XLOC_026401 (si:ch211-76l23.4)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_026401
gene name si:ch211-76l23.4
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 28822065 ~ 28828569 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00051454
gcaaacacagggagaacatgcaaactccacatggaaatgccaactgacccagccaaggctcgaaccagtgaccttcttgctgtgaggtgattgtgctaccgactgcaccaccatgccacccataatttagtttaaatactaaaatgtaaatattttaaccattaaccagCAAAAATGTAGCAAACAAACCTTTACAGAACATTTTGGACCTAAAGGAAAGGTTTTGACATTTAAGTCTCGGTGGCTTGTTTGTACAAGCCAAGGGTTTGGAAAAGATGTGTGTGATGGGGGAATGTTTTAAAACCAGAGGGAGTGTTCTTCAGTCTTTGGGACAGACTGGTGCAACTACCAAGACACAGAACTCCAGGGGCACCACATAGAGCACACATCTTCCCAAACTCTCTGACTGGTATGTAAGCATGGGTATTTAGACCCACACATTTATATTATTCCAAGAATCTAATTTACTTTAGCTGTTTGTAGCAATAACAAAtgacaaatgtctgttaaatgcATTCTATGTATTCATATTAACttcacataaatatatttattatttttatgtgtattgtatttgcatgcatattgtttaaaaaaaaaaaaaaagtagctcacAATCATGAACAATGTTTTCATGCACAGCTATCAGGTAAGTCGACACAGATTGTGCCCTGAAACCAAATAGTGTTtatgcagaaatataatttttaggATTAGGAGTAATAGTGAGTTCAGCAGCACAGGGATTGGTTTATGTCTCACTAAATATACATCATCTGCTTAGTGGAACGGAAGAAAAGACCTGAgccattatttaaacatttttactggAGGAAACTGACTTTTCCGGACATGTTAAACTCTTATAGGAAACGTAAAGAACCAGGATGAGTTTCAGGGTGAGCTTGTTGAACCTGACCATGATTGTGGTCATAGTCTGTGGTCAAAGGAGACGCCCTGCAAAAGAGGAGTGGAACTACCGTGATGGCTCTGAGAAAGTAAGCATGCGAGGAGTTGCAAATCTGACTCAAGTGCTTGATGACTGGAGGTTTGACATCCTGAGCCAGGTCAAAGGACTCCTGCAGAACGACCACCAGTCCCTGCTGCCCGACTACTCTAGGATTCAACCTCTCACCGAAGCGCTTGATGATTTGTACAAAGAGTTTAATGCCCTGAAAGCTCATCTTGGTGATCTGACAGAGAAGTTTGGACCATTGGAGACCTTTGTGGATGAACTAAAGACGGAAAGAGCCAGTGCAAGTGCAGCACCTGCTACCCCGGTGCGCAGACGCCTTGTTAAGAAGACCCCTGCTTCCACCTAAAAGCCTTACACTTTAGTAGAGCTGGATCTCTCTTAAAAGCAAACGACTTTGATATTGATTCGTTTAGCAGCCTTTTCTTGAGCTTTTTACTCTTTGGGCATCTTGTTGCTGTTTATACGTTGCTGGGAAACAAGGTAATAAACAATATGCTGAACATTAAGAATCTCCCTCTACAGTATATGTGGTTTGGATTGTATCCGAAAGCAGCAATTTAAAATGTGACGGCCTGCTCTAATTAACATTGCTAAAAAAATAACGAACACAGCTGTGACCGCAGGACTTTATTTTTAGAGCCCCTTCCATTACTCCTAATAAAAAGGAAACAAACAGCCATTTGTTATTCAGCATAAGAGTATCACATTTGGCTGGAAATGAGTCTGAATGAGTGTATTCAAATATGCATGACTGTCAGTGGAGTGATATGTGGTGTTTGCAGCTCTTGGGATGATCAACGACTCGTGCAGGTATAAACGGATTATGTACAAGCTAAGAACATTTCAGGAACACAATAGATTGAGATTTTCAttgtgtatttgtgcatataatCTGATGAGCATGGTAATTAGATGCTTAATATCTCTTGGCTCATATTTGCCATCTCATGCAAGCTATAATAAATTCAGTCTGTTGCATTCACTCCTAAGTTTCGGTGTGTTAGCTAACTTTTAGCATAATTAGCTTTGTGTGTAACAGTCAGTATGGTGTTTTGTGCAATAATCAACCATTATAAGATTGTTTGTCTCATCTCCTTTTCTCTGCTTCTTAAACTCATCGAAGAagcctccatccatccatccatccatccatctttctgtctgtctttcataatattaataaataagaggACCAAACAGCATTAGAAAAGATGTCCATTATTTATGACAGTGTTTATGTCATTATTTATGGCCAGTTATATAAGGTAATATAATGTCTTCTGTAGCCCTTTATTACTATAATTCAAAAATGTTCCCCCCTcattaaaatgcatataaaaataacatGCAGCACTATTATTTATTGACTCTGTCACAGTTTCAGTCTGAGATTCCTTTCAAAAGTGGAACTGCATATACTCTACAATGTGGACACTTTGCAATTTTACAAACTTCTACAAGACTTTAGGATACTGAAGCCATACAGTTCAGGTTTTTTATTGCATTGATCAAAAATCTATGTATGAAGCATTTcctatacaaaacaaaaacatttttaaaggtgcCAAAATTGTTCAAATACAGTGTTTGATTTAGAAAACAATTTATAAAGACTTAAAGAAATTTGAAagtattatagttttattttagtggCTTTACCATAGTGGAAAAGtgttttacaaaataaccaaATCACTTAAAGGacctaaaaataaccaaaaactcATTATTTTTGAAACTCACCAACACATGGTGATCCAATCAATGGAACAGCAGTTATTGTAGCACAAATGAAGATTAAAAACGTCTATAATTTTCTATCTCCACTGCACTTTTAAAGACCATTTGTTAAAATGAAGAGTTCATCTGCAAAAACagataaacactttttttattataaagtttttttaaaattcaatgtAATTGATATAATTTCTGAAAACTACAAAAGATTGGCAGGTTTAGTAATTTTATCaggtttgcttttttatttatttagtcagtcagtcagtcagtcggtcagtttGTTAGTTATACTTTTCAATGACCAacataaaaatactaaatgacaacaacaacaacaacaacaacaaaagatttaATAGTCTAAATTAAAGTCTTCaaatgttgatttaaaataatcttatgtAAACTGTCACACTTAATTCAACAGTTTATGTAAGAGTGCGATTTACACATAACATCTGGTTGTATTTTATGAATGAGGCTCACAAACCACAGAACTGTGAGGTTTATACAACATGTAACCACCAGGAGGAAATAAAGGATTTTGTATCTCTGTGGGTATACATTAAAAAGTTGTTAGGACACTGTGGTCGTGAAGTCATGTAGTAATATCAGAACTACCAGACCACAACTTTTATGTCCATTATAGCCTCTGTGTCCTAAAGGAACAACACCAAGAGACGGTAGtagcaaaacatattaaaataacgGTAGACTTAATGACGGAGGCATTTCATTAATCATAAATCTCAGAAGGAAGTCTCTTATCTTGGAAGATTTATGAAGCATAACTTTGAAGAATGTGTTACACAGCCCTACATTTTATATAATCACCTCTTATTCCCGTAAGTATCTTGAGCTGTAAATTCATTTTCATGACTGTAATCTGTCATTGGTGTTATGGAAAAAGAAAGTTATTAAAAGTTTTTTGTGACAGTATTA
>TCONS_00051455
TGGGACAGACTGGTGCAACTACCAAGACACAGAACTCCAGGGGCACCACATAGAGCACACATCTTCCCAAACTCTCTGACTGGAAACGTAAAGAACCAGGATGAGTTTCAGGGTGAGCTTGTTGAACCTGACCATGATTGTGGTCATAGTCTGTGGTCAAAGGAGACGCCCTGCAAAAGAGGAGTGGAACTACCGTGATGGCTCTGAGAAAGTAAGCATGCGAGGAGTTGCAAATCTGACTCAAGTGCTTGATGACTGGAGGTTTGACATCCTGAGCCAGGTCAAAGGACTCCTGCAGAACGACCACCAGTCCCTGCTGCCCGACTACTCTAGGATTCAACCTCTCACCGAAGCGCTTGATGATTTGTACAAAGAGTTTAATGCCCTGAAAGCTCATCTTGGTGATCTGACAGAGAAGTTTGGACCATTGGAGACCTTTGTGGATGAACTAAAGACGGAAAGAGCCAGTGCAAGTGCAGCACCTGCTACCCCGGTGCGCAGACGCCTTGTTAAGAAGACCCCTGCTTCCACCTAAAAGCCTTACACTTTAGTAGAGCTGGATCTCTCTTAAAAGCAAACGACTTTGATATTGATTCGTTTAGCAGCCTTTTCTTGAGCTTTTTACTCTTTGGGCATCTTGTTGCTGTTTATACGTTGCTGGGAAACAAGGTAATAAACAATATGCTGAACATTAAGAATCTCCCTCTACAGTATATGTGGTTTGGATTGTATCCGAAAGCAGCAATTTAAAATGTGACGGCCTGCTCTAATTAACATTGCTAAAAAAATAACGAACACAGCTGTGACCGCAGGACTTTATTTTTAGAGCCCCTTCCATTACTCCTAATAAAAAGGAAACAAACAGCCATTTGTTATTCAGCATAAGAGTATCACATTTGGCTGGAAATGAGTCTGAATGAGTGTATTCAAATATGCATGACTGTCAGTGGAGTGATATGTGGTGTTTGCAGCTCTTGGGATGATCAACGACTCGTGCAGGTATAAACGGATTATGTACAAGCTAAGAACATTTCAGGAACACAATAGATTGAGATTTTCAttgtgtatttgtgcatataatCTGATGAGCATGGTAATTAGATGCTTAATATCTCTTGGCTCATATTTGCCATCTCATGCAAGCTATAATAAATTCAGTCTGTTGCATTCACTCCTAAGTTTCGGTGTGTTAGCTAACTTTTAGCATAATTAGCTTTGTGTGTAACAGTCAGTATGGTGTTTTGTGCAATAATCAACCATTATAAGA

Function

GO: NA

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-030131-8310 No description available

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000096242

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00051454 False 3664 mRNA 0.36 3 28822065 28828569
TCONS_00051455 True 1267 mRNA 0.42 4 28823675 28828242

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_026399 NA coding downstream 65445 28752313 ~ 28756620 (-)
XLOC_026398 gsg1l coding downstream 71570 28718817 ~ 28750495 (-)
XLOC_026397 NA coding downstream 123209 28695762 ~ 28698856 (-)
XLOC_026396 fbxl16 coding downstream 156774 28634467 ~ 28665291 (-)
XLOC_026395 NA coding downstream 359714 28459334 ~ 28462351 (-)
XLOC_026402 C3H16orf89 coding upstream 22606 28851175 ~ 28857195 (-)
XLOC_026403 BX510989.3 coding upstream 30715 28859284 ~ 28859400 (-)
XLOC_026404 eef2kmt coding upstream 41041 28869610 ~ 28872756 (-)
XLOC_026405 BX510989.2 coding upstream 71026 28899595 ~ 28909948 (-)
XLOC_026406 BX005369.2 coding upstream 423380 29251949 ~ 29252065 (-)
XLOC_026394 NA non-coding downstream 319572 28444234 ~ 28502493 (-)
XLOC_026392 NA non-coding downstream 898049 27921787 ~ 27924016 (-)
XLOC_026407 NA non-coding upstream 548044 29376613 ~ 29382605 (-)
XLOC_026409 BX571960.1 non-coding upstream 724072 29552641 ~ 29552762 (-)

Expression


Co-expression Network