LOC110532928


Basic Information

Item Value
gene id LOC110532928
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048573.1
NCBI id CM023227.2
chromosome length 79455637
location 14028919 ~ 14030784 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036989204.1
acaacaactacagctcccaaaacaacaactacagctcctaatacaacaacaactacagcacctactacaacaactactgctcctACTAAAACAACTACTGCTCCGACTACAACAACTAAAGCTCCTACTAAAACACctacagctcctactacaacaacaactactgctcctactacaacaactactgctcctactacaacaactacagctcctaatacAACAACTACAGTTCCTAATACAAACACTTCTGTGACAACAGGTACTGCTACtaatacaacaactactgctcctactaaaacaactactgcttctactaaaacaactacagctcccaaaacaacaactacagctcctaatacaacaacaactacagcacctactacaacaactactgctcctACTAAAACAACTACTGCTCCGACTACAACAACTAAAGCTCCTACTAAAACACctacagctcctactacaacgACAACTACTGCTCCTAATACAACAATTACAGCTCCcaatacaacaactacagctcctaatacaacaacaacagctcctactacaacaactactgctcctACTAAAACAACAACTGCTCCGACTACAACAACTAAAGCTCCTACTAAAACACCTACAGCTCCtactaaaacaacaactaaagCTCCTAATACAACTACAGCTCCTAGAACAACAACTACAACTCCTACTACCACAACTACAGCTCATACGACAACAACTACTGCTCCGACTAAAACAACCACTGCTCCTACTataacaactacagctcctactacaacaactactgctcctactaaaacaactactgctcctactacaacaactacaactcctgctacaacaactacagctcctagaacaacaactacagctcctaatacaacaactactgctccgaatacaacaacaactacagctcctaaaACAACTACTACAGCTCCCAAaataacaacaactacagctcctaatacAACAACTACAGTTCCTAAAACAAAAACTTCTGCTACAACAGGTACTGCTACTAATACAACAAATACAGCTCCTACTAAAACAACACCAGATCCTAATTCAACAACAatagctcctactacaacaactactgctcctACTAAAACAACTACTGCTCCGACTACAACATCTAAAGCTCCTACTAAAACACctacagctcctactacaacaacaactactgctcctaatacaacaactacaactcctactacaacaactacagctcctactacaacaactacagctcctcgaccaacaactacagctcctactacaacaactacagctcctacaactacagctcctactacaacaactactgctcctactacaacaactacagctcctactacaacaactacagctcctaataaaacaactacagctcctaataAAACAACCACAGCTCCTAATAAAACAACCACAGATCCTAAAACAACAACTACACCTCCTAATACAACAACTTCAGTTCTAAAAACAAAAACTTCTGCTACAAcaattactgctactactacaacaactactgctcctACATAAACAACTACATCAAcctaatacaacaacaactacagctcctaatacaacaccaactacagctcctaatacaacaacaactacagccccgaatacaacaactacagctccaAATTCAACAACTActgctccgaatacaacaagaACTACAGTTCCTAAAACAAAAACTTCTGCTACAACAGGTACTGCTActaatacaacaactacagctcctactaTAACAAGTACATcttctactacaacaactactgctcctaatacaacaacaactacagcaccTACTACAAAAACtactgctcctactacaacaactac

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036989204.1 True 1866 mRNA 0.39 1 14028919 14030784

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110531549 NA coding downstream 3594 14022650 ~ 14025846 (-)
LOC110531539 NA coding downstream 26859 13988898 ~ 14002060 (-)
LOC110531538 NA coding downstream 41980 13977459 ~ 13987582 (-)
LOC110531537 LOC106577970 coding downstream 58926 13946311 ~ 13969993 (-)
LOC110531536 NA coding downstream 85165 13917998 ~ 13943754 (-)
LOC110531540 LOC106594400 coding upstream 2774 14033558 ~ 14039729 (-)
LOC110532929 LOC106578030 coding upstream 11500 14042284 ~ 14044513 (-)
LOC110531545 NA coding upstream 39251 14070035 ~ 14088275 (-)
ndrg2 LOC106577998 coding upstream 123565 14154349 ~ 14191312 (-)
LOC110531544 LOC106577997 coding upstream 182662 14213446 ~ 14223844 (-)
G773405 NA non-coding downstream 91546 13936934 ~ 13937373 (-)
G773403 NA non-coding downstream 93418 13934972 ~ 13935501 (-)
G774158 NA non-coding upstream 43571 14074355 ~ 14074597 (-)
G774159 NA non-coding upstream 45181 14075965 ~ 14102816 (-)
G774181 NA non-coding upstream 83501 14114285 ~ 14123191 (-)
LOC110531554 LOC106578008 non-coding upstream 280676 14311455 ~ 14405052 (-)
G774281 NA non-coding upstream 305735 14336519 ~ 14336804 (-)
G773168 NA other downstream 329591 13697179 ~ 13699328 (-)
G773163 NA other downstream 436831 13586326 ~ 13666937 (-)
G772877 LOC106577934 other downstream 1032509 12994269 ~ 12996410 (-)
G771614 NA other downstream 2057565 11970904 ~ 11971354 (-)
LOC118966145 LOC106599223 other upstream 218617 14249401 ~ 14254157 (-)
G774427 LOC106578022 other upstream 693270 14724054 ~ 14724522 (-)
G774562 LOC106577809 other upstream 1207274 15238058 ~ 15253973 (-)
G774702 LOC106577875 other upstream 1321523 15352307 ~ 15361319 (-)
G774954 NA other upstream 1594418 15625202 ~ 15625920 (-)

Expression


Co-expression Network