LOC118966156


Basic Information

Item Value
gene id LOC118966156
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048573.1
NCBI id CM023227.2
chromosome length 79455637
location 8530635 ~ 8533005 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036989243.1
ATGGTTAACAGTGGAAGACGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTGGAAGACGGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTAGAAGACGGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTAGAAGACGGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTGGAAGACAGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTGGAAGACAGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTGGAAGACAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTGGAAGACAGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTAGAAGACGGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTAGAAGACAGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTAGAAGACAGGGATAGGAGAACAGGTTTATGGTTAACAGTGGAAGACAGGGACAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTAGAAGACAGGGATAGGACAACAGGTATATGGTTAACAGTGGAAGACGGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTGGAAGACAGTGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTAGAAGACAGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTGGAAGACAGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTGGAAGACAGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTGGAAGACAGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTGGAAGACAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTGGAAGACAGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTGGAAGACAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTAGAAGACAGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTAGAAGACGGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTGGAAGACAGTGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTGGAAGACAGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTAGAAGACGGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTGGAAGACAGGGATAGGACAACAGGTCTATGATTAACAGTAGAAGACAGTGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTGGAAGACAGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTAGAAGACAGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTAGAAGACAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTGGAAGACAGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTAGAAGACAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTGGAAGACAGGGATAGGACAACAGGTCTGTATTTCAGTGAGGAGGTGGAATTTTGGTGCAGAGTTGGTCAGGGGGTCACTCCTTTTATCTGAGCTACACCTGTCTGGGGTCAAAggttaaaggtcaggggtcaggagtcTGGAACGGTCGATCTATATCACTTAATTTTTAT
>TU875485
AGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTAGAAGACGGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTAGAAGACGGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTAGAAGACGGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTAGAAGACGGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTGGAAGACAGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTGGAAGACAGGGATAGGACAACAGGTTTATGGTTAACAGTGGAAG
>TU875486
AAGACGGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTGGAAGACAGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTGGAAGACAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTAGAAGACAGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGCAGAAGACAGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTGGAAGACAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTGGAAGACAGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTAGAAGACGGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTAGAAGACGGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTAGAAGACGGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTGGAAGACAGGGATAGGACAACAGGTCTATGGTTAACAGTGGAAGACAGGGATAGGACAACAGGTTTATGGTTAACAGTGGAAG

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC107558662

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036989243.1 False 1478 mRNA 0.45 2 8530635 8532418
TU875485 False 265 lncRNA 0.46 3 8531674 8533005
TU875486 True 459 lncRNA 0.46 3 8531674 8532743

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110531389 LOC106578069 coding downstream 73054 8450087 ~ 8457581 (-)
LOC110531388 LOC106578104 coding downstream 87537 8437178 ~ 8443098 (-)
LOC118936450 LOC106578067 coding downstream 108384 8418165 ~ 8422251 (-)
LOC110531390 LOC106578068 coding downstream 129967 8356581 ~ 8400668 (-)
LOC110531384 LOC106578065 coding downstream 187572 8340779 ~ 8343063 (-)
nagk nagk coding upstream 34138 8566556 ~ 8580576 (-)
LOC110532904 m1ap coding upstream 107081 8639499 ~ 8684971 (-)
LOC118966157 NA coding upstream 169620 8702038 ~ 8717338 (-)
phka1a LOC106578056 coding upstream 491295 9023713 ~ 9077363 (-)
leap2 leap-2a coding upstream 550958 9083247 ~ 9145704 (-)
G768528 NA non-coding downstream 29333 8459835 ~ 8501302 (-)
G768554 NA non-coding downstream 40879 8489163 ~ 8489756 (-)
G768504 NA non-coding downstream 122199 8408133 ~ 8408436 (-)
G768483 NA non-coding downstream 164745 8358255 ~ 8365890 (-)
LOC118965987 NA non-coding downstream 209626 8318999 ~ 8321009 (-)
G768591 NA non-coding upstream 43248 8575666 ~ 8575993 (-)
G768610 NA non-coding upstream 98198 8630616 ~ 8726033 (-)
G768611 NA non-coding upstream 105515 8637933 ~ 8638389 (-)
G768651 NA non-coding upstream 196098 8728516 ~ 8730832 (-)
G768662 NA non-coding upstream 217396 8749814 ~ 8751739 (-)
LOC110531377 LOC106578102 other downstream 247311 8277882 ~ 8283359 (-)
LOC118936684 LOC106578100 other downstream 277880 8221531 ~ 8253809 (-)
G768390 NA other downstream 338737 8189443 ~ 8191898 (-)
LOC110510419 LOC106560462 other downstream 416565 8112588 ~ 8155916 (-)
G767056 ovol1 other downstream 1279560 7245644 ~ 7251075 (-)
G768780 NA other upstream 450050 8982468 ~ 8990706 (-)
G770225 NA other upstream 1842291 10367459 ~ 10375854 (-)
G770549 NA other upstream 2439955 10972373 ~ 10974413 (-)
G770627 LOC106577876 other upstream 2575410 11107828 ~ 11108159 (-)
G771457 NA other upstream 3096198 11628616 ~ 11629588 (-)

Expression


Co-expression Network