G745760


Basic Information

Item Value
gene id G745760
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 74542839 ~ 74549712 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU846531
GAAAAAATACGAATCAACAAGTGATATATGCTTTTGTCTCCCCCTTTTGACAAAAACAGGATAAGACTTTATTGTTTATTGACATGTAAGATGTAGGATAAAACTTTGGTCATGGAAAACAGAGTAAAGCAGAGCAAAGCATTATTATAAACCATCTGGTCCTCTCAGCTACTCCTATCCTGCACCAGGTGGGCACCATGCCACCCAGGGACTCCAAACCTTCACAACAGGGAGAACAAACATACTGGAAAGAAAAcctatcattaaaaaaaaatgtaaaacaaggAACTGTGGTGGTGTAATATTTATTCTACTACCTCACCCACAGCATACCATGGGTCATCCTCAGTCAGTCCCATCCTCCCCTGAAAGCTTGATTCAGTATCAGCATCTCCAACTGGAGCATCAAGCAAAGGCATCATGCCTGAAGCATTCACCACATCTGTAACAGACTTCTTAAAACATGGTATGAtgcaagcagcacaacacatcaataataaAAATACAAGAATTAGGGTCAGAAATCCAGTAACCACCATACCAGTGAGTGCATCACGGGAGTAATTCACAAAACGCTGTTGATTATAGTAGATGTAATTCATCCATGCAGTCTGTCTAGCATCCACTATGGCTGGACCTATAATAGGTAGTAAGTGCCAGAGTCCATCATTCCTACCCAAGGCCTGAAACTCATGAGGAACCCCCACTGGCACTCCCAACAGGTTAGTGTGTATGTCAACTACATCCTCTGTCCATGGAGCACTACGTCTATGTCTCCCATGGGATGGAATGTTTTCAGGTCCCCTGGATACAGAGCCCAACAGCTGTTCAGCAGTAACATCAACAATGGTCAGTGGAATTATCAAACTGGTCAGAGTACACGTACCTTGTCAGTCTCCTCTAAGAATGGGTCTCAGCAGTCTTTTGGGTCCACATATCCACCACACATCAGCCAGACCACTAGTTTGGTTTAGGCCTGTAACTGGCCAAGTGGCATTAATGGTTATGTTACTACTGCAATCAGCTTCAGGCAATCTCCCATAATCAATGCCATTACCTGTACCCGTGATGCAACTGTAATTGCCCCCATATGCCTTAACACCCCAAGGGGCCCGATGAGGAGGTACTGTAGGAAACACAAGGCtcaaagaggaacagagagtTGAATTAGGCTGAACTTGGTAAAAACCTCTCAGAatacacaaccacccctctccttctcctatagCAAATGGGTGTGTAGCCAGAACAGGTCTAGGCATGACCAATGTTTCATGTAGTCCTTTCTTTTCAGGGTCTTAGCTGTATACCTCATATAAGACAGCCACAAATTGTCCCTACCATCAAAACCAGTCTCAGTGCCTAATTGATCAATAGCTGAATAGTCTCTAACGTTAATTACCTGAATGAGATTTGACACAGTGGTGGTAGGTGGCAGTTTCGGTCCAGGGGTGGTAGAGGAGTGTGTCTGGCTCTGGTTCGTCTGGGACCTCTGTGGTTTTGGCAGCACCTTAATAGAAAACACACCCATCGTGTCTGTCCTGGTCCTTTGTATTCCGAGGGTGTAAGTCCCTGCATCAGAGAgcttaatagttttgatggttaGTAGGATTTCATCACTTTACAAAGTTCAACAGTGCTCCCAGGTTTCCCCCATATcatggaaaacctatccacctttGTGGGATCCCCTATGCTATAAGGATACCCTCTTCTCCAATCCTTAGAACTGTCCCAAGTTGGTTATCATGTAATCCCCATACGGACACCCTcccccattacacaggtacactgacactcctgtaaagccccaccctctcccagaGAACACATCAGCAGCCAGAGACCAAACCACACTTCCACTTCTATGAACGCTACACAGTGATGGGCGGGGTCAGGAAGCTTCGTTAAGAGAGTGAAACCCCGAGCCATATTGGTTTCGGTTCTTCTCTCTAACTCTGTGATGGTTCGGCAGTGTCAGTGTGTCCTACCCTCCAACAATGTGTGATATGTCCCCAGGTAGCTACCGCAAAGGCTGTCACCAGGAGCACTTGGTATGGCCCTCCCAACGGGCTGCTTCACATCTATTCTCCACAAGGACTGGATTGAGTGAATCACCTTCTCCTTTAattcacctgtaatgcataacATCTTGGACATACAggtttggttaacaaacagtttcaCATTTGTTCTGATTATATCTTTAACTTCTATGCCTACTTGTTagctacattttaaaaaattagtTTATTATCCAAACGGCCACATCCTATCCTAGACCACAACTTACCCATCCCCCctttgatacctggctctgcccaggtaatAACCTTGCCTACTCTAAAcaatgacttaggtaagattagtaaattatccttatgtctgacattatcatgtaggagcacccctttcattctccacatgtccaattctcccttggGCGTCCATTCATATCTATCCTGTACCAATTCTCTGTCAAGTGTCTTATCTACTTGAAGAGGTATCTGAGCTGCTTATATATgttcttaaatatatatatttttttcgaTTTAAACAGTAACCCTTTTCTCTCCTATCTTCCAAATATTAACTAAGCGTCTCACTGTTTGGCTTTATCTAAAATCATTGATTTGAGAAAAAAACATGTCTATGGTGGCAATCTCTAAAGTCCTTACATAACTTTTATCTCGATCCTATCAATAATCCTAAATCATCCCAGATGTCATATATCCCTGTCAACTTTAATActattaaaataaaaatattctaatGGTCAAATAAAGCCAAAACAAATGCGAACCATATCAAATCCTTTCTGTACTAATAAGCTCTCTCCTTCAGGGTCACAGTAATTTATCTAACAATACCATGGGTTAACCTTAAAATCAGTCTCATCAATAATTTAATATGTTGCATAGTGTGGGATACCTTATCTACAGTAATTTACCACCCCTAAGAactgaaacatttttattttcattaaTAATTTTAATGCTTATAAAATCACAATTTTTCTATGTATTTTCCTGCCCTATTGGCTTAAAATATATCCTGTCTAAACCTCAATGTACCATATCTTCCCCTATTTATTATCGATGATAAATAGGATTTTTTTCTGTTGTAATACCAAATCAATAATAGCCAATTCAAAACCTTCACAGCAAATGTTTAAAAACAGAATCCTGAACCATCCTCTTCCTCACTAGAGTTTATTCCCCCGCTCCTCATAATTTGTCCTGCCTCAATTCCACTTTTTCCTCTGTGGTTCAAACTATAATTATGTCCAAGAGCTATAAACTCCATTATAATTAATAAATCTAATCCCAGTGCAGGAACATcaatcagcggaaatttcagagcgccaactATAGTtttcgataaaactcaaactttcattaaaacacacatgcaaggtactgaattaaagctacactcgttgtgaatctagccaccaagtcagatttgtaaaattcttttcggcgaaagcatgaaaagctattatctgatagcatgcacccccccaaaataccagaacGTCacctaaacaacagattttgcggtagccggtgctacacaaaacgcagaaataaaatataaaacattcattacctttgacgagcttctctgttggcactcctatatgtcccataaacatcacaattgggtctttttcccgattaaatccgtcaaagtatgccaaaaatgtccatttataaaggcCGTCTGATCCAAGGAAAATGCAGCTTTAcacgacgcaacgtcacttttaaAATTaacaaagttgcctataaacttttacaaatcacttcaaactacttttgtaaaccaactttaggtattaataaacgttaataatcgatcaaattgatcacggggcgatctgtattcgatagcagcaagtcttgaaatcatcttccatttttttcactttcataatttcctgggtgcaccccaagacaggaagtgcctatacgtCATCCCACCAAGGATAAACGTGCAAAGAAATGCCagtattggcgacatcgtgtggaagctgtaggcgttggAATCTCATCTATTTTCTGTCGGCTGATCAGACCACAAGAGATAGCCATGATAAAGGTCAAAGGTTATAACACCCTTTTATAGTCATGTTCCATACCATATTAGACATATTAAAGAACcctttatctaaaaaaaaaatcccttgtgtaattaaaactcagaaaataaaactCCTAATATTCcatatgtgagtgtacccctttaagatttcctcaatgtttcatgtaactcattcaGTCTTTCTCCAAATAATTTATAGGAACACCCTGCCATTGGACTCACACAACTGTGATAaacgtgcactgtccctttaaaatAAAACAAACTCAGCCAGCAATAAACTTTGCGGACCTTTCATTGTTCCCCTTAATGAAAACAGATCATGTTTAGAATACATTAACTTCTTGTTCAAATTCACTGGTGTAACctaaacaatcaaaccaaaaaTCAATAACCGGGAACTTATCACAAACTTTTACTATTCAACTATTCAGACCTCCCTCTCTTTTAGCCAAATATAGCCCAGTAAACGCCACCAATCAGTGATGGCCATCTAGCGATTTTGTTGCTAGTTTTAGCATCTTTTCAGACTACCCTGACGATATAcagctacttttaaaaatgtatttggaactttTATCAACTTCTGAAAAGTGACTCAAAGCTATAATGCACGCATTTTCCTTCTAAATGACACAAACCATTTTCTCTGAGTGATGTCAGTAACAGGCGCTCAACCCGTCCCCAAGCCACAGCGACTTTCAACGAATTGCAAAACAttgttggctgactgcagcagcagtagtacgtACGTGTTCGATAAACCAAACCCCAATTTATCACAAATGTTGGACCTTGAATagaacttacaacatcaatcaacatctCTCAATCAAAATTGTACTGCCAGAAGTACAGCAAAGAGTGTTACCTGAACAACGGTCAAAGCAATT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Function

NR:

description
uncharacterized protein LOC110510149

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU846531 True 6874 lncRNA 0.39 1 74542839 74549712

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110530584 LOC106569421 coding upstream 8822 74530674 ~ 74534017 (+)
LOC110530582 LOC106569368 coding upstream 41717 74480507 ~ 74501122 (+)
parp2 parp2 coding upstream 104258 74431744 ~ 74438581 (+)
sdr39u1 sdr39u1 coding upstream 114697 74424447 ~ 74428142 (+)
ltb4r2b LOC106569372 coding upstream 129634 74408385 ~ 74413205 (+)
LOC110530591 LOC100196652 coding downstream 147637 74697349 ~ 74712803 (+)
LOC110530590 LOC106569450 coding downstream 163378 74713090 ~ 74717411 (+)
LOC110530985 NA coding downstream 245704 74795416 ~ 74796285 (+)
LOC110530598 LOC106569444 coding downstream 254989 74804701 ~ 74813438 (+)
LOC110530599 LOC106569443 coding downstream 272782 74822494 ~ 74843597 (+)
G745899 NA non-coding upstream 13051 74529563 ~ 74529788 (+)
G745898 NA non-coding upstream 13490 74529117 ~ 74529349 (+)
G745893 NA non-coding upstream 19675 74522964 ~ 74523164 (+)
G745892 NA non-coding upstream 20426 74522192 ~ 74522413 (+)
G745884 LOC100136012 non-coding upstream 33113 74509416 ~ 74509726 (+)
G745770 LOC100653464 non-coding downstream 79079 74628791 ~ 74643321 (+)
G745907 NA non-coding downstream 129618 74679330 ~ 74679543 (+)
G745908 NA non-coding downstream 130625 74680337 ~ 74680554 (+)
G745910 NA non-coding downstream 132183 74681895 ~ 74682190 (+)
G745920 NA non-coding downstream 145000 74694712 ~ 74694912 (+)
G745489 NA other upstream 822189 73719716 ~ 73720650 (+)
G745410 LOC106569417 other upstream 947601 73593637 ~ 73595238 (+)
G745083 NA other upstream 1292343 73249424 ~ 73250496 (+)
G744697 NA other upstream 1674457 72867101 ~ 72868382 (+)
G744696 NA other upstream 1678136 72862256 ~ 72864703 (+)
G746052 NA other downstream 402973 74952685 ~ 74953842 (+)
nedd8 nedd8 other downstream 464932 75014644 ~ 75033896 (+)
G746936 NA other downstream 778060 75327772 ~ 75328195 (+)
LOC110530987 LOC106569478 other downstream 800496 75151419 ~ 75357954 (+)
G746951 LOC106591969 other downstream 829790 75379450 ~ 75383243 (+)

Expression


Co-expression Network