G715789


Basic Information

Item Value
gene id G715789
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 48221706 ~ 48230202 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU813477
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>TU813478
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>TU813479
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>TU813480
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Function

NR:

description
Transposable element Tcb1 transposase, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU813477 False 3416 lncRNA 0.36 2 48221706 48230202
TU813478 False 3416 lncRNA 0.36 2 48221706 48230202
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TU813480 False 3416 lncRNA 0.36 2 48221706 48230202
TU813481 True 3416 lncRNA 0.36 2 48221706 48230202

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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G715734 NA non-coding downstream 32994 48188488 ~ 48188712 (-)
G715727 NA non-coding downstream 39479 48182014 ~ 48182227 (-)
G715824 NA non-coding upstream 27520 48257722 ~ 48258017 (-)
G715860 NA non-coding upstream 55689 48285891 ~ 48286307 (-)
G715862 NA non-coding upstream 56830 48287032 ~ 48287824 (-)
G716253 NA non-coding upstream 68363 48298565 ~ 48298788 (-)
G716261 NA non-coding upstream 77984 48308186 ~ 48308467 (-)
G714425 LOC106568665 other downstream 1042970 47178424 ~ 47178736 (-)
LOC110529973 LOC106568664 other downstream 1164046 47051073 ~ 47067973 (-)
crfb16 LOC106568648 other downstream 1896025 46309732 ~ 46325685 (-)
G712814 NA other downstream 2763458 45457777 ~ 45458248 (-)
G711133 NA other downstream 3682202 44538793 ~ 44539504 (-)
G715865 NA other upstream 58740 48288942 ~ 48289581 (-)
G716463 LOC106591423 other upstream 529710 48759912 ~ 48761163 (-)
G716480 tnk2 other upstream 551919 48782121 ~ 48782515 (-)
G716488 NA other upstream 558319 48788521 ~ 48788962 (-)

Expression


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