LOC110531612 (LOC106577840)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110531612
gene name LOC106577840
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048573.1
NCBI id CM023227.2
chromosome length 79455637
location 16095962 ~ 16117909 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036987438.1
TTTGCCTATCCTTAATTTGGATACAACCGACAATAGGACACTACCTGGTTGCAGCGTGTGCATATAGCCTCAATTGCAAGAAAGGGTCATTTTGTGGCTGGGCCATAGAGATGACCAGGCTGTGACGGTtgggttctctctctgtctgtggacCAACCCTGGCATGGCTACTGCTAGGAAGATTGGTCTCTCCCTCTTCAGGCTCCGCAGGAAAGGCGGGAGGTGTTGGTTTCTCAGAAGAGCCAGCCGCCGGCACGCCGTCCCATGTCCACTTTGATGAGAAGCTCCACGACTCTGTCGTCATGGTGATCCCTCAGCCTGACGGGAACTTTATGGTCAAGGTTGGTTTCCTGAAGACCCAGCACAAGTATGAGATTGTCTTCACCCTCCCGGAGCTTCCATCACTGGGGAAGGACGCGTCTCCAGCTCCAGTACCCAACCCCCATATCCGCATCACTGATATCACTCCTGTACCAGAGGgtGGTCTGAGAGTGACATGTGAGTACATGGCCCACCAGGAGGGGGTGCTGTGTGAGGAGGTGATGCTGGTCAGTGAGAGCCAGGAGGACGTCTGCGTGGGGGTCAAGGTGCACGCCCGCGTCATGGACCGTCACCATGGTACACCCATGTTGTTGGAAGGAGTGCGTTGTGTGGGAGTGGAGCTGGAGTATGACTCTGAACAGAGTGACTGGCAAGGATTtgactaaaccagacaatgtgacacagacacacaaaagaCCATGCCACATGTGTTCAAATTCAACATCCACTGTACTTCAAACGATCCCTGACCATTTCAAGATGTTATGGTCCTAAAGGAGGATTAAATTAGGAAATGGATAGAAGTTATTTTAAGTAGTAGTCTGGGTTTTTAATTTTACATTCAGGCCGTACTTGGCCGCTAAAAGCTGAATTGCAGCACACAACGCATACAAGTAAACAAATCAaatcttaccttgcttcaaaagTAAAACAAACAAGCatcaaaaccttttttttttaaagcaagtcCAATGTGATCCGATCACTATTGAGCTTCCCTCAactatactgaacacaaatataaacgtaacatttAACAATttcagttacagttcatataaggaaatcaaataaattcattaggccctaatctatggatttcacgactagAAATACcgatatgttggtcacagataccttaaataaAAAAGATAATGATCAtgcggtttaatcagcttcttgttatgccacacctgtaggtggatggattattttggcaaaggagaaatgctcactatggATGTTAACaagtttgtgcacaaaatgtaagAGATGCTTTTTTTGCATCTGGAAAAGTTCTGGGATCTTTATATTTTAGCTCATGAaccatgggaccagcactttaaatgttgcgtttatatttttgttcagtatagttaacaTATCTGAAATGCATCTGTACGAAGTACTGTTGTTAGTACTGTGATAACACGCTATCCAACTGCCCATGCCATTCCACTGCCTGCCTGCCCCTATGTTGTTTAGAATGTGTTCTGAGTAAACCTTTAGGGGGCAACAAAGTTCACGTAATCAATCCAGACCATTTCACCCAGCCTAAATTCAACTGTACCAATAGGGGGCGACAAAAAACACTAAAATTATCCCTCTCATCTGAATCCAAAGGTGTAGAGGGATTCAAAAGGACTTTTTTAAATGAAAGAATGATACGCTATTAATCAGTCGCAAGTGCCTACGGTGCTGTACAGCTTTTACCATCAACAACTGCCTTCTGTCCCGTACTATCCTATCTATCAAGTATCTCCCCTTCAGGAGTTAAAAGATTTAGGACTTTAGTGGATCAACGATAGCTCAGCCTTCCAATATATAATTTTTATatctacaaaacatttcaagtatatttataaaatattaaAGATTGGTGCCATCAGTACCATTGGTAGTAAATCCACACTCAAATTAGATTGCCAGTTGTTTTTTGCTCTTTTAATATATTTGAGGCAACAAGAAGAAATAAAAGACAAACATTTTGGTTGTTAGCCCACCATGAATCAGCCAACAACTAGTAACTCTTACCCTTTATCTACCCCCAAAGCCCTCACCATCCTCTCTGAGCACTCATACTCTCATTGCAACCTAATAGTTTAGTAGTCACTGTTTACTGTCAATAGCTAGTCATTGTAAATGTATATTCCGATCAAATAAGAATGTCAAGTATCTAGCATAAAACATATCCTAATTTCACATAGCTAAACGGACAAAGCCCTGTTTTAAATATAATTGTTTTATATCAGACAATCTTCATGTGTTAACTGTGTTCGGCCTTAATTGAGGAGAACCTGTATATCGTTTGTTTGTATAATAGGCTCTAATGTCTTAAAGTTATACCTTGTTGTTATGGTGTCCATACTAAATCCATGCTCCAGGGtaggggtcaattccatttcaattcaggaagtacatttGAAATGCCAGTTCTTTTCAATTAGGAAAATGTGGAATTGGAATTCTGTTTACTTTCTGAGTTGACTGGAATGGAAATGTCCTGAACCCTGCCATGCTTCAAAAGCTAGTGAGACCGAGTGTGGATTCAGTTTGGATACAAGGCGATCTTGTCCTTTTGAATAGAAAAGAGAGGGCACTATTGTTCATGCAGTCAGACTTATCAAAATAATATCCTTAGCCCATATTGTGATGGGCATCATAGcaggtttggggtcaattccatttaaattccagtcaattcagaaagtaaaccaacaTCCAAATTGTCTGAATTGAAATGTCAgtgtactttctgaattgactgaaatTCAAATGGAGTTGACCCCAGCTCTGGTTGTTGGGTAATTGTACTGAGGGGTTACGGTACTAGGGGGGTGTGGCATTTTGTCAGTCGATATACAATACATGTTCCTTCATTGGTGTTTGCtactattgtctctgttcttttctTATGCCATAAACTTTGTTTTAAGTGCTTATCAAGAAAAACTCCCAAAAGGACTGATTTGAGGTAGAAAGACGTTGGAgcactcaacaacaaaaaagcaggGATGTATTTATTTTAGCTCACTTTAATCCATTCTATGTGATGTCAACAGGTGGATGTCAAGCTGACAATAAAtcaatgtcagattttaaaataaaataaaattgtttaGTGCTCCAACTTCATTCGACTTCAAATGAGTCCTTTTGGAAGTTTAAGCGCTTCTCATgaattgttgttattgttgttgagcACCTTTGTCTGCTGAAGTGTGAACGCCCACCTGAACTAATAAAGTTTGTGTTTAATTGTG
>XM_021614903.2
GTTTATTCATTTTCTGTGGACCCATATTCCTTTGCCTATCCTTAATTTGGATACAACCGACAATAGGACACTACCTGGTTGCAGCGTGTGCATATAGCCTCAATTGCAAGAAAGGTGAGTTCTTGGTGAGCGAAAAAGGGTCATTTTGTGGCTGGGCCATAGAGATGACCAGGCTGTGACGGTtgggttctctctctgtctgtggacCAACCCTGGCATGGCTACTGCTAGGAAGAGCTCCGCAGGAAAGGCGGGAGGTGTTGGTTTCTCAGAAGAGCCAGCCGCCGGCACGCCGTCCCATGTCCACTTTGATGAGAAGCTCCACGACTCTGTCGTCATGGTGATCCCTCAGCCTGACGGGAACTTTATGGTCAAGGTTGGTTTCCTGAAGACCCAGCACAAGTATGAGATTGTCTTCACCCTCCCGGAGCTTCCATCACTGGGGAAGGACGCGTCTCCAGCTCCAGTACCCAACCCCCATATCCGCATCACTGATATCACTCCTGTACCAGAGGgtGGTCTGAGAGTGACATGTGAGTACATGGCCCACCAGGAGGGGGTGCTGTGTGAGGAGGTGATGCTGGTCAGTGAGAGCCAGGAGGACGTCTGCGTGGGGGTCAAGGTGCACGCCCGCGTCATGGACCGTCACCATGGTACACCCATGTTGTTGGAAGGAGTGCGTTGTGTGGGAGTGGAGCTGGAGTATGACTCTGAACAGAGTGACTGGCAAGGATTtgactaaaccagacaatgtgacacagacacacaaaagaCCATGCCACATGTGTTCAAATTCAACATCCACTGTACTTCAAACGATCCCTGACCATTTCAAGATGTTATGGTCCTAAAGGAGGATTAAATTAGGAAATGGATAGAAGTTATTTTAAGTAGTAGTCTGGGTTTTTAATTTTACATTCAGGCCGTACTTGGCCGCTAAAAGCTGAATTGCAGCACACAACGCATACAAGTAAACAAATCAaatcttaccttgcttcaaaagTAAAACAAACAAGCatcaaaaccttttttttttaaagcaagtcCAATGTGATCCGATCACTATTGAGCTTCCCTCAactatactgaacacaaatataaacgtaacatttAACAATttcagttacagttcatataaggaaatcaaataaattcattaggccctaatctatggatttcacgactagAAATACcgatatgttggtcacagataccttaaataaAAAAGATAATGATCAtgcggtttaatcagcttcttgttatgccacacctgtaggtggatggattattttggcaaaggagaaatgctcactatggATGTTAACaagtttgtgcacaaaatgtaagAGATGCTTTTTTTGCATCTGGAAAAGTTCTGGGATCTTTATATTTTAGCTCATGAaccatgggaccagcactttaaatgttgcgtttatatttttgttcagtatagttaacaTATCTGAAATGCATCTGTACGAAGTACTGTTGTTAGTACTGTGATAACACGCTATCCAACTGCCCATGCCATTCCACTGCCTGCCTGCCCCTATGTTGTTTAGAATGTGTTCTGAGTAAACCTTTAGGGGGCAACAAAGTTCACGTAATCAATCCAGACCATTTCACCCAGCCTAAATTCAACTGTACCAATAGGGGGCGACAAAAAACACTAAAATTATCCCTCTCATCTGAATCCAAAGGTGTAGAGGGATTCAAAAGGACTTTTTTAAATGAAAGAATGATACGCTATTAATCAGTCGCAAGTGCCTACGGTGCTGTACAGCTTTTACCATCAACAACTGCCTTCTGTCCCGTACTATCCTATCTATCAAGTATCTCCCCTTCAGGAGTTAAAAGATTTAGGACTTTAGTGGATCAACGATAGCTCAGCCTTCCAATATATAATTTTTATatctacaaaacatttcaagtatatttataaaatattaaAGATTGGTGCCATCAGTACCATTGGTAGTAAATCCACACTCAAATTAGATTGCCAGTTGTTTTTTGCTCTTTTAATATATTTGAGGCAACAAGAAGAAATAAAAGACAAACATTTTGGTTGTTAGCCCACCATGAATCAGCCAACAACTAGTAACTCTTACCCTTTATCTACCCCCAAAGCCCTCACCATCCTCTCTGAGCACTCATACTCTCATTGCAACCTAATAGTTTAGTAGTCACTGTTTACTGTCAATAGCTAGTCATTGTAAATGTATATTCCGATCAAATAAGAATGTCAAGTATCTAGCATAAAACATATCCTAATTTCACATAGCTAAACGGACAAAGCCCTGTTTTAAATATAATTGTTTTATATCAGACAATCTTCATGTGTTAACTGTGTTCGGCCTTAATTGAGGAGAACCTGTATATCGTTTGTTTGTATAATAGGCTCTAATGTCTTAAAGTTATACCTTGTTGTTATGGTGTCCATACTAAATCCATGCTCCAGGGtaggggtcaattccatttcaattcaggaagtacatttGAAATGCCAGTTCTTTTCAATTAGGAAAATGTGGAATTGGAATTCTGTTTACTTTCTGAGTTGACTGGAATGGAAATGTCCTGAACCCTGCCATGCTTCAAAAGCTAGTGAGACCGAGTGTGGATTCAGTTTGGATACAAGGCGATCTTGTCCTTTTGAATAGAAAAGAGAGGGCACTATTGTTCATGCAGTCAGACTTATCAAAATAATATCCTTAGCCCATATTGTGATGGGCATCATAGcaggtttggggtcaattccatttaaattccagtcaattcagaaagtaaaccaacaTCCAAATTGTCTGAATTGAAATGTCAgtgtactttctgaattgactgaaatTCAAATGGAGTTGACCCCAGCTCTGGTTGTTGGGTAATTGTACTGAGGGGTTACGGTACTAGGGGGGTGTGGCATTTTGTCAGTCGATATACAATACATGTTCCTTCATTGGTGTTTGCtactattgtctctgttcttttctTATGCCATAAACTTTGTTTTAAGTGCTTATCAAGAAAAACTCCCAAAAGGACTGATTTGAGGTAGAAAGACGTTGGAgcactcaacaacaaaaaagcaggGATGTATTTATTTTAGCTCACTTTAATCCATTCTATGTGATGTCAACAGGTGGATGTCAAGCTGACAATAAAtcaatgtcagattttaaaataaaataaaattgtttaGTGCTCCAACTTCATTCGACTTCAAATGAGTCCTTTTGGAAGTTTAAGCGCTTCTCATgaattgttgttattgttgttgagcACCTTTGTCTGCTGAAGTGTGAACGCCCACCTGAACTAATAAAGTTTGTGTTTAATTGTG
>XM_021614901.2
TCTACGGTGGGTGTTCATTCTACTGTTTATTCATTTTCTGTGGACCCATATTCCTTTGCCTATCCTTAATTTGGATACAACCGACAATAGGACACTACCTGGTTGCAGCGTGTGCATATAGCCTCAATTGCAAGAAAGGGTCATTTTGTGGCTGGGCCATAGAGATGACCAGGCTGTGACGGTtgggttctctctctgtctgtggacCAACCCTGGCATGGCTACTGCTAGGAAGAGCTCCGCAGGAAAGGCGGGAGGTGTTGGTTTCTCAGAAGAGCCAGCCGCCGGCACGCCGTCCCATGTCCACTTTGATGAGAAGCTCCACGACTCTGTCGTCATGGTGATCCCTCAGCCTGACGGGAACTTTATGGTCAAGGTTGGTTTCCTGAAGACCCAGCACAAGTATGAGATTGTCTTCACCCTCCCGGAGCTTCCATCACTGGGGAAGGACGCGTCTCCAGCTCCAGTACCCAACCCCCATATCCGCATCACTGATATCACTCCTGTACCAGAGGgtGGTCTGAGAGTGACATGTGAGTACATGGCCCACCAGGAGGGGGTGCTGTGTGAGGAGGTGATGCTGGTCAGTGAGAGCCAGGAGGACGTCTGCGTGGGGGTCAAGGTGCACGCCCGCGTCATGGACCGTCACCATGGTACACCCATGTTGTTGGAAGGAGTGCGTTGTGTGGGAGTGGAGCTGGAGTATGACTCTGAACAGAGTGACTGGCAAGGATTtgactaaaccagacaatgtgacacagacacacaaaagaCCATGCCACATGTGTTCAAATTCAACATCCACTGTACTTCAAACGATCCCTGACCATTTCAAGATGTTATGGTCCTAAAGGAGGATTAAATTAGGAAATGGATAGAAGTTATTTTAAGTAGTAGTCTGGGTTTTTAATTTTACATTCAGGCCGTACTTGGCCGCTAAAAGCTGAATTGCAGCACACAACGCATACAAGTAAACAAATCAaatcttaccttgcttcaaaagTAAAACAAACAAGCatcaaaaccttttttttttaaagcaagtcCAATGTGATCCGATCACTATTGAGCTTCCCTCAactatactgaacacaaatataaacgtaacatttAACAATttcagttacagttcatataaggaaatcaaataaattcattaggccctaatctatggatttcacgactagAAATACcgatatgttggtcacagataccttaaataaAAAAGATAATGATCAtgcggtttaatcagcttcttgttatgccacacctgtaggtggatggattattttggcaaaggagaaatgctcactatggATGTTAACaagtttgtgcacaaaatgtaagAGATGCTTTTTTTGCATCTGGAAAAGTTCTGGGATCTTTATATTTTAGCTCATGAaccatgggaccagcactttaaatgttgcgtttatatttttgttcagtatagttaacaTATCTGAAATGCATCTGTACGAAGTACTGTTGTTAGTACTGTGATAACACGCTATCCAACTGCCCATGCCATTCCACTGCCTGCCTGCCCCTATGTTGTTTAGAATGTGTTCTGAGTAAACCTTTAGGGGGCAACAAAGTTCACGTAATCAATCCAGACCATTTCACCCAGCCTAAATTCAACTGTACCAATAGGGGGCGACAAAAAACACTAAAATTATCCCTCTCATCTGAATCCAAAGGTGTAGAGGGATTCAAAAGGACTTTTTTAAATGAAAGAATGATACGCTATTAATCAGTCGCAAGTGCCTACGGTGCTGTACAGCTTTTACCATCAACAACTGCCTTCTGTCCCGTACTATCCTATCTATCAAGTATCTCCCCTTCAGGAGTTAAAAGATTTAGGACTTTAGTGGATCAACGATAGCTCAGCCTTCCAATATATAATTTTTATatctacaaaacatttcaagtatatttataaaatattaaAGATTGGTGCCATCAGTACCATTGGTAGTAAATCCACACTCAAATTAGATTGCCAGTTGTTTTTTGCTCTTTTAATATATTTGAGGCAACAAGAAGAAATAAAAGACAAACATTTTGGTTGTTAGCCCACCATGAATCAGCCAACAACTAGTAACTCTTACCCTTTATCTACCCCCAAAGCCCTCACCATCCTCTCTGAGCACTCATACTCTCATTGCAACCTAATAGTTTAGTAGTCACTGTTTACTGTCAATAGCTAGTCATTGTAAATGTATATTCCGATCAAATAAGAATGTCAAGTATCTAGCATAAAACATATCCTAATTTCACATAGCTAAACGGACAAAGCCCTGTTTTAAATATAATTGTTTTATATCAGACAATCTTCATGTGTTAACTGTGTTCGGCCTTAATTGAGGAGAACCTGTATATCGTTTGTTTGTATAATAGGCTCTAATGTCTTAAAGTTATACCTTGTTGTTATGGTGTCCATACTAAATCCATGCTCCAGGGtaggggtcaattccatttcaattcaggaagtacatttGAAATGCCAGTTCTTTTCAATTAGGAAAATGTGGAATTGGAATTCTGTTTACTTTCTGAGTTGACTGGAATGGAAATGTCCTGAACCCTGCCATGCTTCAAAAGCTAGTGAGACCGAGTGTGGATTCAGTTTGGATACAAGGCGATCTTGTCCTTTTGAATAGAAAAGAGAGGGCACTATTGTTCATGCAGTCAGACTTATCAAAATAATATCCTTAGCCCATATTGTGATGGGCATCATAGcaggtttggggtcaattccatttaaattccagtcaattcagaaagtaaaccaacaTCCAAATTGTCTGAATTGAAATGTCAgtgtactttctgaattgactgaaatTCAAATGGAGTTGACCCCAGCTCTGGTTGTTGGGTAATTGTACTGAGGGGTTACGGTACTAGGGGGGTGTGGCATTTTGTCAGTCGATATACAATACATGTTCCTTCATTGGTGTTTGCtactattgtctctgttcttttctTATGCCATAAACTTTGTTTTAAGTGCTTATCAAGAAAAACTCCCAAAAGGACTGATTTGAGGTAGAAAGACGTTGGAgcactcaacaacaaaaaagcaggGATGTATTTATTTTAGCTCACTTTAATCCATTCTATGTGATGTCAACAGGTGGATGTCAAGCTGACAATAAAtcaatgtcagattttaaaataaaataaaattgtttaGTGCTCCAACTTCATTCGACTTCAAATGAGTCCTTTTGGAAGTTTAAGCGCTTCTCATgaattgttgttattgttgttgagcACCTTTGTCTGCTGAAGTGTGAACGCCCACCTGAACTAATAAAGTTTGTGTTTAATTGTG
>XM_021614902.2
GCCACAAAGTGAAATTCCTCAGCCACAAACTCAAAATTGGTTAcaaaaattagatttttggtCTTATTTTAAAGTTAGACATACAATTAGCAGTGCGATTAAGGTTACGGTTATAATCAAAAtctgattttaagaagataaatccTAGAAATAGGCGAGTaacgactttgtggctgtgctaacTAGTGACGACCAAGGGGGAGTGGATGCGTATCTACGGGTCATTTTGTGGCTGGGCCATAGAGATGACCAGGCTGTGACGGTtgggttctctctctgtctgtggacCAACCCTGGCATGGCTACTGCTAGGAAGAGCTCCGCAGGAAAGGCGGGAGGTGTTGGTTTCTCAGAAGAGCCAGCCGCCGGCACGCCGTCCCATGTCCACTTTGATGAGAAGCTCCACGACTCTGTCGTCATGGTGATCCCTCAGCCTGACGGGAACTTTATGGTCAAGGTTGGTTTCCTGAAGACCCAGCACAAGTATGAGATTGTCTTCACCCTCCCGGAGCTTCCATCACTGGGGAAGGACGCGTCTCCAGCTCCAGTACCCAACCCCCATATCCGCATCACTGATATCACTCCTGTACCAGAGGgtGGTCTGAGAGTGACATGTGAGTACATGGCCCACCAGGAGGGGGTGCTGTGTGAGGAGGTGATGCTGGTCAGTGAGAGCCAGGAGGACGTCTGCGTGGGGGTCAAGGTGCACGCCCGCGTCATGGACCGTCACCATGGTACACCCATGTTGTTGGAAGGAGTGCGTTGTGTGGGAGTGGAGCTGGAGTATGACTCTGAACAGAGTGACTGGCAAGGATTtgactaaaccagacaatgtgacacagacacacaaaagaCCATGCCACATGTGTTCAAATTCAACATCCACTGTACTTCAAACGATCCCTGACCATTTCAAGATGTTATGGTCCTAAAGGAGGATTAAATTAGGAAATGGATAGAAGTTATTTTAAGTAGTAGTCTGGGTTTTTAATTTTACATTCAGGCCGTACTTGGCCGCTAAAAGCTGAATTGCAGCACACAACGCATACAAGTAAACAAATCAaatcttaccttgcttcaaaagTAAAACAAACAAGCatcaaaaccttttttttttaaagcaagtcCAATGTGATCCGATCACTATTGAGCTTCCCTCAactatactgaacacaaatataaacgtaacatttAACAATttcagttacagttcatataaggaaatcaaataaattcattaggccctaatctatggatttcacgactagAAATACcgatatgttggtcacagataccttaaataaAAAAGATAATGATCAtgcggtttaatcagcttcttgttatgccacacctgtaggtggatggattattttggcaaaggagaaatgctcactatggATGTTAACaagtttgtgcacaaaatgtaagAGATGCTTTTTTTGCATCTGGAAAAGTTCTGGGATCTTTATATTTTAGCTCATGAaccatgggaccagcactttaaatgttgcgtttatatttttgttcagtatagttaacaTATCTGAAATGCATCTGTACGAAGTACTGTTGTTAGTACTGTGATAACACGCTATCCAACTGCCCATGCCATTCCACTGCCTGCCTGCCCCTATGTTGTTTAGAATGTGTTCTGAGTAAACCTTTAGGGGGCAACAAAGTTCACGTAATCAATCCAGACCATTTCACCCAGCCTAAATTCAACTGTACCAATAGGGGGCGACAAAAAACACTAAAATTATCCCTCTCATCTGAATCCAAAGGTGTAGAGGGATTCAAAAGGACTTTTTTAAATGAAAGAATGATACGCTATTAATCAGTCGCAAGTGCCTACGGTGCTGTACAGCTTTTACCATCAACAACTGCCTTCTGTCCCGTACTATCCTATCTATCAAGTATCTCCCCTTCAGGAGTTAAAAGATTTAGGACTTTAGTGGATCAACGATAGCTCAGCCTTCCAATATATAATTTTTATatctacaaaacatttcaagtatatttataaaatattaaAGATTGGTGCCATCAGTACCATTGGTAGTAAATCCACACTCAAATTAGATTGCCAGTTGTTTTTTGCTCTTTTAATATATTTGAGGCAACAAGAAGAAATAAAAGACAAACATTTTGGTTGTTAGCCCACCATGAATCAGCCAACAACTAGTAACTCTTACCCTTTATCTACCCCCAAAGCCCTCACCATCCTCTCTGAGCACTCATACTCTCATTGCAACCTAATAGTTTAGTAGTCACTGTTTACTGTCAATAGCTAGTCATTGTAAATGTATATTCCGATCAAATAAGAATGTCAAGTATCTAGCATAAAACATATCCTAATTTCACATAGCTAAACGGACAAAGCCCTGTTTTAAATATAATTGTTTTATATCAGACAATCTTCATGTGTTAACTGTGTTCGGCCTTAATTGAGGAGAACCTGTATATCGTTTGTTTGTATAATAGGCTCTAATGTCTTAAAGTTATACCTTGTTGTTATGGTGTCCATACTAAATCCATGCTCCAGGGtaggggtcaattccatttcaattcaggaagtacatttGAAATGCCAGTTCTTTTCAATTAGGAAAATGTGGAATTGGAATTCTGTTTACTTTCTGAGTTGACTGGAATGGAAATGTCCTGAACCCTGCCATGCTTCAAAAGCTAGTGAGACCGAGTGTGGATTCAGTTTGGATACAAGGCGATCTTGTCCTTTTGAATAGAAAAGAGAGGGCACTATTGTTCATGCAGTCAGACTTATCAAAATAATATCCTTAGCCCATATTGTGATGGGCATCATAGcaggtttggggtcaattccatttaaattccagtcaattcagaaagtaaaccaacaTCCAAATTGTCTGAATTGAAATGTCAgtgtactttctgaattgactgaaatTCAAATGGAGTTGACCCCAGCTCTGGTTGTTGGGTAATTGTACTGAGGGGTTACGGTACTAGGGGGGTGTGGCATTTTGTCAGTCGATATACAATACATGTTCCTTCATTGGTGTTTGCtactattgtctctgttcttttctTATGCCATAAACTTTGTTTTAAGTGCTTATCAAGAAAAACTCCCAAAAGGACTGATTTGAGGTAGAAAGACGTTGGAgcactcaacaacaaaaaagcaggGATGTATTTATTTTAGCTCACTTTAATCCATTCTATGTGATGTCAACAGGTGGATGTCAAGCTGACAATAAAtcaatgtcagattttaaaataaaataaaattgtttaGTGCTCCAACTTCATTCGACTTCAAATGAGTCCTTTTGGAAGTTTAAGCGCTTCTCATgaattgttgttattgttgttgagcACCTTTGTCTGCTGAAGTGTGAACGCCCACCTGAACTAATAAAGTTTGTGTTTAATTGTG
>XM_021614904.2
GCCACAAAGTGAAATTCCTCAGCCACAAACTCAAAATTGGTTAcaaaaattagatttttggtCTTATTTTAAAGTTAGACATACAATTAGCAGTGCGATTAAGGTTACGGTTATAATCAAAAtctgattttaagaagataaatccTAGAAATAGGCGAGTaacgactttgtggctgtgctaacTAGTGACGACCAAGGGGGAGTGGATGCGTATCTACGGGTCATTTTGTGGCTGGGCCATAGAGATGACCAGGCTGTGACGGTtgggttctctctctgtctgtggacCAACCCTGGCATGGCTACTGCTAGGAAGATTGGTCTCTCCCTCTTCAGGCTCCGCAGGAAAGGCGGGAGGTGTTGGTTTCTCAGAAGAGCCAGCCGCCGGCACGCCGTCCCATGTCCACTTTGATGAGAAGCTCCACGACTCTGTCGTCATGGTGATCCCTCAGCCTGACGGGAACTTTATGGTCAAGGTTGGTTTCCTGAAGACCCAGCACAAGTATGAGATTGTCTTCACCCTCCCGGAGCTTCCATCACTGGGGAAGGACGCGTCTCCAGCTCCAGTACCCAACCCCCATATCCGCATCACTGATATCACTCCTGTACCAGAGGgtGGTCTGAGAGTGACATGTGAGTACATGGCCCACCAGGAGGGGGTGCTGTGTGAGGAGGTGATGCTGGTCAGTGAGAGCCAGGAGGACGTCTGCGTGGGGGTCAAGGTGCACGCCCGCGTCATGGACCGTCACCATGGTACACCCATGTTGTTGGAAGGAGTGCGTTGTGTGGGAGTGGAGCTGGAGTATGACTCTGAACAGAGTGACTGGCAAGGATTtgactaaaccagacaatgtgacacagacacacaaaagaCCATGCCACATGTGTTCAAATTCAACATCCACTGTACTTCAAACGATCCCTGACCATTTCAAGATGTTATGGTCCTAAAGGAGGATTAAATTAGGAAATGGATAGAAGTTATTTTAAGTAGTAGTCTGGGTTTTTAATTTTACATTCAGGCCGTACTTGGCCGCTAAAAGCTGAATTGCAGCACACAACGCATACAAGTAAACAAATCAaatcttaccttgcttcaaaagTAAAACAAACAAGCatcaaaaccttttttttttaaagcaagtcCAATGTGATCCGATCACTATTGAGCTTCCCTCAactatactgaacacaaatataaacgtaacatttAACAATttcagttacagttcatataaggaaatcaaataaattcattaggccctaatctatggatttcacgactagAAATACcgatatgttggtcacagataccttaaataaAAAAGATAATGATCAtgcggtttaatcagcttcttgttatgccacacctgtaggtggatggattattttggcaaaggagaaatgctcactatggATGTTAACaagtttgtgcacaaaatgtaagAGATGCTTTTTTTGCATCTGGAAAAGTTCTGGGATCTTTATATTTTAGCTCATGAaccatgggaccagcactttaaatgttgcgtttatatttttgttcagtatagttaacaTATCTGAAATGCATCTGTACGAAGTACTGTTGTTAGTACTGTGATAACACGCTATCCAACTGCCCATGCCATTCCACTGCCTGCCTGCCCCTATGTTGTTTAGAATGTGTTCTGAGTAAACCTTTAGGGGGCAACAAAGTTCACGTAATCAATCCAGACCATTTCACCCAGCCTAAATTCAACTGTACCAATAGGGGGCGACAAAAAACACTAAAATTATCCCTCTCATCTGAATCCAAAGGTGTAGAGGGATTCAAAAGGACTTTTTTAAATGAAAGAATGATACGCTATTAATCAGTCGCAAGTGCCTACGGTGCTGTACAGCTTTTACCATCAACAACTGCCTTCTGTCCCGTACTATCCTATCTATCAAGTATCTCCCCTTCAGGAGTTAAAAGATTTAGGACTTTAGTGGATCAACGATAGCTCAGCCTTCCAATATATAATTTTTATatctacaaaacatttcaagtatatttataaaatattaaAGATTGGTGCCATCAGTACCATTGGTAGTAAATCCACACTCAAATTAGATTGCCAGTTGTTTTTTGCTCTTTTAATATATTTGAGGCAACAAGAAGAAATAAAAGACAAACATTTTGGTTGTTAGCCCACCATGAATCAGCCAACAACTAGTAACTCTTACCCTTTATCTACCCCCAAAGCCCTCACCATCCTCTCTGAGCACTCATACTCTCATTGCAACCTAATAGTTTAGTAGTCACTGTTTACTGTCAATAGCTAGTCATTGTAAATGTATATTCCGATCAAATAAGAATGTCAAGTATCTAGCATAAAACATATCCTAATTTCACATAGCTAAACGGACAAAGCCCTGTTTTAAATATAATTGTTTTATATCAGACAATCTTCATGTGTTAACTGTGTTCGGCCTTAATTGAGGAGAACCTGTATATCGTTTGTTTGTATAATAGGCTCTAATGTCTTAAAGTTATACCTTGTTGTTATGGTGTCCATACTAAATCCATGCTCCAGGGtaggggtcaattccatttcaattcaggaagtacatttGAAATGCCAGTTCTTTTCAATTAGGAAAATGTGGAATTGGAATTCTGTTTACTTTCTGAGTTGACTGGAATGGAAATGTCCTGAACCCTGCCATGCTTCAAAAGCTAGTGAGACCGAGTGTGGATTCAGTTTGGATACAAGGCGATCTTGTCCTTTTGAATAGAAAAGAGAGGGCACTATTGTTCATGCAGTCAGACTTATCAAAATAATATCCTTAGCCCATATTGTGATGGGCATCATAGcaggtttggggtcaattccatttaaattccagtcaattcagaaagtaaaccaacaTCCAAATTGTCTGAATTGAAATGTCAgtgtactttctgaattgactgaaatTCAAATGGAGTTGACCCCAGCTCTGGTTGTTGGGTAATTGTACTGAGGGGTTACGGTACTAGGGGGGTGTGGCATTTTGTCAGTCGATATACAATACATGTTCCTTCATTGGTGTTTGCtactattgtctctgttcttttctTATGCCATAAACTTTGTTTTAAGTGCTTATCAAGAAAAACTCCCAAAAGGACTGATTTGAGGTAGAAAGACGTTGGAgcactcaacaacaaaaaagcaggGATGTATTTATTTTAGCTCACTTTAATCCATTCTATGTGATGTCAACAGGTGGATGTCAAGCTGACAATAAAtcaatgtcagattttaaaataaaataaaattgtttaGTGCTCCAACTTCATTCGACTTCAAATGAGTCCTTTTGGAAGTTTAAGCGCTTCTCATgaattgttgttattgttgttgagcACCTTTGTCTGCTGAAGTGTGAACGCCCACCTGAACTAATAAAGTTTGTGTTTAATTGTG

Function

NR:

description
UPF0687 protein C20orf27 homolog isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036987438.1 False 3305 mRNA 0.41 6 16095962 16117642
XM_021614903.2 False 3340 mRNA 0.40 6 16095962 16117672
XM_021614901.2 False 3340 mRNA 0.40 6 16095962 16117696
XM_021614902.2 False 3421 mRNA 0.40 6 16095962 16117909
XM_021614904.2 True 3440 mRNA 0.40 6 16095962 16117909
Loading

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110531611 LOC106577839 coding downstream 8932 16048744 ~ 16087030 (-)
LOC110531610 LOC106577838 coding downstream 66064 15991941 ~ 16029898 (-)
trnal-cag-5 NA coding downstream 82344 16013536 ~ 16013618 (-)
LOC110531609 LOC106577837 coding downstream 116161 15951928 ~ 15979801 (-)
LOC110532935 LOC106577836 coding downstream 204693 15867906 ~ 15891269 (-)
trnak-cuu-4 NA coding upstream 15136 16133045 ~ 16133117 (-)
trnan-guu-3 NA coding upstream 15696 16133605 ~ 16133678 (-)
gba2 gba2 coding upstream 68348 16186257 ~ 16220121 (-)
LOC118966005 msmp coding upstream 112749 16230658 ~ 16232360 (-)
LOC110531616 tesk1 coding upstream 145555 16263464 ~ 16289868 (-)
G775612 NA non-coding downstream 30116 16063926 ~ 16065846 (-)
G775603 NA non-coding downstream 48669 16045612 ~ 16047293 (-)
G775602 NA non-coding downstream 52170 16043489 ~ 16043792 (-)
G775600 NA non-coding downstream 53219 16042380 ~ 16042743 (-)
G775599 NA non-coding downstream 53629 16041968 ~ 16042333 (-)
G775645 NA non-coding upstream 2358 16120267 ~ 16127928 (-)
G775650 NA non-coding upstream 10884 16128793 ~ 16129615 (-)
G775651 NA non-coding upstream 12840 16130749 ~ 16131239 (-)
G775653 NA non-coding upstream 14400 16132309 ~ 16132581 (-)
G775656 NA non-coding upstream 19663 16137572 ~ 16137787 (-)
G775532 NA other downstream 182668 15912836 ~ 15913294 (-)
G775139 NA other downstream 232128 15862320 ~ 15863834 (-)
LOC110531603 groa other downstream 308356 15781909 ~ 15787666 (-)
G774954 NA other downstream 470042 15625202 ~ 15625920 (-)
G774702 LOC106577875 other downstream 734643 15352307 ~ 15361319 (-)
LOC110531626 LOC106608856 other upstream 709144 16827053 ~ 16828583 (-)
G776294 NA other upstream 747558 16865467 ~ 16866034 (-)
G776340 LOC106577790 other upstream 892103 17010012 ~ 17014685 (-)
G776355 NA other upstream 907471 17025380 ~ 17025813 (-)
G776461 NA other upstream 1127525 17245434 ~ 17245797 (-)

Expression

LOC110531612(LOC106577840) Expression in all Baseline Samples

Bar chart with 20 bars.
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying values. Range: 0 to 125.
End of interactive chart.

LOC110531612(LOC106577840) Expression in each Bioproject

Bar chart with 21 bars.
LOC110531612(LOC106577840) Expression in each Sample
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying Expression. Range: 0 to 600.
End of interactive chart.

Co-expression Network