G759412


Basic Information

Item Value
gene id G759412
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 88436041 ~ 88443469 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU862988
ctaacctggtgtaatgagtaacctggtgtgatgagtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaaagagtaacctggtgtaatgagtaacctagtgtgatgagtaacctggtgtaacctggtgtGATGAGAAACCTTGTGTAATGAGTAACCTAgtgtgatgagtaacctggtgtaacctgGTCTGATGAGTAAcatggtgtaatgagtaacctggtgtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaatgtgTAACCTGGTATAATtagtaacctggtgtaacctggtgtaatgagtaacccggtgtaatgagtaacctggtgtaatgagtaacatggtgtaatgagtaaccaggtgtgatgagtaacctggtgtaacctggtgtgatgagtaaccaggtgtaatgagtaacctggtgtaatgagtaatctggtgtgacctggtgtaatgagtaacctggtgtaatgagtaatctggtttaacctggtgtaatgagtaacctggtataatgagtaacctggtgtaatgagtaatctggtgtgatgagtaacctggtgtaatgagtaatctggtgtaacctggtgaaataagtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaatgagtaatctggtttaacctggtgtaatgagtaacctggtataatgagtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaacctggtgtaatgagtaatctggtataatgagtaacctggtgtaatgagtaatctggtgtaatgagtaatctggtgtaacctggtgtaatgagtaacctggtataatgagtaacctggtgtaatgagtaatctggtgtaatgagtaacctggagtaatgagtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaacctggtgtgttgagtaacctggtgtaataagtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaatgagtaatctgGTGTGATGAgaaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaataagtaacctggtgtgatgagtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaatgagtaatctgGTGTGATGAgaaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaataagtaacctggtgtgatgagtaacctggtgtaatgagtaatctgGTGTGATGAgaaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaataagtaacctggtgtgatgagtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaatgagtaatctgGTGTGATGAgaaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaataaGTAACCTGGTGTAATAAGTAATCTGGTGTAAtaagtaacctggtgtaatgagtaacctggagtaatgagtaacctggtgtaatgagtaatctggtgtgatgagtaacctggtgtaatgagtaatctggtgtaatgagtaatctggtgtaatgagtaacctggtgtaataaGTAATCTGGTGTAATAAGTAACCTGGTGTAAtaagtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaataagtaacctggtgtgatgagtaacctggtgtaatgagtaatctggtgtgatgagtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaataagtaacctggtgtgatgagtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtgatgagtaacctggtgtaatgagtaatctggtgtaatgagtaatctggtgtaacctggtgtaatgagtaacctggtataatgagtaacctggtgtaatgagtcatctggtgtaatgagtaacc
>TU862989
ctaacctggtgtaatgagtaacctggtgtgatgagtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaaagagtaacctggtgtaatgagtaacctagtgtgatgagtaacctggtgtaacctggtgtGATGAGAAACCTTGTGTAATGAGTAACCTAgtgtgatgagtaacctggtgtaacctgGTCTGATGAGTAAcatggtgtaatgagtaacctggtgtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaatgtgTAACCTGGTATAATtagtaacctggtgtaacctggtgtaatgagtaacccggtgtaatgagtaacctggtgtaatgagtaacatggtgtaatgagtaaccaggtgtgatgagtaacctggtgtaacctggtgtgatgagtaaccaggtgtaatgagtaacctggtgtaatgagtaatctggtgtgacctggtgtaatgagtaacctggtgtaatgagtaatctggtttaacctggtgtaatgagtaacctggtataatgagtaacctggtgtaatgagtaatctggtgtgatgagtaacctggtgtaatgagtaatctggtgtaacctggtgaaataagtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaatgagtaatctggtttaacctggtgtaatgagtaacctggtataatgagtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaacctggtgtaatgagtaatctggtataatgagtaacctggtgtaatgagtaatctggtgtaatgagtaatctggtgtaacctggtgtaatgagtaacctggtataatgagtaacctggtgtaatgagtaatctggtgtaatgagtaacctggagtaatgagtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaacctggtgtgatgagtaacctggtgtaattaGTAACCTagtgtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtaacctggtgtaatgagtaacctggtgtgatgagtaacctggtgtaacctggtgtaatgagtaaccaggtgtaacctggtgtaatgagtaacctggtg

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106576600

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU862988 False 1870 lncRNA 0.40 2 88436041 88443469
TU862989 True 1194 lncRNA 0.42 2 88436041 88437604

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
acss2l LOC106596660 coding upstream 376338 88017220 ~ 88059703 (+)
LOC110513441 apcdd1 coding upstream 660594 87745792 ~ 87775447 (+)
LOC110512127 LOC106591122 coding upstream 744298 87687931 ~ 87691743 (+)
LOC110512128 LOC106596732 coding upstream 764937 87569072 ~ 87671104 (+)
LOC110519501 LOC106569361 coding upstream 886203 87532950 ~ 87549838 (+)
LOC110510807 LOC106569716 coding downstream 181972 88625441 ~ 88642762 (+)
LOC110510805 LOC105030507 coding downstream 202931 88646400 ~ 88667320 (+)
LOC118965580 NA coding downstream 443365 88886834 ~ 88903834 (+)
slc25a24l LOC106569755 coding downstream 631155 89074624 ~ 89139486 (+)
fubp1 LOC106569753 coding downstream 651367 89094836 ~ 89113049 (+)
G759377 NA non-coding upstream 56851 88378975 ~ 88379190 (+)
G759374 NA non-coding upstream 58763 88377048 ~ 88377278 (+)
G759370 NA non-coding upstream 61911 88373924 ~ 88374130 (+)
G759366 NA non-coding upstream 63122 88372445 ~ 88372919 (+)
G759365 NA non-coding upstream 63610 88372167 ~ 88372431 (+)
G759415 NA non-coding downstream 3468 88446937 ~ 88447783 (+)
G759447 NA non-coding downstream 50853 88494322 ~ 88494796 (+)
G759457 NA non-coding downstream 62558 88506027 ~ 88506264 (+)
G759461 NA non-coding downstream 65734 88509203 ~ 88509567 (+)
G759485 NA non-coding downstream 92721 88536190 ~ 88536438 (+)
G759031 LOC106569827 other upstream 325741 88109006 ~ 88110300 (+)
G759020 LOC106569827 other upstream 329094 88082021 ~ 88106947 (+)
G758988 NA other upstream 440896 87991970 ~ 87995145 (+)
G758976 ankrd12 other upstream 464112 87959523 ~ 87971929 (+)
G758892 NA other upstream 559357 87875120 ~ 87876684 (+)
G759556 NA other downstream 254505 88697974 ~ 88701419 (+)
G759598 NA other downstream 417610 88861079 ~ 88861828 (+)
LOC118965583 LOC106569839 other downstream 1124534 89560138 ~ 89659347 (+)
G759892 NA other downstream 1252951 89696420 ~ 89696907 (+)

Expression


Co-expression Network