XLOC_002626


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_002626
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007121.7
NCBI id CM002894.2
chromosome length 45420867
location 10784334 ~ 10787649 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00006010
atatatatatataatattattttgtatataaagttgaagttagaataaaagaaatttaaaactttttaaaaaccattttaaggtcaaaattattagcccctttaatttttttcaatagtctacagaacaaacaatcgttatacattaacttgcctaattacactaacctgtcTAGTAaacgtaattaacctagttaagcctttatgtgactttaagctgtatagtcttaaaaaaatatctggtaaaatttAGCTTAATATCATCAtggcaaaagataaaataaatcagttatcacaaatgagttattatgtttagaaatgtgttgaaataaatcttcactctgttgaacagaaattggggttggggggctaataactctaacttcaactgtataggtCTAAATTcacacttgtaaaaaaaaaagaactgcaattCTGAGAAGAAAAGTCTGAAATCACAAGATATAAACTCAAATAATTCCAATTATACTTTTTGCAACTTTTGGTTGTTTTTACAGTAGATcacaattaacatttttatttatattttcaatttATAACCAGCAGCAGAAACAAGCTTTCATAGTTTTGTGAAAAATGACACATTggtacaatttaaaaacaaaatcatgtaaaaaaaaaaaagataaaaagaaagcAGTTATCCTCTTGAACAAAACCTGACTTCATTGGCTTTGGTGctcaataaaacaagaaaacttGTGTTGACTGAACATGGTCCTTTAAAGCTATTGAAAAAGCAAATAATAAGAACAAAAgttaaataattaagttaaaaataaacatctGAAATCCCTCATAAAATCACGATTAACAATTAACACGTTTTTGGAGGCAAATCAGCCGTTGTGAGCATGATTTGTGGAATGAGCACCACAACCTAGTGGACAGACATGTGAACAACATGGCATTTACTACACAAGATCACCTTAAGAAGAATCagacacacacttgcacacacacaaactgatcTGTGGAAATGTTCACATTCAGACCGAGAAACAGAAAATGGAGTGTAATTGTTTTTTCAGtgaaaaaaatacacaacaatttaaaacaaaataaataaatacaaaattattcaCAGCACTGGCTGTCATGTTTCAAACAGCTAATGAATTTATAtggaaaacaatattattaatgtgattataaataAAACCCAGCAATCCCTCTTAAAACAAAGCTGAGTggatatttgtttgtgtgtgtgtctgcaaatGTGTGTCATTGTATAACACTTTAAATGGACTGTTTTTATTGAGTAAATGTGAAAGATTGTTCATTACGGAGTGTACTGTCCTTTAACTAAACAAATCATCAAGAGAGGCCTCAGCAAATGCTTTGCTGTCATAGGACACAAACTCAGAAAATATCATcgcaaagaaaagaaaatgtctgtaaaGCAGATTTCAGACATCACATTGTGTCTAAAATAAATAACTCAGTGCATAAGATGTGTTTTCCCTCTCTTTCACATGGCCAGAACGAAAACAAGAAACGCCAACAAGCTTAACGGACAACCAAAGCTCAACCCACAACAAATTATTACACTTCATTTGTTTACAAAATAGTTTTTCTTAAAAATCCAAGTGAGAAAGAAAAGGATGAACGATGAAATTAAAACCGAAAAAGGTGCCGATGGAAACAACTGCGTCTGATTGGCTGACTAACTAATGACATCACGGCTGCGCCCTTGGCTAGAAGTATCAGCTGACGTCTAAATCACATGTACAGCTGTGTGGGTGAATCTCACTTCATCACAAAAgaaattaaaagcatattttgtgtaaataaaaaaaagtaattttattacaTCATTGTGCTAAATTAGATTTATGCTAATTACTATGATAATGGTTTTTAAATTCTACATTttgtgaaaaacatttttgacatTGTGGTAATGACAATGATTTAATGTTGTTAAGGTAATGAAATTGTATTGTCATTACagcaatgtgaattttttttgtcattgtgatAATGAGGATGTTATTGTCATTATAGTATTAATAGCCATTGTCATTTGGCTAATGCTCTTTTTGTGTCACGgtaatgacAATGGTTATTGTTACAGTAATGACAATGGGTAATGTTATGGTAATGAGAATGaaattttattgtcattacagCAATGTCAATTAGATTCATTGTGATAATGAGAATGTTATTGTGTATTAGCCATAGTCATTTGATTAATGAGATTTTTGTGTCATGATAATGACAATGATATGATGTTAAGGTAATGagaattatatttttttgtcaatACACCAATGTGAATTAGATTTTCTGTCattgtgataattatattgttattgtgATTATTGTATCTTAGCCATTGGCATTTGGCTAATGAGACTTTGTGTCATGGTAATGACAATTATTTAATGTTGTTAAAGTAATGAGAATTAAATTTTATTAGCATTACAGAAATgtgaattagattttttgttataataatgagattattattgttattattgtatattagCCATTGTCATTTGGCTAACGAGATTTTTTTGTCGTTGCAATGACAATGATTTAATGTTGTTAAGGTAATGAGGACAACATGTTATTGTCAATACAGTAACGTGAATTAGACATTCTGTAATTATGATAATGAAAATTTTATTGTGATTATTGTATATTCACCATGAGATTTTGAGCTAATGAGATTTTTTTTGCCATGGTAATGACAATGATTTAATGTTGTTAAAGTAATGAGAATTACATTTTATTAGCATTACAGCAATTGGATTTTCTGTTATTATGATAATGagattgttattgttattattgtatattagCCATTGTCATTTAgctaatcagattttttttgtagtaATGACAATGATTTAATGTTGTTAAGGTGATGATAATGAAATTTCATTGTCATTACAGTAATGCAAATTAGATTTTCTGTCATTATAATAATGAGAATGTTTAGTGTAATTATAGTGTAAATAGAAGACTTCATTGTCAAATGGCTAAGAAGATTTTTTTGTCATGGTAATGACAATGACTTAACGATATTAAGAATAGGTAATGAGAATTAGATTTTTGTcattatgaaaattattattattattattatttaaatacagaacTTCACAGTCAATTCGCT

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00006010 True 3150 lncRNA 0.29 2 10784334 10787649

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_002625 NA coding downstream 70107 10712178 ~ 10714227 (-)
XLOC_002624 dbh coding downstream 177216 10564261 ~ 10607118 (-)
XLOC_002623 BX323065.1 coding downstream 451907 10319308 ~ 10332427 (-)
XLOC_002621 NA coding downstream 495651 10261345 ~ 10288683 (-)
XLOC_002622 NA coding downstream 505801 10273729 ~ 10278533 (-)
XLOC_002627 nrarpa coding upstream 73110 10860759 ~ 10864331 (-)
XLOC_002628 exd3 coding upstream 91888 10879537 ~ 10969596 (-)
XLOC_002629 ak3 coding upstream 213245 11000894 ~ 11012000 (-)
XLOC_002630 ptbp3 coding upstream 358672 11146321 ~ 11261565 (-)
XLOC_002631 inip coding upstream 532322 11319971 ~ 11323134 (-)
XLOC_002619 NA non-coding downstream 1122642 9646362 ~ 9661692 (-)
XLOC_002638 NA non-coding upstream 1107724 11895373 ~ 11898575 (-)
XLOC_002642 NA non-coding upstream 2511190 13298839 ~ 13301973 (-)
XLOC_002643 CR759894.1 non-coding upstream 2517416 13305065 ~ 13305183 (-)
XLOC_002646 BX293994.2 non-coding upstream 2819378 13607027 ~ 13607143 (-)
XLOC_002647 BX293994.1 non-coding upstream 2824484 13612133 ~ 13612248 (-)

Expression


Co-expression Network