G759772


Basic Information

Item Value
gene id G759772
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 89352707 ~ 89354993 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU863466
GCTCTGACAGAACGGGAGAATGATCCCAACTCAACCGCAGTGCTCTGAGGACAAACCTCATCttcatcacaaatggcaccctattccctatttagtttTGAACAAACGTCTCATCTCAAAAACGGTTAATGTAAGGGTAATTACAGTATTTACAGAATTACAGTAGTGTTAATGTAATAGTAATTACAGAAGTTACAGAATTACAGTAGTGTTAATGTAATGGTAATGACAGTAGTTGCAGGATTACAGTAGTGTTAATGTAATAGTAATTACAGTAGTTACAGAATTACAGTACTGTTAATGTAATAGTAATTACAGTAGTTAGAGAAATTACAGTACTGTTAATGTAATAGTAATTACAGTAGTTACAGAATTACAGTACTGTTAATGTAATGGTAATTACAGAATTACAGTAGGGTTAATGTAATGGTAATTACAGTAGTTACAGAATTACAGTAGTGTTAATGTAATAGTAATTACAGTAGTTACAGAATTACAGTAGTGTTAATGTAATAGTAATTACAGTAGTGTTAATGTAATAGTAATTACAGTAGTTACAGAATTACAGTACTGTTAATGTAACAGTAATTACAGTAGTTACTGAATTACAGTAGTGTTCATGTAATAGTAATTACAGTAGTGTTAATGTAATAgtaattacagtagttacataaTTACAGTACTGTTAATGTAACAGTAATTACAGTAGTTACTGAATTACAGTAGTGTTCATGTAGTAGTAATTACAGTTACAACAATAGCCCAATATGCAGTGAGTGAGTCTCTATCTGAGTGCAATGTCCAATGCTGTTACCTCTGTTATACACTGAGTAAAAaggggtagtaggtgccaggctcaccggtttgtgtcaagaactgcaacgctgctggatttttcatgctcaatagtttcccgtgtgtatgaagaatgttccaccaaccaaaggacagccgacttgacacaactgtgggaagcattggagtcaacatgggccagcatccctgtggaacgctttcgacaccttgtacagtccatgccccgactaattgaggctgttctgagggcaaaatggggggAGTGCAACTCACTATTAGGAAGTGCAGAACCACCCAGTGTCCTAACTTCAGACTGAGGTGGAACATACACAGTGATATTTCCTTTGTTTCAGACTAAATGAAAAATACAGGCCAGTCTAACCTGAAGGTGACAGAAGTGTTCCACAGGAAGGTATTGTTCCTCTCTGAGCCCTTCCACTGTTTGACCATGGTCTACTCCATCTCTGAGCCCTTCCACTGTTTGACCATGGTCTACTCCATCTCTGAGCCCTTCCACTGTTTGACCATGGTCTACTCCATCTCTGAGCCCTTCCACTGTTTGACCATGGTCTACTCCATCTCTGAGCCCTTCCACTGTTTGACCATGGTCTACTCCATGTAGACTCATCCAGTGCATCCAACCGTATTTGGTCCTTGCAGTTGTCCATGACAGATAACAAGAGGAGGACTGTGGATCCTCCCTGAAGGACTCTGTTCTGTATGGACCAGTTCCAGTTGGACCAGTATCTGACCAGTACCAGTTGGACCAGTATCTGACCAGTACCAGTTGGACCAGTATCTTACCAGTTGGACCAGTATCTGACCAGTTGGACCAGTACCAGTTGGACCAGTATCTGACCAGTACTAGTTGGACCAGTATCTGACCAGTACCAGTTGGACCAGTATCTGACCATTTGGACCAGTACCAGTTGGACCAGTATCTGACCAGTACCAGTTGGACCAGTACCAGTTGGACAAGTATCTTACCAGTTGGACCAGTACCAGACCATTTAGACCGGTACCATTTGAACCAGTACCAGTTGGACCAGTACCAGTTGTGGTCAGAAGGCTTTGGACCATCCCATGCGGTCCAGCCTGCTCCAGCCCAGTCCTCAGTCCAATTGAGCTGCACCTCTTCCACAGACGCTCAGCGATCCCCATCCCGGTCCCTCTCCCGGTCACCAGTCACGTATTCTGATCCTGaccttctctgtctccccctgcgtGCGGTTAGCGTGGGTTTAGCGGGGGTCAGTGTGGGTCA
>TU863467
GCTCTGACAGAACGGGAGAATGATCCCAACTCAACCGCAGTGCTCTGAGGACAAACCTCATCttcatcacaaatggcaccctattccctatttagtttTGAACAAACGTCTCATCTCAAAAACGGTTAATGTAAGGGTAATTACAGTATTTACAGAATTACAGTAGTGTTAATGTAATAGTAATTACAGAAGTTACAGAATTACAGTAGTGTTAATGTAATGGTAATGACAGTAGTTGCAGGATTACAGTAGTGTTAATGTAATAGTAATTACAGTAGTTACAGAATTACAGTACTGATAATGTAATGgtaattacagtagttacataaTTACAGTAGTGTTAATGTAATAGTAATTACAGTACTGTTAATGTAATAGTAATTACAGTAGTTACAGAATTACAGTACTGTTAATGTAATGGTAATTACAGTAGTTACAGAATTACAGTAGTGTtaatgtaataataattacagtagTTACAGAATTACAGTAGTGTTAATGTAATAGTAAATACAGTTGTTACAGAATTACAGTAATGTTAAAGTAATGGTAATTACAGAAGTTACAGAATTACAGTAGGGTTAATGTAATGGTAATTACAGTAGTTACAGAATTACAGTAGTGTTAATGTAATAGTAATTACAGTAGTTACAGAATTACAGTAGTGTTAATGTAATAGTAATTACAGTAGTGTTAATGTAATAGTAATTACAGTAGTTACAGAATTACAGTACTGTTAATGTAACAGTAATTACAGTAGTTACTGAATTACAGTAGTGTTCATGTAATAGTAATTACAGTAGTGTTAATGTAATAgtaattacagtagttacataaTTACAGTACTGTTAATGTAACAGTAATTACAGTAGTTACTGAATTACAGTAGTGTTCATGTAGTAGTAATTACAGTTACAACAATAGCCCAATATGCAGTGAGTGAGTCTCTATCTGAGTGCAATGTCCAATGCTGTTACCTCTGTTATACACTGAGTAAAAaggggtagtaggtgccaggctcaccggtttgtgtcaagaactgcaacgctgctggatttttcatgctcaatagtttcccgtgtgtatgaagaatgttccaccaaccaaaggacagccgacttgacacaactgtgggaagcattggagtcaacatgggccagcatccctgtggaacgctttcgacaccttgtacagtccatgccccgactaattgaggctgttctgagggcaaaatggggggAGTGCAACTCACTATTAGGAAGTGCAGAACCACCCAGTGTCCTAACTTCAGACTGAGGTGGAACATACACAGTGATATTTCCTTTGTTTCAGACTAAATGAAAAATACAGGCCAGTCTAACCTGAAGGTGACAGAAGTGTTCCACAGGAAGGTATTGTTCCTCTCTGAGCCCTTCCACTGTTTGACCATGGTCTACTCCATCTCTGAGCCCTTCCACTGTTTGACCATGGTCTACTCCATCTCTGAGCCCTTCCACTGTTTGACCATGGTCTACTCCATCTCTGAGCCCTTCCACTGTTTGACCATGGTCTACTCCATCTCTGAGCCCTTCCACTGTTTGACCATGGTCTACTCCATGTAGACTCATCCAGTGCATCCAACCGTATTTGGTCCTTGCAGTTGTCCATGACAGATAACAAGAGGAGGACTGTGGATCCTCCCTGAAGGACTCTGTTCTGTATGGACCAGTTCCAGTTGGACCAGTATCTGACCAGTACCAGTTGGACCAGTATCTGACCAGTACCAGTTGGACCAGTATCTTACCAGTTGGACCAGTATCTGACCAGTTGGACCAGTACCAGTTGGACCAGTATCTGACCAGTACTAGTTGGACCAGTATCTGACCAGTACCAGTTGGACCAGTATCTGACCATTTGGACCAGTACCAGTTGGACCAGTATCTGACCAGTACCAGTTGGACCAGTACCAGTTGGACAAGTATCTTACCAGTTGGACCAGTACCAGACCATTTAGACCGGTACCATTTGAACCAGTACCAGTTGGACCAGTACCAGTTGTGGTCAGAAGGCTTTGGACCATCCCATGCGGTCCAGCCTGCTCCAGCCCAGTCCTCAGTCCAATTGAGCTGCACCTCTTCCACAGACGCTCAGCGATCCCCATCCCGGTCCCTCTCCCGGTCACCAGTCACGTATTCTGATCCTGaccttctctgtctccccctgcgtGCGGTTAGCGTGGGTTTAGCGGGGGTCAGTGTGGGTCA

Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU863466 False 2080 lncRNA 0.43 3 89352707 89354993
TU863467 True 2243 lncRNA 0.42 2 89352707 89354993

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
pigk pigk coding upstream 31154 89296952 ~ 89321553 (+)
LOC110530860 LOC106569749 coding upstream 61366 89225089 ~ 89291341 (+)
LOC118965581 NA coding upstream 88757 89261614 ~ 89263950 (+)
usp33 LOC106569751 coding upstream 129001 89148990 ~ 89223706 (+)
fubp1 LOC106569753 coding upstream 239658 89094836 ~ 89113049 (+)
LOC118965583 LOC106569839 coding downstream 205145 89560138 ~ 89659347 (+)
yipf1 yipf1 coding downstream 435917 89790910 ~ 89837790 (+)
zgc:113691 LOC106569840 coding downstream 498473 89853466 ~ 89854375 (+)
ndc1 ndc1 coding downstream 506828 89861821 ~ 89911594 (+)
best4 LOC106569841 coding downstream 562049 89917042 ~ 89932074 (+)
G759765 NA non-coding upstream 14874 89336007 ~ 89337833 (+)
G759755 NA non-coding upstream 52552 89298379 ~ 89300155 (+)
G759661 NA non-coding upstream 85763 89264748 ~ 89266944 (+)
G759746 NA non-coding upstream 103046 89248480 ~ 89249661 (+)
G759745 NA non-coding upstream 105359 89246325 ~ 89247348 (+)
G759785 NA non-coding downstream 29467 89384460 ~ 89384998 (+)
G759790 NA non-coding downstream 43239 89398232 ~ 89399847 (+)
G759798 NA non-coding downstream 61399 89416392 ~ 89418335 (+)
G759805 NA non-coding downstream 77864 89432857 ~ 89433399 (+)
G759813 NA non-coding downstream 142976 89497969 ~ 89503002 (+)
slc25a24l LOC106569755 other upstream 258313 89074624 ~ 89139486 (+)
G759598 NA other upstream 490879 88861079 ~ 88861828 (+)
G759556 NA other upstream 651288 88697974 ~ 88701419 (+)
G759031 LOC106569827 other upstream 1242407 88109006 ~ 88110300 (+)
G759020 LOC106569827 other upstream 1245760 88082021 ~ 88106947 (+)
G759892 NA other downstream 341427 89696420 ~ 89696907 (+)
G760623 NA other downstream 805277 90160270 ~ 90208959 (+)
G760718 NA other downstream 1019094 90362653 ~ 90400472 (+)
LOC110530875 rpl37a other downstream 1345302 90700188 ~ 90709778 (+)

Expression


Co-expression Network