XLOC_026481


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_026481
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 32565194 ~ 32572052 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00053062
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>TCONS_00051605
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>TCONS_00052475
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Function

GO:

id name namespace
GO:0018120 peptidyl-arginine ADP-ribosylation biological_process
GO:0003956 NAD(P)+-protein-arginine ADP-ribosyltransferase activity molecular_function

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00053062 False 6666 lncRNA 0.33 1 32565194 32571859
TCONS_00051605 False 6574 lncRNA 0.33 3 32565194 32572052
TCONS_00052475 True 795 lncRNA 0.39 2 32570759 32571628

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_026480 rcn3 coding downstream 24122 32535986 ~ 32541072 (-)
XLOC_026479 si:ch211-195b15.7 coding downstream 93039 32458720 ~ 32472155 (-)
XLOC_026478 prmt1 coding downstream 202173 32356833 ~ 32363021 (-)
XLOC_026477 NA coding downstream 227499 32325134 ~ 32337695 (-)
XLOC_026476 si:dkey-16p21.7 coding downstream 244651 32294745 ~ 32320543 (-)
XLOC_026482 tspan4b coding upstream 14958 32587010 ~ 32596394 (-)
XLOC_026483 NA coding upstream 26592 32598644 ~ 32603191 (-)
XLOC_026484 CU459155.1 coding upstream 31204 32603256 ~ 32637678 (-)
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XLOC_026499 NA non-coding upstream 728142 33300194 ~ 33304123 (-)
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XLOC_026509 CU695077.1 non-coding upstream 1109466 33681518 ~ 33690754 (-)

Expression


Co-expression Network