XLOC_026322


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_026322
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 23663144 ~ 24050854 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

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ensembl_id ENSDARG00000097621 ENSDARG00000097891

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00053008 False 1128 lncRNA 0.40 5 23663144 23859769
TCONS_00053010 False 968 lncRNA 0.33 2 23701286 23703718
TCONS_00053011 False 1046 lncRNA 0.34 2 23701286 23710574
TCONS_00053012 False 1444 lncRNA 0.37 6 23701286 23859769
TCONS_00051332 False 1314 lncRNA 0.37 5 23701286 23860939
TCONS_00053013 False 1483 lncRNA 0.39 7 23701286 24050064
TCONS_00053014 False 1702 lncRNA 0.39 7 23701286 24050290
TCONS_00053015 False 2361 lncRNA 0.37 8 23701286 24050854
TCONS_00051333 False 245 lncRNA 0.51 3 23712766 23857430
TCONS_00053017 False 1847 lncRNA 0.39 2 23747574 23751314
TCONS_00051335 False 851 lncRNA 0.50 5 23747574 23860941
TCONS_00053018 False 2112 lncRNA 0.35 1 23750161 23752272
TCONS_00051336 False 463 lncRNA 0.45 4 23765763 23859753
TCONS_00051338 True 485 lncRNA 0.53 3 23934882 24050083

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_026321 eve1 coding downstream 19314 23641935 ~ 23643830 (-)
XLOC_026320 atp5mc1 coding downstream 58748 23599290 ~ 23604396 (-)
XLOC_026319 ube2z coding downstream 66304 23581614 ~ 23596840 (-)
XLOC_026318 igf2bp1 coding downstream 88029 23518137 ~ 23575115 (-)
XLOC_026317 si:dkey-225f5.4 coding downstream 149989 23498437 ~ 23513155 (-)
XLOC_026326 nfe2l1a coding upstream 21866 24072720 ~ 24093144 (-)
XLOC_026327 si:dkey-110g7.8 coding upstream 151102 24201956 ~ 24205339 (-)
XLOC_026328 csf2rb coding upstream 263843 24314697 ~ 24338163 (-)
XLOC_026329 CR790377.1 coding upstream 352295 24403149 ~ 24403269 (-)
XLOC_026330 baiap2l2a coding upstream 386509 24437363 ~ 24458281 (-)
XLOC_026314 CU459159.1 non-coding downstream 280536 23382492 ~ 23382608 (-)
XLOC_026312 NA non-coding downstream 335591 23323244 ~ 23327553 (-)
XLOC_026311 NA non-coding downstream 422423 23220270 ~ 23240721 (-)
XLOC_026310 NA non-coding downstream 593508 23039508 ~ 23069636 (-)
XLOC_026308 NA non-coding downstream 1241221 22408790 ~ 22421923 (-)
XLOC_026332 BX569789.2 non-coding upstream 694912 24745766 ~ 24745881 (-)
XLOC_026339 BX470254.1 non-coding upstream 1081166 25132020 ~ 25135109 (-)
XLOC_026348 NA non-coding upstream 1632030 25682884 ~ 25701218 (-)
XLOC_026350 NA non-coding upstream 1889354 25940208 ~ 25950390 (-)

Expression


Co-expression Network