LOC110531444 (LOC106577924)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110531444
gene name LOC106577924
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048573.1
NCBI id CM023227.2
chromosome length 79455637
location 11495542 ~ 11535439 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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XM_036987315.1 False 5999 mRNA 0.43 11 11495542 11535436
XM_036987316.1 False 5972 mRNA 0.43 11 11495542 11535436
XM_036987313.1 False 6063 mRNA 0.43 12 11495542 11535437
XM_036987317.1 False 5970 mRNA 0.43 11 11495542 11535437
XM_036987314.1 True 6062 mRNA 0.43 12 11495542 11535439

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110531436 LOC106578050 coding downstream 1221562 10262293 ~ 10273980 (-)
LOC118965991 NA coding downstream 1227839 10265797 ~ 10267703 (-)
LOC110531450 med11 coding upstream 123225 11658664 ~ 11660833 (-)
LOC110531452 LOC106577886 coding upstream 162953 11698392 ~ 11701613 (-)
LOC110531453 LOC106577884 coding upstream 206472 11741911 ~ 11750227 (-)
LOC110532912 LOC106577883 coding upstream 223706 11759145 ~ 11788765 (-)
trnal-aag NA coding upstream 434730 11970169 ~ 11970250 (-)
G770841 NA non-coding downstream 137857 11357318 ~ 11357685 (-)
G770784 NA non-coding downstream 241466 11252758 ~ 11254076 (-)
G770779 NA non-coding downstream 256883 11238247 ~ 11238659 (-)
G770689 NA non-coding downstream 261830 11233501 ~ 11233712 (-)
G770686 NA non-coding downstream 264779 11230491 ~ 11230763 (-)
G770982 hmgb3 non-coding upstream 12409 11547848 ~ 11551525 (-)
G770986 NA non-coding upstream 17263 11552702 ~ 11552914 (-)
G771017 NA non-coding upstream 17662 11553101 ~ 11553442 (-)
G771019 NA non-coding upstream 18993 11554432 ~ 11554803 (-)
G771417 NA non-coding upstream 24723 11560162 ~ 11560391 (-)
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G770549 NA other downstream 521129 10972373 ~ 10974413 (-)
G770225 NA other downstream 1119688 10367459 ~ 10375854 (-)
G768780 NA other downstream 2504836 8982468 ~ 8990706 (-)
LOC110531377 LOC106578102 other downstream 3212218 8277882 ~ 8283359 (-)
G771457 NA other upstream 93177 11628616 ~ 11629588 (-)
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G771614 NA other upstream 435465 11970904 ~ 11971354 (-)

Expression


Co-expression Network