G756044


Basic Information

Item Value
gene id G756044
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 84797483 ~ 84800786 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU858761
accctcactctctctttctctcaccctcattctctctctctctgtctctctctctctcaccctcattctctctctgtgtctcattctctctctctctgtctctttctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctcgctctctcgctctctctctttcaccctcattctctctcactcgctctcgctctctctttctctctcaccctcacacactctctctctttcaccctcactctctcaccctcactctctctctctcaccctcactctctctctcaacctctctctctctttcactctctctctcaccctctctctctctctgtctctcaccctctctctctctctctctctctctctctctctgccaccaaaACCGATTTACCCATGTTGCATTAATGCAGGGAGATGAAAACGAACAGCCCTAAGTCTGTAACCCTAAGGATTTGCAGATTCATGAATATCTTTAAACAAGAGGGGACCTTTGGTTTGTACTCAGGGAATTAAGTTGCGTGAACACGCGTTTGTTTTGTTCGTTGTCTCGACACCCTCGTTGCCCCCGACCGTATAGCATCTCATttatacattctctctctctctgtcctcactctcctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctttttttgctTGCTTGCTTGCCTGCTAGCCACTAGAAGTCATTGGCTAGAGAATGCCATTATGGAAGAGGAAGCCATGTTAACTCACCTTAGGATACTAAGGTATTACTAGAGCAGTCAACAAGATATCACAGTCTCAcgtcctctgtagctcagctggtagagcatggtgcttgaaTTGCCAGGATAGGGGGTTCCATTCCCAGGACAACCCATacagggttaaggtttaggataggatgaatgctgattggttatgttcagggttaaggtttaggataggatgaatgctgattggttatgttcagggttaaggtttaggataggatgaatgctgattggttatgttcagggttaaggtttaggataggattaatgctgattggctattggTTATGTTCAGGGTTAAGGATAGGATGAATTATGTTCAGAAATGTATTATGATTGGTTATGTTCAGGATTAAGGTTTAGGAtatgattaattaattaaattcAGATATTAATTCTGAGTGGTTATGTTCAGGATTAATGTTTAGGATAGGATTAATTAATTAAATTCAGATATTAATTCTGAGTGGTTATGTTCAGGATTAATGTTTAGGATAGGATTAATTAATTAAATTCAGATATTAATTCTGAGTGCTTATgttcagggttaaggtttaggataggatTAATTAATTACATTCAGATATTAATTCTGAGTGGTTATGTTCAGGATTAATGTTTAGGATAGGATTAATTAATTAAATTCAGATATTAATTCTGAGTGGTTATGTTCAGGATTAATGTTTCAGGATAGGATTAATTAATTAAATTCAGATATTAATTCTGAGTGGTTATGTTCAGGATTAATGTTTAGGATAGGATTAATTAATTAAATTCAGATATTAATTCTGAGTGCTTATgttcagggttaaggtttaggataggatTAATTAATTAAATTCAGATATTAATTCTGATTGGTTATgttcagggttaaggtttgggataggattAATTAATTAAATTCAGACATTAATTCTGATTGGTTATGtccagggttaaggtttgggatagggttaattCAATTCAGACATGAataacctttcgattactggcccaacactcaaaCTACTATTGTGTGTGGAGGGCACGGTGTTCTCAGCAGTGACTTCCTGTTCCGTAGATTGTGGATTAAATCCCAGCTCTggagacttaaaaaaaaaaaatatatatatatatatttttttaagcggATTTAACAACgtgaaatcaataagggatcatagctttcacctggtgtaatgggtgttggtggcagggatgtcaggcgcaggagagtgaaCTTGGTATAAAACGGAGCAGTTTAATGAAAAACTcagaaaaccaaaatatacaaaaaataaaataagagggTGCATCTCGTCTCGTCTgcaacccgtcgcacaccagaacatGACTAGCACCAATACATACAACAAACCGACCAGAACATGACTAGCACCAATACATACAACAAACCGACCAGAACATGACTAGCACCAatacatacaacaaacaatcaccgacaaggacatgaggggaaacagagggttaaatacacaacacgtaaTGAATGGGCTTGGAACCAGGTGTAATGGtaaacaagacaaaaccaatggaaaatggatcagcgatggctagaaggtcggtgacgtcgaacACCGCCCGAATAAGGAGAGggtccgacccccccccccccccccccccccccccccccccccatctacttTAGTGACTACGTAGCATTTGGTTTTGAAGCAGGCTACGATATGAGACTGCTGTGTTAAAAACCCATCGTTTATTTCTCTAGTATATGGATGATCTGATAGTCGGAACTGGTCGGAACTGGTCGGAACTGGTTCTGTGACATTTTTAAATTTTTACAACTTTAGCACAAacttagactttttttttttaaaacaataacCTGCATAGTAGTCAGAACGTCTCTGACGCTTGCTGAACAGGTTTTTATTGGTTGTCTTGACGTCAGTGACGCAGGCTGCGTGACCTGTTTGTTGGGACTCCTATCAACATCTCTGGTGGGGCTAAATACGTTCCACAGAACAGGCCTAATTAAAAGAACAGCGGTGGAAGAAATGGAGAAATGTTTGGCAGAGCATGTAGTGCAAATTACGTTCCTCGCCCTTCTTACTCCAACTCCACTCAACTCGCATcctatgcaggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgtgcgtgcgtgcgtgtgcgtgagaGATACAGTGCTATGCTTCAGTAACTCTGTGGCCTTGCCTGCCTCAGCATGGAGGAGAGATGAATGAAGGAAATGaacaagggaaggagagaaagaagaagcACCATCTCAGCTTGTTTCTCTCTGTCAATCAAAaacactccttcctctctccacgtctcttcctccctccttcctctctccacgtctcttcctccctccttcctccctccttcctctctccacgtctcttcctccctcctacctccctccttcctctctccttc

Function

NR:

description
PREDICTED: cilia- and flagella-associated protein 57-like isoform X4

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU858761 True 3197 lncRNA 0.42 3 84797483 84800786

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
tceanc2 tceanc2 coding upstream 844750 83950870 ~ 83952733 (+)
lrrc42 lrrc42 coding upstream 878576 83913983 ~ 83918907 (+)
LOC110530814 LOC106569707 coding upstream 894202 83895686 ~ 83905612 (+)
LOC110530812 zbt17 coding upstream 914760 83875531 ~ 83882723 (+)
LOC110530811 LOC106569621 coding upstream 925922 83846346 ~ 83871561 (+)
LOC118965568 NA coding downstream 487 84801273 ~ 84804572 (+)
LOC118965569 NA coding downstream 142188 84942974 ~ 84964998 (+)
LOC110531029 LOC106569826 coding downstream 165440 84966226 ~ 84970196 (+)
capsla capsl coding downstream 172811 84973597 ~ 84978102 (+)
LOC110531035 LOC106569797 coding downstream 201611 85002397 ~ 85107517 (+)
G756246 NA non-coding upstream 4582 84792583 ~ 84792901 (+)
G756228 NA non-coding upstream 47869 84748212 ~ 84749614 (+)
G756227 NA non-coding upstream 49486 84746955 ~ 84747997 (+)
G756225 NA non-coding upstream 54632 84742134 ~ 84742851 (+)
G756223 NA non-coding upstream 57956 84739113 ~ 84739527 (+)
LOC110492646 LOC105022906 non-coding downstream 7075 84436488 ~ 84931644 (+)
G756264 NA non-coding downstream 50658 84851444 ~ 84855063 (+)
G756269 NA non-coding downstream 74395 84875181 ~ 84875979 (+)
G756271 NA non-coding downstream 76208 84876994 ~ 84878079 (+)
G756273 NA non-coding downstream 83793 84884579 ~ 84884966 (+)
G756134 NA other upstream 235592 84558786 ~ 84561891 (+)
G755602 NA other upstream 489209 84303470 ~ 84308274 (+)
G755585 NA other upstream 534517 84261987 ~ 84262966 (+)
G755428 NA other upstream 826786 83969378 ~ 83970697 (+)
G756298 NA other downstream 135280 84936066 ~ 84937744 (+)
LOC118965572 NA other downstream 455996 85256782 ~ 85264093 (+)
G757472 NA other downstream 1151182 85951968 ~ 86028274 (+)
G757663 NA other downstream 1316877 86117663 ~ 86117948 (+)

Expression


Co-expression Network