XLOC_026277 (CR855865.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_026277
gene name CR855865.1
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 19986341 ~ 19992463 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00051241
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>TCONS_00051240
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Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000117635

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00051241 False 6024 lncRNA 0.39 2 19986341 19992463
TCONS_00051240 True 5429 lncRNA 0.40 3 19986341 19992463

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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XLOC_026275 rnd2 coding downstream 86427 19850937 ~ 19899914 (-)
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XLOC_026272 CU571315.2 coding downstream 468879 19507415 ~ 19517462 (-)
XLOC_026278 atxn7l3 coding upstream 33246 20025709 ~ 20040636 (-)
XLOC_026279 ubtf coding upstream 49444 20041907 ~ 20063782 (-)
XLOC_026280 slc4a1a coding upstream 73398 20065861 ~ 20092124 (-)
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XLOC_026282 selenow2a coding upstream 115758 20108221 ~ 20118342 (-)
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XLOC_026265 CU151886.3 non-coding downstream 1011701 18972408 ~ 18974640 (-)
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XLOC_026285 NA non-coding upstream 908603 20901066 ~ 20915710 (-)
XLOC_026295 CR387996.1 non-coding upstream 1208965 21201428 ~ 21206946 (-)
XLOC_026301 CR790381.1 non-coding upstream 1624457 21616920 ~ 21617040 (-)
XLOC_026303 NA non-coding upstream 2160144 22152607 ~ 22155523 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) CI01000034_03923671_03931871 NA coding CI01000034 null 3922512 ~ 3931903 (+)