G761324


Basic Information

Item Value
gene id G761324
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 91270381 ~ 91272914 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU865634
agtccagttagggctagataatgatcTCTGTTAATAGTAGcccagttagggctagataatgacatgttaacagtagtccagttagggctagataatgacatgttaacagtagttcagttagggctagataatgacatgttaacagtagtccagttagaGCTAGATAATGATCTCTGTTAACAGTATTCCAGTGAGGGCTAGATAATGATCTCttttaacagtagtccagttagggctagataatgatctctgttaacagtagtccagttagggctagataatgatctctgttaacagtagtccagttagggctagataatgatctctgttaacagtagcccagttagggctagataatgatctctgttaacagtagcccagttagggctagataataccattgttaacagtagtccagttagggctagataatgacatgttaacagtagtccagttagggctagataatgatctctgttaacagtagcccagttagggctagataatgatcTGTTAACAATAGTTTCTCCTGATGGCCAGTTGAACAGCGGTGTGACACTGCAACGGCTCCACAGTTGTGGCCTGTTTTCCGAACAGAAATTAAGCCTATTCCTGGATGAAAAAAACCCACTTTCAATGAAGATTCTCAAATGAGATTGGTGTTTGATACAGGACTAAGCTTAATCTGTGTACCAGGATACCGTCCCTTACAGTATATCTCACAGTTAGTGCTGCGTTTCAAAAGCCAGATGAGTTTCTAATCAAAAGGGACTACCAAATGCAGACAGCCCAGCAACAGACCAGGCTCGCCAGCTTAAAAGTTACACCAAACCTACCAAATAAacagtgttattattattatttagaaatCCAGTTCTCTGAACTAGCCAAGTGTTTAATAATGACATTATTCTGTTTTATTATCTAGTTTAATATGTTGGTGCCTCACAGACACTGAAAAATAAGATCCTCTCTCTCTGGGGAAGTGCCTTGACATCAGCTCCTGTTGTGACGTCATTTCTCCACCAGGCAATAGTGTTTACCACGTCTGCATCGGGAATGGTAccctagtgtactatatagggaacagggtgctaatGGGCCCTGCTCTAAAgaagtgcactttatagggaacagggtgataATGGGTCctgctctaaagtagtgcactatatagggaatagggtgctgggGAGACCAGTCCTTCTAATTGGCTGAAGGACTGCATGAGGTTTGTGTTTATTCATTCTAGACGTGACCAAACAAACCGGGTATCGAACCAGAGTCATTTGAGTGCCTCAAGACCACATTCGTCCACAGAGCTAGAGGCTTGATAGGCCCTAGCTTTGGATCTTACACTAGTCCTCAGGTTAGGTTCATCTATCATCACGATGGACGGGGGAGGAAAAACACTAGTCCTCAGGTTAGGTTCATCTATCATCATGAGTGGGGAAGGAAAAACACTAGTCCTCAGGTTAGGTTCATCTATCATTATGAGTGGGGAAGGAAAAACACTAGTCCTCAGGTTAGGTTCATCTATCATCATGAGTGGGGGAGGAAAAACACTAGTCCTCAGGTTAGGTTCATCTATCATTATGAGTGGGGAAGGAAAAACACTAGTCCTCAGGTTAGGTTCATCTATCATGGAGGGATAAGGAATCACATTTCTTAATGAATCAGAGAAGGACAGGTTGACTCTCTTTGATGAGCTAGACCTTTATGAGGCAAGGATGGAGAGGTTGACTGTGTCCCGATTCTCTACCCTTCTTCCGAAGTGCACAGGTGCAAACGGTCATGGATTTCACAATGGTGGAAACTCCCTCTAGCCTTTAAAGCCACAATGTGGAGTGTGCAAGTGCATCCTTGGAGGATCGGGATGTATCCGTGTGCAGTCCTCGGTCTGCTATCATGCTTCATGGTGGTACAGTACTTCGAATTGTTCTACAACAGCGTCTCAACCTTCGTCTTGGGAGACCAGACAGTCCACATCTTTGTTCCAGCCCTatactaacacacctgattaccTCACCGCCAAACCCTTGGTCAGCTGACCTAGGTGTCAAATAGGGCAGAGCTAGAACTAATACTTGCAGCCTGGTGTTTCCCCAGGAGGGTTGGGAAATCATGTGTCCGAATGGCACTCTAgcccctatatagggcactacctttgacctgagccctataggccctggtcaaaagtagagcactattggtgccatttgggacgagcTGATGAATTGAACATAGATCAACTTCAAAATGCAAAGGTTTAGGTTTGGAGAGCCACTGCTATACAGGTTCATGTTTTCTGTTCATAATCAACTGTGCTCTTTTGTGGTAAGTTTACTAACTAGGGGATACCTTTTAATCAAATGTGAATGTTTACAGTATATATGGTTTAGTTTTTTTCTGTTTTATTCCAAGAAAATGATGTGGGCATTTAAAGTCTTTAAGATAAAATAAAGATCAAATTAAGCACAATT
>TU865635
agtccagttagggctagataatgatcTCTGTTAATAGTAGcccagttagggctagataatgacatgttaacagtagtccagttagggctagataatgacatgttaacagtagttcagttagggctagataatgacatgttaacagtagtccagttagaGCTAGATAATGATCTCTGTTAACAGTATTCCAGTGAGGGCTAGATAATGATCTCttttaacagtagtccagttagggctagataatgatctctgttaacagtagtccagttagggctagataatgatctctgttaacagtagtccagttagggctagataatgatctctgttaacagtagcccagttagggctagataatgatctctgttaacagtagcccagttagggctagataataccattgttaacagtagtccagttagggctagataatgacatgttaacagtagtccagttagggctagataatgatctctgttaacagtagcccagttagggctagataatgatcTGTTAACAATAGTTTCTCCTGATGGCCAGTTGAACAGCGGTGTGACACTGCAACGGCTCCACAGTTGTGGCCTGTTTTCCGAACAGAAATTAAGCCTATTCCTGGATGAAAAAAACCCACTTTCAATGAAGATTCTCAAATGAGATTGGTGTTTGATACAGGACTAAGCTTAATCTGTGTACCAGGATACCGTCCCTTACAGTATATCTCACAGTTAGTGCTGCGTTTCAAAAGCCAGATGAGTTTCTAATCAAAAGGGACTACCAAATGCAGACAGCCCAGCAACAGACCAGGCTCGCCAGCTTAAAAGTTACACCAAACCTACCAAATAAacagtgttattattattatttagaaatCCAGTTCTCTGAACTAGCCAAGTGTTTAATAATGACATTATTCTGTTTTATTATCTAGTTTAATATGTTGGTGCCTCACAGACACTGAAAAATAAGATCCTCTCTCTCTGGGGAAGTGCCTTGACATCAGCTCCTGTTGTGACGTCATTTCTCCACCAGGCAATAGTGTTTACCACGTCTGCATCGGGAATGGTAccctagtgtactatatagggaacagggtgctaatGGGCCCTGCTCTAAAgaagtgcactttatagggaacagggtgataATGGGTCctgctctaaagtagtgcactatatagggaatagggtgctgggGAGACCAGTCCTTCTAATTGGCTGAAGGACTGCATGAGGTTTGTGTTTATTCATTCTAGACGTGACCAAACAAACCGGGTATCGAACCAGAGTCATTTGAGTGCCTCAAGACCACATTCGTCCACAGAGCTAGAGGCTTGATAGGCCCTAGCTTTGGATCTTACACTAGTCCTCAGGTTAGGTTCATCTATCATCACGATGGACGGGGGAGGAAAAACACTAGTCCTCAGGTTAGGTTCATCTATCATCATGAGTGGGGGAGGAAAAACACTAGTCCTCAGGTTAGGTTCATCTATCATTATGAGTGGGGAAGGAAAAACACTAGTCCTCAGGTTAGGTTCATCTATCATGGAGGGATAAGGAATCACATTTCTTAATGAATCAGAGAAGGACAGGTTGACTCTCTTTGATGAGCTAGACCTTTATGAGGCAAGGATGGAGAGGTTGACTGTGTCCCGATTCTCTACCCTTCTTCCGAAGTGCACAGGTGCAAACGGTCATGGATTTCACAATGGTGGAAACTCCCTCTAGCCTTTAAAGCCACAATGTGGAGTGTGCAAGTGCATCCTTGGAGGATCGGGATGTATCCGTGTGCAGTCCTCGGTCTGCTATCATGCTTCATGGTGGTACAGTACTTCGAATTGTTCTACAACAGCGTCTCAACCTTCGTCTTGGGAGACCAGACAGTCCACATCTTTGTTCCAGCCCTatactaacacacctgattaccTCACCGCCAAACCCTTGGTCAGCTGACCTAGGTGTCAAATAGGGCAGAGCTAGAACTAATACTTGCAGCCTGGTGTTTCCCCAGGAGGGTTGGGAAATCATGTGTCCGAATGGCACTCTAgcccctatatagggcactacctttgacctgagccctataggccctggtcaaaagtagagcactattggtgccatttgggacgagcTGATGAATTGAACATAGATCAACTTCAAAATGCAAAGGTTTAGGTTTGGAGAGCCACTGCTATACAGGTTCATGTTTTCTGTTCATAATCAACTGTGCTCTTTTGTGGTAAGTTTACTAACTAGGGGATACCTTTTAATCAAATGTGAATGTTTACAGTATATATGGTTTAGTTTTTTTCTGTTTTATTCCAAGAAAATGATGTGGGCATTTAAAGTCTTTAAGATAAAATAAAGATCAAATTAAGCACAATT
>TU865636
agtccagttagggctagataatgatcTCTGTTAATAGTAGcccagttagggctagataatgacatgttaacagtagtccagttagggctagataatgacatgttaacagtagttcagttagggctagataatgacatgttaacagtagtccagttagaGCTAGATAATGATCTCTGTTAACAGTATTCCAGTGAGGGCTAGATAATGATCTCttttaacagtagtccagttagggctagataatgatctctgttaacagtagtccagttagggctagataatgatctctgttaacagtagtccagttagggctagataatgatctctgttaacagtagcccagttagggctagataatgatctctgttaacagtagcccagttagggctagataataccattgttaacagtagtccagttagggctagataatgacatgttaacagtagtccagttagggctagataatgatctctgttaacagtagcccagttagggctagataatgatcTGTTAACAATAGTTTCTCCTGATGGCCAGTTGAACAGCGGTGTGACACTGCAACGGCTCCACAGTTGTGGCCTGTTTTCCGAACAGAAATTAAGCCTATTCCTGGATGAAAAAAACCCACTTTCAATGAAGATTCTCAAATGAGATTGGTGTTTGATACAGGACTAAGCTTAATCTGTGTACCAGGATACCGTCCCTTACAGTATATCTCACAGTTAGTGCTGCGTTTCAAAAGCCAGATGAGTTTCTAATCAAAAGGGACTACCAAATGCAGACAGCCCAGCAACAGACCAGGCTCGCCAGCTTAAAAGTTACACCAAACCTACCAAATAAacagtgttattattattatttagaaatCCAGTTCTCTGAACTAGCCAAGTGTTTAATAATGACATTATTCTGTTTTATTATCTAGTTTAATATGTTGGTGCCTCACAGACACTGAAAAATAAGATCCTCTCTCTCTGGGGAAGTGCCTTGACATCAGCTCCTGTTGTGACGTCATTTCTCCACCAGGCAATAGTGTTTACCACGTCTGCATCGGGAATGGTAccctagtgtactatatagggaacagggtgctaatGGGCCCTGCTCTAAAgaagtgcactttatagggaacagggtgataATGGGTCctgctctaaagtagtgcactatatagggaatagggtgctgggGAGACCAGTCCTTCTAATTGGCTGAAGGACTGCATGAGGTTTGTGTTTATTCATTCTAGACGTGACCAAACAAACCGGGTATCGAACCAGAGTCATTTGAGTGCCTCAAGACCACATTCGTCCACAGAGCTAGAGGCTTGATAGGCCCTAGCTTTGGATCTTACACTAGTCCTCAGGTTAGGTTCATCTATCATCACGATGGACGGGGGAGGAAAAACACTAGTCCTCAGGTTAGGTTCATCTATCATTATGAGTGGGGAAGGAAAAACACTAGTCCTCAGGTTAGGTTCATCTATCATCATGAGTGGGGAAGGAAAAACACTAGTCCTCAGGTTAGGTTCATCTATCATTATGAGTGGGGAAGGAAAAACACTAGTCCTCAGGTTAGGTTCATCTATCATGGAGGGATAAGGAATCACATTTCTTAATGAATCAGAGAAGGACAGGTTGACTCTCTTTGATGAGCTAGACCTTTATGAGGCAAGGATGGAGAGGTTGACTGTGTCCCGATTCTCTACCCTTCTTCCGAAGTGCACAGGTGCAAACGGTCATGGATTTCACAATGGTGGAAACTCCCTCTAGCCTTTAAAGCCACAATGTGGAGTGTGCAAGTGCATCCTTGGAGGATCGGGATGTATCCGTGTGCAGTCCTCGGTCTGCTATCATGCTTCATGGTGGTACAGTACTTCGAATTGTTCTACAACAGCGTCTCAACCTTCGTCTTGGGAGACCAGACAGTCCACATCTTTGTTCCAGCCCTatactaacacacctgattaccTCACCGCCAAACCCTTGGTCAGCTGACCTAGGTGTCAAATAGGGCAGAGCTAGAACTAATACTTGCAGCCTGGTGTTTCCCCAGGAGGGTTGGGAAATCATGTGTCCGAATGGCACTCTAgcccctatatagggcactacctttgacctgagccctataggccctggtcaaaagtagagcactattggtgccatttgggacgagcTGATGAATTGAACATAGATCAACTTCAAAATGCAAAGGTTTAGGTTTGGAGAGCCACTGCTATACAGGTTCATGTTTTCTGTTCATAATCAACTGTGCTCTTTTGTGGTAAGTTTACTAACTAGGGGATACCTTTTAATCAAATGTGAATGTTTACAGTATATATGGTTTAGTTTTTTTCTGTTTTATTCCAAGAAAATGATGTGGGCATTTAAAGTCTTTAAGATAAAATAAAGATCAAATTAAGCACAATT
>TU865637
agtccagttagggctagataatgatcTCTGTTAATAGTAGcccagttagggctagataatgacatgttaacagtagtccagttagggctagataatgacatgttaacagtagttcagttagggctagataatgacatgttaacagtagtccagttagaGCTAGATAATGATCTCTGTTAACAGTATTCCAGTGAGGGCTAGATAATGATCTCttttaacagtagtccagttagggctagataatgatctctgttaacagtagtccagttagggctagataatgatctctgttaacagtagtccagttagggctagataatgatctctgttaacagtagcccagttagggctagataatgatctctgttaacagtagcccagttagggctagataataccattgttaacagtagtccagttagggctagataatgacatgttaacagtagtccagttagggctagataatgatctctgttaacagtagcccagttagggctagataatgatcTGTTAACAATAGTTTCTCCTGATGGCCAGTTGAACAGCGGTGTGACACTGCAACGGCTCCACAGTTGTGGCCTGTTTTCCGAACAGAAATTAAGCCTATTCCTGGATGAAAAAAACCCACTTTCAATGAAGATTCTCAAATGAGATTGGTGTTTGATACAGGACTAAGCTTAATCTGTGTACCAGGATACCGTCCCTTACAGTATATCTCACAGTTAGTGCTGCGTTTCAAAAGCCAGATGAGTTTCTAATCAAAAGGGACTACCAAATGCAGACAGCCCAGCAACAGACCAGGCTCGCCAGCTTAAAAGTTACACCAAACCTACCAAATAAacagtgttattattattatttagaaatCCAGTTCTCTGAACTAGCCAAGTGTTTAATAATGACATTATTCTGTTTTATTATCTAGTTTAATATGTTGGTGCCTCACAGACACTGAAAAATAAGATCCTCTCTCTCTGGGGAAGTGCCTTGACATCAGCTCCTGTTGTGACGTCATTTCTCCACCAGGCAATAGTGTTTACCACGTCTGCATCGGGAATGGTAccctagtgtactatatagggaacagggtgctaatGGGCCCTGCTCTAAAgaagtgcactttatagggaacagggtgataATGGGTCctgctctaaagtagtgcactatatagggaatagggtgctgggGAGACCAGTCCTTCTAATTGGCTGAAGGACTGCATGAGGTTTGTGTTTATTCATTCTAGACGTGACCAAACAAACCGGGTATCGAACCAGAGTCATTTGAGTGCCTCAAGACCACATTCGTCCACAGAGCTAGAGGCTTGATAGGCCCTAGCTTTGGATCTTACACTAGTCCTCAGGTTAGGTTCATCTATCATCACGATGGACGGGGGAGGAAAAACACTAGTCCTCAGGTTAGGTTCATCTATCATCATGAGTGGGGAAGGAAAAACACTAGTCCTCAGGTTAGGTTCATCTATCATCATGAGTGGGGGAGGAAAAACACTAGTCCTCAGGTTAGGTTCATCTATCATTATGAGTGGGGAAGGAAAAACACTAGTCCTCAGGTTAGGTTCATCTATCATGGAGGGATAAGGAATCACATTTCTTAATGAATCAGAGAAGGACAGGTTGACTCTCTTTGATGAGCTAGACCTTTATGAGGCAAGGATGGAGAGGTTGACTGTGTCCCGATTCTCTACCCTTCTTCCGAAGTGCACAGGTGCAAACGGTCATGGATTTCACAATGGTGGAAACTCCCTCTAGCCTTTAAAGCCACAATGTGGAGTGTGCAAGTGCATCCTTGGAGGATCGGGATGTATCCGTGTGCAGTCCTCGGTCTGCTATCATGCTTCATGGTGGTACAGTACTTCGAATTGTTCTACAACAGCGTCTCAACCTTCGTCTTGGGAGACCAGACAGTCCACATCTTTGTTCCAGCCCTatactaacacacctgattaccTCACCGCCAAACCCTTGGTCAGCTGACCTAGGTGTCAAATAGGGCAGAGCTAGAACTAATACTTGCAGCCTGGTGTTTCCCCAGGAGGGTTGGGAAATCATGTGTCCGAATGGCACTCTAgcccctatatagggcactacctttgacctgagccctataggccctggtcaaaagtagagcactattggtgccatttgggacgagcTGATGAATTGAACATAGATCAACTTCAAAATGCAAAGGTTTAGGTTTGGAGAGCCACTGCTATACAGGTTCATGTTTTCTGTTCATAATCAACTGTGCTCTTTTGTGGTAAGTTTACTAACTAGGGGATACCTTTTAATCAAATGTGAATGTTTACAGTATATATGGTTTAGTTTTTTTCTGTTTTATTCCAAGAAAATGATGTGGGCATTTAAAGTCTTTAAGATAAAATAAAGATCAAATTAAGCACAATT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU865634 False 2483 lncRNA 0.43 2 91270381 91272914
TU865635 False 2381 lncRNA 0.43 2 91270381 91272914
TU865636 False 2432 lncRNA 0.43 3 91270381 91272914
TU865637 True 2432 lncRNA 0.43 2 91270381 91272914

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
rgs20 LOC106592360 coding upstream 9413 91239886 ~ 91260968 (+)
LOC110530903 LOC106569743 coding upstream 353644 90913773 ~ 90916737 (+)
LOC110530865 LOC106595329 coding upstream 439856 90799988 ~ 90830525 (+)
LOC110530867 LOC106569722 coding upstream 473443 90779123 ~ 90796938 (+)
ndufb3 ndufb3 coding upstream 527297 90737231 ~ 90743084 (+)
G761388 NA non-coding upstream 17143 91252882 ~ 91253238 (+)
G761385 NA non-coding upstream 21281 91248250 ~ 91249100 (+)
G761382 NA non-coding upstream 26240 91243311 ~ 91244141 (+)
G761375 NA non-coding upstream 39588 91229592 ~ 91230793 (+)
G761352 vath non-coding upstream 68807 91190320 ~ 91201574 (+)
G761418 NA non-coding downstream 46904 91319818 ~ 91324653 (+)
G761648 NA non-coding downstream 99516 91372430 ~ 91372670 (+)
G761654 NA non-coding downstream 104423 91377337 ~ 91378272 (+)
G761656 NA non-coding downstream 105432 91378346 ~ 91378575 (+)
G761666 NA non-coding downstream 199533 91472447 ~ 91472687 (+)
G761291 NA other upstream 166227 91101319 ~ 91104154 (+)
G761280 NA other upstream 229813 91007569 ~ 91040568 (+)
G761244 LOC106569734 other upstream 297818 90952992 ~ 90972563 (+)
G760857 NA other upstream 499344 90770117 ~ 90771037 (+)
G761750 NA other downstream 291159 91564073 ~ 91567098 (+)

Expression


Co-expression Network