LOC118966172


Basic Information

Item Value
gene id LOC118966172
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048573.1
NCBI id CM023227.2
chromosome length 79455637
location 7071957 ~ 7074751 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036989271.1
CAAGGGATTACAGGTATGTATGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAAGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTATGTATGGTAGTCAAGGGAATAcaggtgtgtatggtgtgtatggtaGTCAAGGGAATACAGGCGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTATGTATGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGATTACAGGTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTATGTATGGTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAAGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTATGTATGGTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTATGTATGGTGTGTATGGTAGTCAATGGAATACAGTTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGTTATGTATGGTAGTCAAGGGATTACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGATTACAGGTATGTATGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGCGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTATGTATGGTGTGAATGGTAGTCAAGAGAATACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGATTACAGGTATGTATGGTAGTCAAGGCAATACAGGTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGAGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGTTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAAGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTATGTATGGTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGATTACAGGTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGTTATGTTTGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTATATGGTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGTTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTATATATGGTAGTCAAGGGAATACAGTTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTATATATGGTAGTCAAGGGAATACAGTTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTATGTATGGTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGTTATGTATGGTAGTCAAGGGATTACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGATTACAGGTATGTATGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGCGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTATGTATGGTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTATGTATGGTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAAGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTATGTATGGTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTATGTATGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGTTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGTTATGTATGGTAGTCAAGGGATTACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGATTACAGGTATGTATGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGCGTGTATAGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTATGTATGGTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGTTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTATATGGTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGTTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTATATATGGTAGTCAAGGGAATACAGTTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTATGTATGGTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGTTATGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGCGTGTATGGTAGTCAAGGGATTACAGGTGTGTATGGTAGTCAAGGGAATACAGGTATGTATGGTAGTCATGGAATCTTTTAGTAGGTATGTGAAATGAGAATTCATGAGGTGAAAATAACCCCAAAACcttctgtaaaatatggtggtggctcattgatgttatgggctattttgcttccactggtcatgggacccttgttaaggtcaacagcatcaggaacttt

Function

NR:

description
PREDICTED: collagen alpha-1(I) chain-like

GO:

id name namespace
GO:0048731 system development biological_process

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036989271.1 True 2741 mRNA 0.41 2 7071957 7074751

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110531373 LOC106578114 coding downstream 838 7068527 ~ 7071119 (-)
LOC110531378 LOC106578114 coding downstream 6764 7054835 ~ 7065193 (-)
LOC110531367 LOC106578116 coding downstream 17702 6970858 ~ 7054255 (-)
LOC110531380 LOC106578126 coding downstream 102100 6963142 ~ 6969857 (-)
LOC118966154 NA coding downstream 114177 6954992 ~ 6957780 (-)
tmem179ba t179b coding upstream 286158 7360909 ~ 7379032 (-)
prox3 LOC106578142 coding upstream 308598 7383349 ~ 7390543 (-)
snx15 snx15 coding upstream 332542 7407293 ~ 7426803 (-)
LOC110515519 LOC106578133 coding upstream 730750 7805501 ~ 7873725 (-)
LOC118965986 NA coding upstream 985833 8060584 ~ 8061856 (-)
G766820 LOC106578118 non-coding downstream 70192 7000344 ~ 7001765 (-)
G766970 NA non-coding downstream 73332 6998069 ~ 6998625 (-)
G766967 LOC106578121 non-coding downstream 83472 6986110 ~ 6988485 (-)
G766966 NA non-coding downstream 86315 6985382 ~ 6985642 (-)
G766996 NA non-coding upstream 7176 7081927 ~ 7082698 (-)
G767002 NA non-coding upstream 32325 7107076 ~ 7107275 (-)
G767003 NA non-coding upstream 34612 7109363 ~ 7109608 (-)
G767010 NA non-coding upstream 52000 7126751 ~ 7126980 (-)
G767012 LOC105030512 non-coding upstream 54577 7129328 ~ 7129866 (-)
LOC110531366 LOC106578102 other downstream 189839 6851197 ~ 6882912 (-)
G766850 LOC106578109 other downstream 458545 6612079 ~ 6613412 (-)
G766749 NA other downstream 607326 6457203 ~ 6464631 (-)
G766665 NA other downstream 706429 6340621 ~ 6365895 (-)
G767056 ovol1 other upstream 170893 7245644 ~ 7251075 (-)
LOC110510419 LOC106560462 other upstream 1037837 8112588 ~ 8155916 (-)
G768390 NA other upstream 1114692 8189443 ~ 8191898 (-)
LOC118936684 LOC106578100 other upstream 1146780 8221531 ~ 8253809 (-)
LOC110531377 LOC106578102 other upstream 1204066 8277882 ~ 8283359 (-)

Expression


Co-expression Network