LOC118966034


Basic Information

Item Value
gene id LOC118966034
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048573.1
NCBI id CM023227.2
chromosome length 79455637
location 35874154 ~ 35879299 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036987877.1
ACCGTGGAGGTTACCGGTGGGTGGGAAGAATAATACTTAAAGAACTGAGCTTTATTATCCACTATTTAGTTATGTTTCTACGTTTTCTTATTGTATgttgaattgactgatttccccTTCTTTCCCATCTCTTCTCCACAGTCGAACTCCTATGTACCGGTGTCTATGTACCAGTGTCTATGTACCAGTGTCTATGTACCAGAGAGAAGGATGTTCAAGCAGGTCTATCAgatctcctgtctgtgtgtgactgacaGTGACTGTAGGGATCTGGCCACGGATGCCCTGGAAGGGTTCGACTGTCACCtttaagaaggcctTCATCCGAGTACGAGACCTGCGCTGCCTGGAGCTCATCAACAGCATTGAGGCTGATTGACATCGTCCGTAAGCTGGATAATGCGGAGCACCATGGCTACTCCTCTGAGACCTACTCCAAGATGGGAGACCTGCAGGCCCTGGTGCAGCTGCACGTGGAGGCACGATACTGGGACCAGGTTAGTCAAAACCTTTCACATTTCACTTATGGTCCTTTCACCTGTTGGACACAGCTACAGTATTCTATCTTACTTGGCTCATCAGAAAGTTGACCTCATAGGTCCCACCCAGAACACAGAAAATTCAACTGCATATTTACTGGAACAAGACAAACTGAAACGATGTTCTATTAAAACCAGAGCAACGTTTCCAGCCAAACCAGAGATTTCCTCTGAATCTCTGCCTACATTATGACTAGAATGTGAGAAGCACCCAACAGTCCAAAGCAATAAAGAGCCTTAGCTCAACCACCCCCATCAGAGCAGCTCATACTACAGAGACATGAAGAAAACACTACATTTCCTAAATCCATCACTAGTGTTTCATCAATTACAGGCGGTCCTGAGAGCAAACTGCCGATgtccacggtgaaacagagaatgCCAAAAAAAATAGAACCTTTTATCAGATTCATATTGTATGAATCTGGCATGGCGTTAGCAGCCATGTTTTTACATCCCTTTCTGGGGGAGGTGGACATTgagagagaacagaacacagcctacagtacagtatgaatggGCCATATGGATGCTATTCACTGCACTCACTCTTATCCTGGGCCTAGCCTGGGTTTAGTCTGCTTAGACTCAGAGGCTGATTGGGCTGTGCAGAAGAGGGCTTTGACATTACTGTGACACACAGTTACACATATAAAGAGGAGTGTACTTAACAACATTCTTGCTATGGGACGTTTAGGTTAATCAATCAACATGACAGGCAGGTATGCCTCCATAGGGTACTGTCACACTACTCTATTACAGACAAACACCAGCTACTCTACCACAGACACCACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTATACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTATACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACCACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACACCACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACCACAGACAACACCAGCTACTCTACCACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACCACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAAACACCTGCTACTCTACTACAGACAAACACCAGCTActctactacagacacacaccagcTACTCTACTACAGACAAACACCAGCTACTCTACAACAGACAACACCAGCTACTCTACAACAGACAACACCAGCTACTCTACTAAAGACAACACCAGCTACTCTACTAAAGACAACACCAGCTACTCTACTAAAGACAACACCAGCTACTCTACCACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAAACACCAGCTACTCAACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACATCACCAGCTACTCTACTACAGACAAACACCAGCTACTCTACAACAGACAACACCAGCTACTCTACAACAGACAACACCAGCTACTCTACAACAGACAACACCAGCTACTCTACTAAAGACAACACCAGCTACTCTACTAAAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACGACACCAgctactatactacagacacacaccagcTACTCTACCACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACCACAGACAACACCAGTTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTGCACACTAATTGACCATGACATAAAATCAGTCTAATATACTGTagtagggtggctactttgaagatatATACAATACAAATgtacaatatattttgatttgtttaacactttttggttactttgtttaacactttattggttactacatgattccacatgtgttatttcatagttttgatgtcttcactattattctacaatgtagaatacagaaaaaattaagaaaaacccttggtaCTGTATGTTAACCCTAATATATCACATTAGTAATGAGATGTATTCATGTTTTGGCAAGTGttggtatttatcatcattagtcatttaggtcaacattggatcattcagagatcctcactgaacttctggagagagtttgctgcactg
>XM_036987878.1
ACCGTGGAGGTTACCGGTGGGTGGGAAGAATAATACTTAAAGAACTGAGCTTTATTATCCACTATTTAGTTATGTTTCTACGTTTTCTTATTGTATgttgaattgactgatttccccTTCTTTCCCATCTCTTCTCCACAGTCGAACTCCTATGTACCGGTGTCTATGTACCAGTGTCTATGTACCAGTGTCTATGTACCAGAGAGAAGGATGTTCAAGCAGGTCTATCAgatctcctgtctgtgtgtgactgacaGTGACTGTAGGGATCTGGCCACGGATGCCCTGGAAGGGTTCGACTGTCACCtttaagaaggtcatacaagCACATACTCCCacggaagcacacacacaccttttcactGCAATGCTAGTGTTCACCACTAGATGGAGCAGCCTGATGCTATTTGTATGAATAACCTCTCTCATGCTTGTTTGACCAATGTGACAGAATAGCTTAAGTATGTGGTGTGAGTGGATTCTCTGGCTTCCCCATAATTTGTTGTGGCTCCGGACAAGCACACTTAATTCTGcccttgacaagttgaatcaggtgtttttgtccaagactacaacaaaaatgtgtgctgttggggatactcgaggactggagttcccttttgtttctctctctcaggcctTCATCCGAGTACGAGACCTGCGCTGCCTGGAGCTCATCAACAGCATTGAGGCTGATTGACATCGTCCGTAAGCTGGATAATGCGGAGCACCATGGCTACTCCTCTGAGACCTACTCCAAGATGGGAGACCTGCAGGCCCTGGTGCAGCTGCACGTGGAGGCACGATACTGGGACCAGGTTAGTCAAAACCTTTCACATTTCACTTATGGTCCTTTCACCTGTTGGACACAGCTACAGTATTCTATCTTACTTGGCTCATCAGAAAGTTGACCTCATAGGTCCCACCCAGAACACAGAAAATTCAACTGCATATTTACTGGAACAAGACAAACTGAAACGATGTTCTATTAAAACCAGAGCAACGTTTCCAGCCAAACCAGAGATTTCCTCTGAATCTCTGCCTACATTATGACTAGAATGTGAGAAGCACCCAACAGTCCAAAGCAATAAAGAGCCTTAGCTCAACCACCCCCATCAGAGCAGCTCATACTACAGAGACATGAAGAAAACACTACATTTCCTAAATCCATCACTAGTGTTTCATCAATTACAGGCGGTCCTGAGAGCAAACTGCCGATgtccacggtgaaacagagaatgCCAAAAAAAATAGAACCTTTTATCAGATTCATATTGTATGAATCTGGCATGGCGTTAGCAGCCATGTTTTTACATCCCTTTCTGGGGGAGGTGGACATTgagagagaacagaacacagcctacagtacagtatgaatggGCCATATGGATGCTATTCACTGCACTCACTCTTATCCTGGGCCTAGCCTGGGTTTAGTCTGCTTAGACTCAGAGGCTGATTGGGCTGTGCAGAAGAGGGCTTTGACATTACTGTGACACACAGTTACACATATAAAGAGGAGTGTACTTAACAACATTCTTGCTATGGGACGTTTAGGTTAATCAATCAACATGACAGGCAGGTATGCCTCCATAGGGTACTGTCACACTACTCTATTACAGACAAACACCAGCTACTCTACCACAGACACCACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTATACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTATACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACCACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACACCACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACCACAGACAACACCAGCTACTCTACCACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACCACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAAACACCTGCTACTCTACTACAGACAAACACCAGCTActctactacagacacacaccagcTACTCTACTACAGACAAACACCAGCTACTCTACAACAGACAACACCAGCTACTCTACAACAGACAACACCAGCTACTCTACTAAAGACAACACCAGCTACTCTACTAAAGACAACACCAGCTACTCTACTAAAGACAACACCAGCTACTCTACCACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAAACACCAGCTACTCAACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACATCACCAGCTACTCTACTACAGACAAACACCAGCTACTCTACAACAGACAACACCAGCTACTCTACAACAGACAACACCAGCTACTCTACAACAGACAACACCAGCTACTCTACTAAAGACAACACCAGCTACTCTACTAAAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACGACACCAgctactatactacagacacacaccagcTACTCTACCACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACCACAGACAACACCAGTTACTCTACTACAGACAACACCAGCTACTCTACTACAGACAACACCAGCTGCACACTAATTGACCATGACATAAAATCAGTCTAATATACTGTagtagggtggctactttgaagatatATACAATACAAATgtacaatatattttgatttgtttaacactttttggttactttgtttaacactttattggttactacatgattccacatgtgttatttcatagttttgatgtcttcactattattctacaatgtagaatacagaaaaaattaagaaaaacccttggtaCTGTATGTTAACCCTAATATATCACATTAGTAATGAGATGTATTCATGTTTTGGCAAGTGttggtatttatcatcattagtcatttaggtcaacattggatcattcagagatcctcactgaacttctggagagagtttgctgcactg

Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036987877.1 False 2954 mRNA 0.44 3 35874154 35879299
XM_036987878.1 True 3275 mRNA 0.44 2 35874154 35879299

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118936413 NA coding downstream 5141 35860645 ~ 35869013 (-)
LOC110531974 LOC100136369 coding downstream 14330 35856108 ~ 35859824 (-)
LOC118936388 LOC106571889 coding downstream 307883 35564261 ~ 35566271 (-)
LOC110531156 wdr46 coding downstream 311616 35556867 ~ 35562538 (-)
LOC118966032 LOC106571870 coding downstream 352270 35492026 ~ 35521884 (-)
LOC110531977 LOC106571877 coding upstream 17130 35896429 ~ 35904384 (-)
LOC118966036 NA coding upstream 32226 35911525 ~ 35913838 (-)
LOC118966037 NA coding upstream 36646 35915945 ~ 35918726 (-)
LOC110531978 LOC106571879 coding upstream 39438 35918737 ~ 35927713 (-)
LOC110531979 brpf1 coding upstream 69245 35948544 ~ 35979307 (-)
G798844 LOC106571875 non-coding downstream 48422 35821519 ~ 35825732 (-)
G798836 NA non-coding downstream 60502 35813392 ~ 35813652 (-)
G798744 NA non-coding downstream 161781 35669911 ~ 35712373 (-)
G798344 NA non-coding downstream 270504 35603433 ~ 35603650 (-)
G798340 NA non-coding downstream 273107 35600803 ~ 35601047 (-)
G798883 NA non-coding upstream 34898 35914197 ~ 35914434 (-)
G798890 NA non-coding upstream 51965 35931264 ~ 35932005 (-)
G798901 NA non-coding upstream 79785 35959084 ~ 35961739 (-)
G798902 NA non-coding upstream 80579 35959878 ~ 35967217 (-)
G798906 NA non-coding upstream 88788 35968087 ~ 35969282 (-)
LOC110531966 LOC106571884 other downstream 487022 35381661 ~ 35400349 (-)
G798195 NA other downstream 519479 35354219 ~ 35354675 (-)
G797605 NA other downstream 998275 34869955 ~ 34875879 (-)
G796733 rl32 other downstream 1816605 34051059 ~ 34057549 (-)
G798993 NA other upstream 271039 36150338 ~ 36150637 (-)
LOC110531982 LOC106571893 other upstream 948597 36827882 ~ 36907700 (-)
G800318 NA other upstream 1465096 37344395 ~ 37345147 (-)
LOC110532015 LOC106566767 other upstream 2961910 38839265 ~ 38841685 (-)

Expression


Co-expression Network