstream 2111 43339334 ~ 43345311 (-)
G709651 NA non-coding downstream 9474 43335395 ~ 43337948 (-)
G709609 NA non-coding downstream 67715 43279491 ~ 43279707 (-)
G709603 NA non-coding downstream 70899 43276322 ~ 43276523 (-)
G709597 NA non-coding downstream 76565 43270654 ~ 43270857 (-)
G709657 NA non-coding upstream 3369 43356568 ~ 43362477 (-)
G709661 NA non-coding upstream 10818 43364017 ~ 43370595 (-)
G709662 NA non-coding upstream 16531 43369730 ~ 43372842 (-)
G709663 NA non-coding upstream 21748 43374947 ~ 43377664 (-)
G709667 NA non-coding upstream 27360 43380559 ~ 43381176 (-)
G709454 NA other downstream 176340 43170760 ~ 43171082 (-)
G709272 NA other downstream 626723 42719771 ~ 42720699 (-)
slc22a16 LOC106571810 other downstream 3387809 39956961 ~ 40017167 (-)
G706683 stxbp5 other downstream 4121109 39219644 ~ 39226313 (-)
G704874 NA other downstream 5033619 38313489 ~ 38313803 (-)
G711133 NA other upstream 1185594 44538793 ~ 44539504 (-)
G712814 NA other upstream 2104578 45457777 ~ 45458248 (-)
crfb16 LOC106568648 other upstream 2957931 46309732 ~ 46325685 (-)
LOC110529973 LOC106568664 other upstream 3698268 47051073 ~ 47067973 (-)
G714425 LOC106568665 other upstream 3825225 47178424 ~ 47178736 (-)

Expression


Co-expression Network