XLOC_026666


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_026666
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 40396063 ~ 40405386 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00053082
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Function

GO:

id name namespace
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KEGG:

id description
ko03050 Proteasome
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko05169 Epstein-Barr virus infection
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00053082 False 9107 lncRNA 0.32 2 40396063 40405249
TCONS_00051934 False 3106 lncRNA 0.36 2 40396063 40405386
TCONS_00053083 True 1039 lncRNA 0.43 2 40403056 40405034

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_026665 atp5mf coding downstream 94596 40296785 ~ 40301467 (-)
XLOC_026664 pdap1b coding downstream 111319 40277704 ~ 40284744 (-)
XLOC_026663 shmt1 coding downstream 119992 40260929 ~ 40276071 (-)
XLOC_026662 top3a coding downstream 141429 40235288 ~ 40254634 (-)
XLOC_026661 flii coding downstream 163448 40206031 ~ 40232615 (-)
XLOC_026667 actb2 coding upstream 120721 40526107 ~ 40529804 (-)
XLOC_026668 rnf216 coding upstream 195384 40600770 ~ 40664913 (-)
XLOC_026669 uts2r5 coding upstream 274545 40679931 ~ 40681001 (-)
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XLOC_026671 NA coding upstream 369032 40774418 ~ 40777723 (-)
XLOC_026659 NA non-coding downstream 214409 40180136 ~ 40181654 (-)
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XLOC_026653 BX649356.2 non-coding downstream 444536 39945865 ~ 39951527 (-)
XLOC_026651 BX322795.1 non-coding downstream 746501 39649445 ~ 39649562 (-)
XLOC_026680 CR769786.1 non-coding upstream 906636 41312022 ~ 41312143 (-)
XLOC_026681 BX537310.2 non-coding upstream 990737 41396123 ~ 41512210 (-)
XLOC_026687 NA non-coding upstream 1777967 42183353 ~ 42205112 (-)
XLOC_026688 BX005183.3 non-coding upstream 1807324 42212710 ~ 42216013 (-)

Expression


Co-expression Network