XLOC_026692 (BX908797.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_026692
gene name BX908797.1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 42918143 ~ 42968544 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00051982
ccagttcaaagcaactgtacatatggtgaatgtAATgtatgtggcttagattattCGATTTATTTCATGCGGTTTTGTGCACAATCATTGGCACAAgtatgttacattacaccacCGATGACTATTGTTGGGTTATTGGTTTGGGCATTCGGCTACTTCAATGATGGTGATGTACAGGTAACCTCCTGTTACACTATtataacaattgtatatttGTTCTCAGAGGTATTGGCTTTTtttggactgttttttttttttttttttgtaacatcaCATTTATTAACtaACTTTGAGAAAATATTGTATTTGCTGGTAATAGACAGTATATTTTTTATAagtttttgg
>TCONS_00053097
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Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000114676

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00051982 False 345 mRNA 0.32 16 42918143 42968544
TCONS_00053097 True 4167 lncRNA 0.34 1 42959068 42963234

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_026691 CABZ01079183.1 coding downstream 51943 42866083 ~ 42866200 (-)
XLOC_026690 NA coding downstream 171359 42548944 ~ 42746784 (-)
XLOC_026689 NA coding downstream 544544 42371784 ~ 42373599 (-)
XLOC_026688 BX005183.3 coding downstream 702130 42212710 ~ 42216013 (-)
XLOC_026687 NA coding downstream 713031 42183353 ~ 42205112 (-)
XLOC_026694 NA coding upstream 56277 43024821 ~ 43026735 (-)
XLOC_026695 NA coding upstream 218650 43187194 ~ 43189085 (-)
XLOC_026696 snn coding upstream 378973 43347517 ~ 43821381 (-)
XLOC_026697 uncx coding upstream 384012 43352556 ~ 43356082 (-)
XLOC_026698 axin1 coding upstream 610431 43578975 ~ 43686469 (-)
XLOC_026702 BX682557.2 non-coding upstream 898241 43866785 ~ 43875129 (-)
XLOC_026703 BX682557.1 non-coding upstream 909912 43878456 ~ 43889443 (-)
XLOC_026708 NA non-coding upstream 1143001 44111545 ~ 44124370 (-)

Expression


Co-expression Network