LOC110531673 (LOC106577689)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110531673
gene name LOC106577689
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048573.1
NCBI id CM023227.2
chromosome length 79455637
location 19010092 ~ 19017404 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021614993.2
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>XM_021614994.2
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Function

NR:

description
prostaglandin D2 receptor 2-like

GO: NA

KEGG:

id description
K06715 PTGDR2, GPR44, CD294; prostaglandin D2 receptor 2

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021614993.2 False 5374 mRNA 0.45 3 19010092 19017404
XM_021614994.2 True 5238 mRNA 0.45 2 19010092 19017404

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110532946 NA coding downstream 20448 18987822 ~ 18989644 (-)
LOC110531661 LOC105020576 coding downstream 403870 18331006 ~ 18606222 (-)
LOC110531659 LOC106577767 coding downstream 711275 18283728 ~ 18298817 (-)
LOC110532944 NA coding downstream 764997 18236222 ~ 18245095 (-)
LOC110531655 LOC106577763 coding downstream 809148 18190851 ~ 18200944 (-)
LOC110531672 LOC106577688 coding upstream 142 19017546 ~ 19047473 (-)
LOC118966012 NA coding upstream 49287 19066691 ~ 19070212 (-)
tifa LOC106577687 coding upstream 66628 19084032 ~ 19085999 (-)
nitr2 nitr2 coding upstream 102096 19119500 ~ 19124018 (-)
LOC110532949 nitr3 coding upstream 130698 19148102 ~ 19156589 (-)
G778626 NA non-coding downstream 29032 18970964 ~ 18981060 (-)
G778584 NA non-coding downstream 93483 18916300 ~ 18916609 (-)
G778575 NA non-coding downstream 114534 18895261 ~ 18895558 (-)
G778574 NA non-coding downstream 115457 18894336 ~ 18894635 (-)
G778455 NA non-coding downstream 273373 18715780 ~ 18736719 (-)
G778666 NA non-coding upstream 40716 19058120 ~ 19058420 (-)
G778678 NA non-coding upstream 58714 19076118 ~ 19076772 (-)
G778679 NA non-coding upstream 59661 19077065 ~ 19077316 (-)
G778682 NA non-coding upstream 61701 19079105 ~ 19079319 (-)
G778216 NA other downstream 651989 18355441 ~ 18358103 (-)
G776822 NA other downstream 1349609 17659690 ~ 17660483 (-)
G776820 NA other downstream 1350689 17659016 ~ 17659403 (-)
G776814 LOC106600668 other downstream 1353767 17655988 ~ 17656325 (-)
G776812 LOC106566110 other downstream 1354112 17655594 ~ 17655980 (-)
G780209 NA other upstream 800287 19817691 ~ 19824571 (-)
LOC110531704 LOC106608762 other upstream 1054592 20022194 ~ 20075490 (-)
LOC110531717 LOC106577635 other upstream 1284674 20302051 ~ 20324316 (-)
LOC110531730 adgrl3 other upstream 1913556 20930960 ~ 21272646 (-)
G782003 NA other upstream 2758314 21775718 ~ 21776210 (-)

Expression


Co-expression Network