XLOC_026393 (rbfox1)



Basic Information


Item Value
gene id XLOC_026393
gene name rbfox1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 27982269 ~ 28428198 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence


>TCONS_00051439
ATGATGATGTATTTGTGGgGTAATCAAGACGCCCCAGCACCCCCAGAAACCATGGCCCAGCCTTTCCCATCGGCCCAGTTCGCTCCCCCTCAGAACGGCATTCCTGCTGAGTACACGCCGTCCCACCCTCACCCGACCCCAGACTACTCGGGCCAGACCCCGGTGGCAGAGCACACGCTGAACTTGTACACCCCTGCCCAAACGCACAGTGAGCCCAGCGGACCAGACAACAGCATACAGGCGGTCTCCGGCACAGCCACACAGACAGACGATTCAGCACAGACAGACAGCCAACAGCAAACACAGTCATCCGAAATCACAGAAATCAAAACGCAGCCCAAGAGGCTCCACGTCTCCAACATCCCCTTCAGGTTCAGAGATCCAGACCTCAGGCAAATGTTTGGCCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATCATATTTAATGAACGAGGATCAAAGGGTTTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAGTAGTGCCGATGCGGACAGGGCCAGAGAGAAATTACACGGCACGGTGGTAGAAGGTCGTAAAATAGAGGTTAACAATGCAACAGCACGGGTAATGACGAATAAAAAGACAGTCAACCCATATGCAAATGGCTGGAAGTTGAATCCAGTCGTGGGTGCAGTCTACAGCCCAGAATTCTATGCAGTGCCAGGCTTCCCATACCCAGCAGCCACGGCGGCAGCGGCGGCGTACAGAGGGGCACACTTAAGAGGAAGAGGCCGCACCGTCTACAACACGTTTCGGGCAGCCGCGCCTCCCCCACACATCCCAGCCTATGGAGGTGTTGTTTACCAGGACGGGTTTTACGGTGCAGATATTTATGGTGGTTACACTGCCTACCGATACACTCAGCCTGCTACTGCTACCGCCGCTGCCTACAGTGACAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACAACCACGCACTTGCTCCAGCAGCCACATACAGCGTTGGTGCCATGAATGCTTTCGCACCCTTGACTGATGCCAAGACCAGAAGCCACGCCGATGATGTGGGTCTCGTTCTTTCTTCTTTGCAGGCTAGTATATACCGAGGTGGATACAGTCGTTTCGCGCCAtattaaaagcaaacaaaaaatgcattacaaaaaatcataataaaaacagacaaaaaaaaataaacatttcaaaaccTATTGAGAATCTTCCTGTGGGGGTAAAGGAGGAGTAATTCAGAGGCCTGGGTATTGCAATACATGCAGTAGTGCATCATTTTAGCATCTCTCAAGAGAGAGAAGACAAAAACGGATATTTTTCATCTTATACCTCAGATATTTTGTGCTGTGTATTTTAATATTGTGGgtttttaatttctaaagatTACATAGATTGTTGGCTGTAGAGGTTTCTGTGGTGATCTAGAGAGCTGCTAGATTTTAAAAAgacgaagaagaaaaaaaaaagaataataagatACAAATTGTTAGGGCTTTATCATGTAAATGAGTTCTGTATGATAAATATACGAGTCACTTTGGGGTTATCATATTTTGTAAGAGTGTAAGTGACTAGAGTCGTCCAGTGGTTTCTGCTTTCGTTGACATTGCCTTTACgtctttgttttgttcttttggtTTCAGTTGTTTTTGGGTTCTGTGGCGTAGAGGACGAGCACGCAGGGGATGGTGGGTACGAGTAGATACGGGCGTCTGCGTGGTAAAAGGTCAGTGTAGTTGCAGGAGCACAGCAGAGACACAGAGCCGGTCAAAGAGACCACGGAGGTATCGATTATTTAAGCTGTCTTATATCAGTCATTACTCAAAGCCAAAGGTTATGTTCCTGGGGTGTTCCGTGTGTAGATTCCAACTATACATAGCAGCTCGTAGAAACTCCCCGAAAAGTTCACCacaacagtattttactgtttaactATTATCTAGTCCCTAAGTCCAACCCCTCGCTAGTTTAGGCCTACCACGAGATGTTCTTTTTATATATTACGGTACTTCCAGTACGTCGATTGATATAAATGCTGACTTTTATAATACGGGAGAGACAAAACacgacgaaaaaaaaaaaaacgaaaaaagaaaaaaagacgcCGACCATAGCGCCGgttctattttaatttagtttcttttaccttttgttttgtttagtttttttttttttctcaagagtTTATTTGTACAAGCTGAgagtgggaaaaaataaactaacaGTGTATTAAATTTGATCTGTGCAGTGAAAATGTTCTCTTATACGACAAACACAACTGTATAATGTTTTAGATTTAGTGTGGTAGACCAACTGTTAGAGAAAGGTGTCTCATTTTTTATGGAATCATACACAGATTTATATCAACACTTTACAAGTAATGCAATCATTATGTAGATATAATCATAGTATTTTTGTCAACTGTACAATTTTGCACACACGACCTGCAATTTTTTCATCACAActtcttctcctccttctcctcctcctcctcacttGTCTGTTTTCTTTCGTTTTCTCTGCTTCCTTCGGGTGTTTCGTTTTGATATCATTTTTAATGTGACATCCTTTGTACTATTATTTTCTAGAACACAGCCTTTACACTTTGAAACTGTTTGATTATCAAGAAACTGAGAACTATATGACTTGTGAAAAAGATATCTATATGTAAATAGGAATAATGATAACTATGTCATTTACAAGTGCTACACAAGCAAGCTGTCGAGGTGTTCTTGAAGAGTCGCAGCTTGGCTGTGCATATGCGAAGACTTCCCTTCATGTTGTTTACAAGTATACCTAATTAGAGGTGTTTGTCACATAtctcatttttctttattttgtatttataaaacGTTTCGATtgcataaaaatacaaacaaaagagCAGCTCCAATTTATCCGGCTGCAAAATATCCTCTTGTGTACTGTGTGCGTCACATCACACAACTTGGCAAAAATATCTTACCCACTGCTGTGATTCTGCTCTTTCTGCTTTAAGTACGTGTTGTGGACAGGCTTTCTCCTTGTCATTGTATGTGCATGCACTATGATCTGCATAACAATAACCATCAATAAAGTTTCTCAAGATAACGGGAACGGCTCTCGGAACTTTCTTGTATTCAGATGACGGAGAGCGTTTGTCCTCTGATCTGATTTCATTGCCTGAAATTGCATTGCGATGCTCAAGGCGAAGGGGAAATGATCATCTCCGAGGAGGTTAAGTGGAATTGATGCTGCCAGGTCTGAGGTGGTCATCTGTGTGCCTTTAAGAAGACTCTGTGTTTAGGATGAAGGAGAAAGATCCGATTCCGGCGGCGTGATTAGGTTATCCCACTCGCTATCTGGGATATGAAAGATCTCAGATCCTGCAAATATTTCCacatataaaagaaaagaaatatggGCTTATTTTCAGCCTGGGCTCATGAAAGATGTGGTGACATTTTTGCTAAAATTATATTAGGCTGCTTCCTGCACGTTTGCTTCACTTTCAAAGTGAAACGTCgctaaaagtcatttaaaatttttactaCAGTATGCAAGCAAACGCAACTGTTGCAACATTTttcttacagttaaagtcaaaatgatttgcccccctgaattattatccccctgtttattttttaccccgatttctgtttaacggagaaaagatttttttcaacacatttctaatcatgatagttttaataatttatctctaataactgatttattttatctttgccatgatgataatgaataatatttgactagttatttttcaagacactagtattcagtgtAAAGTGACATTTGATGGCTTAATAGGTTAATTATGCAGGtcggggtaattaggcaagttattgtaaaacgatggtttgttctgtagactatcgaaaaaatatagcttaaaggggctaataattttgacctaaaaatgttttttaaaaatttaaaacagcttttattctagccaaaataaaacaaataagactttctccagaagaaaaaacatcagacatactgtgaaaatttccttgctcttttaaacatcacttatatttttaatatttaaaaaagaaaaaaaaaaggggggctaataattctaacttaaaATCTATATTAGTTTGTGCTTAGATTGTGGCTTTttgaaaattttattattattgtatttataaaattaaatgtattaaatgagagaaaaaaaatatatgattttggATTGTCACGATCCAAAGATTAATAGCAAACTTTAACCCTAATCTGCATCATCACTGAAGTCGCACGCAATTTTAAGCTCTTCACATGAAAGCAAACTTAAGAATTCATTGAATTATTTTTTGTGCACACACAGATAGCCATGtgtcctttttttttccttttgaaagTGAAATGTCGCTAAAATGCAACTGTTTACTATGCAACTTTTATTACGTTGGTTTGTGCGCAGACCATGGTCTTTTAGGAATTGaattatcatatttataaatCAAAAGTATTAAATGAGTTGAAAATAATGTCAGAAAGATGGTACACATTGAGATTCACAGATTGATAGTAAACTTTAATACTAATTTGCATCATCAAAAAAGTTGCATGTGCACTTCaaagataataaaaaacatttatttttatttttattttgtttttttgtgcacaCACAGGTGTCAGAAAGCACACAGATAATTGTTTACATTTCATGTCTATTTGAGCTTGGATGggtgcatacagttgaagtcggaatgaTTTgccccatttttatttattttattttttaatatttcccaaattatgtttaacagagcaaggacattttcacagtatgtctgataatattttttcttctgaagaaagtcttatttgttttatttcggctagaataaaaagcagcctttaatttttttcaaaattattagcccctttaagctatattttttctaataATCTACAGATcacaccatcgttatacaataacttgcctaattcccctaacctgcc
>TCONS_00051440
ATTCCAGGACAACCAATGAGTTGTGATACGGACCAGCTAAGGgGTAATCAAGACGCCCCAGCACCCCCAGAAACCATGGCCCAGCCTTTCCCATCGGCCCAGTTCGCTCCCCCTCAGAACGGCATTCCTGCTGAGTACACGCCGTCCCACCCTCACCCGACCCCAGACTACTCGGGCCAGACCCCGGTGGCAGAGCACACGCTGAACTTGTACACCCCTGCCCAAACGCACAGTGAGCCCAGCGGACCAGACAACAGCATACAGGCGGTCTCCGGCACAGCCACACAGACAGACGATTCAGCACAGACAGACAGCCAACAGCAAACACAGTCATCCGAAATCACAGAAATCAAAACGCAGCCCAAGAGGCTCCACGTCTCCAACATCCCCTTCAGGTTCAGAGATCCAGACCTCAGGCAAATGTTTGGCCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATCATATTTAATGAACGAGGATCAAAGGGTTTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAGTAGTGCCGATGCGGACAGGGCCAGAGAGAAATTACACGGCACGGTGGTAGAAGGTCGTAAAATAGAGGTTAACAATGCAACAGCACGGGTAATGACGAATAAAAAGACAGTCAACCCATATGCAAATGGCTGGAAGTTGAATCCAGTCGTGGGTGCAGTCTACAGCCCAGAATTCTATGCAGTGCCAGGCTTCCCATACCCAGCAGCCACGGCGGCAGCGGCGGCGTACAGAGGGGCACACTTAAGAGGAAGAGGCCGCACCGTCTACAACACGTTTCGGGCAGCCGCGCCTCCCCCACACATCCCAGCCTATGGAGGTGTTGTTTACCAGGACGGGTTTTACGGTGCAGATATTTATGGTGGTTACACTGCCTACCGATACACTCAGCCTGCTACTGCTACCGCCGCTGCCTACAGTGACAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACAACCACGCACTTGCTCCAGCAGCCACATACAGCGTTGGTGCCATGAATGCTTTCGCACCCTTGACTGATGCCAAGACCAGAAGCCACGCCGATGATGTGGGTCTCGTTCTTTCTTCTTTGCAGGCTAGTATATACCGAGGTGGATACAGTCGTTTCGCGCCAtattaaaagcaaacaaaaaatgcattacaaaaaatcataataaaaacagacaaaaaaaaataaacatttcaaaaccTATTGAGAATCTTCCTGTGGGGGTAAAGGAGGAGTAATTCAGAGGCCTGGGTATTGCAATACATGCAGTAGTGCATCATTTTAGCATCTCTCAAGAGAGAGAAGACAAAAACGGATATTTTTCATCTTATACCTCAGATATTTTGTGCTGTGTATTTTAATATTGTGGgtttttaatttctaaagatTACATAGATTGTTGGCTGTAGAGGTTTCTGTGGTGATCTAGAGAGCTGCTAGATTTTAAAAAgacgaagaagaaaaaaaaaagaataataagatACAAATTGTTAGGGCTTTATCATGTAAATGAGTTCTGTATGATAAATATACGAGTCACTTTGGGGTTATCATATTTTGTAAGAGTGTAAGTGACTAGAGTCGTCCAGTGGTTTCTGCTTTCGTTGACATTGCCTTTACgtctttgttttgttcttttggtTTCAGTTGTTTTTGGGTTCTGTGGCGTAGAGGACGAGCACGCAGGGGATGGTGGGTACGAGTAGATACGGGCGTCTGCGTGGTAAAAGGTCAGTGTAGTTGCAGGAGCACAGCAGAGACACAGAGCCGGTCAAAGAGACCACGGAGGTATCGATTATTTAAGCTGTCTTATATCAGTCATTACTCAAAGCCAAAGGTTATGTTCCTGGGGTGTTCCGTGTGTAGATTCCAACTATACATAGCAGCTCGTAGAAACTCCCCGAAAAGTTCACCacaacagtattttactgtttaactATTATCTAGTCCCTAAGTCCAACCCCTCGCTAGTTTAGGCCTACCACGAGATGTTCTTTTTATATATTACGGTACTTCCAGTACGTCGATTGATATAAATGCTGACTTTTATAATACGGGAGAGACAAAACacgacgaaaaaaaaaaaaacgaaaaaagaaaaaaagacgcCGACCATAGCGCCGgttctattttaatttagtttcttttaccttttgttttgtttagtttttttttttttctcaagagtTTATTTGTACAAGCTGAgagtgggaaaaaataaactaacaGTGTATTAAATTTGATCTGTGCAGTGAAAATGTTCTCTTATACGACAAACACAACTGTATAATGTTTTAGATTTAGTGTGGTAGACCAACTGTTAGAGAAAGGTGTCTCATTTTTTATGGAATCATACACAGATTTATATCAACACTTTACAAGTAATGCAATCATTATGTAGATATAATCATAGTATTTTTGTCAACTGTACAATTTTGCACACACGACCTGCAATTTTTTCATCACAActtcttctcctccttctcctcctcctcctcacttGTCTGTTTTCTTTCGTTTTCTCTGCTTCCTTCGGGTGTTTCGTTTTGATATCATTTTTAATGTGACATCCTTTGTACTATTATTTTCTAGAACACAGCCTTTACACTTTGAAACTGTTTGATTATCAAGAAACTGAGAACTATATGACTTGTGAAAAAGATATCTATATGTAAATAGGAATAATGATAACTATGTCATTTACAAGTGCTACACAAGCAAGCTGTCGAGGTGTTCTTGAAGAGTCGCAGCTTGGCTGTGCATATGCGAAGACTTCCCTTCATGTTGTTTACAAGTATACCTAATTAGAGGTGTTTGTCACATAtctcatttttctttattttgtatttataaaacGTTTCGATtgcataaaaatacaaacaaaagagCAGCTCCAATTTATCCGGCTGCAAAATATCCTCTTGTGTACTGTGTGCGTCACATCACACAACTTGGCAAAAATATCTTACCCACTGCTGTGATTCTGCTCTTTCTGCTTTAAGTACGTGTTGTGGACAGGCTTTCTCCTTGTCATTGTATGTGCATGCACTATGATCTGCATAACAATAACCATCAATAAAGTTTCTCAAGATAACGGGAACGGCTCTCGGAACTTTCTTGTATTCAGATGACGGAGAGCGTTTGTCCTCTGATCTGATTTCATTGCCTGAAATTGCATTGCGATGCTCAAGGCGAAGGGGAAATGATCATCTCCGAGGAGGTTAAGTGGAATTGATGCTGCCAGGTCTGAGGTGGTCATCTGTGTGCCTTTAAGAAGACTCTGTGTTTAGGATGAAGGAGAAAGATCCGATTCCGGCGGCGTGATTAGGTTATCCCACTCGCTATCTGGGATATGAAAGATCTCAGATCCTGCAAATATTTCCacatataaaagaaaagaaatatggGCTTATTTTCAGCCTGGGCTCATGAAAGATGTGGTGACATTTTTGCTAAAATTATATTAGGCTGCTTCCTGCACGTTTGCTTCACTTTCAAAGTGAAACGTCgctaaaagtcatttaaaatttttactaCAGTATGCAAGCAAACGCAACTGTTGCAACATTTttcttacagttaaagtcaaaatgatttgcccccctgaattattatccccctgtttattttttaccccgatttctgtttaacggagaaaagatttttttcaacacatttctaatcatgatagttttaataatttatctctaataactgatttattttatctttgccatgatgataatgaataatatttgactagttatttttcaagacactagtattcagtgtAAAGTGACATTTGATGGCTTAATAGGTTAATTATGCAGGtcggggtaattaggcaagttattgtaaaacgatggtttgttctgtagactatcgaaaaaatatagcttaaaggggctaataattttgacctaaaaatgttttttaaaaatttaaaacagcttttattctagccaaaataaaacaaataagactttctccagaagaaaaaacatcagacatactgtgaaaatttccttgctcttttaaacatcacttatatttttaatatttaaaaaagaaaaaaaaaaggggggctaataattctaacttaaaATCTATATTAGTTTGTGCTTAGATTGTGGCTTTttgaaaattttattattattgtatttataaaattaaatgtattaaatgagagaaaaaaaatatatgattttggATTGTCACGATCCAAAGATTAATAGCAAACTTTAACCCTAATCTGCATCATCACTGAAGTCGCACGCAATTTTAAGCTCTTCACATGAAAGCAAACTTAAGAATTCATTGAATTATTTTTTGTGCACACACAGATAGCCATGtgtcctttttttttccttttgaaagTGAAATGTCGCTAAAATGCAACTGTTTACTATGCAACTTTTATTACGTTGGTTTGTGCGCAGACCATGGTCTTTTAGGAATTGaattatcatatttataaatCAAAAGTATTAAATGAGTTGAAAATAATGTCAGAAAGATGGTACACATTGAGATTCACAGATTGATAGTAAACTTTAATACTAATTTGCATCATCAAAAAAGTTGCATGTGCACTTCaaagataataaaaaacatttatttttatttttattttgtttttttgtgcacaCACAGGTGTCAGAAAGCACACAGATAATTGTTTACATTTCATGTCTATTTGAGCTTGGATGggtgcatacagttgaagtcggaatgaTTTgccccatttttatttattttattttttaatatttcccaaattatgtttaacagagcaaggacattttcacagtatgtctgataatattttttcttctgaagaaagtcttatttgttttatttcggctagaataaaaagcagcctttaatttttttcaaaattattagcccctttaagctatattttttctaataATCTACAGATcacaccatcgttatacaataacttgcctaattcccctaacctgcc
>TCONS_00051441
actcgctACACACACAGCGCCGAACACACACCCTCATCTATAATTGATGCTTGCTTTAGGCAGATGCTGCAGGGATTGGGACTAAGGCAGCTGCTTAGTTTATGGAGGAAAAAGGGAGCAAGATGGTGGAAcaggGTAATCAAGACGCCCCAGCACCCCCAGAAACCATGGCCCAGCCTTTCCCATCGGCCCAGTTCGCTCCCCCTCAGAACGGCATTCCTGCTGAGTACACGCCGTCCCACCCTCACCCGACCCCAGACTACTCGGGCCAGACCCCGGTGGCAGAGCACACGCTGAACTTGTACACCCCTGCCCAAACGCACAGTGAGCCCAGCGGACCAGACAACAGCATACAGGCGGTCTCCGGCACAGCCACACAGACAGACGATTCAGCACAGACAGACAGCCAACAGCAAACACAGTCATCCGAAATCACAGAAATCAAAACGCAGCCCAAGAGGCTCCACGTCTCCAACATCCCCTTCAGGTTCAGAGATCCAGACCTCAGGCAAATGTTTGGCCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATCATATTTAATGAACGAGGATCAAAGGGTTTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAGTAGTGCCGATGCGGACAGGGCCAGAGAGAAATTACACGGCACGGTGGTAGAAGGTCGTAAAATAGAGGTTAACAATGCAACAGCACGGGTAATGACGAATAAAAAGACAGTCAACCCATATGCAAATGGCTGGAAGTTGAATCCAGTCGTGGGTGCAGTCTACAGCCCAGAATTCTATGCAGTGCCAGGCTTCCCATACCCAGCAGCCACGGCGGCAGCGGCGGCGTACAGAGGGGCACACTTAAGAGGAAGAGGCCGCACCGTCTACAACACGTTTCGGGCAGCCGCGCCTCCCCCACACATCCCAGCCTATGGAGGTGTTGTTTACCAGGACGGGTTTTACGGTGCAGATATTTATGGTGGTTACACTGCCTACCGATACACTCAGCCTGCTACTGCTACCGCCGCTGCCTACAGTGACAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACAACCACGCACTTGCTCCAGCAGCCACATACAGCGTTGGTGCCATGAATGCTTTCGCACCCTTGACTGATGCCAAGACCAGAAGCCACGCCGATGATGTGGGTCTCGTTCTTTCTTCTTTGCAGGCTAGTATATACCGAGGTGGATACAGTCGTTTCGCGCCAtattaaaagcaaacaaaaaatgcattacaaaaaatcataataaaaacagacaaaaaaaaataaacatttcaaaaccTATTGAGAATCTTCCTGTGGGGGTAAAGGAGGAGTAATTCAGAGGCCTGGGTATTGCAATACATGCAGTAGTGCATCATTTTAGCATCTCTCAAGAGAGAGAAGACAAAAACGGATATTTTTCATCTTATACCTCAGATATTTTGTGCTGTGTATTTTAATATTGTGGgtttttaatttctaaagatTACATAGATTGTTGGCTGTAGAGGTTTCTGTGGTGATCTAGAGAGCTGCTAGATTTTAAAAAgacgaagaagaaaaaaaaaagaataataagatACAAATTGTTAGGGCTTTATCATGTAAATGAGTTCTGTATGATAAATATACGAGTCACTTTGGGGTTATCATATTTTGTAAGAGTGTAAGTGACTAGAGTCGTCCAGTGGTTTCTGCTTTCGTTGACATTGCCTTTACgtctttgttttgttcttttggtTTCAGTTGTTTTTGGGTTCTGTGGCGTAGAGGACGAGCACGCAGGGGATGGTGGGTACGAGTAGATACGGGCGTCTGCGTGGTAAAAGGTCAGTGTAGTTGCAGGAGCACAGCAGAGACACAGAGCCGGTCAAAGAGACCACGGAGGTATCGATTATTTAAGCTGTCTTATATCAGTCATTACTCAAAGCCAAAGGTTATGTTCCTGGGGTGTTCCGTGTGTAGATTCCAACTATACATAGCAGCTCGTAGAAACTCCCCGAAAAGTTCACCacaacagtattttactgtttaactATTATCTAGTCCCTAAGTCCAACCCCTCGCTAGTTTAGGCCTACCACGAGATGTTCTTTTTATATATTACGGTACTTCCAGTACGTCGATTGATATAAATGCTGACTTTTATAATACGGGAGAGACAAAACacgacgaaaaaaaaaaaaacgaaaaaagaaaaaaagacgcCGACCATAGCGCCGgttctattttaatttagtttcttttaccttttgttttgtttagtttttttttttttctcaagagtTTATTTGTACAAGCTGAgagtgggaaaaaataaactaacaGTGTATTAAATTTGATCTGTGCAGTGAAAATGTTCTCTTATACGACAAACACAACTGTATAATGTTTTAGATTTAGTGTGGTAGACCAACTGTTAGAGAAAGGTGTCTCATTTTTTATGGAATCATACACAGATTTATATCAACACTTTACAAGTAATGCAATCATTATGTAGATATAATCATAGTATTTTTGTCAACTGTACAATTTTGCACACACGACCTGCAATTTTTTCATCACAActtcttctcctccttctcctcctcctcctcacttGTCTGTTTTCTTTCGTTTTCTCTGCTTCCTTCGGGTGTTTCGTTTTGATATCATTTTTAATGTGACATCCTTTGTACTATTATTTTCTAGAACACAGCCTTTACACTTTGAAACTGTTTGATTATCAAGAAACTGAGAACTATATGACTTGTGAAAAAGATATCTATATGTAAATAGGAATAATGATAACTATGTCATTTACAAGTGCTACACAAGCAAGCTGTCGAGGTGTTCTTGAAGAGTCGCAGCTTGGCTGTGCATATGCGAAGACTTCCCTTCATGTTGTTTACAAGTATACCTAATTAGAGGTGTTTGTCACATAtctcatttttctttattttgtatttataaaacGTTTCGATtgcataaaaatacaaacaaaagagCAGCTCCAATTTATCCGGCTGCAAAATATCCTCTTGTGTACTGTGTGCGTCACATCACACAACTTGGCAAAAATATCTTACCCACTGCTGTGATTCTGCTCTTTCTGCTTTAAGTACGTGTTGTGGACAGGCTTTCTCCTTGTCATTGTATGTGCATGCACTATGATCTGCATAACAATAACCATCAATAAAGTTTCTCAAGATAACGGG
>TCONS_00051442
CCCAAGAGGCTCCACGTCTCCAACATCCCCTTCAGGTTCAGAGATCCAGACCTCAGGCAAATGTTTGGCCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATCATATTTAATGAACGAGGATCAAAGGGTTTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAGTAGTGCCGATGCGGACAGGGCCAGAGAGAAATTACACGGCACGGTGGTAGAAGGTCGTAAAATAGAGGTTAACAATGCAACAGCACGGGTAATGACGAATAAAAAGACAGTCAACCCATATGCAAATGGCTGGAAGTTGAATCCAGTCGTGGGTGCAGTCTACAGCCCAGAATTCTATGCAGTGCCAGGCTTCCCATACCCAGCAGCCACGGCGGCAGCGGCGGCGTACAGAGGGGCACACTTAAGAGGAAGAGGCCGCACCGTCTACAACACGTTTCGGGCAGCCGCGCCTCCCCCACACATCCCAGCCTATGGAGGTGTTGTTTACCAGGACGGGTTTTACGGTGCAGATATTTATGGTGGTTACACTGCCTACCGATACACTCAGCCTGCTACTGCTACCGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCATTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGAAATTTCTTGTAACACCTCctcagTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACAACCACGCACTTGCTCCAGCAGCCACATACAGCGTTGGTGCCATGAATGCTTTCGCACCCTTGACTGATGCCAAGACCAGAAGCCACGCCGATGATGTGGGTCTCGTTCTTTCTTCTTTGCAGGCTAGTATATACCGAGGTGGATACAGTCGTTTCGCGCCAtattaaaagcaaacaaaaaatgcattacaaaaaatcataataaaaacagacaaaaaaaaataaacatttcaaaaccTATTGAGAATCTTCCTGTGGGGGTAAAGGAGGAGTAATTCAGAGGCCTGG
>TCONS_00051443
TTTCCATTCAGTGTGAGAGTGCATGAGTGTTGCTTCATGGAGCTGCGCGGCCACTGTTAACACTGCCTGGTAGCTATTCTTCCACACAAGAGCTCTCGCGTCACGAGGGGgGTAATCAAGACGCCCCAGCACCCCCAGAAACCATGGCCCAGCCTTTCCCATCGGCCCAGTTCGCTCCCCCTCAGAACGGCATTCCTGCTGAGTACACGCCGTCCCACCCTCACCCGACCCCAGACTACTCGGGCCAGACCCCGGTGGCAGAGCACACGCTGAACTTGTACACCCCTGCCCAAACGCACAGTGAGCCCAGCGGACCAGACAACAGCATACAGGCGGTCTCCGGCACAGCCACACAGACAGACGATTCAGCACAGACAGACAGCCAACAGCAAACACAGTCATCCGAAATCACAGAAATCAAAACGCAGCCCAAGAGGCTCCACGTCTCCAACATCCCCTTCAGGTTCAGAGATCCAGACCTCAGGCAAATGTTTGGCCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATCATATTTAATGAACGAGGATCAAAGGGTTTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAGTAGTGCCGATGCGGACAGGGCCAGAGAGAAATTACACGGCACGGTGGTAGAAGGTCGTAAAATAGAGGTTAACAATGCAACAGCACGGGTAATGACGAATAAAAAGACAGTCAACCCATATGCAAATGGCTGGAAGTTGAATCCAGTCGTGGGTGCAGTCTACAGCCCAGAATTCTATGCAG
>TCONS_00051444
GACCCCAGACTACTCGGGCCAGACCCCGGTGGCAGAGCACACGCTGAACTTGTACACCCCTGCCCAAACGCACAGTGAGCCCAGCGGACCAGACAACAGCATACAGGCGGTCTCCGGCACAGCCACACAGACAGACGATTCAGCACAGACAGACAGCCAACAGCAAACACAGTCATCCGAAATCACAGAAATCAAAACGCAGCCCAAGAGGCTCCACGTCTCCAACATCCCCTTCAGGTTCAGAGATCCAGACCTCAGGCAAATGTTTGGCCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATCATATTTAATGAACGAGGATCAAAGGTACGTTTTGTGACTTTTATCTTTTGCATGCCTTCAAttgctgaccaatcagaacagtgcAGCGAGTTAAACGTGTATCCTGTTTACCTTAAAAACGAGACAGAAGCCAGTACCTGCACTGTACAGAATAATGCTTGTTGTAGTCATGTTAACGTATGTAATGCAATCTCATATCAGCTGCTGTGCTAAAGTTATTAGTGCCCTGTTCAATGGAGTGTGTGGAAATGTGTTTGGCACTTGTCTTTGTTCAGCTACGGTGTCAAATGAAGAACATTCTCCGCTGAGCTCTGTAATTGACAGCGTTATTCAGTGTTATGACACTTAGCATCATTCCTGT
>TCONS_00051445
GCGACTGCATGCATATAGCTCAGCTCTTAACTAGAAGGACTTGTGGTGCAGAAAAGCTGAAGGATTCTGTGCATCACTTTCGAGTTGTTTACACTAAAGCCCTGAGCCAAAGTCAGGCTCGATGCTGTGAACTTGAGAAGGATCACACAAGGATGACTGTGGCACAGGCGCGTGGAGTGACAGATGCAGTCATTTACATGGCACCACGTGGATACGGTCCACTGACTACCACTCGCGCGCTCTCCGTTGCCCGTGCCGCCTCTCTCCGCGCGCAATCGGTTTACCTCCACTGAGAAAACAGGAGGCACTTTTCCTTTGCGTTTTCGCTGCCCGACCACAATGAAATCTTGGCAGCTAATTGCAGTCGTGGGAGATGCCCTTCAGATTCCAGGACAACCAATGAGTTGTGATACGGACCAGCTAAGGgGTAATCAAGACGCCCCAGCACCCCCAGAAACCATGGCCCAGCCTTTCCCATCGGCCCAGTTCGCTCCCCCTCAGAACGGCATTCCTGCTGAGTACACGCCGTCCCACCCTCACCCGACCCCAGACTACTCGGGCCAGACCCCGGTGGCAGAGCACACGCTGAACTTGTACACCCCTGCCCAAACGCACAGTGAGCCCAGCGGACCAGACAACAGCATACAGGCGGTCTCCGGCACAGCCACACAGACAGACGATTCAGCACAGACAGACAGCCAACAGCAAACACAGTCATCCGAAATCACAGAAATCAAAACGCAGCCCAAGAGGCTCCACGTCTCCAACATCCCCTTCAGGTTCAGAGATCCAGACCTCAGGCAAATGTTTGGCCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATCATATTTAATGAACGAGGATCAA
>TCONS_00051446
CCGCTGCAACTTAACTACGTCCAGTCACCAACTCTCCTTCCTCTTGCCTGTGATTGAGCGTATTTACAAGAGCGACAAACGGACTGACTAGTGTTTCGTGTGTATTTACAAAGGCTTTACCAAATCCGTGCAGGACAAGAACAGACTCGCGCTGTGTTTTTTGCTCATCACCGGGACCCTCGCGCTCTCACATCCGCCGGTTATTCAGCCACGTTTGCGCACACTCCGTGGCTGCTTCCAGGCTTTGTAACCGCATCCTATCCTGCCAAAGCAGACTCTGAAACTCGGTGGAGAGAACAGGACGAGCGGACGCGAACACGATGCAGCATCCCTTGACGGGCGGAACGTGCGTCGCCCTGCCGAACGTGGACATGTGTCCGCAGCTCTCCTGTGCCTTGACTTTCATGTACTTACAGCAGgGTAATCAAGACGCCCCAGCACCCCCAGAAACCATGGCCCAGCCTTTCCCATCGGCCCAGTTCGCTCCCCCTCAGAACGGCATTCCTGCTGAGTACACGCCGTCCCACCCTCACCCGACCCCAGACTACTCGGGCCAGACCCCGGTGGCAGAGCACACGCTGAACTTGTACACCCCTGCCCAAACGCACAGTGAGCCCAGCGGACCAGACAACAGCATACAGGCGGTCTCCGGCACAGCCACAACAGACGATTCAGCACAGACAGACAGCCAACAGCAAACACAGTCATCCGAAATCACAGAAATCAAAACGCAGCCCAAGAGGCTCCACGTCTCCAACATCCCCTTCAGGTTCA

Function


symbol description
rbfox1 Predicted to enable mRNA binding activity. Acts upstream of or within heart contraction; hypothalamus development; and regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome. Predicted to be active in cytoplasm and nucleus. Is expressed in digestive system; heart; nervous system; neural keel; and skeletal muscle. Orthologous to human RBFOX1 (RNA binding fox-1 homolog 1).

GO:

id name namespace
GO:0021854 hypothalamus development biological_process
GO:0000381 regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome biological_process
GO:0006397 mRNA processing biological_process
GO:0043484 regulation of RNA splicing biological_process
GO:0007399 nervous system development biological_process
GO:0060047 heart contraction biological_process
GO:0008380 RNA splicing biological_process
GO:0005634 nucleus cellular_component
GO:0005737 cytoplasm cellular_component
GO:0003676 nucleic acid binding molecular_function
GO:0003723 RNA binding molecular_function
GO:0003729 mRNA binding molecular_function

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-040927-11 Predicted to enable mRNA binding activity. Acts upstream of or within heart contraction; hypothalamus development; and regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome. Predicted to be active in cytoplasm and nucleus. Is expressed in digestive system; heart; nervous system; neural keel; and skeletal muscle. Orthologous to human RBFOX1 (RNA binding fox-1 homolog 1).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000014746

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00051439 False 4963 mRNA 0.38 12 27982269 28250722
TCONS_00051440 False 4987 mRNA 0.38 12 27982269 28258462
TCONS_00051441 False 3190 mRNA 0.43 12 27984158 28075756
TCONS_00051442 False 944 mRNA 0.48 11 27986005 28048475
TCONS_00051443 False 759 mRNA 0.53 7 28039535 28120092
TCONS_00051444 False 662 lncRNA 0.46 3 28045341 28068211
TCONS_00051445 False 865 mRNA 0.54 5 28045680 28428198
TCONS_00051446 True 774 mRNA 0.57 3 28048436 28209001

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_026391 NA coding downstream 55216 27916224 ~ 27927053 (-)
XLOC_026392 NA coding downstream 58253 27921787 ~ 27924016 (-)
XLOC_026390 mettl22 coding downstream 66999 27884685 ~ 27915270 (-)
XLOC_026389 abat coding downstream 102040 27832500 ~ 27880229 (-)
XLOC_026388 dnase1 coding downstream 197812 27778975 ~ 27784457 (-)
XLOC_026394 NA coding upstream 16036 28444234 ~ 28502493 (-)
XLOC_026395 NA coding upstream 31136 28459334 ~ 28462351 (-)
XLOC_026396 fbxl16 coding upstream 206269 28634467 ~ 28665291 (-)
XLOC_026397 NA coding upstream 267564 28695762 ~ 28698856 (-)
XLOC_026398 gsg1l coding upstream 290619 28718817 ~ 28750495 (-)
XLOC_026387 NA non-coding downstream 198977 27777362 ~ 27783292 (-)
XLOC_026383 NA non-coding downstream 539776 27408273 ~ 27442493 (-)
XLOC_026382 NA non-coding downstream 691489 27288743 ~ 27290780 (-)
XLOC_026399 NA non-coding upstream 324115 28752313 ~ 28756620 (-)
XLOC_026400 BX510989.1 non-coding upstream 373168 28801366 ~ 28905492 (-)

Expression



Co-expression Network